Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WX01

Protein Details
Accession Q4WX01    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-67IAREVASKENSKRKKKEPTPSSSSESHydrophilic
85-105EEEKPAKKEVKKESKKAESSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-58KASQSPKAKSKQIAREVASKENSKRKKKE
91-99KKEVKKESK
272-292KPSKKRKAEEEPAAAPKKSKK
494-535PRGGRGGFGGRGGRGGPRGGGRGGRGGFGGRGGGAPNKARGG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048255  P:mRNA stabilization  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG afm:AFUA_3G07710  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKTKSVTKKGADKPVDKALSKVKDAGVTKASQSPKAKSKQIAREVASKENSKRKKKEPTPSSSSESDSDEEMESTTSSSESESEEEKPAKKEVKKESKKAESSSESESESDSDEEMDDASSSESESESESEDEKPVKKDMKKESKKAESSDSESESDSESESESESESEDEKAVKKEVKAKADTSESSESESDSDEEEEAPKKAAKKESSDSEDSESESESESESESESEDEAPAKAKKVEKESSEESEDSDESDDSEGSDSDSSESESEKPSKKRKAEEEPAAAPKKSKKTDEEASGASANLFVGNLSWNVDEEWLRQEFESFGELSGVRIVTDRDSGRSRGFGYVEYVNAADAAKAYNAKKDTEIDGRKINLDYATGRPANNNNNQDRAQARARNFGDQTSPESDTLFVGNIPFSANEDSVSELFGQSGTIVGIRLPTDPESGRPKGFGYVQFSSVDEARQAFNDLNGAELNGRPVRLDFSTPRPSNGDAPRGGRGGFGGRGGRGGPRGGGRGGRGGFGGRGGGAPNKARGGIPEFKGTKVTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.73
3 0.71
4 0.61
5 0.57
6 0.56
7 0.53
8 0.52
9 0.5
10 0.42
11 0.42
12 0.43
13 0.44
14 0.39
15 0.35
16 0.35
17 0.38
18 0.39
19 0.4
20 0.44
21 0.46
22 0.51
23 0.57
24 0.62
25 0.63
26 0.69
27 0.72
28 0.76
29 0.77
30 0.71
31 0.72
32 0.69
33 0.68
34 0.65
35 0.61
36 0.6
37 0.62
38 0.68
39 0.7
40 0.75
41 0.76
42 0.81
43 0.84
44 0.87
45 0.87
46 0.87
47 0.85
48 0.82
49 0.78
50 0.7
51 0.63
52 0.54
53 0.47
54 0.39
55 0.31
56 0.27
57 0.21
58 0.19
59 0.16
60 0.14
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.11
70 0.13
71 0.15
72 0.2
73 0.24
74 0.27
75 0.29
76 0.33
77 0.4
78 0.42
79 0.48
80 0.54
81 0.62
82 0.68
83 0.74
84 0.79
85 0.81
86 0.82
87 0.76
88 0.74
89 0.67
90 0.61
91 0.57
92 0.49
93 0.4
94 0.35
95 0.32
96 0.25
97 0.21
98 0.18
99 0.13
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.15
120 0.18
121 0.2
122 0.21
123 0.25
124 0.32
125 0.34
126 0.42
127 0.51
128 0.59
129 0.65
130 0.71
131 0.76
132 0.78
133 0.79
134 0.73
135 0.7
136 0.63
137 0.6
138 0.56
139 0.49
140 0.4
141 0.36
142 0.33
143 0.27
144 0.22
145 0.17
146 0.12
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.11
159 0.12
160 0.14
161 0.16
162 0.18
163 0.2
164 0.28
165 0.33
166 0.39
167 0.4
168 0.4
169 0.41
170 0.42
171 0.4
172 0.37
173 0.35
174 0.28
175 0.28
176 0.26
177 0.22
178 0.18
179 0.18
180 0.13
181 0.1
182 0.11
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.15
191 0.2
192 0.27
193 0.28
194 0.33
195 0.38
196 0.43
197 0.48
198 0.47
199 0.43
200 0.4
201 0.37
202 0.31
203 0.27
204 0.2
205 0.14
206 0.12
207 0.11
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.14
225 0.17
226 0.2
227 0.26
228 0.31
229 0.3
230 0.36
231 0.38
232 0.38
233 0.38
234 0.34
235 0.28
236 0.25
237 0.22
238 0.17
239 0.14
240 0.1
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.1
257 0.14
258 0.2
259 0.26
260 0.34
261 0.42
262 0.46
263 0.51
264 0.57
265 0.63
266 0.65
267 0.66
268 0.63
269 0.58
270 0.61
271 0.56
272 0.48
273 0.4
274 0.37
275 0.38
276 0.37
277 0.37
278 0.33
279 0.38
280 0.43
281 0.46
282 0.44
283 0.36
284 0.34
285 0.31
286 0.27
287 0.2
288 0.14
289 0.09
290 0.06
291 0.05
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.11
323 0.12
324 0.14
325 0.17
326 0.19
327 0.19
328 0.21
329 0.21
330 0.2
331 0.2
332 0.17
333 0.17
334 0.17
335 0.16
336 0.15
337 0.13
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.09
346 0.1
347 0.15
348 0.16
349 0.17
350 0.19
351 0.21
352 0.24
353 0.3
354 0.33
355 0.32
356 0.34
357 0.34
358 0.34
359 0.33
360 0.29
361 0.2
362 0.18
363 0.17
364 0.15
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.21
369 0.26
370 0.32
371 0.38
372 0.44
373 0.41
374 0.44
375 0.45
376 0.46
377 0.41
378 0.39
379 0.38
380 0.36
381 0.35
382 0.4
383 0.41
384 0.43
385 0.43
386 0.39
387 0.35
388 0.31
389 0.33
390 0.28
391 0.29
392 0.23
393 0.23
394 0.22
395 0.19
396 0.18
397 0.13
398 0.09
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.11
409 0.13
410 0.12
411 0.13
412 0.11
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.05
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.1
427 0.11
428 0.15
429 0.15
430 0.21
431 0.27
432 0.3
433 0.3
434 0.29
435 0.28
436 0.29
437 0.33
438 0.32
439 0.32
440 0.31
441 0.32
442 0.32
443 0.31
444 0.3
445 0.26
446 0.22
447 0.16
448 0.15
449 0.14
450 0.14
451 0.15
452 0.13
453 0.13
454 0.15
455 0.13
456 0.13
457 0.12
458 0.12
459 0.11
460 0.11
461 0.16
462 0.15
463 0.15
464 0.14
465 0.15
466 0.18
467 0.19
468 0.25
469 0.24
470 0.31
471 0.42
472 0.42
473 0.44
474 0.44
475 0.45
476 0.48
477 0.5
478 0.49
479 0.43
480 0.45
481 0.46
482 0.44
483 0.41
484 0.33
485 0.28
486 0.25
487 0.22
488 0.22
489 0.21
490 0.2
491 0.21
492 0.21
493 0.23
494 0.21
495 0.21
496 0.2
497 0.21
498 0.24
499 0.26
500 0.28
501 0.27
502 0.32
503 0.31
504 0.29
505 0.26
506 0.24
507 0.22
508 0.2
509 0.18
510 0.11
511 0.12
512 0.13
513 0.16
514 0.19
515 0.22
516 0.25
517 0.26
518 0.27
519 0.26
520 0.29
521 0.32
522 0.35
523 0.35
524 0.41
525 0.41
526 0.41