Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WZS0

Protein Details
Accession Q4WZS0    Localization Confidence Low Confidence Score 6.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-48TTDTTTGRPQRQRQPNELRKIFLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 5, cyto 5, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000177  C:cytoplasmic exosome (RNase complex)  
GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0071028  P:nuclear mRNA surveillance  
GO:0034427  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5'  
GO:0071051  P:polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing  
GO:0016075  P:rRNA catabolic process  
GO:0034475  P:U4 snRNA 3'-end processing  
KEGG afm:AFUA_2G15980  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
Amino Acid Sequences MTDRRRINGPPSGTRPAVFASSLKSTTDTTTGRPQRQRQPNELRKIFLKTGLIPSASGSSYLEFEPSASLAAARSSPQSLIPPSSALKLACTVHGPKPLPRSATFSPNLVLTTHVKYAPFAARRRKGHIRDTSERDLGVHLETALRGVIVAERWPKSGLDITITILEAEDDRWWGDAPDSHDAPWGMMNVLAGCITAASAAIADARIDCLDLVAGGVAALVSDESPEGERSAPKLMLDTDPAEHRSILSACVVAYMPSRDEITEIWLKGDSSKVLLGPDDKRTGHDALINGAVDAARGAHMVLAEAVRESAERFAGLATV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.47
3 0.41
4 0.36
5 0.29
6 0.23
7 0.21
8 0.24
9 0.25
10 0.24
11 0.23
12 0.23
13 0.23
14 0.28
15 0.25
16 0.25
17 0.35
18 0.42
19 0.49
20 0.57
21 0.63
22 0.67
23 0.76
24 0.79
25 0.79
26 0.82
27 0.83
28 0.85
29 0.8
30 0.73
31 0.67
32 0.66
33 0.57
34 0.5
35 0.43
36 0.36
37 0.38
38 0.37
39 0.34
40 0.28
41 0.27
42 0.25
43 0.22
44 0.19
45 0.13
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.12
65 0.15
66 0.16
67 0.18
68 0.18
69 0.18
70 0.18
71 0.19
72 0.2
73 0.17
74 0.16
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.18
79 0.2
80 0.22
81 0.29
82 0.3
83 0.31
84 0.37
85 0.39
86 0.4
87 0.38
88 0.41
89 0.36
90 0.42
91 0.39
92 0.33
93 0.3
94 0.27
95 0.26
96 0.19
97 0.19
98 0.14
99 0.16
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.15
104 0.19
105 0.23
106 0.26
107 0.3
108 0.38
109 0.45
110 0.48
111 0.55
112 0.61
113 0.61
114 0.64
115 0.67
116 0.66
117 0.66
118 0.7
119 0.67
120 0.58
121 0.52
122 0.43
123 0.35
124 0.27
125 0.19
126 0.12
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.06
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.15
145 0.13
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.07
153 0.07
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.08
164 0.11
165 0.15
166 0.15
167 0.15
168 0.17
169 0.16
170 0.16
171 0.14
172 0.11
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.03
211 0.03
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.16
223 0.16
224 0.18
225 0.18
226 0.16
227 0.18
228 0.21
229 0.2
230 0.18
231 0.17
232 0.17
233 0.16
234 0.15
235 0.13
236 0.11
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.16
250 0.2
251 0.19
252 0.19
253 0.19
254 0.19
255 0.19
256 0.21
257 0.16
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.16
263 0.2
264 0.21
265 0.26
266 0.3
267 0.29
268 0.31
269 0.34
270 0.34
271 0.31
272 0.31
273 0.26
274 0.23
275 0.26
276 0.23
277 0.19
278 0.17
279 0.15
280 0.11
281 0.1
282 0.08
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.1