FuNGI

A0A0C7N465

Protein Details

Accession

A0A0C7N465

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-40	QLRRDFLKSRLRKNGTPKPFVK	Hydrophilic
536-563	DQDNGKSSRKNSPRKKSPRSSLLGPRIH	Hydrophilic
642-672	IKELKEKVARHPSNKERMKHLVKKLVKLKDG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
285-293	KRGNVKRKT
542-555	SSRKNSPRKKSPRS
648-661	KVARHPSNKERMKH

Subcellular Location(s)

nucl 24, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSNPLKSSNSASPFIKREQLRRDFLKSRLRKNGTPKPFVKKEDPDSYDERTSRLLNGGENGNGSISGAHPGIKREKADPSQYNEFPLRAVSHEHLENIRTHILKFQSKKKIEPAKDLHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEIAEYKRKADTERTNGNAGPSGTGTNTPAPTDSGAVTSAAPSTAAASQTDTPVGTPAQTPVQTEAKEEANSMDITEGSSQAENSKKTPAPPVTRLEDAGVADDPTKVGRVKYDGKETPVMADGKEDPFADVAPDGGGRFKRGNVKRKTRSLKLLDENAKRLRFEEFYPWVLEDFDGLNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVENDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIDEAEKRMEKNGKGIPRWLMKHLDDIGTTTTRYDRTQRRLRAVDARQGGEDDRDDNSEVELDFDEEFADDEEAPIIDGDEKENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDEDQDEVDDLFGEKKIDDEGERTMKALQKSDMAALYESDDESKLNPYLSESEADPEEEKEKEEDQDNGKSSRKNSPRKKSPRSSLLGPRIHVKSIKNFQVVLKAEKSVLKSFPEGIWNPHIKSERSSAPVGDVSSPVVKVEGSVEDPDFLTEKDIINVVSGRKMNLKQLIKELKEKVARHPSNKERMKHLVKKLVKLKDGYLELTTAESG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.51
3	0.48
4	0.52
5	0.58
6	0.64
7	0.66
8	0.67
9	0.72
10	0.7
11	0.73
12	0.75
13	0.73
14	0.74
15	0.77
16	0.77
17	0.76
18	0.8
19	0.82
20	0.81
21	0.82
22	0.79
23	0.78
24	0.8
25	0.79
26	0.78
27	0.76
28	0.75
29	0.76
30	0.72
31	0.68
32	0.64
33	0.64
34	0.62
35	0.54
36	0.47
37	0.4
38	0.37
39	0.33
40	0.33
41	0.29
42	0.23
43	0.26
44	0.27
45	0.24
46	0.23
47	0.22
48	0.17
49	0.15
50	0.14
51	0.1
52	0.08
53	0.1
54	0.09
55	0.13
56	0.14
57	0.19
58	0.26
59	0.31
60	0.33
61	0.34
62	0.42
63	0.46
64	0.54
65	0.55
66	0.56
67	0.6
68	0.58
69	0.6
70	0.53
71	0.46
72	0.37
73	0.33
74	0.27
75	0.2
76	0.24
77	0.21
78	0.23
79	0.24
80	0.26
81	0.26
82	0.27
83	0.27
84	0.26
85	0.28
86	0.24
87	0.23
88	0.26
89	0.31
90	0.37
91	0.42
92	0.48
93	0.54
94	0.57
95	0.62
96	0.66
97	0.7
98	0.67
99	0.7
100	0.68
101	0.65
102	0.68
103	0.67
104	0.6
105	0.56
106	0.52
107	0.49
108	0.53
109	0.47
110	0.46
111	0.5
112	0.54
113	0.56
114	0.65
115	0.69
116	0.67
117	0.67
118	0.67
119	0.63
120	0.58
121	0.56
122	0.47
123	0.38
124	0.29
125	0.31
126	0.3
127	0.34
128	0.37
129	0.32
130	0.31
131	0.31
132	0.34
133	0.36
134	0.39
135	0.42
136	0.4
137	0.43
138	0.49
139	0.5
140	0.49
141	0.52
142	0.53
143	0.51
144	0.56
145	0.55
146	0.51
147	0.5
148	0.48
149	0.42
150	0.33
151	0.25
152	0.18
153	0.16
154	0.13
155	0.14
156	0.15
157	0.15
158	0.15
159	0.15
160	0.15
161	0.15
162	0.15
163	0.15
164	0.13
165	0.1
166	0.1
167	0.11
168	0.1
169	0.09
170	0.09
171	0.07
172	0.07
173	0.06
174	0.07
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.1
179	0.11
180	0.12
181	0.13
182	0.11
183	0.1
184	0.11
185	0.1
186	0.09
187	0.08
188	0.09
189	0.13
190	0.14
191	0.15
192	0.17
193	0.22
194	0.21
195	0.22
196	0.23
197	0.22
198	0.21
199	0.21
200	0.17
201	0.14
202	0.14
203	0.12
204	0.1
205	0.07
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.11
213	0.15
214	0.15
215	0.16
216	0.22
217	0.22
218	0.24
219	0.32
220	0.36
221	0.39
222	0.43
223	0.46
224	0.44
225	0.44
226	0.43
227	0.36
228	0.3
229	0.23
230	0.19
231	0.15
232	0.11
233	0.1
234	0.09
235	0.08
236	0.07
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.09
241	0.14
242	0.22
243	0.25
244	0.33
245	0.33
246	0.36
247	0.38
248	0.37
249	0.33
250	0.29
251	0.26
252	0.17
253	0.17
254	0.16
