FuNGI

Q4WWH9

Protein Details

Accession

Q4WWH9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
59-84	TGFPQHRRRVNQFAFKQRRANRQQES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
KEGG	afm:AFUA_3G05940 -
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MAFRGQRFTLNLDDDDADLDLDSSQPSLGSSSFGLIGEIRERSPSAAIPPAPKPSTASTGFPQHRRRVNQFAFKQRRANRQQESTPPPAATPSTTLSDEKKSIDEENRRQLASMSPAQIQQEREELMSSLNPSLLERFLRRARIDDDDSITPSEKSSSQPEPPLSSASSAQDASTAKSKKSVSFDVEEDSKTATEKPERSQRKRTPPTVTSSVLTPEDLPPAQPPADLHPASEMPSHEAFHFPTPPRQDKPPNLDPASPSFLSDLQAHYFPEISHDPSALSWLQPPSADPEDPDSTSAYHPASSAEAVHPSALRFSLLGNVLSPATSLSLPTTLGLHHHGKDPHAAGYTIPELAILSRSTFPAQRCIAWQVLGRILFRLGKGQFGERGSPLVEGLWSVIEREGVVAGMLAEADGAPSGPTRSAAAQDSTAADLNHPSPLPAQGTPVPKGATGIGRHASASAWAVEGVWLWQMGGGGDRGILKENTIRSQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.25
3	0.21
4	0.15
5	0.11
6	0.1
7	0.08
8	0.07
9	0.07
10	0.07
11	0.06
12	0.06
13	0.07
14	0.08
15	0.08
16	0.09
17	0.1
18	0.11
19	0.12
20	0.12
21	0.12
22	0.11
23	0.13
24	0.15
25	0.16
26	0.15
27	0.16
28	0.17
29	0.18
30	0.19
31	0.19
32	0.19
33	0.24
34	0.27
35	0.3
36	0.33
37	0.4
38	0.39
39	0.38
40	0.38
41	0.35
42	0.39
43	0.36
44	0.36
45	0.32
46	0.41
47	0.47
48	0.52
49	0.57
50	0.59
51	0.64
52	0.68
53	0.72
54	0.73
55	0.75
56	0.77
57	0.77
58	0.8
59	0.81
60	0.79
61	0.82
62	0.79
63	0.81
64	0.79
65	0.81
66	0.78
67	0.76
68	0.77
69	0.77
70	0.77
71	0.72
72	0.66
73	0.56
74	0.48
75	0.42
76	0.37
77	0.28
78	0.24
79	0.2
80	0.21
81	0.22
82	0.24
83	0.25
84	0.28
85	0.29
86	0.27
87	0.26
88	0.24
89	0.28
90	0.34
91	0.41
92	0.44
93	0.52
94	0.54
95	0.53
96	0.51
97	0.46
98	0.41
99	0.37
100	0.34
101	0.27
102	0.25
103	0.27
104	0.29
105	0.31
106	0.29
107	0.25
108	0.23
109	0.21
110	0.2
111	0.18
112	0.16
113	0.14
114	0.14
115	0.14
116	0.11
117	0.11
118	0.11
119	0.11
120	0.12
121	0.12
122	0.14
123	0.14
124	0.2
125	0.24
126	0.3
127	0.3
128	0.32
129	0.34
130	0.37
131	0.4
132	0.36
133	0.36
134	0.31
135	0.32
136	0.3
137	0.27
138	0.21
139	0.17
140	0.16
141	0.13
142	0.14
143	0.18
144	0.21
145	0.24
146	0.29
147	0.31
148	0.32
149	0.32
150	0.32
151	0.27
152	0.24
153	0.22
154	0.18
155	0.18
156	0.15
157	0.14
158	0.14
159	0.14
160	0.14
161	0.2
162	0.2
163	0.18
164	0.24
165	0.25
166	0.27
167	0.31
168	0.34
169	0.3
170	0.32
171	0.33
172	0.31
173	0.31
174	0.27
175	0.22
176	0.19
177	0.15
178	0.12
179	0.13
180	0.13
181	0.17
182	0.19
183	0.24
184	0.33
185	0.43
186	0.5
187	0.59
188	0.65
189	0.71
190	0.77
191	0.78
192	0.76
193	0.7
194	0.7
195	0.65
196	0.57
197	0.46
198	0.38
199	0.34
200	0.26
201	0.23
202	0.17
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.1
208	0.11
209	0.11
210	0.1
211	0.1
212	0.13
213	0.19
214	0.19
215	0.18
216	0.18
217	0.18
218	0.19
219	0.2
220	0.16
221	0.12
222	0.13
223	0.14
224	0.12
225	0.13
226	0.13
227	0.13
228	0.18
229	0.15
230	0.19
231	0.25
232	0.29
233	0.31
234	0.36
235	0.42
236	0.43
237	0.51
238	0.53
239	0.54
240	0.51
241	0.5
242	0.45
243	0.42
244	0.4
245	0.32
246	0.25
247	0.19
248	0.17
249	0.17
250	0.17
251	0.14
252	0.11
253	0.12
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.09
258	0.12
259	0.12
260	0.13
261	0.13
262	0.13
263	0.13
264	0.12
265	0.15
266	0.11
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.11
271	0.1
272	0.11
273	0.14
274	0.16
275	0.16
276	0.14
277	0.19
278	0.2
279	0.21
280	0.21
281	0.16
282	0.15
283	0.15
284	0.17
285	0.12
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.09
291	0.1
292	0.08
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.09
298	0.09
299	0.08
300	0.08
301	0.06
302	0.06
303	0.09
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.06
321	0.08
322	0.13
323	0.15
324	0.16
325	0.21
326	0.22
327	0.23
328	0.27
329	0.27
330	0.25
331	0.23
332	0.22
333	0.16
334	0.18
335	0.18
336	0.14
337	0.12
338	0.1
339	0.08
340	0.08
341	0.1
342	0.07
343	0.08
344	0.09
345	0.11
346	0.13
347	0.17
348	0.17
349	0.23
350	0.25
351	0.24
352	0.26
353	0.28
354	0.28
355	0.26
356	0.27
357	0.22
358	0.25
359	0.26
360	0.23
361	0.2
362	0.21
363	0.2
364	0.18
365	0.22
366	0.18
367	0.2
368	0.22
369	0.24
370	0.26
371	0.27
372	0.29
373	0.23
374	0.24
375	0.21
376	0.2
377	0.17
378	0.13
379	0.11
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.07
384	0.07
385	0.08
386	0.08
387	0.07
388	0.08
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.05
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.04
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.08
407	0.09
408	0.11
409	0.14
410	0.17
411	0.18
412	0.18
413	0.19
414	0.19
415	0.19
416	0.2
417	0.17
418	0.15
419	0.15
420	0.16
421	0.18
422	0.16
423	0.15
424	0.14
425	0.18
426	0.21
427	0.19
428	0.23
429	0.25
430	0.3
431	0.32
432	0.34
433	0.32
434	0.28
435	0.29
436	0.27
437	0.28
438	0.25
439	0.28
440	0.27
441	0.27
442	0.27
443	0.26
444	0.23
445	0.19
446	0.19
447	0.13
448	0.11
449	0.1
450	0.1
451	0.1
452	0.1
453	0.09
454	0.08
455	0.07
456	0.06
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.09
461	0.09
462	0.08
463	0.09
464	0.1
465	0.11
466	0.14
467	0.14
468	0.15
469	0.2

Q4WWH9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer