Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1XLK3

Protein Details
Accession A0A0D1XLK3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-60FVPFDKSKGHKYPKQNYGGNKHydrophilic
109-133LILRSKKIWERLRRKSHVPKEERETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-125LRSKKIWERLRRKSH
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MSKMAGTKRPSDIGDGQSSKKAKFANGSGKAPSLGTQDDFVPFDKSKGHKYPKQNYGGNKEGHGPPNKKFSAPSEPYLGGAGGTTSRESHVKQKALAQERKAAKPNADLILRSKKIWERLRRKSHVPKEERETLVKELFEIISGRVKDFVFKHDSVRVIQCALKYATPEQRKQIAGELRGSYRELAESKYAKFLIAKMVVNDDEVKNAVVEEFYGHVKRLIRHPEASWIVDDIYRSIATKSQKAVLLREWYGPEFVVFTDNRKSKSDGEVTGDLSDILAQNPEKRGPIMQHLKEMTNQLVQKKTTGFTILHDALLQYFLNCKPASPEITEFLEMLRDDEEGDCYKNLAFTKSGSRLVCLALAHESSKGRRTILRFFKTHIRLLAEDLYGHTVLMTAYDVIDDTVMTGKAIFAELLSRDLGEAADEALVALTEHLTGRVSLLYLMSADPPKWLFVNDDVIRLREDVHKIRAETSKKDAETRRKELVKQISQPLLDLIASHAKFLASSNLGCQFITETLFGAIGDKQAALEAVAQLSNTTDDAESKIVKEGAEAGKPLLSSPAVGRMLKALVQGGRFDKSTKTIVKYDPPVDFHNILYDAIVSQGEDELVNWANGANSFVVVALLETEGFARKQEVVDRLRKDKSKLDSEKVGSKIILEKIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.46
4 0.49
5 0.51
6 0.44
7 0.43
8 0.39
9 0.34
10 0.38
11 0.44
12 0.47
13 0.52
14 0.55
15 0.53
16 0.53
17 0.49
18 0.42
19 0.36
20 0.29
21 0.24
22 0.22
23 0.2
24 0.2
25 0.21
26 0.22
27 0.21
28 0.22
29 0.2
30 0.2
31 0.26
32 0.28
33 0.35
34 0.44
35 0.52
36 0.55
37 0.66
38 0.75
39 0.78
40 0.83
41 0.8
42 0.78
43 0.77
44 0.77
45 0.68
46 0.6
47 0.56
48 0.53
49 0.55
50 0.56
51 0.52
52 0.49
53 0.57
54 0.56
55 0.52
56 0.48
57 0.47
58 0.48
59 0.49
60 0.47
61 0.43
62 0.42
63 0.41
64 0.39
65 0.32
66 0.21
67 0.16
68 0.13
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.11
74 0.14
75 0.16
76 0.25
77 0.32
78 0.35
79 0.36
80 0.42
81 0.49
82 0.56
83 0.61
84 0.56
85 0.56
86 0.59
87 0.64
88 0.65
89 0.59
90 0.51
91 0.5
92 0.52
93 0.48
94 0.44
95 0.38
96 0.37
97 0.44
98 0.43
99 0.38
100 0.38
101 0.38
102 0.46
103 0.54
104 0.59
105 0.59
106 0.68
107 0.79
108 0.79
109 0.84
110 0.86
111 0.86
112 0.86
113 0.83
114 0.8
115 0.78
116 0.8
117 0.73
118 0.66
119 0.6
120 0.54
121 0.49
122 0.41
123 0.33
124 0.27
125 0.23
126 0.2
127 0.17
128 0.13
129 0.16
130 0.17
131 0.17
132 0.18
133 0.18
134 0.22
135 0.22
136 0.26
137 0.27
138 0.28
139 0.31
140 0.32
141 0.35
142 0.33
143 0.35
144 0.31
145 0.26
146 0.27
147 0.24
148 0.24
149 0.24
150 0.21
151 0.2
152 0.24
153 0.31
154 0.36
155 0.39
156 0.41
157 0.45
158 0.45
159 0.44
160 0.46
161 0.42
162 0.39
163 0.4
164 0.37
165 0.32
166 0.32
167 0.32
168 0.25
169 0.19
170 0.19
171 0.15
172 0.15
173 0.2
174 0.21
175 0.21
176 0.24
177 0.24
178 0.22
179 0.22
180 0.21
181 0.21
182 0.23
183 0.23
184 0.19
185 0.22
186 0.22
187 0.22
188 0.24
189 0.17
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.13
204 0.16
205 0.18
206 0.24
207 0.31
208 0.33
209 0.35
210 0.35
211 0.4
212 0.4
213 0.39
214 0.32
215 0.24
216 0.21
217 0.19
218 0.19
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.13
225 0.15
226 0.18
227 0.19
228 0.21
229 0.24
230 0.25
231 0.27
232 0.27
233 0.3
234 0.27
235 0.28
236 0.26
237 0.24
238 0.23
239 0.2
240 0.16
241 0.11
242 0.1
243 0.11
244 0.09
245 0.11
246 0.18
247 0.21
248 0.24
249 0.25
250 0.28
251 0.27
252 0.33
253 0.35
254 0.29
255 0.32
256 0.31
257 0.29
258 0.27
259 0.24
260 0.18
261 0.13
262 0.12
263 0.07
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.08
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.22
275 0.29
276 0.29
277 0.33
278 0.34
279 0.34
280 0.34
281 0.34
282 0.26
283 0.22
284 0.23
285 0.21
286 0.23
287 0.23
288 0.23
289 0.22
290 0.21
291 0.18
292 0.18
293 0.15
294 0.13
295 0.19
296 0.17
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.12
301 0.13
302 0.11
303 0.05
304 0.07
305 0.07
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.12
310 0.14
311 0.16
312 0.16
313 0.17
314 0.16
315 0.18
316 0.19
317 0.16
318 0.14
319 0.13
320 0.11
321 0.1
322 0.08
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.08
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.16
338 0.19
339 0.24
340 0.21
341 0.22
342 0.21
343 0.21
344 0.21
345 0.15
346 0.13
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.15
354 0.16
355 0.15
356 0.19
357 0.22
358 0.3
359 0.39
360 0.43
361 0.4
362 0.42
363 0.5
364 0.5
365 0.49
366 0.42
367 0.34
368 0.29
369 0.31
370 0.31
371 0.22
372 0.18
373 0.16
374 0.15
375 0.12
376 0.11
377 0.08
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.03
399 0.05
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.06
405 0.07
406 0.07
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.08
432 0.09
433 0.08
434 0.1
435 0.1
436 0.11
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.12
441 0.22
442 0.21
443 0.25
444 0.25
445 0.25
446 0.25
447 0.24
448 0.23
449 0.19
450 0.24
451 0.24
452 0.29
453 0.31
454 0.31
455 0.36
456 0.42
457 0.41
458 0.39
459 0.42
460 0.43
461 0.41
462 0.48
463 0.51
464 0.55
465 0.59
466 0.61
467 0.63
468 0.61
469 0.62
470 0.64
471 0.66
472 0.62
473 0.59
474 0.6
475 0.55
476 0.51
477 0.49
478 0.4
479 0.31
480 0.23
481 0.17
482 0.13
483 0.16
484 0.16
485 0.16
486 0.15
487 0.14
488 0.15
489 0.15
490 0.18
491 0.12
492 0.12
493 0.15
494 0.19
495 0.2
496 0.19
497 0.19
498 0.15
499 0.14
500 0.16
501 0.13
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.08
525 0.07
526 0.08
527 0.1
528 0.12
529 0.13
530 0.13
531 0.16
532 0.16
533 0.15
534 0.15
535 0.19
536 0.21
537 0.22
538 0.22
539 0.19
540 0.2
541 0.2
542 0.2
543 0.16
544 0.12
545 0.11
546 0.12
547 0.19
548 0.21
549 0.21
550 0.21
551 0.21
552 0.22
553 0.22
554 0.22
555 0.18
556 0.17
557 0.18
558 0.22
559 0.22
560 0.23
561 0.23
562 0.23
563 0.22
564 0.24
565 0.3
566 0.32
567 0.35
568 0.38
569 0.43
570 0.49
571 0.54
572 0.55
573 0.53
574 0.51
575 0.5
576 0.5
577 0.46
578 0.38
579 0.35
580 0.31
581 0.26
582 0.23
583 0.19
584 0.13
585 0.12
586 0.12
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.09
594 0.1
595 0.1
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.1
600 0.11
601 0.08
602 0.07
603 0.08
604 0.08
605 0.07
606 0.06
607 0.06
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.09
614 0.09
615 0.1
616 0.11
617 0.12
618 0.15
619 0.21
620 0.29
621 0.35
622 0.43
623 0.5
624 0.55
625 0.62
626 0.66
627 0.65
628 0.64
629 0.65
630 0.67
631 0.69
632 0.68
633 0.69
634 0.69
635 0.71
636 0.66
637 0.6
638 0.49
639 0.43
640 0.42