Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3HDG1

Protein Details
Accession A0A0C3HDG1    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
380-406ATEWGGYGRNRRNKKRNQVENTRTAEKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR030843  PAN2  
IPR028881  PAN2_UCH_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF13423  UCH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
CDD cd06143  PAN2_exo  
Amino Acid Sequences MDGDWEEVNRLPLPPSGEHAVPTPVTTLAFDNSHELLWAGNEYGRVTSFYGTELTQYTSFKAGEDPVRQILLHDRGVIALCSRSIHMAMRRGPPIWHIANDEMKDLRCMSFTSKGTSEILLAGLQDTMFIIDIEKGTVSKQIPAADHYTIMKRSRHICAATKTGAVNILDSTTFNVIKTWNAHSSLINDMDAQHDFIVTCGYSLRQGQSYMLDPLVNVFDLKNMISLPPVPFPAGGAYVRMHPRMSTTSIVVSQLGQIHIVDLMNVNTSNVRQANVLSYLSMVEIAPSGEAIALADAEFNIHLWGSPNRIRFAELSNPVDFAEPEDDHIALDWSVDTPLSSIGLPYYREQLLSAWPSHMIVEVGAPPSEIDPQYLATMKATEWGGYGRNRRNKKRNQVENTRTAEKAPTSLQAPKFLSEKARESANDTSTEKKISEVADALGATEISSLQTDVPIMYRIVEIKYSKFGVDDFDFAFYNETSYSGLENHISNSYANSLLQVLHYTPLIRNLALQHAATSCINDKCLLCEMGFVFDMLDKAEGTICHATNLLKTLSIHPQAGPLGLLEEDAPGASLTNMLQGLNRFLLDKIAQDYRSIPPHSAAFDQYKVLATPATMAIRCMSCRSEHTRPGTSFVHDLVYPIPKTLPRNSRAPKPSFCQILKASIERETTSRGWCSRCQRYQSLATRKTIHGAPAVLMLNAAINSPEAKQFWTFPGWLPEEIGIIIDQGQVYCYHGDDLKLHIQRGIHNITVYSLIGLAANVTSGQQQKTHLVSLVNVAHSQPMVPAESQWHLFNDFLVRPTKSEDALTFNSTWKIPSVITYQIKAANNRIDTTWKQNLDTSLLYMDLNPNLAEKRYRPLTPDEAPGEGTIIALDTEFVAIRQPEIEMNSDGERETIRPIAYALARVSVVRGAGENECIPFIDDYIVSKEHIVDYLTSYSGIVSGDLDPRFSKHNLVSLKVAYKKLWILLNLGCKFLGHGLKQDFRVTNIHVPKAQVIDTIDLFFVKARLRKLSLAFLAWYLLREDIQLETHDSIEDARTALKLYKKYLEFSDAGIIETILQDIYRTGREMNFKPPAAKKDGHLIQRMETPTLVADGADSGPSTPIKRPSGLSGPNVFIPGKASPFKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.28
4 0.27
5 0.28
6 0.28
7 0.29
8 0.25
9 0.24
10 0.2
11 0.16
12 0.16
13 0.16
14 0.16
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.19
19 0.19
20 0.18
21 0.17
22 0.15
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.09
27 0.1
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.14
32 0.14
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.14
39 0.15
40 0.15
41 0.17
42 0.19
43 0.19
44 0.2
45 0.21
46 0.21
47 0.2
48 0.21
49 0.22
50 0.27
51 0.3
52 0.33
53 0.32
54 0.33
55 0.33
56 0.32
57 0.35
58 0.33
59 0.3
60 0.27
61 0.24
62 0.24
63 0.25
64 0.24
65 0.18
66 0.14
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.2
73 0.24
74 0.31
75 0.37
76 0.42
77 0.45
78 0.45
79 0.44
80 0.41
81 0.43
82 0.39
83 0.35
84 0.32
85 0.34
86 0.4
87 0.39
88 0.4
89 0.35
90 0.32
91 0.31
92 0.29
93 0.24
94 0.18
95 0.19
96 0.21
97 0.27
98 0.28
99 0.32
100 0.31
101 0.33
102 0.33
103 0.32
104 0.27
105 0.2
106 0.19
107 0.13
108 0.12
109 0.1
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.14
125 0.15
126 0.17
127 0.2
128 0.23
129 0.24
130 0.27
131 0.31
132 0.26
133 0.27
134 0.27
135 0.28