255	0.14
256	0.15
257	0.14
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.09
262	0.07
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.07
268	0.07
269	0.09
270	0.1
271	0.13
272	0.23
273	0.3
274	0.4
275	0.47
276	0.58
277	0.64
278	0.73
279	0.78
280	0.74
281	0.75
282	0.71
283	0.7
284	0.64
285	0.65
286	0.63
287	0.59
288	0.59
289	0.55
290	0.5
291	0.42
292	0.37
293	0.32
294	0.25
295	0.24
296	0.25
297	0.23
298	0.23
299	0.24
300	0.23
301	0.21
302	0.19
303	0.17
304	0.11
305	0.08
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.04
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.08
341	0.08
342	0.11
343	0.12
344	0.15
345	0.19
346	0.27
347	0.36
348	0.38
349	0.39
350	0.38
351	0.38
352	0.36
353	0.34
354	0.29
355	0.2
356	0.17
357	0.18
358	0.17
359	0.16
360	0.15
361	0.15
362	0.13
363	0.16
364	0.2
365	0.17
366	0.23
367	0.28
368	0.32
369	0.32
370	0.35
371	0.36
372	0.37
373	0.39
374	0.36
375	0.36
376	0.31
377	0.34
378	0.32
379	0.28
380	0.22
381	0.21
382	0.2
383	0.16
384	0.15
385	0.11
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.2
390	0.26
391	0.35
392	0.44
393	0.49
394	0.55
395	0.57
396	0.59
397	0.61
398	0.57
399	0.55
400	0.49
401	0.44
402	0.37
403	0.35
404	0.31
405	0.23
406	0.2
407	0.13
408	0.11
409	0.11
410	0.12
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.1
415	0.09
416	0.08
417	0.08
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.07
435	0.12
436	0.13
437	0.14
438	0.15
439	0.15
440	0.18
441	0.23
442	0.31
443	0.35
444	0.37
445	0.4
446	0.42
447	0.45
448	0.51
449	0.5
450	0.44
451	0.37
452	0.35
453	0.33
454	0.32
455	0.29
456	0.19
457	0.15
458	0.13
459	0.12
460	0.12
461	0.11
462	0.08
463	0.09
464	0.1
465	0.1
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.07
473	0.07
474	0.08
475	0.09
476	0.09
477	0.11
478	0.15
479	0.19
480	0.19
481	0.2
482	0.22
483	0.25
484	0.26
485	0.27
486	0.23
487	0.22
488	0.22
489	0.24
490	0.22
491	0.19
492	0.17
493	0.15
494	0.15
495	0.12
496	0.12
497	0.11
498	0.09
499	0.09
500	0.09
501	0.12
502	0.11
503	0.11
504	0.11
505	0.12
506	0.15
507	0.16
508	0.16
509	0.14
510	0.15
511	0.16
512	0.17
513	0.16
514	0.14
515	0.15
516	0.14
517	0.15
518	0.15
519	0.16
520	0.18
521	0.19
522	0.22
523	0.24
524	0.3
525	0.32
526	0.33
527	0.36
528	0.37
529	0.38
530	0.44
531	0.5
532	0.54
533	0.62
534	0.69
535	0.76
536	0.84
537	0.91
538	0.91
539	0.91
540	0.9
541	0.86
542	0.83
543	0.82
544	0.81
545	0.75
546	0.66
547	0.64
548	0.56
549	0.53
550	0.49
551	0.42
552	0.42
553	0.46
554	0.52
555	0.48
556	0.47
557	0.45
558	0.5
559	0.49
560	0.45
561	0.38
562	0.32
563	0.31
564	0.33
565	0.36
566	0.31
567	0.31
568	0.28
569	0.28
570	0.29
571	0.29
572	0.33
573	0.31
574	0.31
575	0.37
576	0.39
577	0.37
578	0.42
579	0.44
580	0.39
581	0.4
582	0.42
583	0.4
584	0.39
585	0.4
586	0.34
587	0.33
588	0.34
589	0.32
590	0.27
591	0.21
592	0.19
593	0.19
594	0.19
595	0.15
596	0.13
597	0.12
598	0.1
599	0.12
600	0.12
601	0.13
602	0.15
603	0.16
604	0.16
605	0.17
606	0.17
607	0.17
608	0.14
609	0.14
610	0.13
611	0.14
612	0.14
613	0.15
614	0.14
615	0.15
616	0.17
617	0.16
618	0.2
619	0.21
620	0.22
621	0.28
622	0.3
623	0.36
624	0.42
625	0.47
626	0.45
627	0.54
628	0.62
629	0.58
630	0.64
631	0.61
632	0.61
633	0.63
634	0.61
635	0.61
636	0.63
637	0.66
638	0.66
639	0.72
640	0.73
641	0.76
642	0.82
643	0.77
644	0.73
645	0.76
646	0.79
647	0.78
648	0.78
649	0.78
650	0.76
651	0.81
652	0.82
653	0.81
654	0.76
655	0.69
656	0.63
657	0.61
658	0.58
659	0.51
660	0.43
661	0.35
662	0.29

A0A0C7N465

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer