FuNGI

Q4WID9

Protein Details

Accession

Q4WID9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
808-838	EDNSRRHREAAQRKKSLWKLRKKAYPGSESE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
813-830	RHREAAQRKKSLWKLRKK

Subcellular Location(s)

mito 19, nucl 5, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045116 Clp1/Grc3 IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0000448 P:cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0016310 P:phosphorylation GO:0006396 P:RNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	afm:AFUA_2G02190 -
Pfam	View protein in Pfam PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MKRKAEKQQATAPVSAFAARKARQQQARLLEPEKTAQNEPAVEPPSKRARRSPEEGAARQAANENDRVQTRRSARTKAETLSSAELAEKQPQESAAAARAQTAERTPPPEKGDADTFDAAEEEEEEEKEEDILERENGVGVIAVEDDAEGYESPADDVPQVQNFPLSKTRLNKSNIVSSDERTLCVRIKEKMTLVLLGHYDLWVKRGVISLMGAKLHPSPRLYRVYAPSTHSLPVIKCVAGVDGESEIEVKSCNSGIYRLRHLSPLYQRIWNGKHTAADKLTLKKVSASTKRTFSVLYTSSDDSWNRHLRPLHLEKQWSSAIRSLSQRGGRLKVLICGPKASGKSTFSRYLLNHLLSPAPQTENNHRNTDGVAFLDLDPGQPEFCPMGQVYLAHLRSPFFGPPFTHPSLAESQDGSIIRSHHIGAISPKEDPDHYVLAAMDLMDRYRALLASYPQCPLIINYPGWIFGLGLEVATWLVKSLGLSDVVYMSEKGPAEVVEPLGHAAQEARVPLTTLPSQPTDFVSRSSAQLRSMQVQSYFHMSHPSEIHNPQWLDTTMSRTRPLVVDYAGPRQGIRGIMVMGSQISPNLLHEALDGALVGVVAVESPNAIMGQADAAGFSGSSHGDATQGAEDLSSAASDIDMNDVTDACHGDVAPTSSSSFESMIIRTPNEDLPYLFVGSGSCNPLDPKASNCLGLALVRSIDVPSRKLELITPIPASKLRDALEQGHGIVLVRGMLDNPSWAISEDYYAARAAERRHQELVAKARKETNTRDGQDAAVDADTQGMVSALLKDRIRRASNVPWMTVIEDNSRRHREAAQRKKSLWKLRKKAYPGSESETDW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.39
3	0.3
4	0.25
5	0.29
6	0.28
7	0.35
8	0.42
9	0.5
10	0.54
11	0.59
12	0.63
13	0.64
14	0.7
15	0.68
16	0.63
17	0.58
18	0.52
19	0.52
20	0.48
21	0.43
22	0.38
23	0.35
24	0.36
25	0.34
26	0.33
27	0.35
28	0.34
29	0.33
30	0.32
31	0.36
32	0.43
33	0.48
34	0.5
35	0.52
36	0.58
37	0.64
38	0.7
39	0.72
40	0.7
41	0.73
42	0.71
43	0.69
44	0.63
45	0.54
46	0.47
47	0.43
48	0.36
49	0.3
50	0.31
51	0.27
52	0.28
53	0.32
54	0.34
55	0.32
56	0.37
57	0.4
58	0.47
59	0.51
60	0.55
61	0.57
62	0.63
63	0.66
64	0.61
65	0.6
66	0.52
67	0.5
68	0.46
69	0.4
70	0.31
71	0.27
72	0.26
73	0.23
74	0.27
75	0.24
76	0.21
77	0.21
78	0.21
79	0.22
80	0.2
81	0.2
82	0.17
83	0.19
84	0.18
85	0.19
86	0.2
87	0.19
88	0.2
89	0.2
90	0.22
91	0.23
92	0.3
93	0.31
94	0.35
95	0.39
96	0.42
97	0.42
98	0.4
99	0.42
100	0.38
101	0.41
102	0.36
103	0.31
104	0.26
105	0.24
106	0.2
107	0.14
108	0.12
109	0.09
110	0.09
111	0.09
112	0.11
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.11
117	0.1
118	0.1
119	0.12
120	0.1
121	0.1
122	0.1
123	0.1
124	0.1
125	0.09
126	0.08
127	0.06
128	0.06
129	0.05
130	0.05
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.04
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.06
140	0.07
141	0.07
142	0.08
143	0.07
144	0.09
145	0.11
146	0.14
147	0.14
148	0.13
149	0.18
150	0.18
151	0.21
152	0.25
153	0.27
154	0.3
155	0.36
156	0.42
157	0.46
158	0.49
159	0.52
160	0.5
161	0.55
162	0.51
163	0.5
164	0.47
165	0.41
166	0.45
167	0.39
168	0.36
169	0.29
170	0.3
171	0.27
172	0.3
173	0.32
174	0.28
175	0.32
176	0.35
177	0.35
178	0.37
179	0.35
180	0.33
181	0.29
182	0.26
183	0.23
184	0.19
185	0.18
186	0.13
187	0.14
188	0.11
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.13
194	0.13
195	0.12
196	0.13
197	0.15
198	0.15
199	0.15
200	0.14
201	0.13
202	0.17
203	0.19
204	0.21
205	0.21
206	0.23
207	0.28
208	0.34
209	0.36
210	0.37
211	0.4
212	0.42
213	0.43
214	0.43
215	0.4
216	0.37
217	0.35
218	0.31
219	0.28
220	0.23
221	0.24
222	0.22
223	0.18
224	0.16
225	0.15
226	0.15
227	0.12
228	0.12
229	0.08
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.12
243	0.17
244	0.22
245	0.28
246	0.3
247	0.31
248	0.34
249	0.34
250	0.37
251	0.38
252	0.41
253	0.38
254	0.38
255	0.39
256	0.42
257	0.44
258	0.4
259	0.36
260	0.3
261	0.31
262	0.3
263	0.33
264	0.27
265	0.29
266	0.29
267	0.31
268	0.33
269	0.3
270	0.29
271	0.27
272	0.31
273	0.35
274	0.39
275	0.41
276	0.41
277	0.44
278	0.45
279	0.43
280	0.39
281	0.31
282	0.29
283	0.24
284	0.23
285	0.22
286	0.23
287	0.23
288	0.26
289	0.25
290	0.21
291	0.26
292	0.3
293	0.27
294	0.31
295	0.31
296	0.31
297	0.4
298	0.45
299	0.45
300	0.43
301	0.46
302	0.42
303	0.44
304	0.45
305	0.37
306	0.31
307	0.27
308	0.25
309	0.25
310	0.27
311	0.25
312	0.27
313	0.28
314	0.31
315	0.3
316	0.32
317	0.29
318	0.29
319	0.27
320	0.25
321	0.27
322	0.27
323	0.24
324	0.22
325	0.22
326	0.23
327	0.24
328	0.23
329	0.21
330	0.2
331	0.23
332	0.27
333	0.3
334	0.26
335	0.3
336	0.29
337	0.31
338	0.33
339	0.3
340	0.26
341	0.22
342	0.22
343	0.18
344	0.19
345	0.14
346	0.12
347	0.12
348	0.15
349	0.23
350	0.29
351	0.33
352	0.34
353	0.33
354	0.31
355	0.3
356	0.28
357	0.2
358	0.14
359	0.1
360	0.09
361	0.08
362	0.09
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.05
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.09
378	0.14
379	0.15
380	0.14
381	0.14
382	0.14
383	0.15
384	0.17
385	0.16
386	0.1
387	0.12
388	0.13
389	0.17
390	0.24
391	0.24
392	0.23
393	0.22
394	0.24
395	0.25
396	0.25
397	0.22
398	0.15
399	0.13
400	0.15
401	0.15
402	0.13
403	0.12
404	0.1
405	0.1
406	0.11
407	0.11
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.11
412	0.13
413	0.13
414	0.13
415	0.13
416	0.12
417	0.12
418	0.13
419	0.13
420	0.11
421	0.1
422	0.11
423	0.1
424	0.1
425	0.1
426	0.08
427	0.05
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.06
437	0.09
438	0.13
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.14
443	0.14
444	0.13
445	0.14
446	0.13
447	0.12
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.13
452	0.12
453	0.08
454	0.05
455	0.07
456	0.05
457	0.05
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.03
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.04
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.06
477	0.09
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.06
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.07
499	0.11
500	0.12
501	0.12
502	0.14
503	0.15
504	0.16
505	0.16
506	0.18
507	0.19
508	0.18
509	0.18
510	0.19
511	0.18
512	0.2
513	0.22
514	0.21
515	0.19
516	0.23
517	0.23
518	0.24
519	0.24
520	0.23
521	0.22
522	0.22
523	0.21
524	0.22
525	0.21
526	0.17
527	0.22
528	0.2
529	0.22
530	0.22
531	0.25
532	0.24
533	0.25
534	0.26
535	0.26
536	0.26
537	0.24
538	0.25
539	0.22
540	0.21
541	0.21
542	0.26
543	0.24
544	0.26
545	0.27
546	0.24
547	0.25
548	0.22
549	0.23
550	0.18
551	0.15
552	0.18
553	0.19
554	0.23
555	0.24
556	0.23
557	0.21
558	0.19
559	0.21
560	0.16
561	0.15
562	0.11
563	0.09
564	0.09
565	0.1
566	0.09
567	0.07
568	0.07
569	0.06
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.06
574	0.08
575	0.08
576	0.07
577	0.07
578	0.08
579	0.08
580	0.08
581	0.07
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.03
587	0.02
588	0.02
589	0.02
590	0.02
591	0.02
592	0.02
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.04
599	0.04
600	0.04
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.08
614	0.08
615	0.08
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.06
620	0.06
621	0.05
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.07
632	0.07
633	0.08
634	0.08
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.07
639	0.08
640	0.1
641	0.1
642	0.1
643	0.11
644	0.11
645	0.12
646	0.13
647	0.12
648	0.12
649	0.12
650	0.12
651	0.16
652	0.17
653	0.17
654	0.17
655	0.19
656	0.2
657	0.2
658	0.2
659	0.16
660	0.18
661	0.19
662	0.19
663	0.16
664	0.13
665	0.12
666	0.13
667	0.16
668	0.14
669	0.13
670	0.13
671	0.14
672	0.16
673	0.2
674	0.19
675	0.19
676	0.23
677	0.24
678	0.25
679	0.24
680	0.23
681	0.2
682	0.19
683	0.17
684	0.12
685	0.11
686	0.1
687	0.1
688	0.1
689	0.14
690	0.15
691	0.16
692	0.17
693	0.21
694	0.21
695	0.22
696	0.23
697	0.25
698	0.27
699	0.3
700	0.3
701	0.27
702	0.28
703	0.31
704	0.32
705	0.27
706	0.28
707	0.25
708	0.27
709	0.29
710	0.31
711	0.33
712	0.3
713	0.28
714	0.24
715	0.23
716	0.18
717	0.16
718	0.12
719	0.07
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.07
724	0.07
725	0.08
726	0.08
727	0.09
728	0.09
729	0.1
730	0.11
731	0.11
732	0.12
733	0.13
734	0.13
735	0.13
736	0.13
737	0.12
738	0.13
739	0.16
740	0.18
741	0.24
742	0.3
743	0.34
744	0.36
745	0.38
746	0.41
747	0.45
748	0.52
749	0.53
750	0.48
751	0.46
752	0.51
753	0.54
754	0.57
755	0.56
756	0.55
757	0.56
758	0.56
759	0.58
760	0.52
761	0.47
762	0.42
763	0.35
764	0.27
765	0.18
766	0.15
767	0.11
768	0.1
769	0.09
770	0.08
771	0.07
772	0.05
773	0.05
774	0.05
775	0.09
776	0.12
777	0.18
778	0.2
779	0.24
780	0.31
781	0.39
782	0.42
783	0.43
784	0.47
785	0.51
786	0.59
787	0.59
788	0.54
789	0.47
790	0.45
791	0.43
792	0.39
793	0.32
794	0.3
795	0.34
796	0.38
797	0.45
798	0.5
799	0.49
800	0.49
801	0.54
802	0.56
803	0.6
804	0.66
805	0.67
806	0.7
807	0.72
808	0.8
809	0.83
810	0.83
811	0.82
812	0.82
813	0.82
814	0.83
815	0.89
816	0.86
817	0.86
818	0.84
819	0.82
820	0.77
821	0.74

Q4WID9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer