Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WSM6

Protein Details
Accession Q4WSM6    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-177EDGQQVKRKREGRREKKNRRRDMEEGLDEGEDKSRRRDRKKRDATPEDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-151GRHKRKRTEEDGQQVKRKREGRREKKNRRRDME
157-169GEDKSRRRDRKKR
185-189RRRAL
191-191R
195-207EALKKPTKRRFRK
447-460MRARQIAASKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
KEGG afm:AFUA_1G12260  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDSPEMQPASPSDVVSTHEFQRDLPEEPENAPTPGGDEDHNEEAPEEGAASATPAAESVAETHEDDPADKEDAGVDSDEESILSEVDEAQFEDFDPENVDIEDRPQLAIDEDNLKLIGRHKRKRTEEDGQQVKRKREGRREKKNRRRDMEEGLDEGEDKSRRRDRKKRDATPEDEELLDPATRRRRALDRAMDEALKKPTKRRFRKADGIDLEQMADAEIEDMRKRMTHAAQMDANNRREGRPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMTALSKLPINKETLIASGIGKVIVFYTKSKRPEPGIKRMAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEAEYDPSPHAHKYYRKLTTRTTSAQASVAEARSRELLPPRLANRARPEITHTSYTIVPRPTVVQESKFARPLGASGEDRFRRMRARQIAASKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.26
4 0.28
5 0.26
6 0.29
7 0.29
8 0.28
9 0.35
10 0.35
11 0.33
12 0.33
13 0.32
14 0.3
15 0.32
16 0.37
17 0.3
18 0.28
19 0.24
20 0.21
21 0.2
22 0.19
23 0.19
24 0.14
25 0.15
26 0.2
27 0.24
28 0.24
29 0.22
30 0.2
31 0.2
32 0.19
33 0.15
34 0.1
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.1
49 0.12
50 0.12
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.17
57 0.15
58 0.15
59 0.14
60 0.14
61 0.15
62 0.13
63 0.11
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.09
89 0.11
90 0.14
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.13
104 0.18
105 0.26
106 0.33
107 0.42
108 0.5
109 0.6
110 0.68
111 0.76
112 0.78
113 0.77
114 0.76
115 0.78
116 0.79
117 0.75
118 0.76
119 0.73
120 0.69
121 0.67
122 0.65
123 0.64
124 0.65
125 0.7
126 0.73
127 0.78
128 0.86
129 0.9
130 0.93
131 0.95
132 0.94
133 0.9
134 0.87
135 0.81
136 0.78
137 0.75
138 0.67
139 0.57
140 0.48
141 0.4
142 0.32
143 0.27
144 0.22
145 0.16
146 0.15
147 0.21
148 0.28
149 0.37
150 0.47
151 0.57
152 0.63
153 0.72
154 0.83
155 0.85
156 0.88
157 0.88
158 0.84
159 0.8
160 0.72
161 0.62
162 0.52
163 0.41
164 0.31
165 0.23
166 0.17
167 0.12
168 0.13
169 0.19
170 0.2
171 0.21
172 0.25
173 0.3
174 0.35
175 0.44
176 0.48
177 0.44
178 0.46
179 0.47
180 0.44
181 0.39
182 0.36
183 0.34
184 0.29
185 0.26
186 0.3
187 0.37
188 0.47
189 0.56
190 0.62
191 0.66
192 0.7
193 0.79
194 0.77
195 0.77
196 0.7
197 0.65
198 0.56
199 0.46
200 0.38
201 0.28
202 0.23
203 0.13
204 0.09
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.1
215 0.11
216 0.16
217 0.17
218 0.2
219 0.23
220 0.26
221 0.31
222 0.33
223 0.33
224 0.31
225 0.3
226 0.27
227 0.26
228 0.25
229 0.23
230 0.26
231 0.33
232 0.37
233 0.4
234 0.4
235 0.39
236 0.43
237 0.43
238 0.34
239 0.26
240 0.2
241 0.19
242 0.18
243 0.18
244 0.14
245 0.11
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.12
280 0.11
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.14
295 0.15
296 0.17
297 0.17
298 0.18
299 0.17
300 0.16
301 0.16
302 0.14
303 0.12
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.11
313 0.17
314 0.23
315 0.28
316 0.31
317 0.35
318 0.4
319 0.5
320 0.54
321 0.59
322 0.61
323 0.59
324 0.6
325 0.6
326 0.56
327 0.48
328 0.41
329 0.32
330 0.32
331 0.29
332 0.26
333 0.23
334 0.22
335 0.23
336 0.24
337 0.24
338 0.19
339 0.21
340 0.25
341 0.3
342 0.38
343 0.37
344 0.39
345 0.41
346 0.43
347 0.42
348 0.4
349 0.35
350 0.28
351 0.32
352 0.33
353 0.33
354 0.3
355 0.29
356 0.28
357 0.29
358 0.29
359 0.24
360 0.23
361 0.25
362 0.32
363 0.38
364 0.47
365 0.54
366 0.59
367 0.62
368 0.67
369 0.69
370 0.69
371 0.65
372 0.6
373 0.53
374 0.47
375 0.45
376 0.37
377 0.32
378 0.29
379 0.26
380 0.24
381 0.21
382 0.21
383 0.21
384 0.22
385 0.23
386 0.26
387 0.31
388 0.33
389 0.4
390 0.42
391 0.49
392 0.51
393 0.54
394 0.55
395 0.58
396 0.55
397 0.49
398 0.54
399 0.51
400 0.54
401 0.51
402 0.43
403 0.37
404 0.38
405 0.4
406 0.39
407 0.33
408 0.28
409 0.26
410 0.29
411 0.3
412 0.34
413 0.34
414 0.32
415 0.36
416 0.41
417 0.45
418 0.47
419 0.43
420 0.36
421 0.33
422 0.31
423 0.29
424 0.3
425 0.27
426 0.26
427 0.36
428 0.37
429 0.4
430 0.41
431 0.39
432 0.41
433 0.44
434 0.51
435 0.51
436 0.56
437 0.61
438 0.67
439 0.71
440 0.7