FuNGI

Q4WCH5

Protein Details

Accession

Q4WCH5

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
107-127	DTQAPSSKKRKRAPAEDLEET	Hydrophilic
337-359	TDPEEDDKKKKKKKSGPADVEEG	Acidic
420-448	FPPMLPRKLRVTRAKKLPKKRDGPETGSH	Basic
496-527	SEGSSRIKIKTKSRGSKGKPKNRSAKRAAAYQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
114-118	KKRKR
136-152	EQKEQEKRRAEKAKRQK
344-351	KKKKKKKS
421-443	PPMLPRKLRVTRAKKLPKKRDGP
472-476	AAKMK
500-538	SRIKIKTKSRGSKGKPKNRSAKRAAAYQAAGGRKGKMAK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, mito_nucl 11.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0019843 F:rRNA binding GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	afm:AFUA_8G04400 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MGKKSKAQSDNVSQPGKTDVTLPFLGGKAAIDPTVASLFEKSAGPVKAPSVQPIITQRKENGPEDDVEKEEDDEEISELEEDLQSEDEDMQDVSEVAGDAERTLAVDTQAPSSKKRKRAPAEDLEETYMRRIAKEEQKEQEKRRAEKAKRQKVEEGGKDSDPVSDKSKDGRDESSEEEDEITVPRHETQSGDPESKELEKSNRTVFLGNVSSQAIKSKSAKKTLLKHLASFLSTLPESTGPHKVESIRFRSVAFASGGKVPKRAAFARREILDDTTPSTNAYVVYSTVQAARKAPAALNGTVVLDRHLRVDSVAHPSQIDHKRCVFVGNLDFVDNETDPEEDDKKKKKKKSGPADVEEGLWRTFNAHTKGSKERASTRGNVESVRVVRDRTTRVGKGFAYVQFYDQVCVEEALLLDGKKFPPMLPRKLRVTRAKKLPKKRDGPETGSHGKALGEGFSTLQGRAGKLFGRAGAAKMKAEGRKSISGNSVVFEGNRASEGSSRIKIKTKSRGSKGKPKNRSAKRAAAYQAAGGRKGKMAK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.5
3	0.43
4	0.33
5	0.29
6	0.22
7	0.25
8	0.26
9	0.25
10	0.23
11	0.22
12	0.22
13	0.17
14	0.16
15	0.11
16	0.12
17	0.11
18	0.09
19	0.09
20	0.11
21	0.12
22	0.12
23	0.11
24	0.11
25	0.11
26	0.13
27	0.13
28	0.12
29	0.18
30	0.18
31	0.19
32	0.2
33	0.22
34	0.27
35	0.28
36	0.31
37	0.29
38	0.28
39	0.31
40	0.39
41	0.46
42	0.43
43	0.46
44	0.45
45	0.5
46	0.55
47	0.54
48	0.5
49	0.43
50	0.42
51	0.4
52	0.4
53	0.33
54	0.29
55	0.26
56	0.21
57	0.19
58	0.17
59	0.14
60	0.12
61	0.11
62	0.09
63	0.08
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.07
68	0.07
69	0.07
70	0.08
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.07
75	0.08
76	0.07
77	0.07
78	0.06
79	0.06
80	0.05
81	0.06
82	0.05
83	0.05
84	0.06
85	0.06
86	0.05
87	0.06
88	0.05
89	0.05
90	0.06
91	0.07
92	0.07
93	0.1
94	0.11
95	0.15
96	0.21
97	0.22
98	0.27
99	0.36
100	0.43
101	0.5
102	0.57
103	0.63
104	0.67
105	0.76
106	0.8
107	0.8
108	0.8
109	0.75
110	0.69
111	0.62
112	0.53
113	0.44
114	0.36
115	0.28
116	0.21
117	0.16
118	0.16
119	0.21
120	0.3
121	0.38
122	0.44
123	0.49
124	0.6
125	0.68
126	0.71
127	0.72
128	0.71
129	0.67
130	0.69
131	0.71
132	0.69
133	0.71
134	0.77
135	0.79
136	0.77
137	0.77
138	0.74
139	0.72
140	0.74
141	0.7
142	0.65
143	0.58
144	0.52
145	0.48
146	0.42
147	0.36
148	0.28
149	0.24
150	0.22
151	0.21
152	0.21
153	0.25
154	0.3
155	0.31
156	0.31
157	0.32
158	0.3
159	0.31
160	0.35
161	0.35
162	0.3
163	0.27
164	0.24
165	0.21
166	0.18
167	0.16
168	0.13
169	0.08
170	0.09
171	0.1
172	0.11
173	0.11
174	0.12
175	0.14
176	0.2
177	0.24
178	0.25
179	0.23
180	0.23
181	0.24
182	0.24
183	0.23
184	0.18
185	0.19
186	0.21
187	0.23
188	0.26
189	0.27
190	0.26
191	0.26
192	0.23
193	0.23
194	0.22
195	0.19
196	0.18
197	0.16
198	0.15
199	0.14
200	0.17
201	0.13
202	0.14
203	0.19
204	0.26
205	0.3
206	0.37
207	0.43
208	0.46
209	0.54
210	0.61
211	0.66
212	0.59
213	0.55
214	0.52
215	0.47
216	0.41
217	0.33
218	0.23
219	0.15
220	0.14
221	0.13
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.12
226	0.18
227	0.16
228	0.17
229	0.18
230	0.2
231	0.24
232	0.29
233	0.32
234	0.29
235	0.29
236	0.28
237	0.29
238	0.27
239	0.24
240	0.19
241	0.14
242	0.12
243	0.16
244	0.19
245	0.18
246	0.18
247	0.17
248	0.18
249	0.21
250	0.24
251	0.25
252	0.27
253	0.31
254	0.34
255	0.34
256	0.34
257	0.31
258	0.3
259	0.24
260	0.2
261	0.18
262	0.14
263	0.13
264	0.11
265	0.11
266	0.09
267	0.08
268	0.08
269	0.06
270	0.06
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.1
275	0.11
276	0.12
277	0.12
278	0.13
279	0.14
280	0.14
281	0.14
282	0.16
283	0.18
284	0.17
285	0.17
286	0.16
287	0.15
288	0.14
289	0.14
290	0.1
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.1
298	0.11
299	0.17
300	0.18
301	0.17
302	0.17
303	0.17
304	0.26
305	0.33
306	0.33
307	0.29
308	0.3
309	0.31
310	0.31
311	0.33
312	0.24
313	0.2
314	0.2
315	0.19
316	0.17
317	0.16
318	0.16
319	0.15
320	0.16
321	0.12
322	0.1
323	0.08
324	0.07
325	0.08
326	0.1
327	0.13
328	0.15
329	0.22
330	0.32
331	0.41
332	0.5
333	0.57
334	0.65
335	0.72
336	0.79
337	0.83
338	0.84
339	0.84
340	0.8
341	0.78
342	0.68
343	0.59
344	0.49
345	0.4
346	0.28
347	0.19
348	0.14
349	0.11
350	0.12
351	0.17
352	0.2
353	0.22
354	0.24
355	0.29
356	0.36
357	0.39
358	0.41
359	0.39
360	0.42
361	0.45
362	0.47
363	0.47
364	0.45
365	0.46
366	0.43
367	0.4
368	0.35
369	0.33
370	0.3
371	0.29
372	0.25
373	0.2
374	0.23
375	0.28
376	0.3
377	0.31
378	0.37
379	0.37
380	0.38
381	0.41
382	0.37
383	0.34
384	0.35
385	0.31
386	0.29
387	0.26
388	0.25
389	0.26
390	0.26
391	0.24
392	0.2
393	0.19
394	0.14
395	0.14
396	0.13
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.1
401	0.09
402	0.09
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.13
407	0.12
408	0.21
409	0.3
410	0.39
411	0.46
412	0.52
413	0.6
414	0.67
415	0.75
416	0.76
417	0.77
418	0.76
419	0.78
420	0.83
421	0.83
422	0.87
423	0.89
424	0.88
425	0.89
426	0.86
427	0.86
428	0.83
429	0.8
430	0.76
431	0.73
432	0.68
433	0.6
434	0.53
435	0.42
436	0.34
437	0.29
438	0.23
439	0.15
440	0.11
441	0.1
442	0.11
443	0.13
444	0.14
445	0.12
446	0.16
447	0.17
448	0.16
449	0.17
450	0.18
451	0.17
452	0.19
453	0.2
454	0.17
455	0.2
456	0.2
457	0.21
458	0.26
459	0.26
460	0.24
461	0.25
462	0.31
463	0.31
464	0.33
465	0.37
466	0.36
467	0.42
468	0.43
469	0.44
470	0.43
471	0.43
472	0.41
473	0.36
474	0.32
475	0.25
476	0.23
477	0.21
478	0.17
479	0.13
480	0.13
481	0.12
482	0.12
483	0.14
484	0.19
485	0.23
486	0.28
487	0.31
488	0.34
489	0.42
490	0.47
491	0.53
492	0.6
493	0.65
494	0.7
495	0.76
496	0.83
497	0.84
498	0.87
499	0.9
500	0.9
501	0.89
502	0.89
503	0.9
504	0.9
505	0.91
506	0.89
507	0.88
508	0.82
509	0.8
510	0.74
511	0.7
512	0.6
513	0.54
514	0.52
515	0.45
516	0.44
517	0.37
518	0.35

Q4WCH5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer