Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q4WGE0

Protein Details
Accession Q4WGE0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34ADNSTPRPKTARRRGRGGRGGRGSVRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-31RPKTARRRGRGGRGGRG
70-99AARGSRGGKRGGRGGGASLDKGRRRGRGRG
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 9.5, cyto_nucl 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG afm:AFUA_7G04710  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
Amino Acid Sequences MSGSPVATADNSTPRPKTARRRGRGGRGGRGSVRSTPTAPDTQSEAQETSQLPASEVSSLNVQPNESSRAARGSRGGKRGGRGGGASLDKGRRRGRGRGEDSKAVSGVLGGRTFEGRLSKPERASDEDQPDIAGDLSLRADAPEFVPGAPADGVIPNGITSSAASSTIGKGKSKNIQARPPKVTTKSTAPDIATRIHEDIAHNLYECPICTSELGRRSRVWSCGLCWTVFHLSCVKKWSKNEGSAAQDAARRQAEGEPSAPRAWRCPGCNLPHEIFPSTYSCWCEKEVDPRPLPGLPPHSCGQTCSRPRKGCPHPCDATCHAGPCSPCTAMGPTQDCFCGRNSSTKRCQDTDYENGWSCGEICSDLLPCGEHTCTRPCHEGLCGACEVKIEGRCYCGKVQTEMLCSSKDEEFESQMARGDDGTIDEWIGCFSCGDRCSRPFDCGVHFCEKDCHPQDAHPAHCPRSPDVVSHCPCGKTPLTEMSDFSPRMSCDDPIPNCSKPCGKMLDCGHSCDQTCHTGPCGSCRRKLPVSCRCGRTTVVTVCHQGMIEPPWCFRVCKAGLHCGRHACAERCCPGEQKAIERQAMRRKLKAHLRPSDEDVEAEHICTRVCGRPLKCGRHTCPEICHKGPCNTCREAIFEDIPCNCGRTVLSPPLPCGTKPPACSFPCERPKPCGHPQTPHNCHTDEESCPKCPFLTEKACLCGRRVLKNQPCWLAETRCGEVCGEPLKCGSHSCQKTCHRPGECEDASRPCQQPCGKTKSLCGHPCTEPCHAPYQCPEKTPCTSTVTVTCGCGRLRQSRRCNAAAASKGPVPQATRGPSLTPLACDDECARLERNRALASALGVEINPTTTAASNLSPSTLPYSTETLDLYVQLSSTSPLSTLQTYESTLHSLAISTTQRSVRFQPAKSPLRAFIHSLAADWGFASESFDPEPHRHVFVLKPTTWTPPLLGVGPENSIGIGGKSVGECVKLRERQRLKEREAQRLAAAEAKALKEAAKAQQSADTAGDGGWAQVAASRRSNGVSSTRSTTPVASPSPWSGSKFAALAGSDSGSWGLPRKEKLVLRSGVGAAKKNLSTPPAAEVADNWEEEEEKVEQEEEERERAAREHEQQFEGEEQHRMEENNEMTDARDSVEMPAEAAISTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.42
3 0.5
4 0.58
5 0.61
6 0.68
7 0.7
8 0.79
9 0.85
10 0.88
11 0.89
12 0.86
13 0.85
14 0.82
15 0.8
16 0.74
17 0.7
18 0.63
19 0.59
20 0.55
21 0.48
22 0.43
23 0.4
24 0.4
25 0.4
26 0.38
27 0.34
28 0.36
29 0.36
30 0.37
31 0.36
32 0.33
33 0.28
34 0.31
35 0.3
36 0.25
37 0.26
38 0.23
39 0.21
40 0.21
41 0.21
42 0.2
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.19
47 0.22
48 0.22
49 0.22
50 0.2
51 0.23
52 0.28
53 0.26
54 0.26
55 0.23
56 0.3
57 0.31
58 0.32
59 0.36
60 0.39
61 0.45
62 0.5
63 0.55
64 0.52
65 0.55
66 0.59
67 0.55
68 0.48
69 0.41
70 0.37
71 0.36
72 0.33
73 0.31
74 0.3
75 0.35
76 0.36
77 0.43
78 0.46
79 0.49
80 0.53
81 0.6
82 0.65
83 0.68
84 0.74
85 0.76
86 0.78
87 0.76
88 0.74
89 0.67
90 0.57
91 0.46
92 0.36
93 0.27
94 0.23
95 0.18
96 0.16
97 0.13
98 0.14
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.19
103 0.17
104 0.25
105 0.31
106 0.36
107 0.39
108 0.44
109 0.47
110 0.49
111 0.53
112 0.53
113 0.53
114 0.48
115 0.45
116 0.4
117 0.35
118 0.28
119 0.23
120 0.14
121 0.08
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.13
154 0.18
155 0.2
156 0.21
157 0.23
158 0.29
159 0.36
160 0.44
161 0.51
162 0.54
163 0.61
164 0.69
165 0.76
166 0.76
167 0.74
168 0.73
169 0.69
170 0.66
171 0.61
172 0.6
173 0.56
174 0.53
175 0.51
176 0.45
177 0.43
178 0.4
179 0.39
180 0.33
181 0.32
182 0.29
183 0.25
184 0.25
185 0.22
186 0.24
187 0.23
188 0.21
189 0.19
190 0.17
191 0.19
192 0.17
193 0.17
194 0.15
195 0.14
196 0.14
197 0.14
198 0.16
199 0.21
200 0.29
201 0.32
202 0.32
203 0.33
204 0.37
205 0.41
206 0.42
207 0.41
208 0.35
209 0.33
210 0.39
211 0.39
212 0.34
213 0.3
214 0.31
215 0.32
216 0.3
217 0.29
218 0.28
219 0.28
220 0.3
221 0.37
222 0.38
223 0.37
224 0.41
225 0.5
226 0.51
227 0.55
228 0.58
229 0.57
230 0.56
231 0.52
232 0.49
233 0.41
234 0.36
235 0.31
236 0.3
237 0.25
238 0.19
239 0.19
240 0.21
241 0.22
242 0.22
243 0.24
244 0.22
245 0.24
246 0.26
247 0.28
248 0.25
249 0.25
250 0.3
251 0.32
252 0.32
253 0.37
254 0.43
255 0.46
256 0.5
257 0.53
258 0.48
259 0.46
260 0.46
261 0.4
262 0.33
263 0.29
264 0.27
265 0.24
266 0.24
267 0.23
268 0.22
269 0.22
270 0.24
271 0.26
272 0.25
273 0.33
274 0.4
275 0.46
276 0.45
277 0.45
278 0.46
279 0.43
280 0.42
281 0.36
282 0.36
283 0.29
284 0.31
285 0.31
286 0.33
287 0.31
288 0.33
289 0.34
290 0.36
291 0.42
292 0.48
293 0.56
294 0.57
295 0.62
296 0.7
297 0.74
298 0.75
299 0.72
300 0.71
301 0.67
302 0.64
303 0.66
304 0.59
305 0.55
306 0.45
307 0.41
308 0.33
309 0.3
310 0.29
311 0.25
312 0.24
313 0.18
314 0.17
315 0.16
316 0.19
317 0.19
318 0.24
319 0.24
320 0.21
321 0.22
322 0.23
323 0.22
324 0.2
325 0.19
326 0.2
327 0.18
328 0.28
329 0.33
330 0.41
331 0.5
332 0.57
333 0.6
334 0.56
335 0.58
336 0.53
337 0.53
338 0.52
339 0.46
340 0.43
341 0.38
342 0.37
343 0.34
344 0.28
345 0.22
346 0.15
347 0.12
348 0.08
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.13
360 0.18
361 0.21
362 0.24
363 0.27
364 0.26
365 0.26
366 0.26
367 0.28
368 0.23
369 0.24
370 0.22
371 0.18
372 0.18
373 0.16
374 0.16
375 0.15
376 0.17
377 0.16
378 0.15
379 0.18
380 0.2
381 0.22
382 0.24
383 0.25
384 0.23
385 0.24
386 0.28
387 0.28
388 0.3
389 0.3
390 0.29
391 0.24
392 0.23
393 0.23
394 0.19
395 0.17
396 0.15
397 0.14
398 0.15
399 0.15
400 0.16
401 0.14
402 0.15
403 0.14
404 0.13
405 0.11
406 0.1
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.08
420 0.1
421 0.13
422 0.17
423 0.18
424 0.25
425 0.26
426 0.28
427 0.27
428 0.28
429 0.29
430 0.29
431 0.32
432 0.31
433 0.31
434 0.29
435 0.31
436 0.3
437 0.35
438 0.34
439 0.32
440 0.27
441 0.28
442 0.37
443 0.38
444 0.38
445 0.36
446 0.37
447 0.36
448 0.38
449 0.38
450 0.31
451 0.33
452 0.31
453 0.27
454 0.29
455 0.36
456 0.36
457 0.37
458 0.37
459 0.31
460 0.3
461 0.32
462 0.27
463 0.2
464 0.21
465 0.24
466 0.25
467 0.25
468 0.26
469 0.24
470 0.27
471 0.26
472 0.24
473 0.19
474 0.16
475 0.18
476 0.19
477 0.17
478 0.15
479 0.22
480 0.23
481 0.26
482 0.3
483 0.28
484 0.28
485 0.29
486 0.29
487 0.23
488 0.26
489 0.28
490 0.25
491 0.3
492 0.33
493 0.4
494 0.37
495 0.39
496 0.37
497 0.33
498 0.32
499 0.26
500 0.25
501 0.19
502 0.2
503 0.17
504 0.17
505 0.18
506 0.17
507 0.24
508 0.32
509 0.31
510 0.35
511 0.37
512 0.42
513 0.45
514 0.51
515 0.53
516 0.52
517 0.57
518 0.59
519 0.6
520 0.55
521 0.51
522 0.47
523 0.41
524 0.37
525 0.32
526 0.29
527 0.27
528 0.27
529 0.25
530 0.24
531 0.2
532 0.15
533 0.13
534 0.12
535 0.13
536 0.12
537 0.12
538 0.14
539 0.15
540 0.15
541 0.14
542 0.2
543 0.18
544 0.22
545 0.24
546 0.31
547 0.35
548 0.38
549 0.4
550 0.34
551 0.33
552 0.31
553 0.32
554 0.26
555 0.24
556 0.25
557 0.25
558 0.26
559 0.27
560 0.26
561 0.25
562 0.28
563 0.26
564 0.27
565 0.3
566 0.32
567 0.34
568 0.33
569 0.36
570 0.39
571 0.47
572 0.45
573 0.42
574 0.41
575 0.45
576 0.53
577 0.57
578 0.57
579 0.55
580 0.59
581 0.57
582 0.58
583 0.55
584 0.45
585 0.37
586 0.28
587 0.24
588 0.18
589 0.16
590 0.12
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.1
595 0.09
596 0.13
597 0.19
598 0.2
599 0.3
600 0.38
601 0.45
602 0.51
603 0.55
604 0.56
605 0.58
606 0.62
607 0.54
608 0.52
609 0.53
610 0.52
611 0.46
612 0.46
613 0.41
614 0.43
615 0.47
616 0.44
617 0.42
618 0.38
619 0.37
620 0.34
621 0.33
622 0.29
623 0.26
624 0.24
625 0.19
626 0.2
627 0.18
628 0.19
629 0.16
630 0.15
631 0.12
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.14
636 0.19
637 0.23
638 0.23
639 0.24
640 0.26
641 0.27
642 0.24
643 0.24
644 0.25
645 0.25
646 0.27
647 0.3
648 0.36
649 0.36
650 0.41
651 0.4
652 0.44
653 0.5
654 0.54
655 0.51
656 0.5
657 0.55
658 0.58
659 0.62
660 0.62
661 0.55
662 0.55
663 0.62
664 0.66
665 0.66
666 0.63
667 0.57
668 0.48
669 0.45
670 0.43
671 0.37
672 0.3
673 0.31
674 0.3
675 0.3
676 0.29
677 0.29
678 0.24
679 0.23
680 0.23
681 0.23
682 0.27
683 0.28
684 0.3
685 0.34
686 0.37
687 0.37
688 0.34
689 0.34
690 0.31
691 0.35
692 0.39
693 0.45
694 0.5
695 0.57
696 0.6
697 0.59
698 0.55
699 0.51
700 0.5
701 0.42
702 0.39
703 0.35
704 0.31
705 0.27
706 0.27
707 0.23
708 0.19
709 0.18
710 0.18
711 0.15
712 0.14
713 0.14
714 0.15
715 0.15
716 0.16
717 0.18
718 0.23
719 0.27
720 0.29
721 0.38
722 0.44
723 0.53
724 0.59
725 0.63
726 0.57
727 0.55
728 0.57
729 0.58
730 0.52
731 0.45
732 0.41
733 0.38
734 0.38
735 0.41
736 0.39
737 0.29
738 0.36
739 0.35
740 0.4
741 0.43
742 0.48
743 0.47
744 0.46
745 0.52
746 0.53
747 0.59
748 0.57
749 0.52
750 0.49
751 0.48
752 0.5
753 0.48
754 0.44
755 0.37
756 0.34
757 0.39
758 0.35
759 0.33
760 0.35
761 0.39
762 0.37
763 0.39
764 0.4
765 0.36
766 0.39
767 0.4
768 0.37
769 0.34
770 0.33
771 0.32
772 0.32
773 0.3
774 0.27
775 0.26
776 0.23
777 0.21
778 0.2
779 0.22
780 0.23
781 0.3
782 0.39
783 0.47
784 0.55
785 0.61
786 0.67
787 0.64
788 0.62
789 0.54
790 0.53
791 0.47
792 0.4
793 0.35
794 0.3
795 0.3
796 0.28
797 0.27
798 0.22
799 0.21
800 0.25
801 0.25
802 0.26
803 0.26
804 0.26
805 0.26
806 0.28
807 0.24
808 0.2
809 0.18
810 0.2
811 0.19
812 0.2
813 0.19
814 0.19
815 0.19
816 0.2
817 0.21
818 0.19
