Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C7MSD0

Protein Details
Accession A0A0C7MSD0    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-87QDALIKRRRKLSKEIVKLKKLKPVHydrophilic
350-384WGQLAKGYKTRRGKNQNRMKVKDRPRGKSGKATRQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-87KRRRKLSKEIVKLKKLKPV
116-140RSSGGRNHSGRITVRHRGGGHKRRI
334-384GGGRGKSKSKKLSVSPWGQLAKGYKTRRGKNQNRMKVKDRPRGKSGKATRQ
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022666  Rbsml_prot_L2_RNA-bd_dom  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR002171  Ribosomal_L2  
IPR005880  Ribosomal_L2_bac/org-type  
IPR022669  Ribosomal_L2_C  
IPR022671  Ribosomal_L2_CS  
IPR014726  Ribosomal_L2_dom3  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00181  Ribosomal_L2  
PF03947  Ribosomal_L2_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00467  RIBOSOMAL_L2  
Amino Acid Sequences MNLFRNLGTSFKRLPALSGLQNARQLTTGVRLSQMETKTDPTPVSARMLKIVPNDTDLVTLEKQDALIKRRRKLSKEIVKLKKLKPVSPGLRWYRAPIYPYLHNGRPIRTLTIAKRSSGGRNHSGRITVRHRGGGHKRRIRLVDFTRFTPGEQIVQRIEYDPGRTAHIALLKHSESGELSYILACDGLRAGDVVESYRKGVPKNLLQEMGGRIDPAILSVRTAQRGNCLPISMIPVGAIIHNVGVTPIGPGKFCRAAGAYARVISKLPEKKKAIIRLQSGEQRLVALEACATLGVVSNIDHQNESLGKAGRSRWRGIRPTVRGVAMNKCDHPHGGGRGKSKSKKLSVSPWGQLAKGYKTRRGKNQNRMKVKDRPRGKSGKATRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.38
4 0.37
5 0.42
6 0.41
7 0.41
8 0.46
9 0.44
10 0.38
11 0.33
12 0.29
13 0.23
14 0.25
15 0.24
16 0.2
17 0.23
18 0.23
19 0.25
20 0.31
21 0.31
22 0.28
23 0.27
24 0.3
25 0.29
26 0.31
27 0.28
28 0.25
29 0.26
30 0.25
31 0.29
32 0.29
33 0.28
34 0.29
35 0.3
36 0.3
37 0.32
38 0.34
39 0.29
40 0.28
41 0.29
42 0.25
43 0.25
44 0.22
45 0.22
46 0.17
47 0.17
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.18
52 0.22
53 0.24
54 0.33
55 0.4
56 0.45
57 0.55
58 0.62
59 0.63
60 0.68
61 0.72
62 0.74
63 0.77
64 0.82
65 0.82
66 0.83
67 0.86
68 0.8
69 0.78
70 0.72
71 0.65
72 0.6
73 0.61
74 0.59
75 0.57
76 0.63
77 0.61
78 0.62
79 0.59
80 0.57
81 0.52
82 0.47
83 0.43
84 0.37
85 0.36
86 0.33
87 0.39
88 0.4
89 0.37
90 0.42
91 0.42
92 0.41
93 0.41
94 0.39
95 0.35
96 0.33
97 0.36
98 0.33
99 0.41
100 0.4
101 0.35
102 0.36
103 0.36
104 0.39
105 0.4
106 0.41
107 0.4
108 0.42
109 0.44
110 0.42
111 0.44
112 0.39
113 0.4
114 0.4
115 0.39
116 0.37
117 0.39
118 0.39
119 0.44
120 0.53
121 0.55
122 0.6
123 0.59
124 0.61
125 0.62
126 0.64
127 0.58
128 0.56
129 0.53
130 0.53
131 0.48
132 0.47
133 0.46
134 0.42
135 0.39
136 0.33
137 0.27
138 0.22
139 0.21
140 0.21
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.16
145 0.17
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.18
155 0.16
156 0.15
157 0.18
158 0.16
159 0.16
160 0.15
161 0.14
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.15
188 0.19
189 0.23
190 0.28
191 0.29
192 0.28
193 0.26
194 0.28
195 0.26
196 0.23
197 0.18
198 0.13
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.07
203 0.08
204 0.06
205 0.07
206 0.1
207 0.12
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.17
212 0.2
213 0.23
214 0.2
215 0.19
216 0.17
217 0.17
218 0.21
219 0.16
220 0.13
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.13
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.16
243 0.18
244 0.21
245 0.25
246 0.21
247 0.21
248 0.22
249 0.2
250 0.19
251 0.18
252 0.23
253 0.27
254 0.31
255 0.38
256 0.41
257 0.47
258 0.54
259 0.62
260 0.63
261 0.62
262 0.62
263 0.58
264 0.6
265 0.6
266 0.55
267 0.46
268 0.38
269 0.3
270 0.25
271 0.21
272 0.16
273 0.09
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.11
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.13
289 0.16
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.17
294 0.17
295 0.2
296 0.26
297 0.32
298 0.35
299 0.4
300 0.43
301 0.5
302 0.56
303 0.63
304 0.67
305 0.65
306 0.68
307 0.67
308 0.6
309 0.55
310 0.52
311 0.51
312 0.48
313 0.46
314 0.41
315 0.38
316 0.38
317 0.35
318 0.35
319 0.33
320 0.34
321 0.39
322 0.41
323 0.46
324 0.53
325 0.61
326 0.65
327 0.68
328 0.69
329 0.68
330 0.71
331 0.71
332 0.73
333 0.73
334 0.73
335 0.68
336 0.67
337 0.61
338 0.53
339 0.51
340 0.45
341 0.44
342 0.45
343 0.46
344 0.48
345 0.56
346 0.64
347 0.71
348 0.78
349 0.8
350 0.82
351 0.88
352 0.89
353 0.9
354 0.9
355 0.86
356 0.86
357 0.86
358 0.85
359 0.84
360 0.81
361 0.8
362 0.82
363 0.81
364 0.81