Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3HDC9

Protein Details
Accession A0A0C3HDC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-50AEELKKGGRSLKRRRVDNKGTEDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-41KGGRSLKRRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MATRKHNEFLDAHDSEDDESQGYDSEAEELKKGGRSLKRRRVDNKGTEDEETDGVEHDEQEQDTDVQDGAEQTKPKNRDAKKIIELSGVSNPLSKRNLVATAEAIKRSGVVYLSRVPPFMKPTKLRSLLEPYGVINRIFLSPEDPASHTRRVRNGGNKKRLYLDGWVEWQNKKDAKHVCELLNAKIIGGKKGTYYHDDVWNLLYLKGFKWHNLTEQIAAENAERASRMRAEISKTTKENKLFVQNVERAKMLEGIESKKAAKRTKEGEDAEEGEDAEEGGNKAVLKNLTKGVVQQRHFKQTAVASKMKQVAQSDQVKRVLSKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.26
3 0.26
4 0.2
5 0.12
6 0.12
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.08
12 0.1
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.16
18 0.19
19 0.2
20 0.25
21 0.32
22 0.41
23 0.52
24 0.61
25 0.68
26 0.74
27 0.8
28 0.83
29 0.85
30 0.84
31 0.82
32 0.79
33 0.74
34 0.66
35 0.59
36 0.51
37 0.41
38 0.31
39 0.22
40 0.15
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.11
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.1
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.1
57 0.13
58 0.15
59 0.16
60 0.24
61 0.26
62 0.32
63 0.4
64 0.42
65 0.49
66 0.53
67 0.6
68 0.6
69 0.62
70 0.58
71 0.52
72 0.49
73 0.41
74 0.38
75 0.31
76 0.23
77 0.22
78 0.21
79 0.22
80 0.23
81 0.2
82 0.18
83 0.19
84 0.23
85 0.2
86 0.21
87 0.19
88 0.24
89 0.26
90 0.24
91 0.22
92 0.18
93 0.17
94 0.16
95 0.15
96 0.09
97 0.08
98 0.11
99 0.16
100 0.2
101 0.2
102 0.21
103 0.2
104 0.21
105 0.26
106 0.28
107 0.31
108 0.31
109 0.37
110 0.45
111 0.5
112 0.48
113 0.47
114 0.5
115 0.44
116 0.42
117 0.36
118 0.28
119 0.26
120 0.26
121 0.22
122 0.14
123 0.13
124 0.12
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.08
129 0.1
130 0.11
131 0.12
132 0.15
133 0.19
134 0.25
135 0.26
136 0.29
137 0.32
138 0.35
139 0.4
140 0.46
141 0.53
142 0.57
143 0.64
144 0.62
145 0.59
146 0.57
147 0.53
148 0.44
149 0.37
150 0.3
151 0.22
152 0.23
153 0.27
154 0.27
155 0.26
156 0.25
157 0.26
158 0.26
159 0.25
160 0.29
161 0.3
162 0.31
163 0.35
164 0.38
165 0.34
166 0.37
167 0.38
168 0.32
169 0.3
170 0.27
171 0.21
172 0.2
173 0.2
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.1
178 0.14
179 0.17
180 0.18
181 0.22
182 0.23
183 0.28
184 0.28
185 0.27
186 0.25
187 0.25
188 0.22
189 0.18
190 0.16
191 0.11
192 0.11
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.2
197 0.21
198 0.24
199 0.27
200 0.29
201 0.25
202 0.25
203 0.24
204 0.19
205 0.19
206 0.15
207 0.12
208 0.11
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.14
216 0.17
217 0.22
218 0.29
219 0.34
220 0.38
221 0.4
222 0.44
223 0.47
224 0.47
225 0.45
226 0.42
227 0.45
228 0.42
229 0.42
230 0.45
231 0.44
232 0.44
233 0.43
234 0.39
235 0.3
236 0.28
237 0.29
238 0.21
239 0.2
240 0.2
241 0.22
242 0.24
243 0.25
244 0.26
245 0.26
246 0.33
247 0.36
248 0.38
249 0.43
250 0.47
251 0.53
252 0.6
253 0.58
254 0.55
255 0.53
256 0.5
257 0.43
258 0.37
259 0.29
260 0.2
261 0.17
262 0.14
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.13
271 0.16
272 0.17
273 0.2
274 0.23
275 0.24
276 0.25
277 0.31
278 0.37
279 0.42
280 0.43
281 0.5
282 0.53
283 0.6
284 0.61
285 0.55
286 0.5
287 0.5
288 0.56
289 0.53
290 0.52
291 0.44
292 0.5
293 0.56
294 0.52
295 0.49
296 0.43
297 0.41
298 0.44
299 0.53
300 0.52
301 0.52
302 0.55
303 0.53
304 0.5