Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3HB52

Protein Details
Accession A0A0C3HB52    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-162LERAPPPKPPRPSKSRSKSSRSLEDEHydrophilic
486-511VPSALDKRSPTKPKNRKEKEATEGWNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
141-154PPPKPPRPSKSRSK
496-502TKPKNRK
Subcellular Location(s) cyto 17, cyto_nucl 13.333, nucl 5.5, mito_nucl 4.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009686  Senescence/spartin_C  
IPR045036  Spartin-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF06911  Senescence  
Amino Acid Sequences MAKDPKLLYAINGINAYHIENGKEECLTPSGPQTLSLLMVPTSSPFHDYASIDSQTQVGEEDFYLHLHLPPELDLPLPATTQIYFQPPSSYLIPRAWDLGLERGAFTRIEFPGIGKGGSQDDVDTFETIIAQCTAFLERAPPPKPPRPSKSRSKSSRSLEDELIPAYNPSAFKPGEGYVRGSSSGSSTARGQIVLVDEENGSVVGELGEGFHVVEDSKMKPGSKDPVVITLPEDGSQEIGVEPATAKHIEKAIHPAYKNSTLVTKAAAASRLIIASSEYVSKTLHAQADHFTQTTKPNPKPMTFTPTTHERVRKVHTFSSGAAGMSSKVVGHVSKYAQSIGATLLKHTNQGVGSDGKPKEDFEPGLLNKSMMAFSTIADGVDHAGRNLLTSSTSAATKVVTYRYGEEAGDISRSIGGNIKNVALVYIDVTGVSRKAIVKSVAKGMIVGRIGDGKHLIVPGTEEEVESTSPTSSQLAPGVVPTVGRVPSALDKRSPTKPKNRKEKEATEGWNTDDASMMSGGKRSPTGVAEASQQFPPPPPIYGSGIGQIIDETQYTGDSKDTWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.23
4 0.19
5 0.19
6 0.16
7 0.17
8 0.19
9 0.2
10 0.2
11 0.19
12 0.17
13 0.19
14 0.19
15 0.19
16 0.22
17 0.24
18 0.24
19 0.24
20 0.23
21 0.21
22 0.21
23 0.2
24 0.16
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.12
31 0.15
32 0.14
33 0.16
34 0.2
35 0.21
36 0.24
37 0.27
38 0.28
39 0.25
40 0.25
41 0.23
42 0.19
43 0.18
44 0.15
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.14
54 0.13
55 0.14
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.11
62 0.12
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.14
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.2
74 0.2
75 0.24
76 0.26
77 0.27
78 0.26
79 0.27
80 0.29
81 0.26
82 0.27
83 0.23
84 0.21
85 0.19
86 0.21
87 0.2
88 0.19
89 0.18
90 0.17
91 0.18
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.14
96 0.16
97 0.15
98 0.15
99 0.19
100 0.2
101 0.19
102 0.14
103 0.15
104 0.15
105 0.16
106 0.15
107 0.1
108 0.1
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.12
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.09
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.11
125 0.15
126 0.23
127 0.25
128 0.32
129 0.38
130 0.47
131 0.56
132 0.62
133 0.66
134 0.68
135 0.74
136 0.77
137 0.8
138 0.82
139 0.82
140 0.8
141 0.81
142 0.78
143 0.81
144 0.76
145 0.7
146 0.62
147 0.55
148 0.48
149 0.39
150 0.32
151 0.22
152 0.16
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.16
161 0.17
162 0.2
163 0.21
164 0.23
165 0.2
166 0.21
167 0.21
168 0.19
169 0.17
170 0.14
171 0.16
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.12
180 0.13
181 0.12
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.06
203 0.07
204 0.1
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.17
209 0.23
210 0.23
211 0.26
212 0.24
213 0.28
214 0.28
215 0.27
216 0.25
217 0.21
218 0.19
219 0.15
220 0.15
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.2
239 0.22
240 0.26
241 0.26
242 0.27
243 0.28
244 0.31
245 0.3
246 0.24
247 0.21
248 0.18
249 0.18
250 0.17
251 0.14
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.11
271 0.12
272 0.11
273 0.12
274 0.14
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.13
279 0.13
280 0.16
281 0.23
282 0.29
283 0.28
284 0.34
285 0.38
286 0.39
287 0.43
288 0.42
289 0.43
290 0.38
291 0.37
292 0.33
293 0.37
294 0.39
295 0.39
296 0.4
297 0.35
298 0.37
299 0.41
300 0.43
301 0.41
302 0.4
303 0.38
304 0.36
305 0.33
306 0.32
307 0.27
308 0.21
309 0.17
310 0.14
311 0.11
312 0.09
313 0.08
314 0.05
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.09
320 0.1
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.13
327 0.12
328 0.14
329 0.11
330 0.12
331 0.15
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.15
336 0.12
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.21
342 0.21
343 0.21
344 0.21
345 0.22
346 0.21
347 0.22
348 0.21
349 0.16
350 0.24
351 0.22
352 0.26
353 0.25
354 0.23
355 0.19
356 0.2
357 0.18
358 0.1
359 0.11
360 0.07
361 0.07
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.07
371 0.08
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.08
376 0.06
377 0.07
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.11
386 0.12
387 0.12
388 0.14
389 0.16
390 0.18
391 0.19
392 0.18
393 0.17
394 0.16
395 0.14
396 0.14
397 0.11
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.13
403 0.13
404 0.15
405 0.16
406 0.16
407 0.15
408 0.15
409 0.14
410 0.1
411 0.09
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.1
422 0.11
423 0.15
424 0.2
425 0.24
426 0.26
427 0.32
428 0.32
429 0.3
430 0.3
431 0.27
432 0.26
433 0.23
434 0.2
435 0.14
436 0.15
437 0.15
438 0.15
439 0.16
440 0.11
441 0.12
442 0.13
443 0.12
444 0.09
445 0.11
446 0.11
447 0.14
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.13
452 0.14
453 0.13
454 0.12
455 0.09
456 0.09
457 0.1
458 0.11
459 0.1
460 0.12
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.13
465 0.14
466 0.12
467 0.11
468 0.1
469 0.12
470 0.12
471 0.12
472 0.11
473 0.13
474 0.21
475 0.27
476 0.29
477 0.29
478 0.34
479 0.4
480 0.5
481 0.57
482 0.58
483 0.63
484 0.71
485 0.78
486 0.84
487 0.88
488 0.88
489 0.88
490 0.88
491 0.84
492 0.83
493 0.78
494 0.74
495 0.67
496 0.59
497 0.53
498 0.44
499 0.37
500 0.29
501 0.23
502 0.17
503 0.16
504 0.14
505 0.11
506 0.13
507 0.13
508 0.14
509 0.15
510 0.14
511 0.16
512 0.17
513 0.21
514 0.21
515 0.21
516 0.27
517 0.29
518 0.31
519 0.29
520 0.29
521 0.25
522 0.26
523 0.32
524 0.27
525 0.26
526 0.26
527 0.29
528 0.33
529 0.34
530 0.32
531 0.29
532 0.28
533 0.26
534 0.23
535 0.19
536 0.15
537 0.13
538 0.11
539 0.09
540 0.08
541 0.09
542 0.1
543 0.11
544 0.11