Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WGB3

Protein Details
Accession Q4WGB3    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-220IRGLSRAERKERIRRNERKMRSNERRSRKSGGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-140KPLPTPKPPTKWELFARKKGIGKYSNKPGAALADKERRKK
181-220AAAKGSSIRGLSRAERKERIRRNERKMRSNERRSRKSGGG
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 7, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007023  Ribosom_reg  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
KEGG afm:AFUA_7G04430  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04939  RRS1  
Amino Acid Sequences MTEVDMATAASEAKPKPERLPVTVSKPTPYTFDLGYLMANDPNPLELPRSEPLNASLKAIARDGTQSLLNQLLTTCPITSSAQNGVLLTLPPPATVLPRHKPLPTPKPPTKWELFARKKGIGKYSNKPGAALADKERRKKLVYDEEKGEWVPRWGYKGKNKSDDEWLVEVKEKDWKKEEEAAAKGSSIRGLSRAERKERIRRNERKMRSNERRSRKSGGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.33
4 0.42
5 0.45
6 0.45
7 0.53
8 0.52
9 0.55
10 0.6
11 0.57
12 0.51
13 0.49
14 0.45
15 0.41
16 0.36
17 0.3
18 0.22
19 0.23
20 0.21
21 0.19
22 0.18
23 0.15
24 0.15
25 0.13
26 0.13
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.15
35 0.17
36 0.2
37 0.19
38 0.19
39 0.22
40 0.27
41 0.26
42 0.24
43 0.24
44 0.23
45 0.23
46 0.23
47 0.2
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.12
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.08
63 0.07
64 0.09
65 0.11
66 0.11
67 0.13
68 0.14
69 0.15
70 0.15
71 0.14
72 0.13
73 0.12
74 0.11
75 0.09
76 0.09
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.13
83 0.19
84 0.21
85 0.26
86 0.28
87 0.28
88 0.34
89 0.41
90 0.47
91 0.5
92 0.55
93 0.56
94 0.61
95 0.62
96 0.62
97 0.56
98 0.51
99 0.48
100 0.5
101 0.5
102 0.51
103 0.52
104 0.51
105 0.52
106 0.49
107 0.49
108 0.46
109 0.46
110 0.46
111 0.51
112 0.52
113 0.49
114 0.47
115 0.4
116 0.36
117 0.32
118 0.28
119 0.25
120 0.28
121 0.33
122 0.38
123 0.4
124 0.39
125 0.38
126 0.39
127 0.42
128 0.44
129 0.47
130 0.46
131 0.48
132 0.47
133 0.47
134 0.44
135 0.37
136 0.26
137 0.21
138 0.18
139 0.15
140 0.18
141 0.21
142 0.28
143 0.36
144 0.45
145 0.51
146 0.58
147 0.59
148 0.57
149 0.62
150 0.58
151 0.53
152 0.47
153 0.4
154 0.32
155 0.33
156 0.3
157 0.23
158 0.28
159 0.25
160 0.27
161 0.31
162 0.33
163 0.34
164 0.42
165 0.46
166 0.45
167 0.46
168 0.45
169 0.4
170 0.37
171 0.33
172 0.25
173 0.22
174 0.16
175 0.13
176 0.13
177 0.16
178 0.22
179 0.3
180 0.38
181 0.43
182 0.51
183 0.59
184 0.67
185 0.73
186 0.78
187 0.8
188 0.82
189 0.86
190 0.88
191 0.89
192 0.89
193 0.89
194 0.9
195 0.9
196 0.91
197 0.9
198 0.9
199 0.9
200 0.86