Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1ZDD3

Protein Details
Accession A0A0D1ZDD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31MPPRKRASNSRTPTRPTRRSARQRATVDNDVHydrophilic
44-69AEERAHPPTPRSSKRRKLSEEPAGDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-174RRKPVGPAERKRR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 12, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPRKRASNSRTPTRPTRRSARQRATVDNDVASIYGDMLAEAVAEERAHPPTPRSSKRRKLSEEPAGDIQLDVELFGSSQFEPLIDLDNGAPITGEPAEAPRPQQVVYDDFEESDESDVEFEEVDLEPSLHNQDDSQTTDQTPLQLDLSTKPADSSRHGVQRRKPVGPAERKRRLEVHKAHLICLLAHLSARNRWCESDAVQSILKPLIPRKLVSLFHVDESKPQFQRSHSFNKGLEEICLLWRTSWTISARGMCRAHWKEDVDALKESENAEDLIDFDDFKSAAHSKTGSRDLGAQLLCALLRSIAVDARLVCSLQVLPFSGVAKGQTPEKPKPKYHFAPTQNYDSAFSRPQRPAPSKKRIIESPFPIFWVEVFSPSTSNWIPIDPLVRNTINKPKTGFEPPASDGLNSMTYVIAFEDDGSAKDVTRRYTQWFNAKTRKQRVESTKNGQTWWNQTMTVFEKTFSEARDDIEDAELTKRAENEAMPRNVQDFKDHPVFVLERHLRMNEVIHPKHEVGKVTAGVSKNAKLESVFRRRDVHLCRSADAWYRRGKDVKEGEQPLKRVLSKRKRDANATQQQQQNSFDDDEGDPDSEGTALYAEYQTSTYVPPPVVDGTIPRNAYGNLDVYVPSMIPAGGVHIRHPLAMEAAKVLGINFAEAVTGFEFKGRQGTAVIDGVVVSADMCDAMINVIEGLESQATEESEQARTQIVLATWKRWLTALRVRDKVQREYGDREGTPDINKGIQKEDQQNEDNNTYSNGDASTSDSDYDDGGGFVTEDAEPAERHEEPRVGLTTAPNLKALPDILPPEIVHREIIVVRSPHKVSPPTPLAISTTSKLKTKTTMLDSSSMGDDYNGDGGGGFLLEDGDEEAEPGRPQSQLMNQPPKEPMSKTTKATTEMDTEEEGGGFVVEDDGKAEAEAEAGVEFLLDSHPINLEANDEEAGGFIVEDNETEATESVTATKTEQPEQQSPVQSPVVKDKNKDKDKLKIEEEPGPPRPATKLSSPPQSQSASPGSPNSLLSHDPDEDDAEPEWLLNSLGELE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.83
3 0.8
4 0.82
5 0.82
6 0.85
7 0.89
8 0.88
9 0.87
10 0.84
11 0.85
12 0.83
13 0.79
14 0.71
15 0.6
16 0.5
17 0.41
18 0.34
19 0.26
20 0.18
21 0.11
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.05
32 0.07
33 0.1
34 0.13
35 0.16
36 0.18
37 0.21
38 0.3
39 0.41
40 0.5
41 0.57
42 0.65
43 0.73
44 0.81
45 0.88
46 0.87
47 0.86
48 0.86
49 0.87
50 0.82
51 0.77
52 0.71
53 0.61
54 0.53
55 0.43
56 0.32
57 0.23
58 0.17
59 0.11
60 0.08
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.08
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.09
70 0.09
71 0.14
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.15
76 0.15
77 0.13
78 0.13
79 0.08
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.07
84 0.11
85 0.15
86 0.16
87 0.18
88 0.21
89 0.23
90 0.23
91 0.26
92 0.26
93 0.25
94 0.27
95 0.28
96 0.23
97 0.22
98 0.22
99 0.19
100 0.17
101 0.15
102 0.12
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.1
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.13
121 0.16
122 0.22
123 0.23
124 0.22
125 0.23
126 0.25
127 0.26
128 0.25
129 0.23
130 0.19
131 0.17
132 0.17
133 0.17
134 0.16
135 0.2
136 0.19
137 0.17
138 0.17
139 0.19
140 0.21
141 0.24
142 0.28
143 0.31
144 0.4
145 0.47
146 0.53
147 0.58
148 0.66
149 0.69
150 0.67
151 0.63
152 0.62
153 0.66
154 0.7
155 0.73
156 0.72
157 0.75
158 0.75
159 0.76
160 0.75
161 0.72
162 0.72
163 0.7
164 0.67
165 0.66
166 0.64
167 0.6
168 0.54
169 0.47
170 0.37
171 0.3
172 0.23
173 0.14
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.2
178 0.23
179 0.26
180 0.26
181 0.28
182 0.29
183 0.29
184 0.29
185 0.33
186 0.31
187 0.3
188 0.28
189 0.27
190 0.27
191 0.24
192 0.23
193 0.16
194 0.19
195 0.23
196 0.25
197 0.26
198 0.28
199 0.34
200 0.34
201 0.35
202 0.39
203 0.33
204 0.33
205 0.36
206 0.31
207 0.31
208 0.36
209 0.4
210 0.34
211 0.35
212 0.36
213 0.36
214 0.43
215 0.44
216 0.47
217 0.45
218 0.49
219 0.48
220 0.49
221 0.49
222 0.42
223 0.37
224 0.28
225 0.24
226 0.21
227 0.21
228 0.17
229 0.13
230 0.13
231 0.15
232 0.14
233 0.19
234 0.18
235 0.19
236 0.22
237 0.27
238 0.28
239 0.33
240 0.33
241 0.28
242 0.37
243 0.38
244 0.39
245 0.39
246 0.39
247 0.34
248 0.4
249 0.42
250 0.34
251 0.33
252 0.29
253 0.25
254 0.24
255 0.23
256 0.17
257 0.14
258 0.11
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.14
273 0.15
274 0.16
275 0.22
276 0.27
277 0.24
278 0.23
279 0.25
280 0.24
281 0.28
282 0.25
283 0.2
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.11
288 0.1
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.08
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.14
315 0.18
316 0.24
317 0.33
318 0.41
319 0.47
320 0.52
321 0.57
322 0.63
323 0.65
324 0.66
325 0.67
326 0.65
327 0.69
328 0.66
329 0.66
330 0.58
331 0.52
332 0.46
333 0.38
334 0.34
335 0.29
336 0.28
337 0.29
338 0.3
339 0.34
340 0.4
341 0.46
342 0.54
343 0.58
344 0.66
345 0.68
346 0.7
347 0.71
348 0.68
349 0.68
350 0.65
351 0.61
352 0.57
353 0.48
354 0.44
355 0.4
356 0.33
357 0.25
358 0.22
359 0.17
360 0.12
361 0.13
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.17
366 0.12
367 0.14
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.16
373 0.13
374 0.14
375 0.17
376 0.17
377 0.18
378 0.22
379 0.3
380 0.29
381 0.31
382 0.31
383 0.29
384 0.32
385 0.36
386 0.36
387 0.29
388 0.32
389 0.31
390 0.33
391 0.31
392 0.27
393 0.21
394 0.19
395 0.17
396 0.12
397 0.11
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.06
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.11
412 0.13
413 0.15
414 0.18
415 0.2
416 0.22
417 0.29
418 0.33
419 0.39
420 0.44
421 0.49
422 0.55
423 0.6
424 0.64
425 0.67
426 0.7
427 0.64
428 0.67
429 0.69
430 0.69
431 0.7
432 0.68
433 0.66
434 0.6
435 0.57
436 0.51
437 0.44
438 0.4
439 0.35
440 0.28
441 0.21
442 0.2
443 0.22
444 0.23
445 0.24
446 0.19
447 0.16
448 0.16
449 0.18
450 0.19
451 0.16
452 0.17
453 0.13
454 0.14
455 0.16
456 0.15
457 0.14
458 0.13
459 0.12
460 0.09
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.1
468 0.1
469 0.15
470 0.21
471 0.22
472 0.22
473 0.22
474 0.23
475 0.25
476 0.25
477 0.22
478 0.16
479 0.19
480 0.23
481 0.23
482 0.21
483 0.2
484 0.2
485 0.17
486 0.25
487 0.21
488 0.18
489 0.19
490 0.2
491 0.18
492 0.18
493 0.19
494 0.17
495 0.23
496 0.23
497 0.22
498 0.24
499 0.24
500 0.29
501 0.29
502 0.23
503 0.17
504 0.18
505 0.18
506 0.17
507 0.2
508 0.15
509 0.16
510 0.16
511 0.16
512 0.15
513 0.15
514 0.14
515 0.11
516 0.17
517 0.23
518 0.32
519 0.32
520 0.33
521 0.36
522 0.37
523 0.44
524 0.44
525 0.44
526 0.42
527 0.41
528 0.39
529 0.37
530 0.37
531 0.38
532 0.34
533 0.31
534 0.29
535 0.31
536 0.32
537 0.35
538 0.33
539 0.35
540 0.38
541 0.4
542 0.42
543 0.43
544 0.46
545 0.46
546 0.46
547 0.4
548 0.37
549 0.33
550 0.32
551 0.38
552 0.43
553 0.49
554 0.57
555 0.64
556 0.64
557 0.68
558 0.69
559 0.69
560 0.68
561 0.63
562 0.61
563 0.56
564 0.54
565 0.5
566 0.44
567 0.35
568 0.28
569 0.25
570 0.18
571 0.16
572 0.15
573 0.14
574 0.13
575 0.12
576 0.09
577 0.08
578 0.08
579 0.06
580 0.06
581 0.04
582 0.04
583 0.03
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.05
589 0.05
590 0.06
591 0.07
592 0.07
593 0.09
594 0.09
595 0.08
596 0.09
597 0.1
598 0.09
599 0.09
600 0.1
601 0.12
602 0.17
603 0.17
604 0.15
605 0.16
606 0.16
607 0.17
608 0.16
609 0.14
610 0.1
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.1
615 0.08
616 0.07
617 0.06
618 0.05
619 0.04
620 0.04
621 0.06
622 0.08
623 0.09
624 0.09
625 0.12
626 0.12
627 0.13
628 0.13
629 0.11
630 0.1
631 0.11
632 0.1
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.04
644 0.04
645 0.06
646 0.05
647 0.06
648 0.06
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.11
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.11
657 0.12
658 0.13
659 0.13
660 0.09
661 0.09
662 0.08
663 0.07
664 0.06
665 0.03
666 0.03
667 0.02
668 0.02
669 0.02
670 0.02
671 0.02
672 0.03
673 0.03
674 0.03
675 0.03
676 0.03
677 0.03
678 0.03
679 0.04
680 0.04
681 0.03
682 0.04
683 0.05
684 0.05
685 0.06
686 0.07
687 0.08
688 0.09
689 0.1
690 0.1
691 0.1
692 0.09
693 0.09
694 0.1
695 0.09
696 0.16
697 0.17
698 0.18
699 0.21
700 0.21
701 0.21
702 0.2
703 0.22
704 0.2
705 0.27
706 0.33
707 0.38
708 0.42
709 0.44
710 0.5
711 0.54
712 0.53
713 0.52
714 0.49
715 0.46
716 0.48
717 0.51
718 0.49
719 0.43
720 0.41
721 0.36
722 0.32
723 0.29
724 0.25
725 0.21
726 0.2
727 0.21
728 0.2
729 0.21
730 0.23
731 0.27
732 0.34
733 0.37
734 0.38
735 0.4
736 0.42
737 0.43
738 0.41
739 0.36
740 0.27
741 0.25
742 0.21
743 0.18
744 0.15
745 0.1
746 0.09
747 0.09
748 0.12
749 0.12
750 0.12
751 0.13
752 0.12
753 0.12
754 0.12
755 0.12
756 0.09
757 0.07
758 0.06
759 0.06
760 0.05
761 0.05
762 0.06
763 0.05
764 0.05
765 0.06
766 0.07
767 0.07
768 0.08
769 0.12
770 0.12
771 0.14
772 0.17
773 0.18
774 0.18
775 0.22
776 0.22
777 0.19
778 0.19
779 0.19
780 0.23
781 0.26
782 0.26
783 0.23
784 0.21
785 0.2
786 0.2
787 0.2
788 0.15
789 0.13
790 0.15
791 0.15
792 0.16
793 0.16
794 0.19
795 0.2
796 0.19
797 0.16
798 0.14
799 0.15
800 0.15
801 0.17
802 0.17
803 0.17
804 0.19
805 0.24
806 0.26
807 0.26
808 0.31
809 0.34
810 0.3
811 0.38
812 0.4
813 0.36
814 0.35
815 0.34
816 0.31
817 0.3
818 0.31
819 0.23
820 0.25
821 0.26
822 0.28
823 0.3
824 0.29
825 0.3
826 0.33
827 0.38
828 0.38
829 0.42
830 0.4
831 0.41
832 0.4
833 0.37
834 0.33
835 0.26
836 0.2
837 0.14
838 0.12
839 0.1
840 0.1
841 0.08
842 0.06
843 0.06
844 0.06
845 0.06
846 0.05
847 0.04
848 0.03
849 0.03
850 0.03
851 0.03
852 0.04
853 0.05
854 0.05
855 0.05
856 0.06
857 0.08
858 0.08
859 0.09
860 0.1
861 0.09
862 0.1
863 0.14
864 0.21
865 0.3
866 0.39
867 0.49
868 0.49
869 0.52
870 0.55
871 0.54
872 0.51
873 0.43
874 0.4
875 0.39
876 0.44
877 0.44
878 0.47
879 0.47
880 0.47
881 0.47
882 0.43
883 0.39
884 0.35
885 0.33
886 0.28
887 0.26
888 0.21
889 0.19
890 0.15
891 0.11
892 0.09
893 0.06
894 0.05
895 0.05
896 0.05
897 0.05
898 0.06
899 0.06
900 0.06
901 0.06
902 0.07
903 0.06
904 0.06
905 0.06
906 0.06
907 0.05
908 0.05
909 0.05
910 0.04
911 0.04
912 0.04
913 0.04
914 0.05
915 0.05
916 0.06
917 0.07
918 0.09
919 0.1
920 0.09
921 0.11
922 0.11
923 0.12
924 0.12
925 0.11
926 0.1
927 0.09
928 0.09
929 0.07
930 0.06
931 0.05
932 0.05
933 0.05
934 0.05
935 0.07
936 0.07
937 0.07
938 0.08
939 0.08
940 0.08
941 0.08
942 0.09
943 0.09
944 0.1
945 0.1
946 0.12
947 0.17
948 0.2
949 0.24
950 0.29
951 0.34
952 0.38
953 0.43
954 0.47
955 0.47
956 0.45
957 0.46
958 0.46
959 0.42
960 0.39
961 0.44
962 0.48
963 0.47
964 0.51
965 0.56
966 0.62
967 0.68
968 0.74
969 0.7
970 0.71
971 0.75
972 0.78
973 0.74
974 0.72
975 0.68
976 0.68
977 0.68
978 0.66
979 0.63
980 0.58
981 0.52
982 0.45
983 0.44
984 0.4
985 0.38
986 0.38
987 0.42
988 0.45
989 0.55
990 0.57
991 0.57
992 0.58
993 0.56
994 0.49
995 0.45
996 0.45
997 0.38
998 0.37
999 0.36
1000 0.34
1001 0.33
1002 0.33
1003 0.29
1004 0.26
1005 0.24
1006 0.26
1007 0.28
1008 0.25
1009 0.24
1010 0.24
1011 0.25
1012 0.23
1013 0.24
1014 0.21
1015 0.17
1016 0.16
1017 0.15
1018 0.14
1019 0.11
1020 0.1
1021 0.08