FuNGI

A0A0D1ZP40

Protein Details

Accession

A0A0D1ZP40

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
53-89	DTATTPRKRKHDHEAKDSSKKKKNKKQRIEEDANDTP	Basic
92-121	AQASPIETPKKSKKKKKRRDKADASPGLQE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
59-80	RKRKHDHEAKDSSKKKKNKKQR
100-112	PKKSKKKKKRRDK
322-336	KGQGGKGRKGRKARL

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSDGSRNFVNLSSRAQSAQLKTLDGKVYTSVSTQSFMSIKANGAHKAQQAEMDTATTPRKRKHDHEAKDSSKKKKNKKQRIEEDANDTPPPAQASPIETPKKSKKKKKRRDKADASPGLQEEIEQTDKVNGVEVDQEEAVDAIEEDSNLEQDVLESPQVEEILADLLESSDPSSFYSTRLSLYVSIPAIALESASSSILAAHLAPLLLTYFPPAKGIVLGFSDPVLSAKPDSSANLPLLAPDSAEVRPGTEVLARTADEFGVCWTWLTVTLLTFRPERGDELYGWTNVTSEGFIGLVSYNYFQSAIGQNRIPQEWTWNGPHKGQGGKGRKGRKARLRDEDGTSKEQDIDMLDEGSQPQDPAGPTESTDEIGFFTDETGNKVSSTLTYRVLDTEVVPGHDRHTWSLQIDGTLLNKDAEQKALEEDRLRFERIQQSGARPEISAVGAFMTGARGLSREGSVTSRLSAPAQTPSRIRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.32
3	0.35
4	0.33
5	0.38
6	0.35
7	0.34
8	0.35
9	0.39
10	0.39
11	0.33
12	0.31
13	0.26
14	0.26
15	0.24
16	0.24
17	0.22
18	0.19
19	0.2
20	0.18
21	0.19
22	0.18
23	0.19
24	0.2
25	0.18
26	0.19
27	0.23
28	0.27
29	0.26
30	0.28
31	0.32
32	0.34
33	0.35
34	0.33
35	0.32
36	0.31
37	0.3
38	0.27
39	0.23
40	0.2
41	0.2
42	0.27
43	0.28
44	0.32
45	0.36
46	0.45
47	0.51
48	0.57
49	0.66
50	0.7
51	0.73
52	0.78
53	0.82
54	0.81
55	0.84
56	0.85
57	0.84
58	0.83
59	0.83
60	0.84
61	0.84
62	0.87
63	0.87
64	0.9
65	0.92
66	0.93
67	0.94
68	0.92
69	0.87
70	0.84
71	0.77
72	0.69
73	0.58
74	0.47
75	0.37
76	0.29
77	0.26
78	0.18
79	0.15
80	0.13
81	0.19
82	0.23
83	0.32
84	0.36
85	0.34
86	0.42
87	0.51
88	0.61
89	0.66
90	0.72
91	0.74
92	0.8
93	0.9
94	0.94
95	0.95
96	0.95
97	0.96
98	0.95
99	0.95
100	0.94
101	0.91
102	0.81
103	0.74
104	0.63
105	0.53
106	0.42
107	0.31
108	0.21
109	0.18
110	0.17
111	0.13
112	0.12
113	0.13
114	0.14
115	0.14
116	0.14
117	0.1
118	0.09
119	0.13
120	0.12
121	0.13
122	0.12
123	0.12
124	0.1
125	0.1
126	0.09
127	0.06
128	0.05
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.05
137	0.04
138	0.05
139	0.06
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.08
145	0.08
146	0.07
147	0.06
148	0.05
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.04
153	0.04
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.04
158	0.05
159	0.06
160	0.09
161	0.09
162	0.1
163	0.13
164	0.13
165	0.14
166	0.14
167	0.14
168	0.13
169	0.14
170	0.16
171	0.13
172	0.13
173	0.12
174	0.11
175	0.1
176	0.08
177	0.07
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.03
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.05
197	0.06
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.07
202	0.08
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.08
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.06
217	0.07
218	0.08
219	0.09
220	0.11
221	0.11
222	0.12
223	0.11
224	0.1
225	0.11
226	0.1
227	0.08
228	0.06
229	0.08
230	0.07
231	0.08
232	0.08
233	0.07
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.09
239	0.08
240	0.1
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.09
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.09
258	0.11
259	0.12
260	0.13
261	0.12
262	0.13
263	0.13
264	0.15
265	0.15
266	0.15
267	0.14
268	0.19
269	0.2
270	0.19
271	0.18
272	0.16
273	0.13
274	0.12
275	0.12
276	0.06
277	0.05
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.08
291	0.13
292	0.16
293	0.18
294	0.19
295	0.21
296	0.24
297	0.24
298	0.23
299	0.18
300	0.2
301	0.2
302	0.24
303	0.26
304	0.32
305	0.33
306	0.33
307	0.36
308	0.35
309	0.34
310	0.35
311	0.39
312	0.4
313	0.46
314	0.52
315	0.57
316	0.61
317	0.67
318	0.72
319	0.72
320	0.73
321	0.74
322	0.77
323	0.77
324	0.74
325	0.72
326	0.7
327	0.65
328	0.59
329	0.51
330	0.42
331	0.34
332	0.3
333	0.24
334	0.17
335	0.15
336	0.12
337	0.11
338	0.1
339	0.1
340	0.1
341	0.11
342	0.1
343	0.07
344	0.07
345	0.09
346	0.09
347	0.11
348	0.14
349	0.13
350	0.14
351	0.17
352	0.18
353	0.16
354	0.16
355	0.14
356	0.11
357	0.12
358	0.11
359	0.08
360	0.08
361	0.1
362	0.11
363	0.14
364	0.15
365	0.15
366	0.14
367	0.15
368	0.14
369	0.14
370	0.18
371	0.18
372	0.21
373	0.21
374	0.22
375	0.22
376	0.23
377	0.21
378	0.17
379	0.19
380	0.16
381	0.17
382	0.18
383	0.18
384	0.19
385	0.22
386	0.23
387	0.21
388	0.24
389	0.25
390	0.24
391	0.27
392	0.26
393	0.22
394	0.22
395	0.19
396	0.17
397	0.16
398	0.16
399	0.13
400	0.13
401	0.17
402	0.18
403	0.19
404	0.18
405	0.17
406	0.22
407	0.25
408	0.27
409	0.27
410	0.28
411	0.33
412	0.36
413	0.38
414	0.33
415	0.37
416	0.43
417	0.41
418	0.44
419	0.41
420	0.44
421	0.48
422	0.5
423	0.44
424	0.35
425	0.34
426	0.3
427	0.27
428	0.21
429	0.13
430	0.11
431	0.1
432	0.1
433	0.09
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.08
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.13
444	0.16
445	0.19
446	0.2
447	0.21
448	0.21
449	0.22
450	0.22
451	0.23
452	0.22
453	0.28
454	0.31
455	0.34

A0A0D1ZP40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer