FuNGI

A0A0D1YBH6

Protein Details

Accession

A0A0D1YBH6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1208-1229	QSQLYKPPHKPAQVRRKKLDGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MSKFTSSKASSLLDDTNPPYPDAQRMGILSRTFSSSQVIRWIIPARIRSPFKSDVVFVGETFVQLREFLENGQLADATAKLDFGTQILAAKVISARVEVVPVVDALLSYGRDQERYMIDGRPVKGTEPPQILVLCTFDNEMIYLYAKDGPGGDTKFFFAKRSLYPGLVLPDRQCQHMAVDQDSRALAVASSSGYVATFSLQTIHNVRSQVDEWEPHKPRSFQPWHEQRFIQVDGSILKMEFLRSSDTELSKVLLLLLVDSGEETHQILYKWDTRHPLQKMRSMSCSGRALKEDRFPLMLIPSTRPYCFVVVMDTGISFYENIHTHDFKRINCRFMKPTAGPLVWVQWAKPRRHTGHLEKRDDLFIVREDGMLQQFLIEKASNLKFNMNFIVGYLDINVDTAFCMLAGPPGMGGDVLIAAGDMTDGGVYHLPARGVPTRIQVIPNLAPLHDMVIGAQLPDPVPQHSETGREQPERLYLCGGKDEAHGEVSELRYGLEAQMIWTMDCPDANTIDHMSTIEVPLQQKLLFVASHNTHTTVIIFDLDTQESEFADATSLPRFDFNSATLAVRLFANHYLIQITHSGVVVVDMSSKDDARDHDMQDPRSFSHAAIADDGTVALVVRNPGGYEVEVAAIQPCESEAPVVRYGPSNTILSSLGEVTCLCHVMHGSASLIIIGTSTARVIGYNVKQDMTLEPAFESDLTSGASDIEVAPIASLAVLSPEGSKLSLLLVGLRNGILLCLQLKIGGSSIPNPTLLSHRRLGPTTVDIMPEKNSLGPHPPSSALVLCQSQLYRITLHHATTSLDFTMSSVWLTNRIDPTAGQPDINASHRIPQLTGHYTDPGGLLVCAGDDELYFASLVSEEHSLATRRRVDGVPRRILFSNSLNHFAIAVEKSVRVDKFSMDTYTNPNPGQQIGLKSPNGSNLQRASGFEDVVQISLQFARQDLGSTDEIEPIIVDDKNARLNAMIEWQFRDGKDVHSWIVMALEQIEPNDHRQTAGRVIAVNTKNILLGGRSVTPKVLYRSNAAPVTALCAYGVSSLLFSAGNELMLLKLSYSKKQSDIVYKYQLPSPARSISCQGSMIFVATSHHSLVVLIEKDEKLELHKTDIKARNATDVVAFGDNSAMLLSFDDRGTHLVAFAGFNQASTRQPVPIFQADLPLLIDRIQLRHDRISRGGAHHRFFGSTTDGTIYHLTTIQHHEWKLLHFLEEQSQLYKPPHKPAQVRRKKLDGSGYMWQPAMRLTDLHVRGDRLLMMVEPGPYNLRRVLKNQDQLERFQQLARPVLRADVDDPVEAITCWLRGILRFPPNFPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.32
3	0.35
4	0.33
5	0.32
6	0.31
7	0.29
8	0.32
9	0.32
10	0.3
11	0.27
12	0.28
13	0.3
14	0.33
15	0.32
16	0.28
17	0.26
18	0.29
19	0.27
20	0.26
21	0.27
22	0.24
23	0.25
24	0.3
25	0.31
26	0.26
27	0.3
28	0.34
29	0.33
30	0.37
31	0.4
32	0.36
33	0.44
34	0.48
35	0.47
36	0.51
37	0.51
38	0.49
39	0.47
40	0.44
41	0.38
42	0.39
43	0.36
44	0.29
45	0.26
46	0.23
47	0.2
48	0.2
49	0.17
50	0.12
51	0.11
52	0.12
53	0.11
54	0.12
55	0.12
56	0.16
57	0.16
58	0.16
59	0.17
60	0.16
61	0.13
62	0.14
63	0.13
64	0.09
65	0.08
66	0.08
67	0.07
68	0.08
69	0.08
70	0.08
71	0.09
72	0.08
73	0.1
74	0.1
75	0.11
76	0.09
77	0.11
78	0.11
79	0.11
80	0.11
81	0.1
82	0.11
83	0.11
84	0.13
85	0.11
86	0.11
87	0.1
88	0.1
89	0.09
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.08
94	0.09
95	0.08
96	0.14
97	0.15
98	0.16
99	0.17
100	0.21
101	0.21
102	0.24
103	0.26
104	0.23
105	0.28
106	0.34
107	0.35
108	0.36
109	0.34
110	0.32
111	0.36
112	0.38
113	0.39
114	0.37
115	0.37
116	0.35
117	0.35
118	0.34
119	0.28
120	0.26
121	0.18
122	0.15
123	0.15
124	0.11
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.09
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.13
133	0.13
134	0.13
135	0.13
136	0.14
137	0.18
138	0.21
139	0.21
140	0.19
141	0.21
142	0.25
143	0.25
144	0.25
145	0.22
146	0.25
147	0.26
148	0.33
149	0.34
150	0.3
151	0.31
152	0.32
153	0.35
154	0.33
155	0.32
156	0.27
157	0.32
158	0.33
159	0.33
160	0.31
161	0.26
162	0.27
163	0.29
164	0.3
165	0.25
166	0.29
167	0.27
168	0.27
169	0.26
170	0.23
171	0.18
172	0.15
173	0.11
174	0.07
175	0.07
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.07
184	0.07
185	0.06
186	0.09
187	0.1
188	0.13
189	0.16
190	0.18
191	0.2
192	0.21
193	0.22
194	0.24
195	0.24
196	0.25
197	0.25
198	0.29
199	0.28
200	0.37
201	0.41
202	0.41
203	0.46
204	0.45
205	0.46
206	0.51
207	0.58
208	0.54
209	0.61
210	0.67
211	0.68
212	0.7
213	0.66
214	0.59
215	0.55
216	0.5
217	0.4
218	0.29
219	0.24
220	0.2
221	0.21
222	0.18
223	0.13
224	0.12
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.14
230	0.13
231	0.19
232	0.23
233	0.24
234	0.24
235	0.24
236	0.24
237	0.2
238	0.19
239	0.14
240	0.1
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.06
251	0.06
252	0.08
253	0.09
254	0.1
255	0.14
256	0.2
257	0.22
258	0.26
259	0.31
260	0.34
261	0.42
262	0.48
263	0.53
264	0.52
265	0.57
266	0.6
267	0.58
268	0.58
269	0.55
270	0.5
271	0.47
272	0.49
273	0.45
274	0.41
275	0.4
276	0.39
277	0.39
278	0.43
279	0.39
280	0.34
281	0.33
282	0.3
283	0.27
284	0.26
285	0.25
286	0.21
287	0.21
288	0.25
289	0.26
290	0.26
291	0.27
292	0.26
293	0.24
294	0.23
295	0.2
296	0.17
297	0.15
298	0.15
299	0.13
300	0.11
301	0.1
302	0.09
303	0.09
304	0.06
305	0.06
306	0.1
307	0.11
308	0.14
309	0.18
310	0.2
311	0.21
312	0.29
313	0.33
314	0.31
315	0.41
316	0.42
317	0.45
318	0.48
319	0.53
320	0.49
321	0.48
322	0.53
323	0.44
324	0.46
325	0.46
326	0.41
327	0.36
328	0.32
329	0.31
330	0.27
331	0.26
332	0.2
333	0.22
334	0.29
335	0.31
336	0.38
337	0.45
338	0.46
339	0.53
340	0.61
341	0.64
342	0.68
343	0.75
344	0.73
345	0.66
346	0.64
347	0.57
348	0.49
349	0.39
350	0.3
351	0.21
352	0.19
353	0.16
354	0.14
355	0.13
356	0.14
357	0.14
358	0.12
359	0.11
360	0.08
361	0.09
362	0.09
363	0.1
364	0.08
365	0.08
366	0.14
367	0.17
368	0.19
369	0.18
370	0.23
371	0.21
372	0.23
373	0.25
374	0.19
375	0.17
376	0.14
377	0.15
378	0.11
379	0.11
380	0.09
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.03
390	0.04
391	0.03
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.04
399	0.04
400	0.03
401	0.03
402	0.03
403	0.03
404	0.02
405	0.02
406	0.02
407	0.02
408	0.02
409	0.02
410	0.02
411	0.02
412	0.03
413	0.04
414	0.04
415	0.05
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.11
420	0.14
421	0.16
422	0.17
423	0.2
424	0.22
425	0.23
426	0.24
427	0.21
428	0.22
429	0.21
430	0.24
431	0.21
432	0.17
433	0.17
434	0.16
435	0.16
436	0.12
437	0.1
