Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C7NDG0

Protein Details
Accession A0A0C7NDG0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
369-394FTGNGATDKKPRPDRRPGIGGRRRDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
377-409KKPRPDRRPGIGGRRRDADAPPRSRFVRRSARR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11.5, cyto 8, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040132  Tex1/THOC3  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MTASISIPNTLSTHHSKVFAKFEKNVLPDQHFSQVSSRTSSKSTEFTDNPKTPVGSLEFHPTGAYVVYTRLDGTLNMWKLKSDRAEDYKPLTLDLANDSIGFSKSCVSWSPFTGFLFAMVDGSSAIRIFDASTGANIKTLHSDDDDRYNVCTYDPNGKWLATVTQNNQVLLFDVDADYQLAWRSPLLRSANTTQSIPAPAKELSSYHTTSLIWSHDSSKIYAAFDSGEIRIYDVLAAGLQELIHVSGHTGPVNCLRLTQTGSYLLAAGEDTVCSIWDLSSMCCVFTINDFPDSIRDMDISHGESVIALSSPSCIQIYALETRESIYKVEFNSLISGPKFRFYPGRLTFISTTDNDLVTKFHRPEPTEEFTGNGATDKKPRPDRRPGIGGRRRDADAPPRSRFVRRSARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.36
3 0.38
4 0.43
5 0.51
6 0.53
7 0.53
8 0.51
9 0.55
10 0.57
11 0.57
12 0.57
13 0.53
14 0.51
15 0.48
16 0.47
17 0.48
18 0.41
19 0.39
20 0.37
21 0.38
22 0.34
23 0.37
24 0.36
25 0.32
26 0.33
27 0.35
28 0.34
29 0.33
30 0.36
31 0.38
32 0.39
33 0.44
34 0.51
35 0.51
36 0.5
37 0.48
38 0.44
39 0.36
40 0.37
41 0.33
42 0.26
43 0.25
44 0.3
45 0.28
46 0.27
47 0.27
48 0.23
49 0.19
50 0.17
51 0.15
52 0.07
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.12
61 0.19
62 0.21
63 0.23
64 0.23
65 0.24
66 0.25
67 0.3
68 0.32
69 0.29
70 0.33
71 0.39
72 0.44
73 0.46
74 0.5
75 0.49
76 0.44
77 0.39
78 0.32
79 0.25
80 0.22
81 0.21
82 0.17
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.13
88 0.11
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.11
93 0.13
94 0.16
95 0.17
96 0.2
97 0.22
98 0.23
99 0.23
100 0.23
101 0.2
102 0.17
103 0.15
104 0.13
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.14
129 0.17
130 0.16
131 0.21
132 0.22
133 0.2
134 0.21
135 0.2
136 0.18
137 0.16
138 0.17
139 0.14
140 0.22
141 0.22
142 0.23
143 0.24
144 0.23
145 0.23
146 0.21
147 0.22
148 0.18
149 0.21
150 0.2
151 0.26
152 0.28
153 0.27
154 0.27
155 0.24
156 0.19
157 0.16
158 0.14
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.13
173 0.16
174 0.16
175 0.2
176 0.23
177 0.28
178 0.27
179 0.27
180 0.21
181 0.2
182 0.21
183 0.18
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.15
192 0.16
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.14
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.15
209 0.13
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.04
233 0.05
234 0.06
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.13
239 0.16
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.16
244 0.19
245 0.18
246 0.16
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.13
251 0.11
252 0.09
253 0.08
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.1
272 0.12
273 0.16
274 0.13
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.18
280 0.17
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.12
285 0.14
286 0.14
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.08
293 0.06
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.12
304 0.16
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.18
309 0.2
310 0.19
311 0.17
312 0.14
313 0.15
314 0.16
315 0.2
316 0.19
317 0.18
318 0.2
319 0.2
320 0.22
321 0.2
322 0.23
323 0.2
324 0.23
325 0.22
326 0.21
327 0.28
328 0.26
329 0.36
330 0.36
331 0.42
332 0.4
333 0.45
334 0.44
335 0.39
336 0.4
337 0.3
338 0.31
339 0.27
340 0.27
341 0.21
342 0.2
343 0.2
344 0.19
345 0.26
346 0.24
347 0.28
348 0.34
349 0.37
350 0.43
351 0.49
352 0.53
353 0.5
354 0.47
355 0.42
356 0.37
357 0.35
358 0.28
359 0.23
360 0.19
361 0.18
362 0.27
363 0.32
364 0.4
365 0.49
366 0.59
367 0.66
368 0.74
369 0.81
370 0.81
371 0.84
372 0.84
373 0.85
374 0.83
375 0.83
376 0.77
377 0.73
378 0.66
379 0.59
380 0.57
381 0.56
382 0.58
383 0.58
384 0.57
385 0.59
386 0.61
387 0.65
388 0.62
389 0.62