Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3H8C3

Protein Details
Accession A0A0C3H8C3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
384-403REKMRREKMKEEERKFRQSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-239PKFKHKKIPRGPPSPP
384-403REKMRREKMKEEERKFRQSR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MTSISASLAGALPKPKYTGEEEEIPQHAQQRGPRIIGAGALDDTQIVLKKSGPPPYGNRAGWRPRGQEDFGDGGAFPEVLVAQYPLDMGQKSHSSSTALAVQVNAGGKVKYDAIARRGHDDKRIVHASFKDLIPLRQRADAGEINLDRPSEEEVQASKERTQNALAALVSGAVAAQKPKNVNVGTRKDPTYVRYTPANQMGDNSKKNDRIMKIVERQVDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRALMQQRLAEKEKTQKEDHLRMLAQKAREERAGAGRRDSRTSRSRSRSYSESESERSGSEEEEVREREKMRREKMKEEERKFRQSRMGAERKLQVLAREQGRDISEKMALGLAKPTQSTEGMFDSRLFNRTSGFDSGFNEDQAYDKPLFAAQDAVNSIYRPTHNIDEDDDEAAEAELGRIQKSNRFSEALGRGTFKGAADVEAREGPVQFEKDTGDVFNVDEFLSKVGEGSSKREYGLQEGDERAPKRARVDEDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.24
4 0.29
5 0.34
6 0.35
7 0.41
8 0.41
9 0.45
10 0.46
11 0.44
12 0.39
13 0.37
14 0.34
15 0.32
16 0.34
17 0.38
18 0.4
19 0.4
20 0.39
21 0.35
22 0.33
23 0.3
24 0.27
25 0.19
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.13
36 0.22
37 0.27
38 0.36
39 0.38
40 0.41
41 0.47
42 0.54
43 0.61
44 0.55
45 0.56
46 0.56
47 0.62
48 0.65
49 0.66
50 0.63
51 0.59
52 0.63
53 0.59
54 0.53
55 0.49
56 0.43
57 0.36
58 0.31
59 0.25
60 0.2
61 0.18
62 0.14
63 0.09
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.13
77 0.17
78 0.19
79 0.2
80 0.2
81 0.2
82 0.2
83 0.22
84 0.23
85 0.2
86 0.19
87 0.17
88 0.16
89 0.17
90 0.17
91 0.15
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.16
99 0.19
100 0.23
101 0.29
102 0.3
103 0.35
104 0.39
105 0.4
106 0.42
107 0.44
108 0.42
109 0.44
110 0.49
111 0.43
112 0.43
113 0.42
114 0.4
115 0.38
116 0.34
117 0.33
118 0.28
119 0.32
120 0.34
121 0.37
122 0.35
123 0.34
124 0.34
125 0.29
126 0.33
127 0.31
128 0.25
129 0.27
130 0.25
131 0.23
132 0.24
133 0.23
134 0.17
135 0.15
136 0.18
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.2
142 0.23
143 0.25
144 0.25
145 0.25
146 0.27
147 0.27
148 0.27
149 0.24
150 0.22
151 0.23
152 0.18
153 0.15
154 0.13
155 0.11
156 0.09
157 0.07
158 0.06
159 0.04
160 0.04
161 0.06
162 0.08
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.2
167 0.21
168 0.27
169 0.34
170 0.4
171 0.43
172 0.46
173 0.46
174 0.43
175 0.43
176 0.4
177 0.39
178 0.34
179 0.31
180 0.32
181 0.33
182 0.36
183 0.41
184 0.39
185 0.31
186 0.31
187 0.35
188 0.36
189 0.36
190 0.35
191 0.33
192 0.35
193 0.37
194 0.41
195 0.36
196 0.35
197 0.38
198 0.42
199 0.44
200 0.46
201 0.48
202 0.43
203 0.42
204 0.38
205 0.33
206 0.26
207 0.27
208 0.27
209 0.23
210 0.24
211 0.34
212 0.39
213 0.4
214 0.49
215 0.52
216 0.58
217 0.66
218 0.76
219 0.75
220 0.77
221 0.79
222 0.78
223 0.75
224 0.71
225 0.65
226 0.55
227 0.52
228 0.48
229 0.49
230 0.49
231 0.49
232 0.47
233 0.48
234 0.5
235 0.45
236 0.42
237 0.42
238 0.41
239 0.39
240 0.36
241 0.34
242 0.32
243 0.32
244 0.3
245 0.28
246 0.21
247 0.16
248 0.18
249 0.19
250 0.27
251 0.3
252 0.38
253 0.42
254 0.47
255 0.52
256 0.49
257 0.49
258 0.42
259 0.41
260 0.37
261 0.4
262 0.37
263 0.37
264 0.39
265 0.35
266 0.32
267 0.32
268 0.28
269 0.19
270 0.17
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.15
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.11
285 0.12
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.16
300 0.25
301 0.3
302 0.32
303 0.33
304 0.32
305 0.38
306 0.41
307 0.41
308 0.34
309 0.33
310 0.32
311 0.36
312 0.38
313 0.32
314 0.3
315 0.36
316 0.39
317 0.4
318 0.37
319 0.39
320 0.44
321 0.49
322 0.49
323 0.44
324 0.4
325 0.37
326 0.41
327 0.37
328 0.32
329 0.28
330 0.29
331 0.27
332 0.27
333 0.25
334 0.22
335 0.28
336 0.33
337 0.3
338 0.33
339 0.36
340 0.37
341 0.41
342 0.41
343 0.38
344 0.39
345 0.46
346 0.5
347 0.53
348 0.57
349 0.57
350 0.6
351 0.57
352 0.55
353 0.54
354 0.49
355 0.45
356 0.42
357 0.39
358 0.35
359 0.31
360 0.26
361 0.2
362 0.16
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.17
367 0.19
368 0.18
369 0.21
370 0.22
371 0.26
372 0.33
373 0.4
374 0.45
375 0.54
376 0.57
377 0.63
378 0.71
379 0.77
380 0.78
381 0.76
382 0.78
383 0.75
384 0.81
385 0.74
386 0.69
387 0.66
388 0.59
389 0.61
390 0.61
391 0.63
392 0.55
393 0.57
394 0.57
395 0.5
396 0.49
397 0.41
398 0.33
399 0.3
400 0.33
401 0.33
402 0.3
403 0.29
404 0.3
405 0.3
406 0.3
407 0.25
408 0.21
409 0.18
410 0.16
411 0.16
412 0.15
413 0.14
414 0.12
415 0.13
416 0.13
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.14
422 0.15
423 0.14
424 0.17
425 0.17
426 0.17
427 0.18
428 0.2
429 0.21
430 0.23
431 0.21
432 0.18
433 0.18
434 0.2
435 0.22
436 0.22
437 0.22
438 0.21
439 0.23
440 0.28
441 0.27
442 0.25
443 0.22
444 0.18
445 0.18
446 0.17
447 0.19
448 0.14
449 0.13
450 0.13
451 0.14
452 0.15
453 0.14
454 0.16
455 0.13
456 0.15
457 0.17
458 0.18
459 0.17
460 0.17
461 0.17
462 0.17
463 0.17
464 0.17
465 0.2
466 0.24
467 0.26
468 0.27
469 0.3
470 0.31
471 0.32
472 0.3
473 0.25
474 0.19
475 0.17
476 0.15
477 0.12
478 0.07
479 0.06
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.11
484 0.13
485 0.19
486 0.24
487 0.29
488 0.3
489 0.32
490 0.32
491 0.39
492 0.43
493 0.43
494 0.39
495 0.37
496 0.34
497 0.33
498 0.34
499 0.25
500 0.22
501 0.18
502 0.18
503 0.17
504 0.18
505 0.19
506 0.19
507 0.2
508 0.17
509 0.17
510 0.16
511 0.19
512 0.21
513 0.18
514 0.18
515 0.19
516 0.19
517 0.2
518 0.19
519 0.15
520 0.14
521 0.14
522 0.13
523 0.13
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.1
528 0.1
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.14
533 0.15
534 0.2
535 0.25
536 0.26
537 0.27
538 0.3
539 0.31
540 0.32
541 0.36
542 0.34
543 0.33
544 0.35
545 0.39
546 0.43
547 0.43
548 0.43
549 0.42
550 0.42
551 0.44
552 0.48
553 0.5