Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3HFN1

Protein Details
Accession A0A0C3HFN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-107ATSPKPRSKTSTKKKASKKPKKVTAKPKAKSRPKKVLTPEEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-116SPKPRSKTSTKKKASKKPKKVTAKPKAKSRPKKVLTPEEKKKLRIKELK
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 9.5, cyto_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MLSTIARAAAKKVGAGAVRSSTNRVFQSIWHSQRLRTRENTEATLSGANISFTPRRTFATATKAHATSPKPRSKTSTKKKASKKPKKVTAKPKAKSRPKKVLTPEEKKKLRIKELKAVALSTPKLKPSTAWTVLVGEEVSESAAGGKSLASSTTDAAAKYKSLSPSEVESYNRKANSNKAENETLLRDWIKSYTPEQIRLANNARGLLKKLTGKSYGHQLQDDRIPKRLRSEMALFAQDRWASGDLKGVKLTDAAKLLRGEFLELPEGERKAYRDRAIADRERYVREYKAAFNRDPEFVKRARTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.24
4 0.23
5 0.26
6 0.27
7 0.3
8 0.28
9 0.32
10 0.31
11 0.31
12 0.28
13 0.27
14 0.34
15 0.4
16 0.42
17 0.45
18 0.45
19 0.48
20 0.55
21 0.59
22 0.57
23 0.54
24 0.55
25 0.54
26 0.57
27 0.55
28 0.51
29 0.45
30 0.39
31 0.33
32 0.27
33 0.21
34 0.17
35 0.14
36 0.11
37 0.14
38 0.15
39 0.16
40 0.2
41 0.2
42 0.23
43 0.26
44 0.29
45 0.3
46 0.36
47 0.38
48 0.39
49 0.43
50 0.4
51 0.38
52 0.41
53 0.4
54 0.4
55 0.46
56 0.5
57 0.48
58 0.51
59 0.57
60 0.62
61 0.69
62 0.7
63 0.72
64 0.73
65 0.79
66 0.86
67 0.9
68 0.91
69 0.91
70 0.91
71 0.9
72 0.91
73 0.93
74 0.92
75 0.93
76 0.93
77 0.92
78 0.88
79 0.88
80 0.88
81 0.88
82 0.88
83 0.87
84 0.87
85 0.8
86 0.82
87 0.8
88 0.8
89 0.8
90 0.79
91 0.79
92 0.78
93 0.77
94 0.75
95 0.73
96 0.69
97 0.69
98 0.68
99 0.64
100 0.63
101 0.64
102 0.62
103 0.56
104 0.49
105 0.4
106 0.35
107 0.31
108 0.25
109 0.21
110 0.19
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.2
115 0.28
116 0.26
117 0.26
118 0.24
119 0.24
120 0.24
121 0.24
122 0.17
123 0.09
124 0.06
125 0.05
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.14
152 0.17
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.23
158 0.26
159 0.26
160 0.25
161 0.25
162 0.29
163 0.36
164 0.4
165 0.39
166 0.39
167 0.4
168 0.38
169 0.39
170 0.34
171 0.26
172 0.21
173 0.19
174 0.14
175 0.13
176 0.14
177 0.14
178 0.13
179 0.15
180 0.21
181 0.23
182 0.26
183 0.27
184 0.32
185 0.32
186 0.35
187 0.38
188 0.32
189 0.31
190 0.3
191 0.3
192 0.25
193 0.26
194 0.22
195 0.22
196 0.24
197 0.25
198 0.27
199 0.3
200 0.3
201 0.29
202 0.37
203 0.39
204 0.36
205 0.36
206 0.34
207 0.33
208 0.39
209 0.44
210 0.36
211 0.38
212 0.39
213 0.38
214 0.43
215 0.45
216 0.4
217 0.38
218 0.4
219 0.39
220 0.39
221 0.42
222 0.37
223 0.32
224 0.34
225 0.28
226 0.24
227 0.21
228 0.19
229 0.16
230 0.15
231 0.22
232 0.2
233 0.21
234 0.22
235 0.19
236 0.18
237 0.2
238 0.2
239 0.16
240 0.19
241 0.18
242 0.21
243 0.22
244 0.22
245 0.22
246 0.21
247 0.21
248 0.18
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.21
253 0.23
254 0.23
255 0.21
256 0.22
257 0.23
258 0.27
259 0.34
260 0.34
261 0.35
262 0.39
263 0.46
264 0.53
265 0.58
266 0.55
267 0.56
268 0.56
269 0.56
270 0.55
271 0.51
272 0.45
273 0.43
274 0.42
275 0.42
276 0.48
277 0.5
278 0.49
279 0.52
280 0.52
281 0.51
282 0.52
283 0.49
284 0.45
285 0.41