Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BPF0

Protein Details
Accession Q6BPF0    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-251RFLPMFRKRNVARKKSKKIGEKKEKKVYTPBasic
268-293GEYFLGKKEKERKKLQEKRDKQEEATBasic
311-353SYENKLVTKEKSHKKDKKDKKDKKEKKDKKRSKHNDDDEEGSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-247RKRNVARKKSKKIGEKKEKK
274-286KKEKERKKLQEKR
319-343KEKSHKKDKKDKKDKKEKKDKKRSK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG dha:DEHA2E14146g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MVSTHNRDKPWDTEDIDKWSIEEFKPEDNASGLHFTEESSFMTLFPKYREQYLRTIWSDVTRNLDKYFIDCQLDLVEGSMTVKTTRKTFDPAIILKARDLIKLLARSVPFPQAVKILQDDIACDVIKIGNFVTNKDRFVKRRQRLVGPNGNTLKALELLTKCYILVQGNTVSAMGPFKGLKEVRRVVEDCMNNVHPIYYIKELMIKQELAKNPELAHEDWSRFLPMFRKRNVARKKSKKIGEKKEKKVYTPFPPAQLPRKVDLQIESGEYFLGKKEKERKKLQEKRDKQEEATEVKKQERLKDFEAPEENSYENKLVTKEKSHKKDKKDKKDKKEKKDKKRSKHNDDDEEGSSSKKSRHD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.5
3 0.47
4 0.41
5 0.37
6 0.33
7 0.35
8 0.27
9 0.3
10 0.24
11 0.26
12 0.3
13 0.3
14 0.29
15 0.25
16 0.25
17 0.21
18 0.23
19 0.19
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.16
24 0.17
25 0.15
26 0.14
27 0.14
28 0.13
29 0.15
30 0.16
31 0.16
32 0.19
33 0.26
34 0.25
35 0.33
36 0.39
37 0.41
38 0.47
39 0.51
40 0.55
41 0.5
42 0.51
43 0.44
44 0.43
45 0.43
46 0.38
47 0.38
48 0.34
49 0.34
50 0.32
51 0.33
52 0.28
53 0.27
54 0.29
55 0.26
56 0.25
57 0.22
58 0.22
59 0.21
60 0.21
61 0.17
62 0.14
63 0.1
64 0.07
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.11
70 0.12
71 0.15
72 0.18
73 0.2
74 0.26
75 0.27
76 0.31
77 0.35
78 0.35
79 0.39
80 0.4
81 0.37
82 0.32
83 0.35
84 0.3
85 0.24
86 0.23
87 0.19
88 0.2
89 0.22
90 0.23
91 0.22
92 0.21
93 0.22
94 0.23
95 0.25
96 0.22
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.19
101 0.19
102 0.18
103 0.15
104 0.16
105 0.15
106 0.15
107 0.13
108 0.14
109 0.12
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.1
117 0.1
118 0.13
119 0.19
120 0.2
121 0.22
122 0.28
123 0.33
124 0.33
125 0.43
126 0.52
127 0.53
128 0.6
129 0.63
130 0.66
131 0.68
132 0.73
133 0.72
134 0.64
135 0.65
136 0.57
137 0.52
138 0.44
139 0.36
140 0.27
141 0.19
142 0.16
143 0.12
144 0.11
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.1
166 0.12
167 0.14
168 0.2
169 0.24
170 0.24
171 0.28
172 0.29
173 0.26
174 0.32
175 0.3
176 0.24
177 0.24
178 0.24
179 0.2
180 0.19
181 0.16
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.18
192 0.16
193 0.15
194 0.2
195 0.23
196 0.22
197 0.23
198 0.22
199 0.2
200 0.23
201 0.25
202 0.2
203 0.22
204 0.21
205 0.2
206 0.2
207 0.21
208 0.19
209 0.15
210 0.16
211 0.19
212 0.25
213 0.32
214 0.33
215 0.41
216 0.44
217 0.54
218 0.63
219 0.66
220 0.68
221 0.72
222 0.8
223 0.81
224 0.85
225 0.85
226 0.86
227 0.87
228 0.87
229 0.87
230 0.86
231 0.88
232 0.83
233 0.77
234 0.75
235 0.71
236 0.68
237 0.68
238 0.61
239 0.54
240 0.56
241 0.57
242 0.56
243 0.56
244 0.51
245 0.44
246 0.46
247 0.43
248 0.39
249 0.36
250 0.31
251 0.25
252 0.25
253 0.22
254 0.17
255 0.16
256 0.14
257 0.12
258 0.11
259 0.14
260 0.12
261 0.19
262 0.29
263 0.39
264 0.49
265 0.59
266 0.67
267 0.75
268 0.84
269 0.88
270 0.89
271 0.89
272 0.9
273 0.9
274 0.83
275 0.74
276 0.72
277 0.67
278 0.62
279 0.57
280 0.53
281 0.46
282 0.45
283 0.48
284 0.44
285 0.47
286 0.49
287 0.5
288 0.49
289 0.55
290 0.53
291 0.56
292 0.58
293 0.52
294 0.45
295 0.41
296 0.37
297 0.29
298 0.3
299 0.23
300 0.19
301 0.18
302 0.19
303 0.22
304 0.26
305 0.34
306 0.42
307 0.51
308 0.6
309 0.69
310 0.75
311 0.8
312 0.87
313 0.89
314 0.9
315 0.91
316 0.92
317 0.92
318 0.96
319 0.96
320 0.96
321 0.96
322 0.95
323 0.95
324 0.96
325 0.96
326 0.95
327 0.96
328 0.96
329 0.95
330 0.96
331 0.94
332 0.93
333 0.87
334 0.81
335 0.72
336 0.66
337 0.55
338 0.46
339 0.37
340 0.31