FuNGI

A0A0C7NC61

Protein Details

Accession

A0A0C7NC61

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-53	LPDAPIGKRKTRKDYQVCIATE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MTGTPTGLELYHLTLQRQSNYVHSCVGHFVDLPDAPIGKRKTRKDYQVCIATETHLELYDLEEGDFRRLALIPIFATITAMQSLPVETNYSYLVLVTDSGNLSLLQFVNDAKAIRLHSLFNEPFARSGLRKVAPQKHIEVDPQGRCIFVSATERNKLCYQTDFRNNILNVSSPLEFQKPNRITISTTVCDVAFDNPTYASLEIDTTDGSKYLAFYMLDLGLNHIIQQSETLLPSSASFLVAVPNLERYGVNARSEQHESQANDSINSFVIVGLDSRLMLKDAHGYFSLEVNLPTRTLESLTIISAAVHKLKKEFFLLVQCSNGDLYKVKIIPNEAFNFCPKVTVVYFDSIAPSSRLHIFRNGLLLSLQELSGYSLYEFESLGNDENLLTSDEPAEHLKISPTSQLENLSVLHQSGSSNPILASEVLESNPLTLLMSQYKRDLKCLKSGVNFSDLITSPLPPKASGLWSIRLTSDPWHRLILLALPKTTMVLKVEDGTLEELEAANNKFKTDNDSTIYAGLMGQRTIIQVCENSMLQIDYEGRTTKMSINSEWLPPAGIKILRATSSSSQLALALSNNEVVYFELDITAGMETLNEYQERLELPNRITDLSLCDVLRSDFLAVGCQDSSVKVYGLKLGSDDSFLEMLSMQVLLSPPSSVQFMPSKASLLLHVGLDSGVYIRSSVDKFDGQLFDLRTKFLGSRPVRITPLPHVDHNIVSQAEEEEGEEEEEEGHGEEEKEPEAHASLSESSCVVLHCDKTWLSYETDDMFYVRPFILSKNVSLEAIAAFRTSDIKSNGCCAISSRGSLLIGRLDKFTKRNEWFQQNEETDADDEALKTTQYRGHRIISDPFDQKLFYSVENSTIGKACRVSAHRSGFSLDINTKENKYFNIDDICLDAQIAKFGTSNTYLVLSTKSMHLKTFLIQKGSKENKSSLHIEFVHDTVVGETIHSIASFADRLLVPFSSNLVLYALGRKQLLKKSISSIPPSVSKVVSVCTWKNDRVAIGDIHESVTLFIFDKTSNEFIGLADDVVKRHVTTITFLDKSTIIGGDRFGNVWVLRVPPHIEKLISEEYSFFASKYEKPGSNELPRNIMECPCKWDMINHFYVNDIPISFRVVKGLDMSDRVSILYTGLQGTIACLVPLLTKNEIDFYHALEDTLRNADETFFMDNETESTFLDNDYRDEAGIAGNLVAKAKQSNPRPMIEGAYSFVGREHLMYRSYYAPVKGVVDGDFCESFLSLYPSEQEFLVNRMSVKHVKQVQSRLNEMRTSNI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.31
3	0.32
4	0.34
5	0.31
6	0.34
7	0.37
8	0.38
9	0.36
10	0.33
11	0.31
12	0.32
13	0.32
14	0.25
15	0.21
16	0.2
17	0.2
18	0.2
19	0.2
20	0.18
21	0.18
22	0.17
23	0.24
24	0.29
25	0.33
26	0.42
27	0.49
28	0.57
29	0.65
30	0.76
31	0.78
32	0.82
33	0.83
34	0.83
35	0.75
36	0.69
37	0.61
38	0.51
39	0.43
40	0.36
41	0.27
42	0.18
43	0.17
44	0.14
45	0.15
46	0.16
47	0.15
48	0.13
49	0.15
50	0.15
51	0.18
52	0.18
53	0.16
54	0.14
55	0.14
56	0.16
57	0.15
58	0.17
59	0.14
60	0.15
61	0.16
62	0.14
63	0.15
64	0.13
65	0.13
66	0.11
67	0.11
68	0.1
69	0.1
70	0.11
71	0.1
72	0.11
73	0.12
74	0.11
75	0.12
76	0.13
77	0.13
78	0.12
79	0.11
80	0.1
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.1
85	0.1
86	0.1
87	0.1
88	0.1
89	0.1
90	0.12
91	0.11
92	0.1
93	0.1
94	0.1
95	0.12
96	0.14
97	0.14
98	0.12
99	0.16
100	0.17
101	0.2
102	0.21
103	0.21
104	0.21
105	0.3
106	0.3
107	0.31
108	0.33
109	0.3
110	0.3
111	0.3
112	0.31
113	0.23
114	0.28
115	0.31
116	0.3
117	0.35
118	0.44
119	0.51
120	0.55
121	0.58
122	0.58
123	0.55
124	0.56
125	0.53
126	0.52
127	0.51
128	0.47
129	0.48
130	0.43
131	0.37
132	0.34
133	0.32
134	0.24
135	0.19
136	0.24
137	0.25
138	0.31
139	0.38
140	0.39
141	0.41
142	0.44
143	0.43
144	0.38
145	0.4
146	0.39
147	0.42
148	0.52
149	0.52
150	0.5
151	0.55
152	0.53
153	0.47
154	0.43
155	0.35
156	0.27
157	0.26
158	0.25
159	0.17
160	0.2
161	0.22
162	0.23
163	0.23
164	0.32
165	0.31
166	0.35
167	0.37
168	0.36
169	0.34
170	0.38
171	0.44
172	0.34
173	0.33
174	0.3
175	0.27
176	0.26
177	0.24
178	0.2
179	0.16
180	0.15
181	0.14
182	0.13
183	0.14
184	0.16
185	0.15
186	0.12
187	0.1
188	0.1
189	0.09
190	0.1
191	0.09
192	0.08
193	0.09
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.11
200	0.1
201	0.1
202	0.12
203	0.13
204	0.14
205	0.13
206	0.14
207	0.13
208	0.13
209	0.13
210	0.12
211	0.11
212	0.09
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.11
217	0.11
218	0.1
219	0.1
220	0.11
221	0.12
222	0.11
223	0.09
224	0.09
225	0.09
226	0.1
227	0.11
228	0.11
229	0.09
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.12
235	0.19
236	0.21
237	0.22
238	0.23
239	0.25
240	0.29
241	0.34
242	0.32
243	0.28
244	0.31
245	0.31
246	0.32
247	0.37
248	0.32
249	0.28
250	0.27
251	0.25
252	0.18
253	0.17
254	0.14
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.08
265	0.07
266	0.08
267	0.15
268	0.15
269	0.18
270	0.18
271	0.19
272	0.19
273	0.2
274	0.21
275	0.14
276	0.14
277	0.13
278	0.13
279	0.12
280	0.12
281	0.11
282	0.1
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.12
287	0.12
288	0.12
289	0.11
290	0.1
291	0.1
292	0.11
293	0.14
294	0.15
295	0.15
296	0.18
297	0.2
298	0.22
299	0.23
300	0.23
301	0.21
302	0.28
303	0.31
304	0.29
305	0.29
306	0.27
307	0.25
308	0.24
309	0.21
310	0.14
311	0.11
312	0.12
313	0.15
314	0.17
315	0.18
316	0.19
317	0.22
318	0.24
319	0.28
320	0.31
321	0.28
322	0.28
323	0.29
324	0.3
325	0.26
326	0.25
327	0.19
328	0.18
329	0.16
330	0.19
331	0.19
332	0.18
333	0.19
334	0.17
335	0.19
336	0.16
337	0.16
338	0.14
339	0.12
340	0.12
341	0.17
342	0.19
343	0.19
344	0.24
345	0.25
346	0.25
347	0.3
348	0.27
349	0.22
350	0.2
351	0.18
352	0.14
353	0.13
354	0.11
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.08
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.07
367	0.08
368	0.09
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.09
383	0.1
384	0.11
385	0.12
386	0.13
387	0.15
388	0.15
389	0.16
390	0.17
391	0.19
392	0.18
393	0.17
394	0.17
395	0.14
396	0.13
397	0.11
398	0.1
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.11
403	0.09
404	0.1
405	0.09
406	0.1
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.08
411	0.09
412	0.08
413	0.09
414	0.09
415	0.08
416	0.08
417	0.07
418	0.06
419	0.05
420	0.07
421	0.12
422	0.14
423	0.15
424	0.2
425	0.26
426	0.27
427	0.33
428	0.37
429	0.34
430	0.4
431	0.43
432	0.44
433	0.42
434	0.45
435	0.4
436	0.37
437	0.35
438	0.27
439	0.27
440	0.22
441	0.2
442	0.17
443	0.16
444	0.14
445	0.16
446	0.16
447	0.12
448	0.13
449	0.12
450	0.14
451	0.19
452	0.2
453	0.23
454	0.23
455	0.24
456	0.23
457	0.22
458	0.21
459	0.21
460	0.26
461	0.24
462	0.24
463	0.24
464	0.24
465	0.23
466	0.22
467	0.23
468	0.2
469	0.19
470	0.17
471	0.17
472	0.17
473	0.17
474	0.17
475	0.13
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.1
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.1
484	0.08
485	0.07
486	0.07
487	0.06
488	0.06
489	0.08
490	0.08
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.11
495	0.12
496	0.19
497	0.2
498	0.23
499	0.22
500	0.24
501	0.24
502	0.24
503	0.23
504	0.16
505	0.13
506	0.11
507	0.08
508	0.06
509	0.06
510	0.06
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.06
515	0.06
516	0.07
517	0.09
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.08
522	0.07
523	0.07
524	0.08
525	0.06
526	0.08
527	0.08
528	0.09
529	0.09
530	0.1
531	0.13
532	0.16
533	0.18
534	0.17
535	0.21
536	0.22
537	0.22
538	0.22
539	0.18
540	0.14
541	0.12
542	0.12
543	0.1
544	0.09
545	0.08
546	0.1
547	0.11
548	0.11
549	0.12
550	0.14
551	0.13
552	0.17
553	0.17
554	0.15
555	0.14
556	0.14
557	0.13
558	0.11
559	0.09
560	0.06
561	0.06
562	0.07
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.05
569	0.05
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.05
574	0.04
575	0.04
576	0.03
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.06
585	0.07
586	0.08
587	0.1
588	0.12
589	0.12
590	0.15
591	0.15
592	0.15
593	0.14
594	0.13
595	0.13
596	0.12
597	0.13
598	0.11
599	0.1
600	0.1
601	0.1
602	0.1
603	0.08
604	0.07
605	0.06
606	0.06
607	0.07
608	0.07
609	0.08
610	0.07
611	0.07
612	0.07
613	0.06
614	0.07
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.09
620	0.1
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.09
626	0.09
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.05
632	0.05
633	0.04
634	0.04
635	0.03
636	0.03
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.05
641	0.04
642	0.05
643	0.07
644	0.06
645	0.08
646	0.1
647	0.11
648	0.13
649	0.13
650	0.13
651	0.12
652	0.13
653	0.11
654	0.1
655	0.1
656	0.08
657	0.07
658	0.07
659	0.06
660	0.06
661	0.05
662	0.04
663	0.03
664	0.03
665	0.03
666	0.04
667	0.06
668	0.06
669	0.07
670	0.09
671	0.09
672	0.1
673	0.13
674	0.13
675	0.12
676	0.15
677	0.15
678	0.17
679	0.17
680	0.16
681	0.14
682	0.14
683	0.14
684	0.13
685	0.22
686	0.2
687	0.26
688	0.29
689	0.32
690	0.33
691	0.33
692	0.33
693	0.28
694	0.35
695	0.3
696	0.27
697	0.27
698	0.26
699	0.26
700	0.24
701	0.21
702	0.13
703	0.12
704	0.11
705	0.09
706	0.08
707	0.07
708	0.07
709	0.05
710	0.05
711	0.05
712	0.05
713	0.05
714	0.05
715	0.05
716	0.05
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.05
721	0.06
722	0.06
723	0.07
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.07
729	0.06
730	0.07
731	0.08
732	0.08
733	0.08
734	0.08
735	0.07
736	0.08
737	0.08
738	0.08
739	0.08
740	0.09
741	0.09
742	0.12
743	0.11
744	0.13
745	0.15
746	0.15
747	0.15
748	0.15
749	0.16
750	0.15
751	0.16
752	0.15
753	0.13
754	0.12
755	0.1
756	0.11
757	0.09
758	0.08
759	0.08
760	0.09
761	0.14
762	0.14
763	0.15
764	0.17
765	0.18
766	0.17
767	0.17
768	0.16
769	0.1
770	0.1
771	0.09
772	0.06
773	0.05
774	0.05
775	0.08
776	0.08
777	0.11
778	0.13
779	0.15
780	0.15
781	0.18
782	0.2
783	0.18
784	0.17
785	0.15
786	0.19
787	0.18
788	0.18
789	0.16
790	0.15
791	0.15
792	0.15
793	0.14
794	0.13
795	0.14
796	0.14
797	0.15
798	0.16
799	0.19
800	0.22
801	0.26
802	0.3
803	0.32
804	0.4
805	0.45
806	0.52
807	0.52
808	0.53
809	0.56
810	0.48
811	0.47
812	0.39
813	0.32
814	0.24
815	0.21
816	0.18
817	0.1
818	0.09
819	0.08
820	0.08
821	0.07
822	0.06
823	0.08
824	0.12
825	0.15
826	0.21
827	0.23
828	0.26
829	0.29
830	0.31
831	0.36
832	0.36
833	0.39
834	0.35
835	0.33
836	0.3
837	0.28
838	0.25
839	0.22
840	0.19
841	0.13
842	0.14
843	0.14
844	0.16
845	0.17
846	0.18
847	0.15
848	0.17
849	0.17
850	0.15
851	0.15
852	0.14
853	0.17
854	0.2
855	0.24
856	0.3
857	0.35
858	0.35
859	0.35
860	0.36
861	0.32
862	0.29
863	0.27
864	0.2
865	0.17
866	0.19
867	0.2
868	0.2
869	0.21
870	0.22
871	0.19
872	0.24
873	0.23
874	0.23
875	0.25
876	0.24
877	0.22
878	0.24
879	0.23
880	0.17
881	0.15
882	0.13
883	0.09
884	0.1
885	0.1
886	0.07
887	0.08
888	0.08
889	0.1
890	0.11
891	0.11
892	0.1
893	0.11
894	0.11
895	0.11
896	0.12
897	0.11
898	0.1
899	0.14
900	0.18
901	0.18
902	0.19
903	0.2
904	0.2
905	0.22
906	0.31
907	0.29
908	0.3
909	0.31
910	0.33
911	0.41
912	0.47
913	0.48
914	0.42
915	0.42
916	0.41
917	0.44
918	0.46
919	0.37
920	0.36
921	0.33
922	0.32
923	0.3
924	0.27
925	0.22
926	0.18
927	0.17
928	0.11
929	0.11
930	0.08
931	0.07
932	0.07
933	0.06
934	0.06
935	0.06
936	0.06
937	0.05
938	0.06
939	0.06
940	0.06
941	0.08
942	0.08
943	0.09
944	0.11
945	0.11
946	0.1
947	0.1
948	0.12
949	0.1
950	0.1
951	0.09
952	0.08
953	0.08
954	0.08
955	0.13
956	0.13
957	0.14
958	0.15
959	0.17
960	0.22
961	0.28
962	0.34
963	0.32
964	0.33
965	0.36
966	0.43
967	0.46
968	0.45
969	0.41
970	0.38
971	0.4
972	0.4
973	0.37
974	0.3
975	0.26
976	0.21
977	0.21
978	0.21
979	0.22
980	0.21
981	0.25
982	0.3
983	0.31
984	0.33
985	0.33
986	0.3
987	0.28
988	0.29
989	0.24
990	0.21
991	0.21
992	0.19
993	0.18
994	0.17
995	0.14
996	0.11
997	0.11
998	0.09
999	0.08
1000	0.08
1001	0.08
1002	0.08
1003	0.1
1004	0.13
1005	0.14
1006	0.14
1007	0.14
1008	0.14
1009	0.13
1010	0.15
1011	0.13
1012	0.1
1013	0.12
1014	0.12
1015	0.12
1016	0.13
1017	0.14
1018	0.12
1019	0.13
1020	0.15
1021	0.13
1022	0.15
1023	0.2
1024	0.25
1025	0.25
1026	0.25
1027	0.26
1028	0.23
1029	0.23
1030	0.22
1031	0.18
1032	0.12
1033	0.11
1034	0.13
1035	0.13
1036	0.14
1037	0.13
1038	0.12
1039	0.14
1040	0.13
1041	0.14
1042	0.14
1043	0.14
1044	0.14
1045	0.17
1046	0.2
1047	0.2
1048	0.25
1049	0.25
1050	0.24
1051	0.23
1052	0.28
1053	0.31
1054	0.28
1055	0.26
1056	0.22
1057	0.21
1058	0.24
1059	0.24
1060	0.17
1061	0.14
1062	0.16
1063	0.18
1064	0.24
1065	0.3
1066	0.31
1067	0.35
1068	0.42
1069	0.48
1070	0.55
1071	0.6
1072	0.55
1073	0.54
1074	0.5
1075	0.48
1076	0.42
1077	0.4
1078	0.36
1079	0.3
1080	0.35
1081	0.31
1082	0.32
1083	0.3
1084	0.34
1085	0.36
1086	0.38
1087	0.43
1088	0.37
1089	0.35
1090	0.35
1091	0.36
1092	0.3
1093	0.24
1094	0.17
1095	0.12
1096	0.12
1097	0.17
1098	0.17
1099	0.16
1100	0.17
1101	0.16
1102	0.17
1103	0.18
1104	0.21
1105	0.18
1106	0.19
1107	0.21
1108	0.19
1109	0.19
1110	0.18
1111	0.16
1112	0.13
1113	0.12
1114	0.11
1115	0.1
1116	0.1
1117	0.09
1118	0.1
1119	0.09
1120	0.09
1121	0.11
1122	0.1
1123	0.08
1124	0.08
1125	0.08
1126	0.1
1127	0.14
1128	0.17
1129	0.17
1130	0.18
1131	0.18
1132	0.22
1133	0.22
1134	0.24
1135	0.21
1136	0.2
1137	0.22
1138	0.21
1139	0.21
1140	0.19
1141	0.2
1142	0.17
1143	0.2
1144	0.17
1145	0.14
1146	0.14
1147	0.15
1148	0.14
1149	0.16
1150	0.16
1151	0.13
1152	0.14
1153	0.14
1154	0.13
1155	0.14
1156	0.14
1157	0.13
1158	0.1
1159	0.12
1160	0.11
1161	0.11
1162	0.14
1163	0.14
1164	0.14
1165	0.16
1166	0.16
1167	0.14
1168	0.14
1169	0.14
1170	0.12
1171	0.12
1172	0.1
1173	0.08
1174	0.09
1175	0.1
1176	0.1
1177	0.1
1178	0.11
1179	0.14
1180	0.2
1181	0.28
1182	0.34
1183	0.44
1184	0.48
1185	0.51
1186	0.53
1187	0.52
1188	0.5
1189	0.44
1190	0.38
1191	0.3
1192	0.29
1193	0.26
1194	0.21
1195	0.2
1196	0.17
1197	0.15
1198	0.15
1199	0.15
1200	0.15
1201	0.17
1202	0.18
1203	0.2
1204	0.21
1205	0.25
1206	0.26
1207	0.26
1208	0.24
1209	0.25
1210	0.25
1211	0.24
1212	0.23
1213	0.21
1214	0.19
1215	0.18
1216	0.21
1217	0.19
1218	0.17
1219	0.16
1220	0.14
1221	0.13
1222	0.13
1223	0.17
1224	0.13
1225	0.14
1226	0.17
1227	0.18
1228	0.19
1229	0.18
1230	0.19
1231	0.16
1232	0.19
1233	0.21
1234	0.19
1235	0.18
1236	0.2
1237	0.26
1238	0.3
1239	0.32
1240	0.38
1241	0.43
1242	0.5
1243	0.57
1244	0.65
1245	0.67
1246	0.66
1247	0.72
1248	0.7
1249	0.66
1250	0.63

A0A0C7NC61

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer