Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4X0U0

Protein Details
Accession Q4X0U0    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
275-295LDDYSQPKKRQRTSIKQEDDEHydrophilic
301-320STRPRSRRSKSSASGKARRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-329PRSRRSKSSASGKARRTSNDTIRKPK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG afm:AFUA_2G12310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11404  bHLHzip_Mlx_like  
Amino Acid Sequences MDTPYEPAPAPPPGPALLDDNESNMLDNFFTTMNSSHFTDDFWLRNQHSKFLDPVNFEWSTELPPTFEGSTTSLGQPSLPHRGIEKPDIVPNNQGASSDILAAASMLYQNGMAGSDINPGFGQQQFPSMSELNFNHSIANGHGKNQQSSNHISSKQPNSSHTRLPVGFHTSEMLFDVREPISPEQQASAKIRPLHWGSDVSFMEQGYIAPPDQPNEEERTKELLGNLECLEPQSSAANTRAPSPERTAGGYNSHWGESGGPVPLNSLQREYNPDLDDYSQPKKRQRTSIKQEDDEQSDADSTRPRSRRSKSSASGKARRTSNDTIRKPKLQQGAKAPRENLTEEQKRNNHILSEQKRRNLIRQGFDDLCSLVPGLKGGGFSKSAMLTQAADWLEDILRGNEILKAQLAELKTMNGLVMPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.24
4 0.22
5 0.25
6 0.23
7 0.23
8 0.23
9 0.21
10 0.21
11 0.17
12 0.15
13 0.12
14 0.11
15 0.11
16 0.09
17 0.09
18 0.1
19 0.11
20 0.13
21 0.16
22 0.17
23 0.19
24 0.18
25 0.19
26 0.22
27 0.24
28 0.25
29 0.26
30 0.32
31 0.32
32 0.4
33 0.41
34 0.43
35 0.42
36 0.42
37 0.41
38 0.42
39 0.45
40 0.41
41 0.41
42 0.4
43 0.37
44 0.35
45 0.33
46 0.26
47 0.24
48 0.22
49 0.21
50 0.15
51 0.16
52 0.19
53 0.17
54 0.16
55 0.15
56 0.15
57 0.18
58 0.19
59 0.19
60 0.17
61 0.17
62 0.17
63 0.18
64 0.2
65 0.25
66 0.24
67 0.24
68 0.25
69 0.31
70 0.36
71 0.38
72 0.38
73 0.32
74 0.37
75 0.4
76 0.4
77 0.37
78 0.34
79 0.32
80 0.27
81 0.25
82 0.2
83 0.19
84 0.18
85 0.15
86 0.12
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.13
108 0.13
109 0.15
110 0.1
111 0.14
112 0.15
113 0.16
114 0.19
115 0.18
116 0.17
117 0.2
118 0.21
119 0.22
120 0.23
121 0.22
122 0.18
123 0.18
124 0.18
125 0.15
126 0.22
127 0.17
128 0.18
129 0.22
130 0.24
131 0.25
132 0.27
133 0.29
134 0.25
135 0.3
136 0.33
137 0.33
138 0.33
139 0.35
140 0.4
141 0.43
142 0.45
143 0.41
144 0.42
145 0.44
146 0.46
147 0.47
148 0.42
149 0.41
150 0.35
151 0.35
152 0.33
153 0.31
154 0.27
155 0.23
156 0.22
157 0.17
158 0.16
159 0.15
160 0.13
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.12
167 0.12
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.15
172 0.16
173 0.19
174 0.19
175 0.2
176 0.21
177 0.22
178 0.23
179 0.26
180 0.26
181 0.25
182 0.23
183 0.23
184 0.2
185 0.25
186 0.24
187 0.21
188 0.19
189 0.17
190 0.16
191 0.14
192 0.12
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.15
203 0.17
204 0.16
205 0.17
206 0.21
207 0.2
208 0.2
209 0.19
210 0.18
211 0.17
212 0.19
213 0.18
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.08
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.09
223 0.1
224 0.13
225 0.12
226 0.15
227 0.18
228 0.19
229 0.21
230 0.23
231 0.26
232 0.24
233 0.26
234 0.25
235 0.23
236 0.24
237 0.22
238 0.2
239 0.18
240 0.17
241 0.15
242 0.13
243 0.12
244 0.1
245 0.11
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.13
251 0.15
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.17
256 0.23
257 0.25
258 0.26
259 0.24
260 0.24
261 0.23
262 0.24
263 0.26
264 0.25
265 0.29
266 0.31
267 0.35
268 0.42
269 0.49
270 0.54
271 0.6
272 0.67
273 0.71
274 0.75
275 0.81
276 0.81
277 0.75
278 0.75
279 0.69
280 0.62
281 0.52
282 0.42
283 0.31
284 0.25
285 0.22
286 0.18
287 0.18
288 0.18
289 0.25
290 0.3
291 0.35
292 0.43
293 0.5
294 0.59
295 0.62
296 0.68
297 0.68
298 0.74
299 0.78
300 0.79
301 0.81
302 0.77
303 0.76
304 0.7
305 0.65
306 0.62
307 0.61
308 0.61
309 0.63
310 0.65
311 0.68
312 0.7
313 0.74
314 0.7
315 0.69
316 0.68
317 0.63
318 0.62
319 0.63
320 0.68
321 0.69
322 0.71
323 0.65
324 0.6
325 0.57
326 0.55
327 0.49
328 0.48
329 0.49
330 0.47
331 0.55
332 0.55
333 0.55
334 0.55
335 0.52
336 0.44
337 0.39
338 0.46
339 0.46
340 0.53
341 0.55
342 0.56
343 0.62
344 0.64
345 0.67
346 0.67
347 0.65
348 0.62
349 0.6
350 0.62
351 0.56
352 0.54
353 0.48
354 0.38
355 0.3
356 0.23
357 0.18
358 0.12
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.16
369 0.16
370 0.16
371 0.16
372 0.16
373 0.15
374 0.14
375 0.19
376 0.17
377 0.16
378 0.16
379 0.15
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.1
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.18
394 0.18
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.17
399 0.16
400 0.16