136 0.3
137 0.34
138 0.33
139 0.34
140 0.39
141 0.43
142 0.47
143 0.47
144 0.5
145 0.5
146 0.54
147 0.51
148 0.48
149 0.43
150 0.37
151 0.36
152 0.28
153 0.23
154 0.16
155 0.15
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.13
160 0.13
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.16
165 0.19
166 0.22
167 0.23
168 0.26
169 0.27
170 0.27
171 0.29
172 0.3
173 0.28
174 0.24
175 0.2
176 0.17
177 0.18
178 0.18
179 0.16
180 0.11
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.11
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.12
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.17
195 0.19
196 0.21
197 0.2
198 0.19
199 0.16
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.12
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.18
226 0.21
227 0.22
228 0.21
229 0.18
230 0.22
231 0.23
232 0.26
233 0.23
234 0.21
235 0.22
236 0.23
237 0.23
238 0.2
239 0.17
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.1
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.16
262 0.17
263 0.17
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.08
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.03
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.07
291 0.09
292 0.14
293 0.19
294 0.22
295 0.24
296 0.25
297 0.26
298 0.25
299 0.28
300 0.31
301 0.32
302 0.32
303 0.31
304 0.31
305 0.29
306 0.28
307 0.24
308 0.17
309 0.16
310 0.12
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.08
331 0.1
332 0.11
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.17
339 0.18
340 0.18
341 0.15
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.14
346 0.1
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.1
365 0.09
366 0.12
367 0.11
368 0.1
369 0.09
370 0.1
371 0.14
372 0.18
373 0.26
374 0.31
375 0.39
376 0.49
377 0.58
378 0.67
379 0.74
380 0.8
381 0.83
382 0.86
383 0.86
384 0.89
385 0.86
386 0.85
387 0.8
388 0.72
389 0.62
390 0.52
391 0.45
392 0.34
393 0.29
394 0.21
395 0.17
396 0.17
397 0.23
398 0.23
399 0.27
400 0.27
401 0.27
402 0.27
403 0.27
404 0.29
405 0.26
406 0.29
407 0.24
408 0.26
409 0.24
410 0.27
411 0.3
412 0.27
413 0.27
414 0.25
415 0.27
416 0.26
417 0.27
418 0.22
419 0.18
420 0.19
421 0.16
422 0.16
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.15
451 0.15
452 0.14
453 0.14
454 0.13
455 0.14
456 0.14
457 0.15
458 0.12
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.14
463 0.1
464 0.09
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.14
498 0.15
499 0.14
500 0.11
501 0.1
502 0.12
503 0.11
504 0.11
505 0.12
506 0.11
507 0.12
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.14
512 0.14
513 0.1
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.09
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.04
525 0.04
