Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4WW08

Protein Details
Accession Q4WW08    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-35ICHINPPKYRCPRCSTRTCSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007529  Znf_HIT  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070761  C:pre-snoRNP complex  
GO:0000492  P:box C/D snoRNP assembly  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0048254  P:snoRNA localization  
KEGG afm:AFUA_5G14010  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04438  zf-HIT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51083  ZF_HIT  
Amino Acid Sequences MSNSSGDTLLSDLCTICHINPPKYRCPRCSTRTCSLPCSRRHKLWSQCSGVRDPAAYLKRSELATESAFDRDFNFITKIERSLERAEREAEVRGIPLDGTTAADPAVLGLEHELGQDGPDAEAGSKRKRPEQGGYVKGEAGFLRGAQAAGVRVIRAPRGMSRNKANASKWNPKHKCLSWTVEWITANGKKVTRNCLESCTLAEAYDRIYPQPKERAGEIVPKAKKDGQTSESTGDREQELEPTSSEQQTQSETVGPPSAAPTGQSTTEPTPDQPSGSFESKHEIIPHRGISFYLHHPRTATKQPVLIPLAPTMTFTSALRDRSVLEFPTIYALPQPPEALRAEKESPMFLLEEDYLRTERPETDLSEAMVQDASQDQVDAGDLDIGNIDEKKVLEVLKQDLWEPVTADAAAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.12
4 0.21
5 0.27
6 0.35
7 0.43
8 0.49
9 0.57
10 0.67
11 0.75
12 0.73
13 0.75
14 0.77
15 0.78
16 0.82
17 0.8
18 0.78
19 0.79
20 0.76
21 0.76
22 0.76
23 0.75
24 0.74
25 0.75
26 0.74
27 0.73
28 0.75
29 0.76
30 0.76
31 0.79
32 0.79
33 0.77
34 0.74
35 0.71
36 0.68
37 0.61
38 0.52
39 0.42
40 0.34
41 0.35
42 0.36
43 0.32
44 0.29
45 0.29
46 0.3
47 0.3
48 0.3
49 0.23
50 0.22
51 0.22
52 0.22
53 0.21
54 0.2
55 0.19
56 0.18
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.17
62 0.15
63 0.18
64 0.2
65 0.21
66 0.22
67 0.23
68 0.25
69 0.3
70 0.36
71 0.36
72 0.36
73 0.36
74 0.34
75 0.34
76 0.32
77 0.26
78 0.2
79 0.17
80 0.15
81 0.14
82 0.11
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.11
110 0.14
111 0.19
112 0.23
113 0.26
114 0.32
115 0.37
116 0.42
117 0.45
118 0.51
119 0.55
120 0.57
121 0.58
122 0.53
123 0.48
124 0.43
125 0.37
126 0.27
127 0.19
128 0.13
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.08
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.14
145 0.22
146 0.26
147 0.29
148 0.35
149 0.41
150 0.44
151 0.48
152 0.45
153 0.47
154 0.51
155 0.57
156 0.57
157 0.62
158 0.61
159 0.6
160 0.66
161 0.6
162 0.58
163 0.53
164 0.52
165 0.43
166 0.46
167 0.44
168 0.4
169 0.36
170 0.3
171 0.29
172 0.25
173 0.24
174 0.2
175 0.21
176 0.21
177 0.24
178 0.3
179 0.29
180 0.32
181 0.31
182 0.32
183 0.33
184 0.29
185 0.27
186 0.23
187 0.2
188 0.15
189 0.14
190 0.1
191 0.1
192 0.12
193 0.11
194 0.09
195 0.13
196 0.14
197 0.18
198 0.24
199 0.25
200 0.24
201 0.24
202 0.27
203 0.24
204 0.31
205 0.3
206 0.32
207 0.32
208 0.31
209 0.33
210 0.32
211 0.34
212 0.3
213 0.32
214 0.28
215 0.31
216 0.33
217 0.33
218 0.31
219 0.29
220 0.26
221 0.21
222 0.18
223 0.15
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.14
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.13
235 0.14
236 0.14
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.08
247 0.08
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.14
253 0.15
254 0.18
255 0.18
256 0.16
257 0.2
258 0.19
259 0.2
260 0.17
261 0.19
262 0.21
263 0.23
264 0.23
265 0.19
266 0.24
267 0.24
268 0.25
269 0.26
270 0.25
271 0.27
272 0.3
273 0.32
274 0.28
275 0.27
276 0.26
277 0.24
278 0.23
279 0.27
280 0.33
281 0.31
282 0.31
283 0.32
284 0.34
285 0.38
286 0.43
287 0.41
288 0.34
289 0.37
290 0.39
291 0.44
292 0.45
293 0.41
294 0.33
295 0.28
296 0.28
297 0.23
298 0.23
299 0.17
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.17
304 0.19
305 0.21
306 0.21
307 0.2
308 0.21
309 0.23
310 0.26
311 0.21
312 0.19
313 0.18
314 0.17
315 0.2
316 0.18
317 0.15
318 0.15
319 0.16
320 0.16
321 0.17
322 0.18
323 0.15
324 0.17
325 0.2
326 0.2
327 0.19
328 0.24
329 0.25
330 0.28
331 0.28
332 0.26
333 0.25
334 0.22
335 0.21
336 0.15
337 0.15
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.15
342 0.15
343 0.15
344 0.16
345 0.15
346 0.15
347 0.19
348 0.21
349 0.21
350 0.25
351 0.26
352 0.26
353 0.27
354 0.26
355 0.22
356 0.19
357 0.16
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.09
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.12
379 0.14
380 0.15
381 0.16
382 0.2
383 0.25
384 0.27
385 0.28
386 0.28
387 0.29
388 0.29
389 0.27
390 0.24
391 0.2
392 0.17