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.08
443	0.07
444	0.06
445	0.08
446	0.09
447	0.08
448	0.1
449	0.11
450	0.13
451	0.13
452	0.17
453	0.17
454	0.24
455	0.29
456	0.28
457	0.28
458	0.27
459	0.32
460	0.3
461	0.28
462	0.24
463	0.2
464	0.19
465	0.2
466	0.2
467	0.15
468	0.14
469	0.15
470	0.12
471	0.11
472	0.1
473	0.09
474	0.11
475	0.1
476	0.1
477	0.09
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.07
483	0.06
484	0.06
485	0.08
486	0.08
487	0.07
488	0.08
489	0.09
490	0.08
491	0.08
492	0.08
493	0.07
494	0.08
495	0.08
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.09
500	0.08
501	0.08
502	0.07
503	0.08
504	0.08
505	0.09
506	0.1
507	0.1
508	0.11
509	0.1
510	0.1
511	0.1
512	0.1
513	0.08
514	0.08
515	0.12
516	0.12
517	0.15
518	0.15
519	0.16
520	0.15
521	0.15
522	0.15
523	0.11
524	0.1
525	0.07
526	0.07
527	0.06
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.07
533	0.06
534	0.07
535	0.06
536	0.04
537	0.05
538	0.05
539	0.06
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.08
544	0.09
545	0.1
546	0.11
547	0.1
548	0.11
549	0.12
550	0.12
551	0.11
552	0.11
553	0.1
554	0.09
555	0.08
556	0.07
557	0.07
558	0.09
559	0.09
560	0.09
561	0.09
562	0.09
563	0.1
564	0.1
565	0.09
566	0.08
567	0.07
568	0.07
569	0.06
570	0.06
571	0.05
572	0.04
573	0.05
574	0.04
575	0.05
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.08
580	0.09
581	0.14
582	0.17
583	0.18
584	0.24
585	0.28
586	0.3
587	0.3
588	0.3
589	0.25
590	0.25
591	0.24
592	0.16
593	0.17
594	0.17
595	0.16
596	0.16
597	0.15
598	0.12
599	0.11
600	0.11
601	0.07
602	0.04
603	0.04
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.05
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.05
620	0.05
621	0.04
622	0.04
623	0.03
624	0.04
625	0.04
626	0.05
627	0.08
628	0.09
629	0.09
630	0.1
631	0.11
632	0.12
633	0.13
634	0.14
635	0.11
636	0.11
637	0.12
638	0.12
639	0.11
640	0.1
641	0.09
642	0.07
643	0.07
644	0.06
645	0.06
646	0.05
647	0.06
648	0.06
649	0.05
650	0.06
651	0.06
652	0.06
653	0.06
654	0.06
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.04
659	0.04
660	0.03
661	0.03
662	0.03
663	0.03
664	0.03
665	0.03
666	0.03
667	0.03
668	0.04
669	0.09
670	0.11
671	0.14
672	0.15
673	0.15
674	0.15
675	0.16
676	0.15
677	0.16
678	0.14
679	0.11
680	0.1
681	0.1
682	0.11
683	0.1
684	0.1
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.05
691	0.05
692	0.04
693	0.04
694	0.04
695	0.04
696	0.03
697	0.03
698	0.03
699	0.03
700	0.03
701	0.02
702	0.02
703	0.02
704	0.03
705	0.03
706	0.03
707	0.04
708	0.04
709	0.05
710	0.05
711	0.04
712	0.05
713	0.05
714	0.05
715	0.07
716	0.08
717	0.08
718	0.08
719	0.08
720	0.08
721	0.07
722	0.07
723	0.05
724	0.04
725	0.04
726	0.05
727	0.05
728	0.05
