FuNGI

Q4WQD2

Protein Details

Accession

Q4WQD2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
126-156	LSPGKVRVAKPPRIRRRAKKASNRESKPKLP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
127-155	SPGKVRVAKPPRIRRRAKKASNRESKPKL
271-272	KK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009071 HMG_box_dom IPR036910 HMG_box_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0000981 F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific GO:0000978 F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding GO:0009653 P:anatomical structure morphogenesis GO:0030154 P:cell differentiation GO:0000122 P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	afm:AFUA_4G12410 -
Pfam	View protein in Pfam PF00505 HMG_box
PROSITE	View protein in PROSITE PS50118 HMG_BOX_2
CDD	cd01389 HMG-box_ROX1-like

Amino Acid Sequences

MATAAATARFVQPPSPPQSTDGDLASQQCGMLNSLYCSQNPFVTSSLPCSAEAANSELNPQAMTYGPSSSPRYVSHEYSTPLPLQHTMPPSDSQINTPPPTADEGVVPSKLEATPPRWPSSSALKLSPGKVRVAKPPRIRRRAKKASNRESKPKLPGPLSEVTKHLTNVPLRDMDSWVHRPKEVRHAEVAKKNGKVARPMNSFMLYRSAYAERTKEWFAQNNHQVVSEVAGDSWRIETPEIREKYEVLANVEKANHLKAHPGYKFSPSKEKKKRSETDDDQLTVDGGEMTSGSSPAFLQVRAVGSSEVDSNGWASRDSTPFDFPEHGLPTTTYYDSSWQTSHPSMSAPKPSSYLQQPIHPNLIGPPTEDSRFKHVGLQNIQFTSSTALAGLPGAAHHDLLQPQNNSGAGPDGQLDPQLLSLSDHSGQRAMYNHSHYAIWQEVPTSNCYVPVPSPLQSTYHVGATYHQGLQTLGDSRDTWDSINNETSFDASNGEFEHWINSQASGYA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.41
3	0.39
4	0.39
5	0.43
6	0.44
7	0.41
8	0.34
9	0.29
10	0.27
11	0.27
12	0.25
13	0.2
14	0.17
15	0.16
16	0.15
17	0.14
18	0.14
19	0.13
20	0.15
21	0.21
22	0.22
23	0.21
24	0.24
25	0.24
26	0.25
27	0.25
28	0.24
29	0.2
30	0.23
31	0.23
32	0.25
33	0.28
34	0.26
35	0.25
36	0.25
37	0.24
38	0.21
39	0.22
40	0.2
41	0.18
42	0.16
43	0.18
44	0.17
45	0.17
46	0.15
47	0.13
48	0.11
49	0.09
50	0.11
51	0.11
52	0.13
53	0.14
54	0.19
55	0.23
56	0.24
57	0.27
58	0.27
59	0.34
60	0.36
61	0.38
62	0.38
63	0.38
64	0.38
65	0.38
66	0.39
67	0.33
68	0.29
69	0.27
70	0.25
71	0.23
72	0.26
73	0.27
74	0.27
75	0.27
76	0.28
77	0.3
78	0.33
79	0.32
80	0.29
81	0.32
82	0.36
83	0.36
84	0.35
85	0.31
86	0.27
87	0.3
88	0.28
89	0.22
90	0.16
91	0.18
92	0.2
93	0.2
94	0.19
95	0.14
96	0.15
97	0.14
98	0.17
99	0.17
100	0.2
101	0.28
102	0.32
103	0.36
104	0.35
105	0.37
106	0.37
107	0.43
108	0.45
109	0.4
110	0.37
111	0.4
112	0.42
113	0.44
114	0.46
115	0.39
116	0.36
117	0.39
118	0.41
119	0.45
120	0.5
121	0.56
122	0.6
123	0.69
124	0.74
125	0.79
126	0.86
127	0.86
128	0.88
129	0.9
130	0.9
131	0.9
132	0.91
133	0.91
134	0.92
135	0.89
136	0.88
137	0.84
138	0.8
139	0.77
140	0.71
141	0.66
142	0.58
143	0.53
144	0.49
145	0.48
146	0.46
147	0.39
148	0.35
149	0.31
150	0.3
151	0.28
152	0.24
153	0.22
154	0.21
155	0.21
156	0.22
157	0.22
158	0.21
159	0.22
160	0.22
161	0.18
162	0.22
163	0.27
164	0.29
165	0.29
166	0.29
167	0.31
168	0.33
169	0.42
170	0.41
171	0.37
172	0.38
173	0.44
174	0.49
175	0.52
176	0.56
177	0.5
178	0.47
179	0.47
180	0.44
181	0.4
182	0.4
183	0.39
184	0.42
185	0.4
186	0.42
187	0.4
188	0.39
189	0.37
190	0.3
191	0.3
192	0.21
193	0.17
194	0.18
195	0.17
196	0.17
197	0.19
198	0.19
199	0.16
200	0.19
201	0.21
202	0.21
203	0.23
204	0.28
205	0.29
206	0.37
207	0.41
208	0.4
209	0.39
210	0.35
211	0.33
212	0.26
213	0.23
214	0.15
215	0.09
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.07
221	0.06
222	0.05
223	0.06
224	0.07
225	0.12
226	0.21
227	0.22
228	0.23
229	0.23
230	0.23
231	0.24
232	0.25
233	0.22
234	0.16
235	0.16
236	0.15
237	0.16
238	0.16
239	0.15
240	0.13
241	0.14
242	0.12
243	0.1
244	0.13
245	0.14
246	0.22
247	0.22
248	0.25
249	0.26
250	0.32
251	0.36
252	0.34
253	0.42
254	0.41
255	0.51
256	0.58
257	0.66
258	0.68
259	0.74
260	0.78
261	0.75
262	0.79
263	0.74
264	0.71
265	0.65
266	0.57
267	0.48
268	0.41
269	0.33
270	0.23
271	0.17
272	0.09
273	0.05
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.04
279	0.03
280	0.04
281	0.04
282	0.06
283	0.07
284	0.06
285	0.07
286	0.08
287	0.09
288	0.1
289	0.1
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.09
294	0.08
295	0.07
296	0.06
297	0.07
298	0.07
299	0.08
300	0.07
301	0.08
302	0.11
303	0.13
304	0.15
305	0.16
306	0.18
307	0.18
308	0.2
309	0.2
310	0.17
311	0.21
312	0.21
313	0.19
314	0.18
315	0.17
316	0.18
317	0.19
318	0.19
319	0.15
320	0.13
321	0.16
322	0.17
323	0.19
324	0.16
325	0.14
326	0.18
327	0.18
328	0.18
329	0.16
330	0.16
331	0.18
332	0.21
333	0.29
334	0.27
335	0.27
336	0.29
337	0.29
338	0.32
339	0.33
340	0.37
341	0.31
342	0.35
343	0.4
344	0.4
345	0.43
346	0.37
347	0.33
348	0.28
349	0.3
350	0.23
351	0.19
352	0.19
353	0.18
354	0.21
355	0.23
356	0.23
357	0.27
358	0.29
359	0.28
360	0.33
361	0.33
362	0.39
363	0.43
364	0.46
365	0.43
366	0.4
367	0.4
368	0.32
369	0.3
370	0.24
371	0.18
372	0.13
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.08
377	0.07
378	0.04
379	0.04
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.11
385	0.13
386	0.17
387	0.23
388	0.21
389	0.22
390	0.23
391	0.23
392	0.2
393	0.18
394	0.17
395	0.11
396	0.11
397	0.12
398	0.11
399	0.11
400	0.12
401	0.12
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.12
409	0.14
410	0.15
411	0.15
412	0.16
413	0.16
414	0.18
415	0.2
416	0.22
417	0.25
418	0.29
419	0.31
420	0.31
421	0.31
422	0.28
423	0.3
424	0.27
425	0.23
426	0.18
427	0.18
428	0.2
429	0.22
430	0.24
431	0.24
432	0.21
433	0.22
434	0.22
435	0.22
436	0.2
437	0.25
438	0.25
439	0.23
440	0.26
441	0.26
442	0.28
443	0.28
444	0.32
445	0.28
446	0.27
447	0.25
448	0.22
449	0.23
450	0.26
451	0.27
452	0.24
453	0.23
454	0.21
455	0.2
456	0.21
457	0.23
458	0.21
459	0.18
460	0.18
461	0.18
462	0.2
463	0.24
464	0.23
465	0.21
466	0.22
467	0.23
468	0.26
469	0.32
470	0.3
471	0.27
472	0.27
473	0.28
474	0.24
475	0.22
476	0.2
477	0.13
478	0.14
479	0.14
480	0.16
481	0.15
482	0.14
483	0.17
484	0.15
485	0.19
486	0.18
487	0.17

Q4WQD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer