Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1Y6H5

Protein Details
Accession A0A0D1Y6H5    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-73QGHGTAKKTKKSKPSANSPKTNGIGSKTNKSKRKSPTPESTTSDHydrophilic
111-131TSSANKRKSRPEPQTASRKKTHydrophilic
340-374QTDGGDTPKKQKKDKSKASPEKKKKRRRIVDEEVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-63KKTKKSKPSANSPKTNGIGSKTNKSKRK
116-133KRKSRPEPQTASRKKTKP
347-367PKKQKKDKSKASPEKKKKRRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAKSKVQARPSQLSNERIVDTSDEENDMVQGHGTAKKTKKSKPSANSPKTNGIGSKTNKSKRKSPTPESTTSDAESSSSPLAEDEAQESSGAESDDGSDSEGDSSSATSSTSSANKRKSRPEPQTASRKKTKPNTSSKVRIAPVPYKAPSGYESFALSASDSASQSTSLFENLSGKQIWHISAPASLSLQPITELDIQAALQGRSILTKNGIDYNMHPAPSQHEILLLPAGQDSTYEQIEVGVTRTFDLREMSTIPRAKAKDKAQSSTASIVFTATKEGTTGQPRKQPEGLRQRYIPFGAQVGNPDQAIGKSRTTFQVPDEILREEPANKATTSSLKKMQTDGGDTPKKQKKDKSKASPEKKKKRRRIVDEEVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.56
3 0.5
4 0.43
5 0.4
6 0.32
7 0.29
8 0.26
9 0.23
10 0.21
11 0.19
12 0.18
13 0.17
14 0.16
15 0.12
16 0.09
17 0.09
18 0.1
19 0.14
20 0.17
21 0.25
22 0.3
23 0.39
24 0.46
25 0.53
26 0.61
27 0.68
28 0.75
29 0.77
30 0.82
31 0.85
32 0.87
33 0.88
34 0.83
35 0.81
36 0.73
37 0.66
38 0.57
39 0.5
40 0.49
41 0.45
42 0.49
43 0.51
44 0.58
45 0.62
46 0.65
47 0.69
48 0.71
49 0.77
50 0.77
51 0.77
52 0.79
53 0.79
54 0.81
55 0.78
56 0.72
57 0.63
58 0.55
59 0.46
60 0.35
61 0.28
62 0.22
63 0.18
64 0.14
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.07
80 0.06
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.09
98 0.15
99 0.21
100 0.27
101 0.36
102 0.43
103 0.49
104 0.58
105 0.65
106 0.69
107 0.72
108 0.75
109 0.74
110 0.76
111 0.82
112 0.8
113 0.78
114 0.77
115 0.73
116 0.72
117 0.74
118 0.75
119 0.74
120 0.76
121 0.77
122 0.77
123 0.79
124 0.76
125 0.73
126 0.64
127 0.57
128 0.51
129 0.48
130 0.44
131 0.41
132 0.37
133 0.31
134 0.3
135 0.28
136 0.25
137 0.24
138 0.2
139 0.15
140 0.15
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.08
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.1
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.13
201 0.2
202 0.2
203 0.2
204 0.19
205 0.16
206 0.19
207 0.22
208 0.21
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.1
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.09
237 0.1
238 0.13
239 0.15
240 0.21
241 0.24
242 0.24
243 0.28
244 0.3
245 0.31
246 0.36
247 0.41
248 0.43
249 0.44
250 0.47
251 0.44
252 0.45
253 0.45
254 0.42
255 0.36
256 0.27
257 0.22
258 0.2
259 0.18
260 0.15
261 0.15
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.11
266 0.15
267 0.23
268 0.29
269 0.32
270 0.38
271 0.41
272 0.46
273 0.51
274 0.51
275 0.52
276 0.57
277 0.59
278 0.59
279 0.6
280 0.57
281 0.55
282 0.51
283 0.43
284 0.33
285 0.27
286 0.23
287 0.21
288 0.21
289 0.2
290 0.2
291 0.18
292 0.17
293 0.16
294 0.14
295 0.18
296 0.18
297 0.18
298 0.18
299 0.21
300 0.24
301 0.27
302 0.28
303 0.25
304 0.31
305 0.29
306 0.31
307 0.32
308 0.3
309 0.27
310 0.27
311 0.27
312 0.2
313 0.21
314 0.2
315 0.2
316 0.18
317 0.19
318 0.2
319 0.27
320 0.32
321 0.35
322 0.4
323 0.43
324 0.45
325 0.46
326 0.49
327 0.44
328 0.44
329 0.44
330 0.46
331 0.49
332 0.49
333 0.57
334 0.59
335 0.62
336 0.64
337 0.69
338 0.7
339 0.74
340 0.83
341 0.84
342 0.87
343 0.91
344 0.95
345 0.96
346 0.96
347 0.96
348 0.96
349 0.96
350 0.95
351 0.96
352 0.95
353 0.94
354 0.94