FuNGI

A0A0D1ZU44

Protein Details

Accession

A0A0D1ZU44

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
56-77	NGHIPKPQQLRKPLPHPPRTSS	Hydrophilic
139-159	SEFPKPARLHRRDPKAQPPGP	Basic
206-225	GSKSTFKKKTQQVWLPNRSV	Hydrophilic
529-552	GTDASTRKKKIKSKHLSSTQPTPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-28	KRKKPA
417-434	RKEAEAKKRNFRDLRKAL
536-540	KKKIK

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MNPGGVPPGGPANRPQVPAPTIKRKKPAADPFFKASRKPALTGNLQSKGGLPLPVNGHIPKPQQLRKPLPHPPRTSSPATLPVPENERVSGFSDPRVTAEGIPYKDYKLVTTKRDLINAARYHILQLAGEKVLDIRNESEFPKPARLHRRDPKAQPPGPQPKEETGPEPKDGLNAVEREELGRRKEIRQKEREANLAQIAPSQKTGSKSTFKKKTQQVWLPNRSVEQKRRDQTAYEEKLPWHLEDFDNKHTLVGHHQPGSISTHAAFLYEPGSNGTDGKFRLIPVEKLYQFKPKRELAQQMSIEEVEAAMKKRGTDPEWLVRQRESRIAEAGREAAARQAKSLFSGAQKQNIAGRGGEDADLDFEDDFADDEEGDLFADKDEDEKIAEKRIKEDQLTANFLDFKDIKEYDEAEERERKEAEAKKRNFRDLRKALERRERNYNHGSDSDESSSTDSEEERERIERERLENIKREEDAANKSGLNSGANTPSGRKEKHATSSDREGSGIKKSASSRTLKRPGSPNLSDASGTDASTRKKKIKSKHLSSTQPTPSVSRPMSPANVPSSSAPGGLDPNRIRQRGRGGAGAGSDTDNVASDREGGAMSDASRARQKLKLKMSASPPPGGGTSTPQPSSRAGSPARSPSAMIGVTELPSKDEIRKAIPQGGIAIKDLMKVVAHPKDRRAEFVALVKEVARMDQVSRLLVLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.39
3	0.37
4	0.39
5	0.47
6	0.52
7	0.55
8	0.59
9	0.65
10	0.72
11	0.72
12	0.76
13	0.77
14	0.8
15	0.79
16	0.79
17	0.77
18	0.75
19	0.77
20	0.72
21	0.64
22	0.59
23	0.58
24	0.53
25	0.49
26	0.48
27	0.46
28	0.51
29	0.56
30	0.58
31	0.53
32	0.5
33	0.48
34	0.43
35	0.4
36	0.35
37	0.3
38	0.22
39	0.22
40	0.25
41	0.28
42	0.31
43	0.28
44	0.29
45	0.32
46	0.35
47	0.38
48	0.44
49	0.49
50	0.53
51	0.62
52	0.69
53	0.72
54	0.77
55	0.8
56	0.81
57	0.83
58	0.81
59	0.78
60	0.77
61	0.74
62	0.71
63	0.64
64	0.59
65	0.58
66	0.53
67	0.5
68	0.44
69	0.42
70	0.41
71	0.4
72	0.37
73	0.29
74	0.28
75	0.26
76	0.26
77	0.27
78	0.23
79	0.24
80	0.26
81	0.26
82	0.26
83	0.27
84	0.25
85	0.21
86	0.26
87	0.29
88	0.27
89	0.3
90	0.29
91	0.28
92	0.3
93	0.29
94	0.26
95	0.28
96	0.33
97	0.36
98	0.42
99	0.48
100	0.48
101	0.51
102	0.5
103	0.45
104	0.48
105	0.45
106	0.4
107	0.35
108	0.32
109	0.3
110	0.29
111	0.25
112	0.16
113	0.16
114	0.16
115	0.14
116	0.14
117	0.12
118	0.11
119	0.13
120	0.13
121	0.14
122	0.13
123	0.15
124	0.18
125	0.19
126	0.23
127	0.25
128	0.27
129	0.34
130	0.35
131	0.41
132	0.5
133	0.55
134	0.61
135	0.66
136	0.74
137	0.74
138	0.79
139	0.81
140	0.81
141	0.78
142	0.75
143	0.76
144	0.77
145	0.72
146	0.67
147	0.61
148	0.54
149	0.55
150	0.5
151	0.45
152	0.43
153	0.42
154	0.4
155	0.38
156	0.34
157	0.3
158	0.28
159	0.25
160	0.2
161	0.17
162	0.17
163	0.17
164	0.17
165	0.17
166	0.22
167	0.24
168	0.22
169	0.29
170	0.29
171	0.35
172	0.43
173	0.52
174	0.57
175	0.62
176	0.68
177	0.7
178	0.72
179	0.72
180	0.65
181	0.58
182	0.5
183	0.43
184	0.34
185	0.29
186	0.26
187	0.2
188	0.19
189	0.17
190	0.17
191	0.19
192	0.23
193	0.25
194	0.32
195	0.39
196	0.48
197	0.57
198	0.59
199	0.65
200	0.7
201	0.74
202	0.76
203	0.77
204	0.77
205	0.78
206	0.81
207	0.74
208	0.67
209	0.6
210	0.58
211	0.57
212	0.54
213	0.52
214	0.53
215	0.54
216	0.59
217	0.58
218	0.52
219	0.51
220	0.54
221	0.52
222	0.46
223	0.44
224	0.38
225	0.42
226	0.41
227	0.33
228	0.24
229	0.21
230	0.19
231	0.24
232	0.28
233	0.27
234	0.28
235	0.27
236	0.25
237	0.24
238	0.23
239	0.21
240	0.24
241	0.24
242	0.23
243	0.24
244	0.24
245	0.24
246	0.27
247	0.22
248	0.16
249	0.12
250	0.13
251	0.12
252	0.12
253	0.11
254	0.08
255	0.09
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.1
264	0.1
265	0.12
266	0.12
267	0.11
268	0.16
269	0.18
270	0.19
271	0.2
272	0.27
273	0.27
274	0.29
275	0.31
276	0.36
277	0.37
278	0.39
279	0.42
280	0.38
281	0.42
282	0.44
283	0.51
284	0.46
285	0.51
286	0.48
287	0.42
288	0.39
289	0.34
290	0.28
291	0.19
292	0.14
293	0.07
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.09
298	0.09
299	0.12
300	0.15
301	0.17
302	0.21
303	0.24
304	0.3
305	0.37
306	0.39
307	0.38
308	0.37
309	0.37
310	0.33
311	0.35
312	0.29
313	0.23
314	0.25
315	0.24
316	0.22
317	0.2
318	0.19
319	0.14
320	0.12
321	0.1
322	0.11
323	0.13
324	0.13
325	0.12
326	0.13
327	0.13
328	0.14
329	0.14
330	0.12
331	0.11
332	0.2
333	0.2
334	0.23
335	0.23
336	0.23
337	0.24
338	0.25
339	0.24
340	0.15
341	0.15
342	0.11
343	0.11
344	0.11
345	0.08
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.03
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.08
372	0.09
373	0.15
374	0.18
375	0.17
376	0.2
377	0.26
378	0.28
379	0.27
380	0.31
381	0.3
382	0.31
383	0.34
384	0.31
385	0.26
386	0.24
387	0.23
388	0.22
389	0.16
390	0.13
391	0.15
392	0.15
393	0.15
394	0.15
395	0.17
396	0.15
397	0.21
398	0.21
399	0.2
400	0.25
401	0.25
402	0.26
403	0.26
404	0.24
405	0.26
406	0.32
407	0.39
408	0.44
409	0.49
410	0.56
411	0.61
412	0.69
413	0.69
414	0.68
415	0.68
416	0.65
417	0.68
418	0.68
419	0.7
420	0.68
421	0.71
422	0.71
423	0.64
424	0.68
425	0.62
426	0.59
427	0.59
428	0.54
429	0.47
430	0.42
431	0.41
432	0.32
433	0.32
434	0.27
435	0.21
436	0.19
437	0.17
438	0.16
439	0.13
440	0.12
441	0.09
442	0.09
443	0.12
444	0.12
445	0.13
446	0.15
447	0.16
448	0.19
449	0.23
450	0.25
451	0.25
452	0.32
453	0.37
454	0.4
455	0.45
456	0.45
457	0.45
458	0.42
459	0.41
460	0.35
461	0.34
462	0.33
463	0.28
464	0.26
465	0.22
466	0.22
467	0.21
468	0.2
469	0.16
470	0.12
471	0.13
472	0.13
473	0.15
474	0.15
475	0.15
476	0.21
477	0.26
478	0.26
479	0.28
480	0.31
481	0.35
482	0.43
483	0.49
484	0.48
485	0.47
486	0.55
487	0.55
488	0.5
489	0.45
490	0.38
491	0.32
492	0.32
493	0.3
494	0.22
495	0.22
496	0.24
497	0.29
498	0.34
499	0.39
500	0.41
501	0.47
502	0.57
503	0.55
504	0.59
505	0.61
506	0.63
507	0.64
508	0.59
509	0.51
510	0.44
511	0.42
512	0.37
513	0.29
514	0.27
515	0.19
516	0.17
517	0.17
518	0.19
519	0.23
520	0.29
521	0.35
522	0.36
523	0.44
524	0.51
525	0.59
526	0.66
527	0.73
528	0.76
529	0.81
530	0.83
531	0.84
532	0.82
533	0.81
534	0.75
535	0.68
536	0.59
537	0.52
538	0.45
539	0.44
540	0.4
541	0.33
542	0.3
543	0.31
544	0.33
545	0.31
546	0.32
547	0.29
548	0.29
549	0.28
550	0.25
551	0.26
552	0.23
553	0.22
554	0.18
555	0.14
556	0.18
557	0.19
558	0.26
559	0.23
560	0.33
561	0.4
562	0.42
563	0.42
564	0.43
565	0.5
566	0.5
567	0.51
568	0.45
569	0.39
570	0.38
571	0.38
572	0.33
573	0.25
574	0.18
575	0.15
576	0.11
577	0.1
578	0.09
579	0.08
580	0.08
581	0.07
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.08
586	0.08
587	0.09
588	0.09
589	0.09
590	0.14
591	0.14
592	0.16
593	0.21
594	0.23
595	0.26
596	0.32
597	0.39
598	0.43
599	0.51
600	0.58
601	0.55
602	0.61
603	0.64
604	0.67
605	0.64
606	0.57
607	0.48
608	0.41
609	0.39
610	0.33
611	0.27
612	0.23
613	0.25
614	0.28
615	0.3
616	0.29
617	0.31
618	0.31
619	0.36
620	0.33
621	0.34
622	0.32
623	0.35
624	0.4
625	0.45
626	0.47
627	0.42
628	0.4
629	0.34
630	0.36
631	0.31
632	0.25
633	0.2
634	0.17
635	0.17
636	0.19
637	0.18
638	0.15
639	0.17
640	0.19
641	0.2
642	0.24
643	0.26
644	0.29
645	0.36
646	0.39
647	0.43
648	0.42
649	0.39
650	0.39
651	0.4
652	0.36
653	0.3
654	0.29
655	0.22
656	0.22
657	0.21
658	0.17
659	0.13
660	0.14
661	0.21
662	0.27
663	0.35
664	0.38
665	0.45
666	0.54
667	0.55
668	0.59
669	0.56
670	0.52
671	0.48
672	0.51
673	0.49
674	0.4
675	0.39
676	0.34
677	0.31
678	0.27
679	0.23
680	0.18
681	0.15
682	0.16
683	0.2
684	0.22
685	0.2

A0A0D1ZU44

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer