Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1ZRB7

Protein Details
Accession A0A0D1ZRB7    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-101QDNQKKAKLPSKRAGKNKTPSSGHydrophilic
389-417LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGQIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-95KAKLPSKRAGKN
396-407GFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10.5, cyto_mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MKQSKKSGKAPPSAQTLSLIAKFLEDHDLDATGKTFAKELKKLQRSAGPPTADLVSKGVKLEDIVETYNDSGYGTPGSQDNQKKAKLPSKRAGKNKTPSSGSSGSSNSDSTTSSSSEDDSSSDESEAEIARQGEMKSQQIKRSTRASSSSSSSSSSSSSSSSASASSSDSDADDEDEAFPEAKPKVGSTKTSRSTSLSSNAVKKSLKRKADSSSSELSTSDSDSDSDSYDDNHTAKRIKREQSASSSDDSSSSEDTSSASDSASAASVASGDSSEESSDSDVSSADEDKDHIIKPASNSSSANSSDDRSDSSGTVQGDNVKVEVTTVESKVLLADGRTVQTKTSATATRKHTGAKPTPLAELSALATEGSHISNAYQSYNYADRAYNDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGQIDISGGKGFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.52
3 0.45
4 0.4
5 0.36
6 0.3
7 0.21
8 0.19
9 0.19
10 0.18
11 0.21
12 0.17
13 0.16
14 0.16
15 0.18
16 0.18
17 0.18
18 0.17
19 0.13
20 0.15
21 0.13
22 0.15
23 0.18
24 0.26
25 0.31
26 0.4
27 0.49
28 0.56
29 0.58
30 0.61
31 0.64
32 0.61
33 0.63
34 0.61
35 0.53
36 0.45
37 0.44
38 0.41
39 0.34
40 0.3
41 0.24
42 0.19
43 0.18
44 0.18
45 0.16
46 0.14
47 0.14
48 0.15
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.13
57 0.11
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.1
64 0.12
65 0.2
66 0.25
67 0.32
68 0.37
69 0.4
70 0.45
71 0.51
72 0.58
73 0.6
74 0.63
75 0.65
76 0.69
77 0.75
78 0.79
79 0.81
80 0.82
81 0.82
82 0.81
83 0.78
84 0.71
85 0.64
86 0.62
87 0.57
88 0.48
89 0.42
90 0.35
91 0.3
92 0.28
93 0.26
94 0.19
95 0.17
96 0.16
97 0.14
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.11
119 0.11
120 0.14
121 0.16
122 0.21
123 0.27
124 0.31
125 0.36
126 0.42
127 0.45
128 0.45
129 0.5
130 0.48
131 0.44
132 0.44
133 0.43
134 0.38
135 0.38
136 0.37
137 0.31
138 0.29
139 0.26
140 0.23
141 0.2
142 0.18
143 0.15
144 0.13
145 0.13
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.16
173 0.18
174 0.23
175 0.27
176 0.36
177 0.39
178 0.41
179 0.42
180 0.38
181 0.38
182 0.36
183 0.33
184 0.29
185 0.27
186 0.3
187 0.29
188 0.3
189 0.29
190 0.31
191 0.37
192 0.4
193 0.44
194 0.41
195 0.45
196 0.46
197 0.53
198 0.52
199 0.47
200 0.43
201 0.38
202 0.35
203 0.31
204 0.27
205 0.19
206 0.16
207 0.12
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.16
222 0.2
223 0.27
224 0.34
225 0.37
226 0.43
227 0.48
228 0.5
229 0.52
230 0.54
231 0.48
232 0.42
233 0.38
234 0.31
235 0.26
236 0.23
237 0.18
238 0.14
239 0.12
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.1
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.15
281 0.17
282 0.24
283 0.24
284 0.24
285 0.25
286 0.24
287 0.27
288 0.26
289 0.26
290 0.19
291 0.19
292 0.18
293 0.19
294 0.19
295 0.17
296 0.17
297 0.15
298 0.16
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.17
303 0.18
304 0.18
305 0.18
306 0.16
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.12
316 0.13
317 0.12
318 0.13
319 0.1
320 0.07
321 0.1
322 0.11
323 0.13
324 0.15
325 0.16
326 0.15
327 0.18
328 0.19
329 0.17
330 0.21
331 0.26
332 0.27
333 0.34
334 0.4
335 0.42
336 0.43
337 0.46
338 0.46
339 0.49
340 0.54
341 0.55
342 0.54
343 0.51
344 0.52
345 0.48
346 0.44
347 0.34
348 0.28
349 0.2
350 0.15
351 0.13
352 0.1
353 0.09
354 0.08
355 0.09
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.1
361 0.12
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.17
366 0.2
367 0.21
368 0.21
369 0.22
370 0.22
371 0.26
372 0.28
373 0.25
374 0.23
375 0.22
376 0.22
377 0.24
378 0.24
379 0.22
380 0.23
381 0.22
382 0.29
383 0.35
384 0.43
385 0.51
386 0.6
387 0.68
388 0.76
389 0.85
390 0.87
391 0.9
392 0.91
393 0.9
394 0.9
395 0.88
396 0.88
397 0.88
398 0.82
399 0.71
400 0.61
401 0.55
402 0.45
403 0.38
404 0.3
405 0.2
406 0.17