Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1ZN11

Protein Details
Accession A0A0D1ZN11    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
508-551LDAPPKTRSQKVKQSPRRPSTPPRRLGRLNRKSRREDKSPSPTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-365KRRIGGLRRTHATK
370-378KTKSPSSPK
435-469KRRLGRLGKREESISPTRSSSTGRSPSPRRKATKA
513-549KTRSQKVKQSPRRPSTPPRRLGRLNRKSRREDKSPSP
645-660KRNIAEGVGVKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MPPKVQQGWQELQIPSRKECPKLFYLFTTSSDSFLLLLTDLISIWQCSLDKFGIIAEANRQNASIDPSDSDTQFKVLLSKLSQSLQGGQNALARDDKRTSNDLHLITKCNLPRPLKPLKWTFRASQQDTSELAERLLRPSLHEVSVLEAKIASLLEIIREKDHIISRLLDRIGTSGVDLGLIFPSISGLASRKGGQLSASDAQKHVPGMATFDEKSWIMQFATEDGYEGFDSTGLKNLVSGCEKCFAHTREQHEGWLRTLPSSNQLDKMEGETNDSTSSTAPEGQAESSVKRSSRPSCDTTGSDGDFERQPTPPRSKKAGSSPKTTSPPVSPAKQDEGSTDETDPEQTRPNKRRIGGLRRTHATKVSSDKTKSPSSPKKPAASSSHRASSASSGTPTASETQSESETDQRKQHQNSINAQPTQKAANTESHTNGKRRLGRLGKREESISPTRSSSTGRSPSPRRKATKAPDAKQDSKTSTPLSNRRLGRLNKHSAPSPEASSDEDDDLDAPPKTRSQKVKQSPRRPSTPPRRLGRLNRKSRREDKSPSPTETPRSTKRTPSSRSKIDADGDIAMQEGKDCDTDAETNTDTAGSSSDTPGAARSAAGQTNVTIPAADTTGGSSTAQQPEQEETVEQRADRRRVELKRNIAEGVGVKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.44
3 0.48
4 0.49
5 0.49
6 0.52
7 0.53
8 0.54
9 0.57
10 0.56
11 0.51
12 0.53
13 0.49
14 0.47
15 0.48
16 0.41
17 0.36
18 0.32
19 0.28
20 0.21
21 0.19
22 0.16
23 0.09
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.06
28 0.07
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.15
41 0.16
42 0.16
43 0.2
44 0.25
45 0.26
46 0.26
47 0.26
48 0.23
49 0.24
50 0.28
51 0.22
52 0.18
53 0.18
54 0.23
55 0.26
56 0.26
57 0.27
58 0.22
59 0.21
60 0.21
61 0.19
62 0.17
63 0.16
64 0.19
65 0.19
66 0.22
67 0.24
68 0.24
69 0.26
70 0.25
71 0.29
72 0.29
73 0.3
74 0.27
75 0.26
76 0.28
77 0.26
78 0.26
79 0.25
80 0.22
81 0.23
82 0.26
83 0.28
84 0.3
85 0.33
86 0.35
87 0.36
88 0.42
89 0.41
90 0.43
91 0.42
92 0.42
93 0.4
94 0.43
95 0.39
96 0.39
97 0.44
98 0.42
99 0.45
100 0.48
101 0.57
102 0.56
103 0.61
104 0.64
105 0.65
106 0.68
107 0.67
108 0.63
109 0.62
110 0.67
111 0.64
112 0.61
113 0.55
114 0.51
115 0.48
116 0.47
117 0.4
118 0.31
119 0.26
120 0.22
121 0.21
122 0.19
123 0.22
124 0.19
125 0.19
126 0.24
127 0.27
128 0.24
129 0.24
130 0.22
131 0.22
132 0.26
133 0.23
134 0.17
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.08
140 0.05
141 0.05
142 0.08
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.13
147 0.14
148 0.17
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.21
153 0.22
154 0.27
155 0.26
156 0.23
157 0.19
158 0.18
159 0.17
160 0.14
161 0.12
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.11
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.17
185 0.2
186 0.21
187 0.2
188 0.2
189 0.2
190 0.21
191 0.2
192 0.15
193 0.12
194 0.1
195 0.12
196 0.13
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.16
201 0.14
202 0.15
203 0.13
204 0.13
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.08
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.14
226 0.16
227 0.17
228 0.14
229 0.19
230 0.2
231 0.2
232 0.27
233 0.26
234 0.32
235 0.36
236 0.41
237 0.43
238 0.44
239 0.46
240 0.46
241 0.45
242 0.37
243 0.36
244 0.3
245 0.23
246 0.24
247 0.2
248 0.2
249 0.24
250 0.24
251 0.24
252 0.24
253 0.24
254 0.23
255 0.26
256 0.23
257 0.18
258 0.21
259 0.17
260 0.17
261 0.16
262 0.16
263 0.13
264 0.1
265 0.11
266 0.08
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.08
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.14
277 0.14
278 0.16
279 0.21
280 0.24
281 0.3
282 0.35
283 0.36
284 0.37
285 0.4
286 0.39
287 0.38
288 0.36
289 0.29
290 0.24
291 0.21
292 0.19
293 0.17
294 0.17
295 0.14
296 0.13
297 0.17
298 0.21
299 0.3
300 0.34
301 0.38
302 0.43
303 0.43
304 0.46
305 0.52
306 0.58
307 0.53
308 0.54
309 0.52
310 0.53
311 0.54
312 0.51
313 0.42
314 0.33
315 0.36
316 0.33
317 0.31
318 0.27
319 0.26
320 0.29
321 0.29
322 0.27
323 0.21
324 0.21
325 0.22
326 0.21
327 0.19
328 0.15
329 0.14
330 0.15
331 0.15
332 0.13
333 0.16
334 0.2
335 0.29
336 0.35
337 0.42
338 0.45
339 0.46
340 0.53
341 0.55
342 0.61
343 0.61
344 0.63
345 0.62
346 0.6
347 0.61
348 0.54
349 0.49
350 0.4
351 0.34
352 0.33
353 0.32
354 0.35
355 0.34
356 0.37
357 0.38
358 0.41
359 0.41
360 0.44
361 0.49
362 0.51
363 0.59
364 0.61
365 0.62
366 0.59
367 0.62
368 0.6
369 0.58
370 0.56
371 0.5
372 0.48
373 0.43
374 0.41
375 0.36
376 0.3
377 0.25
378 0.2
379 0.16
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.13
384 0.12
385 0.1
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.17
393 0.2
394 0.23
395 0.26
396 0.31
397 0.38
398 0.4
399 0.47
400 0.48
401 0.51
402 0.55
403 0.59
404 0.59
405 0.55
406 0.53
407 0.45
408 0.39
409 0.35
410 0.3
411 0.23
412 0.18
413 0.22
414 0.25
415 0.27
416 0.28
417 0.34
418 0.36
419 0.37
420 0.39
421 0.4
422 0.43
423 0.42
424 0.48
425 0.51
426 0.55
427 0.61
428 0.66
429 0.62
430 0.58
431 0.58
432 0.5
433 0.47
434 0.45
435 0.39
436 0.31
437 0.29
438 0.28
439 0.27
440 0.28
441 0.25
442 0.28
443 0.31
444 0.33
445 0.4
446 0.48
447 0.57
448 0.65
449 0.7
450 0.67
451 0.67
452 0.74
453 0.74
454 0.76
455 0.76
456 0.71
457 0.72
458 0.74
459 0.74
460 0.69
461 0.65
462 0.59
463 0.52
464 0.51
465 0.44
466 0.41
467 0.43
468 0.47
469 0.47
470 0.5
471 0.48
472 0.49
473 0.55
474 0.55
475 0.56
476 0.58
477 0.61
478 0.59
479 0.6
480 0.6
481 0.55
482 0.54
483 0.47
484 0.4
485 0.33
486 0.29
487 0.28
488 0.26
489 0.24
490 0.2
491 0.18
492 0.15
493 0.14
494 0.13
495 0.14
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.16
500 0.21
501 0.28
502 0.36
503 0.43
504 0.54
505 0.63
506 0.74
507 0.8
508 0.86
509 0.89
510 0.88
511 0.86
512 0.83
513 0.83
514 0.83
515 0.82
516 0.81
517 0.77
518 0.77
519 0.79
520 0.82
521 0.83
522 0.82
523 0.83
524 0.84
525 0.86
526 0.87
527 0.88
528 0.85
529 0.82
530 0.8
531 0.79
532 0.8
533 0.78
534 0.74
535 0.71
536 0.67
537 0.65
538 0.65
539 0.63
540 0.6
541 0.62
542 0.6
543 0.63
544 0.68
545 0.71
546 0.7
547 0.73
548 0.74
549 0.74
550 0.76
551 0.71
552 0.66
553 0.59
554 0.54
555 0.45
556 0.37
557 0.29
558 0.23
559 0.19
560 0.14
561 0.11
562 0.09
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.08
567 0.08
568 0.11
569 0.13
570 0.14
571 0.18
572 0.18
573 0.17
574 0.17
575 0.16
576 0.13
577 0.12
578 0.11
579 0.09
580 0.1
581 0.11
582 0.12
583 0.12
584 0.13
585 0.14
586 0.14
587 0.12
588 0.1
589 0.12
590 0.15
591 0.17
592 0.18
593 0.18
594 0.17
595 0.2
596 0.21
597 0.18
598 0.13
599 0.12
600 0.12
601 0.12
602 0.11
603 0.09
604 0.09
605 0.1
606 0.11
607 0.11
608 0.12
609 0.17
610 0.23
611 0.24
612 0.23
613 0.25
614 0.28
615 0.29
616 0.28
617 0.23
618 0.22
619 0.27
620 0.28
621 0.26
622 0.3
623 0.38
624 0.43
625 0.44
626 0.47
627 0.5
628 0.57
629 0.67
630 0.69
631 0.7
632 0.71
633 0.72
634 0.66
635 0.57
636 0.51
637 0.45
638 0.44
639 0.44
640 0.42