Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WED1

Protein Details
Accession Q4WED1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
323-351TETPPPPSFARVKKPKKPLINGLGIKKKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
333-353RVKKPKKPLINGLGIKKKPKP
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 14, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG afm:AFUA_5G02580  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MPYRRLVASSIYRYITHPSNSNIKSASADQPAASCLGLFDSLAFKNSLQRSRDNQTSTTARPCPNERYSGKSTQQLENGPRNQLTSHSKYYPPDFDPSAIGRTPKHLRQTGPKVITVRLMAPFSMKCTHCGEYIYKGRKFNARKETTDQKYLNIPIYRFYIRCTRCSGEITFLTDPKAMDYKAEKGAKRNFEPWRDAKNDIEETEQETLDRLEREENEEQERLERDKMAELEEKMLDSKREMAIADALDEIRTRNARIERNEALSGDVALAHVRNEVDEARLREEKEIEEAARRAFTTETGEKVKRLVEDDTIAGTTPGSSQTETPPPPSFARVKKPKKPLINGLGIKKKPKPSLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.36
4 0.35
5 0.35
6 0.43
7 0.43
8 0.45
9 0.41
10 0.36
11 0.36
12 0.35
13 0.37
14 0.32
15 0.32
16 0.28
17 0.28
18 0.27
19 0.25
20 0.2
21 0.13
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.1
28 0.11
29 0.13
30 0.14
31 0.13
32 0.2
33 0.27
34 0.33
35 0.33
36 0.39
37 0.44
38 0.5
39 0.58
40 0.54
41 0.49
42 0.48
43 0.51
44 0.48
45 0.5
46 0.49
47 0.45
48 0.47
49 0.5
50 0.51
51 0.5
52 0.55
53 0.49
54 0.51
55 0.54
56 0.57
57 0.56
58 0.55
59 0.55
60 0.51
61 0.53
62 0.51
63 0.52
64 0.52
65 0.52
66 0.48
67 0.45
68 0.41
69 0.36
70 0.36
71 0.37
72 0.35
73 0.37
74 0.37
75 0.4
76 0.42
77 0.46
78 0.46
79 0.4
80 0.38
81 0.34
82 0.31
83 0.31
84 0.3
85 0.28
86 0.24
87 0.23
88 0.19
89 0.24
90 0.29
91 0.31
92 0.37
93 0.38
94 0.41
95 0.49
96 0.58
97 0.61
98 0.57
99 0.56
100 0.5
101 0.46
102 0.45
103 0.36
104 0.29
105 0.22
106 0.2
107 0.16
108 0.17
109 0.16
110 0.16
111 0.21
112 0.19
113 0.2
114 0.24
115 0.25
116 0.24
117 0.26
118 0.25
119 0.26
120 0.35
121 0.39
122 0.39
123 0.39
124 0.41
125 0.47
126 0.5
127 0.51
128 0.54
129 0.51
130 0.52
131 0.56
132 0.64
133 0.6
134 0.63
135 0.55
136 0.45
137 0.44
138 0.42
139 0.41
140 0.33
141 0.29
142 0.22
143 0.26
144 0.26
145 0.22
146 0.23
147 0.26
148 0.25
149 0.27
150 0.31
151 0.28
152 0.29
153 0.31
154 0.3
155 0.25
156 0.24
157 0.26
158 0.22
159 0.21
160 0.2
161 0.18
162 0.17
163 0.14
164 0.15
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.14
169 0.21
170 0.26
171 0.25
172 0.31
173 0.37
174 0.41
175 0.42
176 0.46
177 0.45
178 0.44
179 0.5
180 0.48
181 0.48
182 0.46
183 0.45
184 0.39
185 0.39
186 0.36
187 0.31
188 0.28
189 0.22
190 0.21
191 0.2
192 0.19
193 0.13
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.17
202 0.19
203 0.21
204 0.23
205 0.23
206 0.23
207 0.23
208 0.24
209 0.21
210 0.19
211 0.18
212 0.15
213 0.18
214 0.18
215 0.19
216 0.2
217 0.19
218 0.2
219 0.19
220 0.19
221 0.17
222 0.18
223 0.15
224 0.12
225 0.15
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.16
242 0.23
243 0.29
244 0.33
245 0.4
246 0.4
247 0.43
248 0.44
249 0.38
250 0.33
251 0.27
252 0.23
253 0.15
254 0.12
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.09
264 0.11
265 0.16
266 0.18
267 0.22
268 0.26
269 0.26
270 0.27
271 0.29
272 0.26
273 0.26
274 0.26
275 0.22
276 0.24
277 0.24
278 0.23
279 0.23
280 0.22
281 0.2
282 0.17
283 0.17
284 0.2
285 0.21
286 0.24
287 0.3
288 0.31
289 0.3
290 0.32
291 0.33
292 0.28
293 0.28
294 0.26
295 0.23
296 0.23
297 0.24
298 0.24
299 0.21
300 0.19
301 0.16
302 0.13
303 0.1
304 0.09
305 0.11
306 0.1
307 0.11
308 0.13
309 0.18
310 0.27
311 0.29
312 0.33
313 0.34
314 0.37
315 0.38
316 0.42
317 0.45
318 0.45
319 0.54
320 0.6
321 0.67
322 0.72
323 0.8
324 0.84
325 0.86
326 0.87
327 0.87
328 0.85
329 0.85
330 0.82
331 0.81
332 0.82
333 0.76
334 0.75
335 0.72
336 0.72