Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3HVR6

Protein Details
Accession A0A0C3HVR6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-131EVEEKMDRRRKARREAREKAEREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-127RRRKARREAREKA
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_mito 9, mito 6.5, nucl 6, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLNQQAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAALGSAAPTAYGVSEKKDDEDDDDERFQDPENEVGLFAGGVYDKDDDEADRIYQEVEEKMDRRRKARREAREKAEREEYERNNPKIQQQFVDLKRALGTVSDEDWANLPEVGDLTGKNRRSKLAMKQRFYAVPDSVIAGARDSTELGTTVTDDGMASSGGDGVDGTMTNFAQIGAARDKVLKVKLDQASQGTDSVAGSATNIDPKGYLTSLAKSQAGEGEEQVGDIKRVRVLLESVIRTNPKHGPGWIAAARLEELAGKIVAARNVIARGCEFCPKNEDVWLENIRLNDNHNAKIIAANAIKANDNSVNLWIEAMKLESDSRAKKRVLRHALDHIPQSVTLWKEAVNLEEDPEDAKLLLAKSTELIPLSVELWLALARLETSENAQKVLNKARKAIPTSHEIWIAAARLQEQMGNANKISVMKRAVQELAKESAMLKREDWIAEAEKCEDEGAILTCVNIIRETLGWGLDEDDDRKDQWMEDAKSSIGRGKYETGRAIYAYALRVFVNSRKLWLAAADLEKNHGTREALWQLLEKAVEACPQAEVLWMMLAKEKWQAGEIDNARRVLGKAFNQNPNNEDIWLAAVKLEADNKQTEQARELLKTARQEAPTDRVWTKSVAFERQLGDVDAALDLVTQALQLFPGTAKLWMMKGQIYEGEGKLPLAREAYSTGTKACPKSIPLWLLFSRLEEKAGMVVKARSVLDRARLAVPKSAELWTESVRVERRANNISQAKVLMAKALQEVPTSGLLYSESIWHLEPRTQRKPRALEAIKKVDNDPILFVTIARIFWGERRLEKAQNWFEKAILLDSDLGDTWAWYYKFLLQHGTEEKRADVIAKCILSEPRHGEVWQTVAKDPKNATRGIEEILKIVVGKLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.3
3 0.22
4 0.2
5 0.15
6 0.12
7 0.1
8 0.09
9 0.08
10 0.09
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.28
38 0.27
39 0.31
40 0.29
41 0.24
42 0.21
43 0.16
44 0.15
45 0.15
46 0.14
47 0.09
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.11
52 0.1
53 0.13
54 0.18
55 0.19
56 0.21
57 0.23
58 0.24
59 0.25
60 0.3
61 0.29
62 0.3
63 0.31
64 0.29
65 0.27
66 0.27
67 0.23
68 0.22
69 0.21
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.17
74 0.16
75 0.15
76 0.1
77 0.09
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.11
88 0.13
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.11
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.19
98 0.21
99 0.3
100 0.38
101 0.42
102 0.48
103 0.57
104 0.62
105 0.69
106 0.76
107 0.78
108 0.81
109 0.86
110 0.88
111 0.89
112 0.83
113 0.78
114 0.78
115 0.69
116 0.65
117 0.64
118 0.59
119 0.6
120 0.65
121 0.62
122 0.59
123 0.59
124 0.6
125 0.59
126 0.57
127 0.49
128 0.46
129 0.52
130 0.49
131 0.55
132 0.47
133 0.4
134 0.38
135 0.35
136 0.29
137 0.2
138 0.2
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.13
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.12
155 0.19
156 0.24
157 0.29
158 0.31
159 0.32
160 0.37
161 0.44
162 0.51
163 0.55
164 0.61
165 0.59
166 0.62
167 0.64
168 0.62
169 0.57
170 0.51
171 0.41
172 0.32
173 0.29
174 0.26
175 0.22
176 0.19
177 0.17
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.19
220 0.22
221 0.21
222 0.2
223 0.28
224 0.32
225 0.33
226 0.34
227 0.32
228 0.31
229 0.29
230 0.28
231 0.19
232 0.16
233 0.13
234 0.11
235 0.09
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.09
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.12
246 0.11
247 0.13
248 0.11
249 0.13
250 0.16
251 0.18
252 0.18
253 0.16
254 0.16
255 0.17
256 0.16
257 0.15
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.16
273 0.2
274 0.21
275 0.22
276 0.24
277 0.26
278 0.25
279 0.28
280 0.27
281 0.25
282 0.25
283 0.24
284 0.25
285 0.24
286 0.3
287 0.28
288 0.24
289 0.21
290 0.2
291 0.2
292 0.16
293 0.14
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.12
310 0.13
311 0.2
312 0.19
313 0.18
314 0.23
315 0.24
316 0.25
317 0.25
318 0.26
319 0.2
320 0.26
321 0.27
322 0.23
323 0.23
324 0.23
325 0.21
326 0.2
327 0.21
328 0.22
329 0.23
330 0.22
331 0.22
332 0.21
333 0.2
334 0.21
335 0.19
336 0.17
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.15
342 0.13
343 0.15
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.07
359 0.12
360 0.17
361 0.21
362 0.26
363 0.28
364 0.32
365 0.39
366 0.48
367 0.53
368 0.51
369 0.52
370 0.54
371 0.58
372 0.56
373 0.49
374 0.4
375 0.32
376 0.28
377 0.24
378 0.19
379 0.14
380 0.12
381 0.11
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.07
405 0.07
406 0.06
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.03
417 0.03
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.07
422 0.1
423 0.11
424 0.12
425 0.12
426 0.13
427 0.16
428 0.25
429 0.28
430 0.25
431 0.28
432 0.33
433 0.36
434 0.38
435 0.39
436 0.33
437 0.32
438 0.35
439 0.33
440 0.28
441 0.24
442 0.21
443 0.18
444 0.16
445 0.12
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.11
453 0.12
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.14
459 0.14
460 0.13
461 0.13
462 0.15
463 0.16
464 0.18
465 0.19
466 0.18
467 0.19
468 0.19
469 0.19
470 0.16
471 0.15
472 0.14
473 0.14
474 0.16
475 0.15
476 0.12
477 0.12
478 0.13
479 0.13
480 0.14
481 0.13
482 0.14
483 0.14
484 0.14
485 0.14
486 0.12
487 0.12
488 0.11
489 0.09
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.1
517 0.09
518 0.12
519 0.19
520 0.2
521 0.2
522 0.21
523 0.2
524 0.21
525 0.21
526 0.21
527 0.14
528 0.13
529 0.14
530 0.17
531 0.2
532 0.22
533 0.24
534 0.21
535 0.21
536 0.2
537 0.19
538 0.16
539 0.14
540 0.12
541 0.11
542 0.1
543 0.09
544 0.1
545 0.11
546 0.13
547 0.18
548 0.17
549 0.18
550 0.18
551 0.18
552 0.18
553 0.17
554 0.15
555 0.12
556 0.15
557 0.15
558 0.14
559 0.16
560 0.16
561 0.16
562 0.15
563 0.13
564 0.11
565 0.1
566 0.17
567 0.17
568 0.17
569 0.17
570 0.18
571 0.17
572 0.18
573 0.17
574 0.11
575 0.09
576 0.09
577 0.1
578 0.1
579 0.09
580 0.08
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.07
585 0.05
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.08
590 0.08
591 0.09
592 0.12
593 0.12
594 0.11
595 0.12
596 0.14
597 0.12
598 0.21
599 0.23
600 0.26
601 0.29
602 0.29
603 0.28
604 0.27
605 0.26
606 0.21
607 0.22
608 0.21
609 0.28
610 0.34
611 0.42
612 0.45
613 0.46
614 0.45
615 0.43
616 0.4
617 0.31
618 0.24
619 0.16
620 0.15
621 0.13
622 0.11
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.08
627 0.1
628 0.09
629 0.12
630 0.13
631 0.14
632 0.19
633 0.22
634 0.22
635 0.22
636 0.25
637 0.25
638 0.25
639 0.26
640 0.24
641 0.24
642 0.26
643 0.29
644 0.29
645 0.28
646 0.3
647 0.31
648 0.33
649 0.33
650 0.35
651 0.32
652 0.28
653 0.28
654 0.28
655 0.25
656 0.27
657 0.28
658 0.28
659 0.28
660 0.3
661 0.3
662 0.29
663 0.29
664 0.23
665 0.19
666 0.14
667 0.13
668 0.09
669 0.08
670 0.06
671 0.05
672 0.04
673 0.04
674 0.03
675 0.03
676 0.03
677 0.03
678 0.03
679 0.03
680 0.04
681 0.04
682 0.07
683 0.07
684 0.08
685 0.09
686 0.1
687 0.11
688 0.14
689 0.15
690 0.15
691 0.15
692 0.16
693 0.16
694 0.16
695 0.18
696 0.15
697 0.15
698 0.14
699 0.14
700 0.14
701 0.14
702 0.13
703 0.11
704 0.11
705 0.11
706 0.13
707 0.17
708 0.18
709 0.18
710 0.18
711 0.21
712 0.26
713 0.26
714 0.27
715 0.25
716 0.26
717 0.29
718 0.34
719 0.34
720 0.31
721 0.36
722 0.34
723 0.35
724 0.33
725 0.31
726 0.28
727 0.24
728 0.23
729 0.17
730 0.17
731 0.17
732 0.19
733 0.17
734 0.15
735 0.16
736 0.15
737 0.19
738 0.19
739 0.16
740 0.17
741 0.2
742 0.23
743 0.25
744 0.27
745 0.29
746 0.33
747 0.33
748 0.35
749 0.34
750 0.3
751 0.29
752 0.28
753 0.23
754 0.21
755 0.22
756 0.19
757 0.21
758 0.19
759 0.22
760 0.24
761 0.28
762 0.31
763 0.32
764 0.37
765 0.4
766 0.41
767 0.45
768 0.47
769 0.44
770 0.42
771 0.38
772 0.32
773 0.3
774 0.28
775 0.21
776 0.16
777 0.16
778 0.16
779 0.18
780 0.18
781 0.15
782 0.16
783 0.16
784 0.17
785 0.16
786 0.14
787 0.11
788 0.11
789 0.11
790 0.11
791 0.11
792 0.1
793 0.11
794 0.12
795 0.14
796 0.15
797 0.19
798 0.27
799 0.34
800 0.44
801 0.52
802 0.58
803 0.65
804 0.7
805 0.71
806 0.74
807 0.73
808 0.72
809 0.73
810 0.76
811 0.7
812 0.66
813 0.61
814 0.55
815 0.5
816 0.41
817 0.34
818 0.26
819 0.24
820 0.21
821 0.2
822 0.19
823 0.17
824 0.16
825 0.14
826 0.13
827 0.12
828 0.16
829 0.22
830 0.23
831 0.24
832 0.31
833 0.36
834 0.41
835 0.46
836 0.52
837 0.56
838 0.6
839 0.62
840 0.56
841 0.51
842 0.47
843 0.43
844 0.35
845 0.26
846 0.19
847 0.15
848 0.15
849 0.16
850 0.13
851 0.13
852 0.11
853 0.1
854 0.1
855 0.15
856 0.14
857 0.14
858 0.16
859 0.2
860 0.25
861 0.26
862 0.32
863 0.27
864 0.34
865 0.42
866 0.45
867 0.44
868 0.41
869 0.4
870 0.35
871 0.34
872 0.31
873 0.25
874 0.24
875 0.26
876 0.25
877 0.25
878 0.27
879 0.32
880 0.3
881 0.35
882 0.37
883 0.34
884 0.37
885 0.36
886 0.36
887 0.33
888 0.36
889 0.33
890 0.3
891 0.3
892 0.35
893 0.37
894 0.4
895 0.41
896 0.44
897 0.44
898 0.43
899 0.43
900 0.4
901 0.4
902 0.38
903 0.39
904 0.31
905 0.28
906 0.26
907 0.24
908 0.19