Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3HDC4

Protein Details
Accession A0A0C3HDC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-94DSGVPRPVRAPKKKKALLHTPAHydrophilic
451-473GGESAEKKKKTWRRVQDDLEDNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-87VRAPKKKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSLAQLARLLPLPESDLQQVLDYAATLSKEETVGHFKNLLGTSRETLEFISSFNSRRKDPASKPLSEQTTQSDSGVPRPVRAPKKKKALLHTPAPRQVQNNYAAQGKAYVKKDEDDYISKRPTSSEASTSTHASVPQPKADVVPATISRAPPSAAGSLISDLKPKSAPTSRGTSRKSSPAPSKTKVNITGGTSMQGGSNVLRELDAAIRSLEISTNSTLLDNEKRKCNCIGARHPLLTAAPNCLNCGKVICVKEGLGPCTFCGVPLLSATEIQGMIRELREEAGREKMALDASIHRRAEVSKTPAPFTTPKGGDLLGFQAQNARRTTVRDEAADFETPMTGGLNMWASPAERAKQLKKQQKVLAEQEWNARPEYEKRRQVVSIDLVKGKVVKRMGAAEKPPQPQSDSEDDIEDLPMSDMSGNKGGGAFSRNPLLGSLIKPVYNSDKGKDIGGESAEKKKKTWRRVQDDLEDNEDIILDGGVYGGEALV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.2
4 0.2
5 0.2
6 0.19
7 0.16
8 0.14
9 0.11
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.09
14 0.1
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.15
19 0.22
20 0.23
21 0.25
22 0.26
23 0.25
24 0.31
25 0.32
26 0.32
27 0.28
28 0.29
29 0.29
30 0.3
31 0.31
32 0.25
33 0.23
34 0.22
35 0.19
36 0.16
37 0.18
38 0.17
39 0.2
40 0.26
41 0.29
42 0.28
43 0.33
44 0.4
45 0.46
46 0.5
47 0.57
48 0.57
49 0.57
50 0.61
51 0.64
52 0.62
53 0.54
54 0.49
55 0.45
56 0.43
57 0.4
58 0.35
59 0.32
60 0.27
61 0.31
62 0.37
63 0.32
64 0.28
65 0.33
66 0.41
67 0.47
68 0.57
69 0.62
70 0.63
71 0.74
72 0.79
73 0.81
74 0.8
75 0.81
76 0.78
77 0.78
78 0.78
79 0.76
80 0.76
81 0.73
82 0.67
83 0.6
84 0.55
85 0.5
86 0.45
87 0.4
88 0.34
89 0.33
90 0.3
91 0.27
92 0.29
93 0.27
94 0.3
95 0.3
96 0.31
97 0.3
98 0.32
99 0.34
100 0.33
101 0.33
102 0.33
103 0.34
104 0.38
105 0.4
106 0.39
107 0.36
108 0.34
109 0.33
110 0.33
111 0.31
112 0.28
113 0.29
114 0.32
115 0.33
116 0.34
117 0.32
118 0.26
119 0.24
120 0.23
121 0.27
122 0.26
123 0.27
124 0.26
125 0.25
126 0.25
127 0.25
128 0.23
129 0.16
130 0.17
131 0.15
132 0.18
133 0.2
134 0.19
135 0.19
136 0.18
137 0.18
138 0.15
139 0.16
140 0.13
141 0.11
142 0.12
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.12
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.18
153 0.22
154 0.26
155 0.27
156 0.35
157 0.4
158 0.48
159 0.51
160 0.5
161 0.48
162 0.51
163 0.52
164 0.51
165 0.54
166 0.55
167 0.59
168 0.57
169 0.6
170 0.56
171 0.58
172 0.55
173 0.5
174 0.43
175 0.38
176 0.38
177 0.3
178 0.28
179 0.22
180 0.18
181 0.14
182 0.11
183 0.1
184 0.06
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.1
207 0.17
208 0.21
209 0.23
210 0.3
211 0.31
212 0.33
213 0.34
214 0.38
215 0.35
216 0.38
217 0.43
218 0.44
219 0.46
220 0.45
221 0.43
222 0.38
223 0.34
224 0.28
225 0.21
226 0.16
227 0.15
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.12
233 0.12
234 0.1
235 0.13
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.18
241 0.19
242 0.19
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.13
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.18
280 0.25
281 0.24
282 0.23
283 0.24
284 0.24
285 0.28
286 0.28
287 0.3
288 0.28
289 0.29
290 0.31
291 0.31
292 0.33
293 0.31
294 0.29
295 0.3
296 0.27
297 0.26
298 0.26
299 0.26
300 0.22
301 0.2
302 0.2
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.16
307 0.18
308 0.23
309 0.23
310 0.22
311 0.21
312 0.24
313 0.29
314 0.3
315 0.3
316 0.26
317 0.27
318 0.28
319 0.3
320 0.28
321 0.23
322 0.17
323 0.14
324 0.13
325 0.11
326 0.08
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.09
336 0.11
337 0.12
338 0.16
339 0.22
340 0.27
341 0.36
342 0.46
343 0.53
344 0.58
345 0.65
346 0.65
347 0.68
348 0.69
349 0.67
350 0.65
351 0.6
352 0.55
353 0.54
354 0.52
355 0.46
356 0.39
357 0.33
358 0.28
359 0.32
360 0.4
361 0.43
362 0.46
363 0.48
364 0.51
365 0.53
366 0.51
367 0.49
368 0.47
369 0.44
370 0.41
371 0.4
372 0.36
373 0.35
374 0.37
375 0.32
376 0.3
377 0.24
378 0.22
379 0.23
380 0.3
381 0.35
382 0.37
383 0.41
384 0.43
385 0.49
386 0.52
387 0.53
388 0.47
389 0.44
390 0.4
391 0.42
392 0.4
393 0.37
394 0.33
395 0.31
396 0.3
397 0.28
398 0.26
399 0.2
400 0.14
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.11
407 0.14
408 0.13
409 0.13
410 0.13
411 0.13
412 0.14
413 0.18
414 0.17
415 0.17
416 0.21
417 0.21
418 0.2
419 0.21
420 0.22
421 0.21
422 0.2
423 0.24
424 0.23
425 0.23
426 0.23
427 0.26
428 0.3
429 0.35
430 0.36
431 0.32
432 0.36
433 0.36
434 0.37
435 0.36
436 0.3
437 0.26
438 0.26
439 0.29
440 0.26
441 0.36
442 0.41
443 0.4
444 0.41
445 0.48
446 0.55
447 0.6
448 0.68
449 0.69
450 0.71
451 0.8
452 0.86
453 0.86
454 0.85
455 0.78
456 0.73
457 0.62
458 0.53
459 0.43
460 0.34
461 0.24
462 0.16
463 0.11
464 0.05
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04