Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C7MWT0

Protein Details
Accession A0A0C7MWT0    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-57VPLEDRRSRNKSSRNAKSPFHydrophilic
334-359LPQINSKKKTSKSKGKTRRQKGAMSDHydrophilic
450-474ADQVSKGKLSQRRNKSRQGQNGIDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-354KKKTSKSKGKTRRQK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSLKPGFDRKTAKKFAVVHRSHDDPRFHDTEASEHVLVPLEDRRSRNKSSRNAKSPFSQGTGPQTKDSKRTPAHDHVGEATLYGIDFDDSKYDYTQHLRPVGMDPQNAVLLSAKSTAQSRPREAKVEDLFAGLEIHDSREKKNETMFERGGIAKREYLEHQQDVDEELHGFRPDLNPALREVLEALDDEAYVVNKDVAVKKSKSRAETRDEEEEGDDDLFEELLLGGEVEGAQDFEEEFDEWDVDNLQDYEETQYRDELQQLENVENLEDLQNIDYQADVTRFKKQQSRKTRDGTLEVDGDDLDSLNDFDNVSDIGSVAPLQEDGEELDTLDDLPQINSKKKTSKSKGKTRRQKGAMSDVSGFSMSSSAITRSEALTVLDDRHDQIIAGYENYQEEQDEDEDDYQPFNMANERADFESMLDDFLENYELESGGRKLVKKNHEAAKFQEAADQVSKGKLSQRRNKSRQGQNGIDSITGNLKSLRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.71
3 0.73
4 0.67
5 0.63
6 0.62
7 0.66
8 0.64
9 0.63
10 0.58
11 0.51
12 0.55
13 0.51
14 0.47
15 0.44
16 0.39
17 0.36
18 0.36
19 0.37
20 0.3
21 0.27
22 0.26
23 0.24
24 0.23
25 0.21
26 0.21
27 0.22
28 0.27
29 0.3
30 0.39
31 0.43
32 0.51
33 0.58
34 0.62
35 0.66
36 0.72
37 0.79
38 0.8
39 0.79
40 0.75
41 0.72
42 0.7
43 0.64
44 0.57
45 0.49
46 0.43
47 0.48
48 0.52
49 0.48
50 0.45
51 0.48
52 0.48
53 0.52
54 0.53
55 0.53
56 0.51
57 0.55
58 0.59
59 0.61
60 0.65
61 0.6
62 0.57
63 0.5
64 0.46
65 0.39
66 0.31
67 0.22
68 0.13
69 0.11
70 0.09
71 0.07
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.15
81 0.19
82 0.23
83 0.27
84 0.29
85 0.28
86 0.29
87 0.31
88 0.36
89 0.36
90 0.33
91 0.28
92 0.26
93 0.27
94 0.25
95 0.22
96 0.15
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.1
101 0.11
102 0.13
103 0.18
104 0.24
105 0.29
106 0.35
107 0.42
108 0.45
109 0.49
110 0.48
111 0.52
112 0.47
113 0.45
114 0.38
115 0.31
116 0.28
117 0.22
118 0.21
119 0.12
120 0.11
121 0.07
122 0.09
123 0.13
124 0.14
125 0.16
126 0.23
127 0.26
128 0.26
129 0.31
130 0.35
131 0.35
132 0.41
133 0.4
134 0.34
135 0.34
136 0.34
137 0.32
138 0.29
139 0.26
140 0.2
141 0.2
142 0.21
143 0.22
144 0.27
145 0.29
146 0.27
147 0.27
148 0.25
149 0.25
150 0.25
151 0.23
152 0.16
153 0.11
154 0.1
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.13
162 0.14
163 0.13
164 0.14
165 0.17
166 0.16
167 0.14
168 0.14
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.06
174 0.05
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.05
182 0.07
183 0.11
184 0.14
185 0.19
186 0.21
187 0.25
188 0.33
189 0.37
190 0.41
191 0.44
192 0.47
193 0.48
194 0.52
195 0.52
196 0.5
197 0.47
198 0.42
199 0.35
200 0.29
201 0.23
202 0.17
203 0.12
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.07
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.14
245 0.13
246 0.11
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.13
251 0.12
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.1
267 0.11
268 0.18
269 0.2
270 0.24
271 0.31
272 0.38
273 0.47
274 0.56
275 0.63
276 0.64
277 0.68
278 0.7
279 0.66
280 0.63
281 0.55
282 0.47
283 0.39
284 0.31
285 0.25
286 0.19
287 0.15
288 0.11
289 0.08
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.05
321 0.06
322 0.1
323 0.14
324 0.19
325 0.23
326 0.27
327 0.34
328 0.42
329 0.53
330 0.58
331 0.66
332 0.71
333 0.79
334 0.85
335 0.89
336 0.92
337 0.9
338 0.91
339 0.86
340 0.82
341 0.77
342 0.76
343 0.69
344 0.62
345 0.54
346 0.44
347 0.39
348 0.32
349 0.26
350 0.15
351 0.12
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.11
372 0.11
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.12
387 0.13
388 0.15
389 0.15
390 0.15
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.12
396 0.12
397 0.14
398 0.15
399 0.18
400 0.18
401 0.19
402 0.19
403 0.15
404 0.17
405 0.15
406 0.13
407 0.11
408 0.1
409 0.09
410 0.1
411 0.1
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.11
418 0.11
419 0.14
420 0.18
421 0.21
422 0.27
423 0.36
424 0.44
425 0.49
426 0.57
427 0.61
428 0.65
429 0.66
430 0.65
431 0.65
432 0.59
433 0.51
434 0.47
435 0.39
436 0.35
437 0.34
438 0.3
439 0.23
440 0.23
441 0.23
442 0.2
443 0.27
444 0.31
445 0.39
446 0.48
447 0.58
448 0.67
449 0.75
450 0.84
451 0.86
452 0.89
453 0.89
454 0.88
455 0.84
456 0.77
457 0.74
458 0.65
459 0.56
460 0.46
461 0.36
462 0.32
463 0.25
464 0.22