FuNGI

Q4WCH4

Protein Details

Accession

Q4WCH4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
223-252	DLPTAPAKNRKGKKGKRKGRKTRDTADDDM	Basic
548-567	HPIHHHHHHHHQQHHHHHHQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
156-158	KRK
229-244	AKNRKGKKGKRKGRKT

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013907 Sds3
Gene Ontology	GO:0070822 C:Sin3-type complex GO:0042826 F:histone deacetylase binding GO:0016575 P:histone deacetylation GO:0000122 P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	afm:AFUA_8G04410 -
Pfam	View protein in Pfam PF08598 Sds3

Amino Acid Sequences

MEVAASRDSAPVGPPTGPDATITNGDQDLLLDDSLMDDGRSSSLSDIDDVLDNEPSDYEESPKPEKLAAENDSEAETERIEDSPNHFRRTNIVVSSYGPSPSKLAQSTTYDDAVDGDDQIEDSPSKPRSKPNGILESAEDILGLEDSTLSEGTGKKRKRPESGADVEGETGDEGEPPQKRRGSVKSELSDPPADDSALSPEPIEEVIKANEEDNPADDLPESDLPTAPAKNRKGKKGKRKGRKTRDTADDDMDSGALETGAEGPVDDGDDENIERGEDADDGEAAAKLEEESSEAAKRMSAMESLAILEKEFAALRDKIYDERISKLNRELEMLTGPNPTHPEYLRQLECVKRHRDAKIKYEHTLFQYRIQALMNKSLAERAQTHSTYFQRIRDIREKHSSAVSKHFYAIQHDRFKSEELSAQHYIPFPTRRSQQIAHQTAYNQEVSIMAGVAKYVGFPAAPSLAPARPSELEEDMEKMGVSLILRTCFAYLELTYMSGQISFETRAPTSQPSTNLPRGAMPSMSSNAFRTAAEEAFLEQTPWANPQHPIHHHHHHHHQQHHHHHHQIQPGPHSRVFENPHASSFTTPAAQKRVVDINAPNGSASTIAENLSAANSSANNTPYGAEQDHQRHGLAHFGVPDYDADRKSGYRSLSSSPLDVRKPHPAYATLDHRASQATSSRNPPFSPQPARVGLFQSNASKHDSSPPLSSKQVNSMHPSTGILTGSGSSHMTAR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.2
3	0.21
4	0.21
5	0.2
6	0.19
7	0.2
8	0.22
9	0.22
10	0.2
11	0.18
12	0.18
13	0.17
14	0.15
15	0.14
16	0.12
17	0.11
18	0.08
19	0.08
20	0.08
21	0.09
22	0.09
23	0.07
24	0.06
25	0.07
26	0.08
27	0.09
28	0.09
29	0.09
30	0.11
31	0.12
32	0.13
33	0.13
34	0.13
35	0.15
36	0.15
37	0.16
38	0.15
39	0.14
40	0.14
41	0.13
42	0.13
43	0.13
44	0.13
45	0.16
46	0.19
47	0.24
48	0.29
49	0.31
50	0.31
51	0.31
52	0.32
53	0.33
54	0.36
55	0.34
56	0.35
57	0.33
58	0.33
59	0.31
60	0.29
61	0.26
62	0.19
63	0.15
64	0.11
65	0.12
66	0.11
67	0.12
68	0.15
69	0.19
70	0.29
71	0.35
72	0.39
73	0.39
74	0.39
75	0.42
76	0.46
77	0.46
78	0.38
79	0.35
80	0.31
81	0.33
82	0.35
83	0.31
84	0.28
85	0.23
86	0.21
87	0.21
88	0.22
89	0.25
90	0.23
91	0.25
92	0.26
93	0.3
94	0.34
95	0.35
96	0.33
97	0.27
98	0.26
99	0.24
100	0.21
101	0.16
102	0.12
103	0.09
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.09
108	0.08
109	0.08
110	0.15
111	0.19
112	0.25
113	0.28
114	0.37
115	0.45
116	0.54
117	0.61
118	0.64
119	0.68
120	0.64
121	0.63
122	0.56
123	0.5
124	0.41
125	0.32
126	0.22
127	0.13
128	0.12
129	0.1
130	0.08
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.05
135	0.05
136	0.05
137	0.07
138	0.1
139	0.17
140	0.26
141	0.3
142	0.37
143	0.46
144	0.54
145	0.61
146	0.66
147	0.68
148	0.69
149	0.71
150	0.66
151	0.58
152	0.51
153	0.42
154	0.34
155	0.26
156	0.15
157	0.1
158	0.07
159	0.05
160	0.06
161	0.11
162	0.15
163	0.18
164	0.25
165	0.27
166	0.29
167	0.36
168	0.43
169	0.46
170	0.51
171	0.56
172	0.53
173	0.55
174	0.55
175	0.53
176	0.47
177	0.39
178	0.33
179	0.25
180	0.22
181	0.17
182	0.15
183	0.16
184	0.15
185	0.15
186	0.12
187	0.11
188	0.11
189	0.12
190	0.11
191	0.07
192	0.08
193	0.09
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.13
198	0.14
199	0.14
200	0.13
201	0.16
202	0.14
203	0.14
204	0.13
205	0.12
206	0.13
207	0.14
208	0.14
209	0.11
210	0.11
211	0.13
212	0.15
213	0.16
214	0.17
215	0.24
216	0.3
217	0.39
218	0.44
219	0.53
220	0.62
221	0.7
222	0.78
223	0.81
224	0.85
225	0.87
226	0.92
227	0.93
228	0.93
229	0.94
230	0.91
231	0.88
232	0.87
233	0.83
234	0.75
235	0.67
236	0.56
237	0.46
238	0.38
239	0.29
240	0.19
241	0.12
242	0.09
243	0.05
244	0.04
245	0.03
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.06
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.05
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.05
297	0.06
298	0.05
299	0.06
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.11
304	0.12
305	0.13
306	0.16
307	0.19
308	0.17
309	0.19
310	0.24
311	0.24
312	0.25
313	0.29
314	0.3
315	0.26
316	0.27
317	0.24
318	0.2
319	0.2
320	0.19
321	0.15
322	0.12
323	0.11
324	0.11
325	0.12
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.17
330	0.19
331	0.25
332	0.24
333	0.24
334	0.26
335	0.28
336	0.33
337	0.36
338	0.36
339	0.35
340	0.39
341	0.43
342	0.49
343	0.49
344	0.53
345	0.55
346	0.55
347	0.53
348	0.51
349	0.47
350	0.42
351	0.43
352	0.35
353	0.3
354	0.3
355	0.28
356	0.26
357	0.24
358	0.24
359	0.2
360	0.23
361	0.2
362	0.16
363	0.16
364	0.16
365	0.16
366	0.14
367	0.15
368	0.13
369	0.18
370	0.18
371	0.19
372	0.22
373	0.23
374	0.27
375	0.28
376	0.26
377	0.29
378	0.31
379	0.36
380	0.4
381	0.42
382	0.42
383	0.48
384	0.48
385	0.42
386	0.45
387	0.42
388	0.36
389	0.39
390	0.36
391	0.29
392	0.28
393	0.29
394	0.25
395	0.27
396	0.32
397	0.32
398	0.37
399	0.37
400	0.38
401	0.36
402	0.37
403	0.32
404	0.26
405	0.23
406	0.17
407	0.23
408	0.23
409	0.22
410	0.22
411	0.22
412	0.21
413	0.21
414	0.23
415	0.19
416	0.22
417	0.25
418	0.28
419	0.32
420	0.33
421	0.37
422	0.44
423	0.46
424	0.42
425	0.4
426	0.37
427	0.34
428	0.34
429	0.27
430	0.16
431	0.11
432	0.11
433	0.09
434	0.09
435	0.07
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.05
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.09
451	0.1
452	0.12
453	0.13
454	0.15
455	0.14
456	0.15
457	0.17
458	0.16
459	0.16
460	0.15
461	0.17
462	0.14
463	0.13
464	0.12
465	0.09
466	0.08
467	0.07
468	0.06
469	0.07
470	0.08
471	0.09
472	0.09
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.1
477	0.09
478	0.08
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.07
486	0.07
487	0.06
488	0.08
489	0.08
490	0.09
491	0.11
492	0.12
493	0.12
494	0.14
495	0.17
496	0.19
497	0.21
498	0.23
499	0.26
500	0.33
501	0.37
502	0.36
503	0.33
504	0.32
505	0.31
506	0.3
507	0.25
508	0.18
509	0.17
510	0.17
511	0.18
512	0.17
513	0.16
514	0.17
515	0.17
516	0.16
517	0.15
518	0.15
519	0.14
520	0.14
521	0.13
522	0.12
523	0.13
524	0.13
525	0.12
526	0.09
527	0.1
528	0.1
529	0.12
530	0.13
531	0.13
532	0.17
533	0.21
534	0.29
535	0.33
536	0.39
537	0.44
538	0.52
539	0.57
540	0.6
541	0.66
542	0.67
543	0.7
544	0.71
545	0.73
546	0.74
547	0.78
548	0.81
549	0.78
550	0.76
551	0.72
552	0.7
553	0.69
554	0.64
555	0.58
556	0.56
557	0.57
558	0.55
559	0.52
560	0.49
561	0.42
562	0.44
563	0.44
564	0.44
565	0.43
566	0.38
567	0.38
568	0.38
569	0.38
570	0.32
571	0.28
572	0.22
573	0.19
574	0.2
575	0.22
576	0.25
577	0.26
578	0.26
579	0.28
580	0.33
581	0.3
582	0.32
583	0.3
584	0.34
585	0.34
586	0.33
587	0.29
588	0.23
589	0.22
590	0.18
591	0.17
592	0.1
593	0.09
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.09
598	0.09
599	0.08
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.09
604	0.12
605	0.13
606	0.13
607	0.14
608	0.14
609	0.14
610	0.18
611	0.18
612	0.16
613	0.22
614	0.28
615	0.32
616	0.33
617	0.32
618	0.3
619	0.29
620	0.33
621	0.27
622	0.23
623	0.2
624	0.2
625	0.2
626	0.18
627	0.19
628	0.15
629	0.18
630	0.17
631	0.17
632	0.18
633	0.19
634	0.22
635	0.26
636	0.26
637	0.26
638	0.28
639	0.31
640	0.37
641	0.37
642	0.37
643	0.38
644	0.42
645	0.42
646	0.43
647	0.43
648	0.46
649	0.48
650	0.49
651	0.46
652	0.44
653	0.45
654	0.49
655	0.53
656	0.48
657	0.46
658	0.43
659	0.4
660	0.38
661	0.33
662	0.28
663	0.25
664	0.26
665	0.29
666	0.37
667	0.42
668	0.44
669	0.44
670	0.47
671	0.5
672	0.53
673	0.57
674	0.53
675	0.54
676	0.56
677	0.57
678	0.54
679	0.5
680	0.44
681	0.39
682	0.38
683	0.38
684	0.35
685	0.34
686	0.38
687	0.34
688	0.32
689	0.38
690	0.39
691	0.36
692	0.42
693	0.45
694	0.44
695	0.48
696	0.51
697	0.45
698	0.49
699	0.52
700	0.49
701	0.52
702	0.5
703	0.47
704	0.43
705	0.41
706	0.34
707	0.3
708	0.25
709	0.18
710	0.16
711	0.14
712	0.14
713	0.14
714	0.13

Q4WCH4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer