Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3H8S9

Protein Details
Accession A0A0C3H8S9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-51QSINSSKYRNTMRQKKPQSSVEESMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-137LPERKAASSIKNTRSSRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.333, cyto 3, cyto_mito 2.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MYSLNWNQPGRRTGLTRDGYKAPNLLQSINSSKYRNTMRQKKPQSSVEESMGPVNEVLSEEGIYAPPKDQSDTSDEENASRAADIIPTVFIRRGSEDSNVNSQNSKGVAREIRGKGSSPLPERKAASSIKNTRSSRRLSPGSSSKRKNDENDAQLGTGMVDQFGQVKVKKAKAGKTYGLASHKRHTIRPQQQQSEGSPPAKQFKFPSALSPSYDEESDVNSPVKSDFKKLDSTEFDSPEEGVANTPPSTTFKRLDTTEFDSPMKSIAESPLKSTFRKVDMSGFESSSEESATNFRAPKKFEGQRLPPRKTSEPLTEELPLTQLPTFKKFPVEGDLAAKAQDIIGPRIDLPDLVPTPLDEDDDNFMTQLSRCPMCRRSVDPEELRKCGEMNTRQQEKFCRGHQKQDAEEEWSSRGYPEINWDILDSRISQHYTFIKNLINGADSHYKLLLDQTVKAGKDRTLLKSETNLTPGYYGTRGLRVISENIMREFTPLLKKRAIKDRLMAARGVTGFVQSVLVPELTVLLIMEDMNTAIGEARRVLKESAEIGELVHEEIRDVVLRRAEDSGEDDEECEENYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.54
3 0.52
4 0.53
5 0.54
6 0.52
7 0.51
8 0.48
9 0.4
10 0.39
11 0.37
12 0.34
13 0.29
14 0.32
15 0.35
16 0.37
17 0.4
18 0.36
19 0.35
20 0.41
21 0.47
22 0.51
23 0.56
24 0.62
25 0.67
26 0.76
27 0.85
28 0.87
29 0.87
30 0.85
31 0.83
32 0.8
33 0.75
34 0.68
35 0.6
36 0.52
37 0.47
38 0.39
39 0.31
40 0.22
41 0.17
42 0.13
43 0.11
44 0.11
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.1
52 0.11
53 0.13
54 0.14
55 0.17
56 0.17
57 0.2
58 0.24
59 0.28
60 0.31
61 0.33
62 0.32
63 0.3
64 0.31
65 0.28
66 0.22
67 0.18
68 0.14
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.13
78 0.15
79 0.18
80 0.2
81 0.21
82 0.24
83 0.27
84 0.3
85 0.37
86 0.37
87 0.34
88 0.32
89 0.3
90 0.29
91 0.26
92 0.24
93 0.17
94 0.21
95 0.23
96 0.25
97 0.35
98 0.34
99 0.38
100 0.38
101 0.39
102 0.35
103 0.37
104 0.42
105 0.39
106 0.45
107 0.43
108 0.47
109 0.47
110 0.46
111 0.46
112 0.43
113 0.43
114 0.44
115 0.5
116 0.52
117 0.6
118 0.6
119 0.62
120 0.64
121 0.63
122 0.6
123 0.6
124 0.58
125 0.51
126 0.56
127 0.59
128 0.63
129 0.67
130 0.67
131 0.65
132 0.68
133 0.71
134 0.68
135 0.67
136 0.65
137 0.61
138 0.6
139 0.53
140 0.45
141 0.39
142 0.35
143 0.25
144 0.17
145 0.12
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.07
150 0.08
151 0.11
152 0.11
153 0.18
154 0.24
155 0.27
156 0.32
157 0.36
158 0.43
159 0.47
160 0.52
161 0.48
162 0.47
163 0.46
164 0.46
165 0.48
166 0.47
167 0.43
168 0.42
169 0.45
170 0.44
171 0.45
172 0.48
173 0.51
174 0.56
175 0.63
176 0.67
177 0.66
178 0.68
179 0.67
180 0.62
181 0.58
182 0.52
183 0.43
184 0.36
185 0.33
186 0.36
187 0.34
188 0.33
189 0.28
190 0.29
191 0.34
192 0.31
193 0.36
194 0.34
195 0.35
196 0.34
197 0.35
198 0.31
199 0.27
200 0.26
201 0.21
202 0.15
203 0.16
204 0.15
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.16
211 0.15
212 0.17
213 0.19
214 0.21
215 0.27
216 0.28
217 0.32
218 0.31
219 0.36
220 0.36
221 0.35
222 0.33
223 0.28
224 0.27
225 0.21
226 0.17
227 0.12
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.11
235 0.14
236 0.18
237 0.19
238 0.2
239 0.23
240 0.24
241 0.27
242 0.28
243 0.3
244 0.29
245 0.3
246 0.28
247 0.25
248 0.24
249 0.22
250 0.17
251 0.11
252 0.09
253 0.11
254 0.17
255 0.17
256 0.19
257 0.26
258 0.27
259 0.28
260 0.29
261 0.28
262 0.25
263 0.27
264 0.25
265 0.23
266 0.23
267 0.27
268 0.26
269 0.23
270 0.2
271 0.18
272 0.17
273 0.13
274 0.11
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.1
280 0.12
281 0.15
282 0.18
283 0.2
284 0.23
285 0.31
286 0.35
287 0.39
288 0.45
289 0.51
290 0.58
291 0.65
292 0.66
293 0.62
294 0.62
295 0.58
296 0.53
297 0.49
298 0.46
299 0.4
300 0.37
301 0.35
302 0.3
303 0.28
304 0.25
305 0.21
306 0.13
307 0.11
308 0.1
309 0.12
310 0.12
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.2
315 0.2
316 0.2
317 0.22
318 0.22
319 0.19
320 0.19
321 0.2
322 0.18
323 0.17
324 0.15
325 0.1
326 0.08
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.08
336 0.07
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.07
346 0.08
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.12
355 0.12
356 0.13
357 0.15
358 0.2
359 0.24
360 0.28
361 0.32
362 0.34
363 0.39
364 0.44
365 0.5
366 0.52
367 0.58
368 0.57
369 0.54
370 0.51
371 0.42
372 0.37
373 0.33
374 0.34
375 0.31
376 0.36
377 0.44
378 0.51
379 0.52
380 0.54
381 0.55
382 0.54
383 0.53
384 0.5
385 0.52
386 0.46
387 0.55
388 0.6
389 0.61
390 0.57
391 0.59
392 0.54
393 0.48
394 0.46
395 0.38
396 0.32
397 0.26
398 0.23
399 0.16
400 0.15
401 0.1
402 0.1
403 0.15
404 0.17
405 0.17
406 0.17
407 0.18
408 0.18
409 0.18
410 0.18
411 0.13
412 0.11
413 0.14
414 0.16
415 0.15
416 0.18
417 0.23
418 0.26
419 0.26
420 0.28
421 0.27
422 0.26
423 0.27
424 0.24
425 0.19
426 0.16
427 0.2
428 0.23
429 0.21
430 0.21
431 0.2
432 0.19
433 0.18
434 0.2
435 0.2
436 0.15
437 0.15
438 0.19
439 0.24
440 0.24
441 0.26
442 0.26
443 0.23
444 0.27
445 0.31
446 0.32
447 0.33
448 0.34
449 0.34
450 0.38
451 0.41
452 0.38
453 0.35
454 0.31
455 0.25
456 0.24
457 0.23
458 0.2
459 0.16
460 0.16
461 0.15
462 0.18
463 0.18
464 0.18
465 0.19
466 0.19
467 0.2
468 0.22
469 0.25
470 0.24
471 0.25
472 0.25
473 0.23
474 0.22
475 0.21
476 0.21
477 0.27
478 0.3
479 0.34
480 0.39
481 0.44
482 0.5
483 0.59
484 0.61
485 0.56
486 0.56
487 0.61
488 0.63
489 0.6
490 0.54
491 0.44
492 0.42
493 0.37
494 0.32
495 0.23
496 0.15
497 0.13
498 0.13
499 0.13
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.06
510 0.04
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.07
520 0.08
521 0.09
522 0.11
523 0.16
524 0.17
525 0.2
526 0.21
527 0.2
528 0.23
529 0.25
530 0.25
531 0.21
532 0.19
533 0.17
534 0.18
535 0.17
536 0.15
537 0.14
538 0.11
539 0.1
540 0.11
541 0.12
542 0.13
543 0.15
544 0.18
545 0.21
546 0.22
547 0.23
548 0.25
549 0.24
550 0.22
551 0.25
552 0.25
553 0.23
554 0.22
555 0.21
556 0.21
557 0.21