819 0.23
820 0.24
821 0.27
822 0.24
823 0.24
824 0.23
825 0.21
826 0.19
827 0.16
828 0.13
829 0.09
830 0.08
831 0.08
832 0.07
833 0.07
834 0.06
835 0.05
836 0.06
837 0.06
838 0.07
839 0.08
840 0.09
841 0.1
842 0.1
843 0.11
844 0.11
845 0.11
846 0.15
847 0.14
848 0.15
849 0.15
850 0.18
851 0.18
852 0.19
853 0.18
854 0.15
855 0.15
856 0.13
857 0.12
858 0.09
859 0.08
860 0.07
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.07
865 0.07
866 0.08
867 0.1
868 0.11
869 0.11
870 0.12
871 0.13
872 0.15
873 0.16
874 0.16
875 0.16
876 0.15
877 0.15
878 0.13
879 0.12
880 0.1
881 0.14
882 0.15
883 0.14
884 0.18
885 0.21
886 0.22
887 0.25
888 0.3
889 0.35
890 0.41
891 0.41
892 0.46
893 0.53
894 0.58
895 0.59
896 0.58
897 0.54
898 0.52
899 0.53
900 0.47
901 0.4
902 0.39
903 0.34
904 0.31
905 0.26
906 0.21
907 0.19
908 0.16
909 0.13
910 0.08
911 0.07
912 0.1
913 0.09
914 0.1
915 0.11
916 0.13
917 0.16
918 0.17
919 0.22
920 0.21
921 0.23
922 0.22
923 0.23
924 0.26
925 0.32
926 0.38
927 0.34
928 0.36
929 0.36
930 0.41
931 0.4
932 0.37
933 0.3
934 0.25
935 0.26
936 0.23
937 0.22
938 0.17
939 0.17
940 0.17
941 0.16
942 0.13
943 0.1
944 0.09
945 0.09
946 0.07
947 0.06
948 0.06
949 0.06
950 0.06
951 0.08
952 0.09
953 0.11
954 0.12
955 0.17
956 0.26
957 0.32
958 0.37
959 0.46
960 0.53
961 0.61
962 0.71
963 0.75
964 0.73
965 0.75
966 0.78
967 0.78
968 0.75
969 0.67
970 0.58
971 0.51
972 0.45
973 0.4
974 0.33
975 0.25
976 0.23
977 0.21
978 0.2
979 0.18
980 0.18
981 0.15
982 0.19
983 0.23
984 0.26
985 0.27
986 0.27
987 0.31
988 0.32
989 0.31
990 0.28
991 0.21
992 0.15
993 0.14
994 0.14
995 0.09
996 0.08
997 0.06
998 0.06
999 0.05
1000 0.08
1001 0.11
1002 0.14
1003 0.17
1004 0.18
1005 0.19
1006 0.21
1007 0.22
1008 0.23
1009 0.26
1010 0.27
1011 0.28
1012 0.32
1013 0.33
1014 0.34
1015 0.34
1016 0.33
1017 0.3
1018 0.32
1019 0.31
1020 0.27
1021 0.29
1022 0.29
1023 0.34
1024 0.34
1025 0.34
1026 0.31
1027 0.29
1028 0.3
1029 0.26
1030 0.24
1031 0.21
1032 0.18
1033 0.16
1034 0.15
1035 0.14
1036 0.12
1037 0.12
1038 0.12
1039 0.09
1040 0.1
1041 0.14
1042 0.18
1043 0.22
1044 0.25
1045 0.28
1046 0.36
1047 0.4
1048 0.45
1049 0.49
1050 0.47
1051 0.44
1052 0.44
1053 0.43
1054 0.41
1055 0.4
1056 0.38
1057 0.32
1058 0.34
1059 0.32
1060 0.31
1061 0.32
1062 0.3
1063 0.29
1064 0.26
1065 0.28
1066 0.27
1067 0.26
1068 0.24
1069 0.21
1070 0.25
1071 0.25
1072 0.23
1073 0.2
1074 0.17
1075 0.17
1076 0.17
1077 0.2
1078 0.14
1079 0.12
1080 0.13
1081 0.13
1082 0.13
1083 0.14
1084 0.2
1085 0.2
1086 0.22
1087 0.22
1088 0.22
1089 0.23
1090 0.25
1091 0.28
1092 0.3
1093 0.36
1094 0.41
1095 0.45
1096 0.46
1097 0.45
1098 0.46
1099 0.43
1100 0.4
1101 0.33
1102 0.3
1103 0.25
1104 0.26
1105 0.28
1106 0.26
1107 0.24
1108 0.27
1109 0.26
1110 0.25
1111 0.25
1112 0.23
1113 0.22
1114 0.24
1115 0.23
1116 0.17
1117 0.16
1118 0.14
1119 0.15
1120 0.19
1121 0.18
1122 0.16
1123 0.16
1124 0.15