Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1ZIF3

Protein Details
Accession A0A0D1ZIF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-38LTPSPPTDQKARPRRAKISSKRQANPLRRGIIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-29KARPRRAKISSKRQ
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030382  MeTrfase_TRM5/TYW2  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR026274  tRNA_wybutosine_synth_prot_2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0008757  F:S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity  
GO:0031591  P:wybutosine biosynthetic process  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51684  SAM_MT_TRM5_TYW2  
Amino Acid Sequences MSDSTTLTPSPPTDQKARPRRAKISSKRQANPLRRGIIAFCAKSGFREINPINHAAETETKNKTDETLAASLSVEDVPKRFTSYPPLLLLPFNFARHSESWARFYDKLNNDEKTELFRSIAGDGFVGSGITHVAISAPIALSTEQGHDDDGDGCNLGEEKRSQPLTRQNVMRSPSGLTPVYGDWGSRDTDGDVNANADAFENAFWVSTSQHKGITQCWAPLYTMFSRGNISEKARILGIESGAPAPQQRTQQKPSFYGLSNDQLGQPVKDVDVVDFYVGIGYFAFCYLMRGVRRVWGWDINPWSIEGLRRGCNANGWNCLVVRVDEHGSLTDSTPKDIAMQILRLDRSDSEPAQRVRCVAFLGDNRWATKVLSEIDKAMSSIDASDGQGSGINLKHANLGLLPSSNDSWESAVAVLSRLKDRGVQRSSWLHVHENVDMTKEDSIREDIVNDIRKIVEAEAETVRYEDQDHKVSCVCLHVQHVKTFAPGVMHCVFDIQIQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.56
3 0.64
4 0.72
5 0.76
6 0.79
7 0.83
8 0.85
9 0.88
10 0.88
11 0.88
12 0.88
13 0.88
14 0.85
15 0.86
16 0.86
17 0.85
18 0.84
19 0.81
20 0.75
21 0.66
22 0.62
23 0.54
24 0.52
25 0.5
26 0.41
27 0.33
28 0.32
29 0.3
30 0.3
31 0.33
32 0.28
33 0.21
34 0.3
35 0.31
36 0.36
37 0.4
38 0.4
39 0.36
40 0.33
41 0.33
42 0.25
43 0.3
44 0.26
45 0.29
46 0.3
47 0.3
48 0.31
49 0.31
50 0.31
51 0.26
52 0.25
53 0.24
54 0.23
55 0.22
56 0.21
57 0.21
58 0.19
59 0.17
60 0.15
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.13
65 0.13
66 0.18
67 0.19
68 0.2
69 0.28
70 0.33
71 0.37
72 0.36
73 0.38
74 0.34
75 0.34
76 0.32
77 0.3
78 0.26
79 0.23
80 0.21
81 0.2
82 0.24
83 0.23
84 0.29
85 0.31
86 0.32
87 0.34
88 0.37
89 0.41
90 0.38
91 0.4
92 0.44
93 0.42
94 0.45
95 0.47
96 0.45
97 0.42
98 0.42
99 0.4
100 0.36
101 0.33
102 0.28
103 0.22
104 0.21
105 0.2
106 0.19
107 0.2
108 0.13
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.1
146 0.11
147 0.17
148 0.2
149 0.2
150 0.26
151 0.35
152 0.41
153 0.46
154 0.48
155 0.46
156 0.49
157 0.51
158 0.46
159 0.38
160 0.32
161 0.27
162 0.26
163 0.23
164 0.18
165 0.16
166 0.15
167 0.16
168 0.13
169 0.12
170 0.09
171 0.1
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.06
194 0.1
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.16
199 0.18
200 0.19
201 0.24
202 0.21
203 0.19
204 0.19
205 0.18
206 0.17
207 0.16
208 0.19
209 0.14
210 0.18
211 0.17
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.19
216 0.18
217 0.19
218 0.18
219 0.18
220 0.18
221 0.17
222 0.17
223 0.15
224 0.13
225 0.12
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.1
234 0.17
235 0.21
236 0.27
237 0.34
238 0.39
239 0.41
240 0.42
241 0.41
242 0.38
243 0.34
244 0.3
245 0.26
246 0.24
247 0.22
248 0.19
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.14
253 0.12
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.06
275 0.1
276 0.11
277 0.13
278 0.13
279 0.16
280 0.17
281 0.18
282 0.2
283 0.2
284 0.21
285 0.24
286 0.27
287 0.24
288 0.23
289 0.21
290 0.19
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.17
296 0.19
297 0.2
298 0.2
299 0.23
300 0.26
301 0.25
302 0.25
303 0.24
304 0.24
305 0.22
306 0.23
307 0.19
308 0.15
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.16
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.16
326 0.12
327 0.13
328 0.15
329 0.18
330 0.18
331 0.17
332 0.18
333 0.16
334 0.19
335 0.22
336 0.2
337 0.22
338 0.28
339 0.31
340 0.33
341 0.33
342 0.3
343 0.27
344 0.26
345 0.23
346 0.17
347 0.19
348 0.19
349 0.22
350 0.27
351 0.27
352 0.27
353 0.27
354 0.27
355 0.22
356 0.19
357 0.19
358 0.15
359 0.17
360 0.17
361 0.17
362 0.18
363 0.18
364 0.17
365 0.14
366 0.12
367 0.09
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.1
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.14
383 0.13
384 0.13
385 0.11
386 0.12
387 0.11
388 0.11
389 0.12
390 0.12
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.12
404 0.14
405 0.14
406 0.15
407 0.2
408 0.25
409 0.33
410 0.36
411 0.35
412 0.39
413 0.45
414 0.48
415 0.47
416 0.46
417 0.4
418 0.4
419 0.42
420 0.38
421 0.35
422 0.32
423 0.29
424 0.26
425 0.24
426 0.22
427 0.2
428 0.18
429 0.17
430 0.19
431 0.19
432 0.19
433 0.18
434 0.18
435 0.25
436 0.31
437 0.28
438 0.27
439 0.25
440 0.25
441 0.26
442 0.23
443 0.2
444 0.15
445 0.18
446 0.19
447 0.2
448 0.19
449 0.19
450 0.19
451 0.15
452 0.17
453 0.19
454 0.22
455 0.29
456 0.3
457 0.32
458 0.34
459 0.35
460 0.33
461 0.32
462 0.29
463 0.24
464 0.3
465 0.37
466 0.38
467 0.4
468 0.43
469 0.39
470 0.38
471 0.36
472 0.3
473 0.26
474 0.22
475 0.25
476 0.24
477 0.24
478 0.22
479 0.22
480 0.2