Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WTG8

Protein Details
Accession Q4WTG8    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-38GMNLAHRSKHRHVRRGNTVSNSHydrophilic
42-62HTSLSPKRSSRPQQGTPKPSVHydrophilic
109-131SASETDSKKKKKQNRNNPSSMAEHydrophilic
266-289DGTGGKKSKGKGKRPSRRDSDATEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-128KKKKKQNRNNPSS
130-136AEPRARA
269-283GGKKSKGKGKRPSRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG afm:AFUA_1G09350  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MADHGGNSSDRLGSPAGMNLAHRSKHRHVRRGNTVSNSTAPHTSLSPKRSSRPQQGTPKPSVPARFGSSGHVPSELAPPWPFNPQETALIRSGYIPAFKPKVPAAQEDSASETDSKKKKKQNRNNPSSMAEPRARAARHKGQMNFASELRLLLLAYGDPSPHPSFPSEPLPETVRVLDEIVTDFVLEMCHNAAQYASYSRRQKIKVDDFRFALRRDPNKLGRVQELLRMERELKEARKAFDQNDDQVGNLKEAGKKGLEELGEGADGTGGKKSKGKGKRPSRRDSDATEDTVLKKRKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.16
4 0.15
5 0.16
6 0.2
7 0.25
8 0.27
9 0.3
10 0.36
11 0.43
12 0.53
13 0.62
14 0.65
15 0.69
16 0.76
17 0.84
18 0.85
19 0.83
20 0.8
21 0.73
22 0.67
23 0.62
24 0.53
25 0.45
26 0.37
27 0.3
28 0.25
29 0.23
30 0.27
31 0.3
32 0.33
33 0.39
34 0.41
35 0.47
36 0.56
37 0.63
38 0.66
39 0.69
40 0.73
41 0.76
42 0.82
43 0.83
44 0.79
45 0.74
46 0.67
47 0.62
48 0.57
49 0.49
50 0.44
51 0.41
52 0.37
53 0.34
54 0.35
55 0.35
56 0.33
57 0.3
58 0.26
59 0.22
60 0.2
61 0.24
62 0.2
63 0.18
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.22
68 0.21
69 0.18
70 0.21
71 0.21
72 0.27
73 0.27
74 0.29
75 0.25
76 0.25
77 0.24
78 0.21
79 0.2
80 0.15
81 0.14
82 0.12
83 0.16
84 0.19
85 0.19
86 0.21
87 0.21
88 0.27
89 0.27
90 0.29
91 0.3
92 0.3
93 0.31
94 0.29
95 0.3
96 0.24
97 0.23
98 0.2
99 0.15
100 0.2
101 0.26
102 0.32
103 0.36
104 0.45
105 0.54
106 0.65
107 0.74
108 0.78
109 0.83
110 0.86
111 0.85
112 0.8
113 0.73
114 0.66
115 0.58
116 0.51
117 0.42
118 0.33
119 0.28
120 0.29
121 0.26
122 0.24
123 0.28
124 0.32
125 0.35
126 0.4
127 0.41
128 0.42
129 0.45
130 0.45
131 0.4
132 0.32
133 0.28
134 0.22
135 0.2
136 0.14
137 0.11
138 0.07
139 0.05
140 0.05
141 0.03
142 0.04
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.17
153 0.23
154 0.21
155 0.2
156 0.22
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.19
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.11
183 0.14
184 0.2
185 0.25
186 0.3
187 0.37
188 0.39
189 0.43
190 0.49
191 0.56
192 0.6
193 0.6
194 0.61
195 0.56
196 0.6
197 0.58
198 0.49
199 0.45
200 0.42
201 0.42
202 0.44
203 0.5
204 0.5
205 0.52
206 0.55
207 0.52
208 0.48
209 0.47
210 0.42
211 0.4
212 0.38
213 0.35
214 0.32
215 0.31
216 0.29
217 0.26
218 0.3
219 0.3
220 0.28
221 0.35
222 0.37
223 0.37
224 0.43
225 0.44
226 0.41
227 0.45
228 0.46
229 0.4
230 0.42
231 0.4
232 0.33
233 0.35
234 0.34
235 0.25
236 0.22
237 0.22
238 0.19
239 0.2
240 0.23
241 0.19
242 0.18
243 0.19
244 0.22
245 0.19
246 0.17
247 0.17
248 0.15
249 0.14
250 0.14
251 0.12
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.11
256 0.11
257 0.13
258 0.17
259 0.21
260 0.3
261 0.4
262 0.5
263 0.56
264 0.67
265 0.76
266 0.82
267 0.88
268 0.88
269 0.86
270 0.82
271 0.78
272 0.76
273 0.7
274 0.64
275 0.57
276 0.51
277 0.46
278 0.49