526 0.05
527 0.05
528 0.07
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.11
533 0.11
534 0.1
535 0.12
536 0.1
537 0.08
538 0.09
539 0.11
540 0.16
541 0.17
542 0.17
543 0.15
544 0.17
545 0.16
546 0.15
547 0.13
548 0.07
549 0.06
550 0.05
551 0.06
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.03
556 0.04
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.04
563 0.05
564 0.05
565 0.06
566 0.06
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.07
571 0.07
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.1
576 0.12
577 0.13
578 0.13
579 0.15
580 0.16
581 0.21
582 0.21
583 0.18
584 0.17
585 0.18
586 0.19
587 0.18
588 0.18
589 0.15
590 0.15
591 0.15
592 0.14
593 0.13
594 0.12
595 0.11
596 0.08
597 0.06
598 0.06
599 0.07
600 0.08
601 0.08
602 0.08
603 0.09
604 0.1
605 0.1
606 0.11
607 0.1
608 0.1
609 0.14
610 0.22
611 0.27
612 0.32
613 0.37
614 0.41
615 0.41
616 0.45
617 0.42
618 0.36
619 0.31
620 0.25
621 0.22
622 0.15
623 0.15
624 0.12
625 0.15
626 0.13
627 0.12
628 0.13
629 0.14
630 0.18
631 0.25
632 0.31
633 0.3
634 0.4
635 0.43
636 0.51
637 0.56
638 0.59
639 0.55
640 0.52
641 0.54
642 0.51
643 0.48
644 0.44
645 0.38
646 0.38
647 0.36
648 0.33
649 0.29
650 0.26
651 0.27
652 0.22
653 0.22
654 0.2
655 0.2
656 0.2
657 0.22
658 0.22
659 0.23
660 0.29
661 0.36
662 0.41
663 0.45
664 0.49
665 0.5
666 0.52
667 0.58
668 0.62
669 0.64
670 0.59
671 0.57
672 0.55
673 0.51
674 0.49
675 0.41
676 0.33
677 0.24
678 0.21
679 0.17
680 0.17
681 0.17
682 0.14
683 0.12
684 0.1
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.04
689 0.04
690 0.05
691 0.06
692 0.08
693 0.08
694 0.09
695 0.1
696 0.11
697 0.13
698 0.15
699 0.15
700 0.15
701 0.2
702 0.21
703 0.2
704 0.19
705 0.17
706 0.15
707 0.14
708 0.13
709 0.07
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.04
715 0.05
716 0.05
717 0.06
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.08
722 0.09
723 0.1
724 0.13
725 0.2
726 0.22
727 0.22
728 0.23
729 0.23
730 0.25
731 0.3
732 0.29
733 0.22
734 0.2
735 0.2
736 0.19
737 0.19
738 0.16
739 0.1
740 0.07
741 0.06
742 0.06
743 0.05
744 0.05
745 0.03
746 0.04
747 0.04
748 0.04
749 0.07
750 0.09
751 0.11
752 0.12
753 0.14
754 0.18
755 0.2
756 0.2
757 0.19
758 0.17
759 0.17
760 0.2
761 0.21
762 0.18
763 0.16
764 0.15
765 0.14
766 0.14
767 0.13
768 0.09
769 0.08
770 0.08
771 0.08
772 0.09
773 0.11
774 0.13
775 0.14
776 0.14
777 0.14
778 0.14
779 0.14
780 0.14
781 0.15
782 0.14
783 0.16
784 0.19
785 0.18
786 0.18
787 0.22
788 0.23
789 0.19
790 0.2
791 0.19
792 0.22
793 0.24
794 0.26
795 0.23
796 0.23
797 0.23
798 0.22
799 0.21
800 0.16
801 0.15
802 0.12
803 0.14
804 0.15
805 0.22
806 0.24
807 0.24
808 0.26
809 0.3
810 0.33
811 0.32
812 0.34
813 0.32
814 0.31
815 0.31
816 0.31
817 0.3
818 0.3
819 0.36
820 0.38
821 0.34
822 0.34
823 0.35
824 0.35
825 0.33
826 0.31
827 0.24
828 0.17
829 0.16
830 0.14
831 0.13
832 0.13
833 0.1
834 0.1
835 0.09
836 0.1
837 0.1
838 0.12
839 0.14
840 0.14
841 0.21
842 0.25
843 0.27
844 0.28
845 0.34
846 0.39
847 0.4
848 0.45
849 0.39
850 0.35
851 0.35
852 0.32
853 0.26
854 0.19
855 0.15
856 0.09
857 0.07
858 0.05
859 0.04
860 0.04
861 0.04
862 0.04
863 0.04
864 0.04
865 0.07
866 0.07
867 0.07
868 0.08
869 0.08
870 0.09
871 0.11
872 0.14
873 0.13
874 0.15
875 0.16
876 0.16
877 0.15
878 0.14
879 0.14
880 0.12
881 0.13
882 0.14
883 0.13
884 0.12
885 0.13
886 0.16
887 0.16
888 0.18
889 0.16
890 0.15
891 0.15
892 0.15
893 0.15
894 0.12
895 0.12
896 0.09
897 0.09
898 0.1
899 0.11
900 0.13
901 0.13
902 0.13
903 0.13
904 0.12
905 0.13
906 0.11
907 0.1
908 0.1
909 0.09
910 0.1
911 0.14
912 0.14
913 0.13
914 0.14
915 0.14
916 0.13
917 0.14
918 0.13
919 0.1
920 0.13
921 0.14
922 0.14
923 0.13
924 0.12
925 0.11
926 0.11
927 0.1
928 0.07
929 0.07
930 0.08
931 0.14
932 0.14
933 0.15
934 0.15
935 0.17
936 0.21
937 0.21
938 0.24
939 0.21
940 0.28
941 0.3
942 0.32
943 0.35
944 0.34
945 0.4
946 0.41
947 0.41
948 0.35
949 0.35
950 0.34
951 0.35
952 0.34
953 0.28
954 0.27
955 0.29
956 0.38
957 0.35
958 0.34
959 0.3
960 0.26
961 0.26
962 0.27
963 0.28
964 0.2
965 0.26
966 0.32
967 0.36
968 0.39
969 0.44
970 0.4
971 0.36
972 0.39
973 0.37
974 0.4
975 0.41
976 0.43
977 0.39
978 0.39
979 0.4
980 0.38
981 0.34
982 0.28
983 0.23
984 0.23
985 0.21
986 0.21
987 0.18
988 0.15
989 0.15
990 0.13
991 0.13
992 0.15
993 0.18
994 0.21
995 0.27
996 0.31
997 0.36
998 0.38
999 0.44
1000 0.41
1001 0.39
1002 0.36
1003 0.31
1004 0.29
1005 0.24
1006 0.22
1007 0.15
1008 0.13
1009 0.11
1010 0.11
1011 0.11
1012 0.11
1013 0.13
1014 0.13
1015 0.16
1016 0.16
1017 0.16
1018 0.16
1019 0.15
1020 0.14
1021 0.14
1022 0.13
1023 0.1
1024 0.1
1025 0.1
1026 0.12
1027 0.16
1028 0.22
1029 0.25
1030 0.29
1031 0.37
1032 0.38
1033 0.41
1034 0.43
1035 0.44
1036 0.39
1037 0.37
1038 0.39
1039 0.31
1040 0.29
1041 0.26
1042 0.22
1043 0.16
1044 0.16
1045 0.14
1046 0.07
1047 0.06
1048 0.06
1049 0.07
1050 0.1
1051 0.11
1052 0.12
1053 0.14
1054 0.19
1055 0.27
1056 0.3
1057 0.38
1058 0.44
1059 0.44
1060 0.5
1061 0.55
1062 0.57
1063 0.56
1064 0.56
1065 0.49
1066 0.51
1067 0.56
1068 0.56
1069 0.56
1070 0.51
1071 0.47
1072 0.53
1073 0.53
1074 0.44
1075 0.36
1076 0.3
1077 0.23
1078 0.23
1079 0.2
1080 0.12
1081 0.1
1082 0.09
1083 0.1
1084 0.1
1085 0.09
1086 0.08
1087 0.11
1088 0.13
1089 0.16
1090 0.19
1091 0.27
1092 0.31
1093 0.34
1094 0.36
1095 0.41
1096 0.48
1097 0.51
1098 0.53
1099 0.5
1100 0.48
1101 0.47
1102 0.47
1103 0.4
1104 0.31
1105 0.28
1106 0.24
1107 0.25