Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3HWE5

Protein Details
Accession A0A0C3HWE5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-38VPEPSGQSPPRKRRQSSLSNASPKRHydrophilic
79-98TLERRKSSVQEERKRSRRLFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039853  Pinin  
IPR006786  Pinin_SDK_MemA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04696  Pinin_SDK_memA  
Amino Acid Sequences MSGSIGPISSAVIVPEPSGQSPPRKRRQSSLSNASPKRPRLSHDGSTGPPSTLGALPQVDAATPEPATVPDDEKERDLTLERRKSSVQEERKRSRRLFGGILSALSQTAPSGQQKRRQEIEKRQAEKAKQQKVNDEDQRAERLARLKATRKAEQIKYNRESMRSRHSNILSRANFLSTRTEPKLYYKPWELLPEEEDRIKRQISEVEILIEREVEEFNTLYPYEPVKDALVPEEKQNNSSKETVGEPRTESPPNSNIQVDPTNPPTQTPQSNQPATGRHSLEEHNGEVVVEADEDTVIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.19
6 0.22
7 0.31
8 0.41
9 0.51
10 0.59
11 0.67
12 0.7
13 0.75
14 0.8
15 0.81
16 0.8
17 0.8
18 0.8
19 0.8
20 0.79
21 0.79
22 0.77
23 0.72
24 0.69
25 0.62
26 0.56
27 0.55
28 0.6
29 0.58
30 0.56
31 0.55
32 0.49
33 0.52
34 0.48
35 0.39
36 0.31
37 0.25
38 0.21
39 0.17
40 0.15
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.12
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.09
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.13
57 0.12
58 0.16
59 0.17
60 0.18
61 0.19
62 0.18
63 0.18
64 0.19
65 0.25
66 0.31
67 0.38
68 0.38
69 0.39
70 0.4
71 0.41
72 0.46
73 0.49
74 0.5
75 0.52
76 0.6
77 0.67
78 0.75
79 0.8
80 0.74
81 0.69
82 0.64
83 0.59
84 0.54
85 0.46
86 0.42
87 0.35
88 0.33
89 0.28
90 0.22
91 0.17
92 0.13
93 0.11
94 0.05
95 0.06
96 0.08
97 0.12
98 0.2
99 0.25
100 0.33
101 0.39
102 0.45
103 0.5
104 0.55
105 0.6
106 0.62
107 0.69
108 0.7
109 0.68
110 0.67
111 0.67
112 0.62
113 0.62
114 0.6
115 0.59
116 0.55
117 0.53
118 0.55
119 0.54
120 0.6
121 0.57
122 0.5
123 0.43
124 0.39
125 0.4
126 0.33
127 0.29
128 0.22
129 0.21
130 0.19
131 0.21
132 0.23
133 0.27
134 0.33
135 0.38
136 0.4
137 0.41
138 0.47
139 0.48
140 0.52
141 0.54
142 0.56
143 0.53
144 0.56
145 0.51
146 0.48
147 0.46
148 0.41
149 0.44
150 0.41
151 0.41
152 0.41
153 0.43
154 0.46
155 0.46
156 0.52
157 0.43
158 0.4
159 0.38
160 0.33
161 0.3
162 0.24
163 0.26
164 0.18
165 0.24
166 0.24
167 0.25
168 0.25
169 0.3
170 0.36
171 0.32
172 0.36
173 0.33
174 0.33
175 0.34
176 0.38
177 0.34
178 0.28
179 0.29
180 0.27
181 0.25
182 0.26
183 0.25
184 0.22
185 0.23
186 0.22
187 0.2
188 0.18
189 0.2
190 0.2
191 0.21
192 0.19
193 0.19
194 0.2
195 0.2
196 0.18
197 0.14
198 0.11
199 0.09
200 0.09
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.14
213 0.13
214 0.14
215 0.14
216 0.17
217 0.21
218 0.2
219 0.24
220 0.3
221 0.3
222 0.32
223 0.38
224 0.36
225 0.35
226 0.36
227 0.32
228 0.26
229 0.3
230 0.34
231 0.31
232 0.31
233 0.3
234 0.32
235 0.36
236 0.37
237 0.34
238 0.32
239 0.33
240 0.34
241 0.34
242 0.32
243 0.28
244 0.3
245 0.32
246 0.29
247 0.3
248 0.32
249 0.34
250 0.32
251 0.33
252 0.34
253 0.37
254 0.41
255 0.41
256 0.45
257 0.5
258 0.52
259 0.53
260 0.51
261 0.51
262 0.49
263 0.52
264 0.44
265 0.36
266 0.37
267 0.37
268 0.4
269 0.38
270 0.34
271 0.28
272 0.26
273 0.24
274 0.21
275 0.19
276 0.12
277 0.09
278 0.08
279 0.07