Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1ZHM0

Protein Details
Accession A0A0D1ZHM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
231-253NGQSPRRRSSKSYSRSRSRSASDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 7, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSHRADASNTLDNRGYSGPLIRGQNPALLLETAMRDRITDSLYWKEQCFGLNAATLCDRAVELTHIGGTYGVAMKPTPFICLAFKLLTLVPDREIILEYLNVGGEEWKYLRALAAFYVRLTFDPPMVYKTLEPFLEDSRKLRQRRKEAYVLVHMDEFVDNLLTKERVCGTSLWKLPARQLLEDLDQLEERVSPLQAELDAMEEEEGDGDQNEGEYDEVMEDADRNGTASENGQSPRRRSSKSYSRSRSRSASD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.25
3 0.18
4 0.21
5 0.21
6 0.24
7 0.28
8 0.27
9 0.3
10 0.3
11 0.31
12 0.28
13 0.26
14 0.22
15 0.18
16 0.16
17 0.14
18 0.15
19 0.14
20 0.15
21 0.14
22 0.12
23 0.13
24 0.14
25 0.15
26 0.14
27 0.17
28 0.22
29 0.28
30 0.3
31 0.29
32 0.29
33 0.28
34 0.27
35 0.26
36 0.2
37 0.17
38 0.18
39 0.18
40 0.18
41 0.17
42 0.16
43 0.14
44 0.12
45 0.11
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.12
67 0.13
68 0.15
69 0.17
70 0.15
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.14
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.12
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.09
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.09
116 0.11
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.14
122 0.17
123 0.18
124 0.18
125 0.24
126 0.32
127 0.37
128 0.43
129 0.49
130 0.55
131 0.62
132 0.67
133 0.66
134 0.63
135 0.61
136 0.61
137 0.54
138 0.44
139 0.36
140 0.3
141 0.23
142 0.18
143 0.14
144 0.07
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.1
153 0.1
154 0.12
155 0.13
156 0.16
157 0.23
158 0.26
159 0.29
160 0.3
161 0.3
162 0.32
163 0.37
164 0.35
165 0.27
166 0.27
167 0.25
168 0.25
169 0.25
170 0.23
171 0.18
172 0.15
173 0.15
174 0.13
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.16
218 0.19
219 0.26
220 0.32
221 0.35
222 0.44
223 0.5
224 0.52
225 0.54
226 0.62
227 0.65
228 0.69
229 0.77
230 0.77
231 0.8
232 0.83
233 0.84