729	0.05
730	0.06
731	0.06
732	0.06
733	0.06
734	0.09
735	0.1
736	0.1
737	0.11
738	0.11
739	0.11
740	0.16
741	0.19
742	0.2
743	0.21
744	0.24
745	0.26
746	0.27
747	0.27
748	0.23
749	0.22
750	0.21
751	0.2
752	0.18
753	0.17
754	0.17
755	0.17
756	0.15
757	0.14
758	0.12
759	0.11
760	0.11
761	0.16
762	0.17
763	0.17
764	0.18
765	0.18
766	0.17
767	0.18
768	0.18
769	0.13
770	0.13
771	0.12
772	0.11
773	0.11
774	0.11
775	0.1
776	0.11
777	0.11
778	0.11
779	0.1
780	0.15
781	0.16
782	0.16
783	0.16
784	0.15
785	0.15
786	0.15
787	0.16
788	0.11
789	0.1
790	0.09
791	0.08
792	0.08
793	0.07
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.1
798	0.11
799	0.14
800	0.14
801	0.15
802	0.15
803	0.14
804	0.18
805	0.21
806	0.2
807	0.17
808	0.16
809	0.17
810	0.19
811	0.21
812	0.19
813	0.13
814	0.19
815	0.21
816	0.21
817	0.19
818	0.19
819	0.22
820	0.23
821	0.25
822	0.2
823	0.2
824	0.19
825	0.19
826	0.18
827	0.12
828	0.09
829	0.07
830	0.06
831	0.04
832	0.04
833	0.04
834	0.03
835	0.03
836	0.03
837	0.04
838	0.04
839	0.04
840	0.04
841	0.04
842	0.04
843	0.05
844	0.05
845	0.05
846	0.06
847	0.06
848	0.07
849	0.08
850	0.1
851	0.12
852	0.17
853	0.19
854	0.19
855	0.23
856	0.24
857	0.32
858	0.4
859	0.48
860	0.51
861	0.48
862	0.51
863	0.48
864	0.48
865	0.42
866	0.36
867	0.35
868	0.28
869	0.32
870	0.29
871	0.28
872	0.26
873	0.23
874	0.21
875	0.14
876	0.13
877	0.1
878	0.1
879	0.11
880	0.15
881	0.15
882	0.15
883	0.15
884	0.15
885	0.17
886	0.18
887	0.2
888	0.17
889	0.19
890	0.23
891	0.27
892	0.29
893	0.26
894	0.25
895	0.24
896	0.23
897	0.23
898	0.2
899	0.19
900	0.2
901	0.25
902	0.24
903	0.25
904	0.25
905	0.28
906	0.31
907	0.28
908	0.28
909	0.25
910	0.27
911	0.27
912	0.27
913	0.25
914	0.21
915	0.21
916	0.16
917	0.17
918	0.14
919	0.14
920	0.13
921	0.09
922	0.08
923	0.08
924	0.09
925	0.07
926	0.07
927	0.07
928	0.07
929	0.08
930	0.08
931	0.12
932	0.12
933	0.14
934	0.15
935	0.15
936	0.15
937	0.14
938	0.13
939	0.09
940	0.11
941	0.08
942	0.08
943	0.08
944	0.1
945	0.14
946	0.14
947	0.14
948	0.12
949	0.13
950	0.14
951	0.19
952	0.22
953	0.19
954	0.21
955	0.23
956	0.25
957	0.24
958	0.27
959	0.2
960	0.2
961	0.23
962	0.23
963	0.22
964	0.2
965	0.2
966	0.16
967	0.16
968	0.13
969	0.08
970	0.08
971	0.08
972	0.07
973	0.07
974	0.1
975	0.1
976	0.14
977	0.17
978	0.16
979	0.16
980	0.17
981	0.2
982	0.23
983	0.24
984	0.22
985	0.2
986	0.21
987	0.29
988	0.28
989	0.27
990	0.23
991	0.2
992	0.19
993	0.18
994	0.17
995	0.09
996	0.1
997	0.1
998	0.13
999	0.15
1000	0.15
1001	0.16
1002	0.18
1003	0.21
1004	0.23
1005	0.26
1006	0.24
1007	0.27
1008	0.3
1009	0.35
1010	0.34
1011	0.31
1012	0.28
1013	0.22
1014	0.25
1015	0.21
1016	0.18
1017	0.11
1018	0.1
1019	0.1
1020	0.1
1021	0.11
1022	0.06
1023	0.06
1024	0.05
1025	0.06
1026	0.06
1027	0.06
1028	0.08
1029	0.08
1030	0.07
1031	0.07
1032	0.08
1033	0.07
1034	0.08
1035	0.08
1036	0.05
1037	0.12
1038	0.14
1039	0.2
1040	0.24
1041	0.27
1042	0.29
1043	0.34
1044	0.39
1045	0.42
1046	0.46
1047	0.47
1048	0.5
1049	0.51
1050	0.5
1051	0.49
1052	0.5
1053	0.43
1054	0.41
1055	0.39
1056	0.38
1057	0.36
1058	0.37
1059	0.37
1060	0.34
1061	0.34
1062	0.31
1063	0.27
1064	0.21
1065	0.2
1066	0.19
1067	0.15
1068	0.12
1069	0.11
1070	0.12
1071	0.13
1072	0.11
1073	0.11
1074	0.11
1075	0.11
1076	0.11
1077	0.16
1078	0.14
1079	0.14
1080	0.17
1081	0.17
1082	0.17
1083	0.18
1084	0.17
1085	0.16
1086	0.2
1087	0.21
1088	0.24
1089	0.3
1090	0.32
1091	0.41
1092	0.49
1093	0.5
1094	0.5
1095	0.5
1096	0.49
1097	0.44
1098	0.43
1099	0.33
1100	0.26
1101	0.23
1102	0.19
1103	0.18
1104	0.12
1105	0.11
1106	0.1
1107	0.09
1108	0.08
1109	0.06
1110	0.05
1111	0.05
1112	0.07
1113	0.08
1114	0.08
1115	0.09
1116	0.09
1117	0.11
1118	0.13
1119	0.12
1120	0.11
1121	0.1
1122	0.11
1123	0.11
1124	0.11
1125	0.15
1126	0.13
1127	0.13
1128	0.14
1129	0.15
1130	0.17
1131	0.21
1132	0.21
1133	0.19
1134	0.2
1135	0.22
1136	0.27
1137	0.3
1138	0.32
1139	0.27
1140	0.31
1141	0.27
1142	0.27
1143	0.26
1144	0.21
1145	0.17
1146	0.13
1147	0.16
1148	0.12
1149	0.14
1150	0.18
1151	0.22
1152	0.26
1153	0.34
1154	0.38
1155	0.4
1156	0.42
1157	0.46
1158	0.47
1159	0.48
1160	0.55
1161	0.53
1162	0.51
1163	0.51
1164	0.49
1165	0.43
1166	0.39
1167	0.35
1168	0.3
1169	0.23
1170	0.23
1171	0.2
1172	0.19
1173	0.21
1174	0.21
1175	0.18
1176	0.14
1177	0.16
1178	0.16
1179	0.17
1180	0.24
1181	0.27
1182	0.32
1183	0.32
1184	0.35
1185	0.34
1186	0.36
1187	0.39
1188	0.33
1189	0.29
1190	0.25
1191	0.27
1192	0.29
1193	0.31
1194	0.3
1195	0.26
1196	0.26
1197	0.27
1198	0.3
1199	0.37
1200	0.36
1201	0.41
1202	0.48
1203	0.55
1204	0.64
1205	0.71
1206	0.78
1207	0.8
1208	0.85
1209	0.83
1210	0.83
1211	0.79
1212	0.76
1213	0.74
1214	0.69
1215	0.64
1216	0.62
1217	0.58
1218	0.52
1219	0.48
1220	0.42
1221	0.32
1222	0.29
1223	0.26
1224	0.18
1225	0.15
1226	0.17
1227	0.26
1228	0.28
1229	0.33
1230	0.33
1231	0.32
1232	0.32
1233	0.33
1234	0.3
1235	0.21
1236	0.19
1237	0.14
1238	0.14
1239	0.14
1240	0.15
1241	0.13
1242	0.14
1243	0.18
1244	0.18
1245	0.21
1246	0.25
1247	0.29
1248	0.31
1249	0.36
1250	0.45
1251	0.5
1252	0.58
1253	0.62
1254	0.66
1255	0.63
1256	0.64
1257	0.66
1258	0.6
1259	0.51
1260	0.45
1261	0.42
1262	0.38
1263	0.43
1264	0.4
1265	0.36
1266	0.32
1267	0.35
1268	0.33
1269	0.32
1270	0.28
1271	0.27
1272	0.26
1273	0.24
1274	0.23
1275	0.2
1276	0.2
1277	0.17
1278	0.17
1279	0.11
1280	0.1
1281	0.1
1282	0.11
1283	0.11
1284	0.12
1285	0.17
1286	0.24
1287	0.32
1288	0.34

A0A0D1YBH6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer