Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1XV80

Protein Details
Accession A0A0D1XV80    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
392-418TSEQREKKTRDLFRRIKEIKKPFNVKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
398-429KKTRDLFRRIKEIKKPFNVKALLNRKRDKQAA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6.5, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MSYAIETKKRKFDRILEALSDAAAASPPRSSLNSRNNATTTSSSLSLSLDDTSDGSKRRRVTPTSRVALLPRTSTTSLSTHYLPSSRAAFLERLQTFRQVTQWHVPSTDPINATVWAKRGWICVDTDTVFCGSCKERVHVDLTIDPSRLRATKIADVTEGDVQDDQDDDLAMVTEVYNSIVKKYQDMITTAHSEGCLWRKRGSDSSVQRIEGLLNTSIALASLKERYDSIMTREDELPAVAPLPLPLSEDEESLTKNLSEEEERKVNLNAFRLAITGWDRKAEDIIECHHCFRSLGLWLYRGDKPAMETLDAIDSHLDYCPWKSADAQDTEVILPSKRDTNDESGAKKERVPGWILVYSAIVKGSNKKQAKDSPVPMVAEEEDVTTVGESLTSEQREKKTRDLFRRIKEIKKPFNVKALLNRKRDKQAAVPRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.72
3 0.64
4 0.6
5 0.53
6 0.44
7 0.35
8 0.24
9 0.15
10 0.11
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.12
16 0.16
17 0.21
18 0.3
19 0.39
20 0.48
21 0.5
22 0.54
23 0.53
24 0.52
25 0.51
26 0.43
27 0.37
28 0.31
29 0.29
30 0.25
31 0.24
32 0.22
33 0.18
34 0.17
35 0.13
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.12
40 0.15
41 0.19
42 0.21
43 0.26
44 0.3
45 0.37
46 0.44
47 0.5
48 0.56
49 0.61
50 0.68
51 0.68
52 0.66
53 0.6
54 0.55
55 0.54
56 0.48
57 0.4
58 0.32
59 0.32
60 0.31
61 0.3
62 0.31
63 0.26
64 0.25
65 0.25
66 0.25
67 0.22
68 0.23
69 0.23
70 0.21
71 0.22
72 0.22
73 0.2
74 0.19
75 0.2
76 0.2
77 0.2
78 0.28
79 0.26
80 0.27
81 0.28
82 0.32
83 0.31
84 0.31
85 0.33
86 0.26
87 0.3
88 0.35
89 0.37
90 0.34
91 0.33
92 0.32
93 0.31
94 0.32
95 0.31
96 0.23
97 0.21
98 0.21
99 0.21
100 0.22
101 0.21
102 0.2
103 0.16
104 0.17
105 0.17
106 0.18
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.17
111 0.2
112 0.19
113 0.18
114 0.16
115 0.15
116 0.14
117 0.12
118 0.13
119 0.12
120 0.16
121 0.17
122 0.18
123 0.2
124 0.22
125 0.26
126 0.25
127 0.26
128 0.24
129 0.27
130 0.27
131 0.26
132 0.23
133 0.2
134 0.21
135 0.2
136 0.18
137 0.16
138 0.18
139 0.23
140 0.25
141 0.25
142 0.24
143 0.23
144 0.23
145 0.23
146 0.19
147 0.13
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.07
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.15
171 0.18
172 0.18
173 0.2
174 0.2
175 0.19
176 0.22
177 0.21
178 0.19
179 0.16
180 0.14
181 0.15
182 0.2
183 0.22
184 0.2
185 0.23
186 0.25
187 0.28
188 0.32
189 0.33
190 0.36
191 0.36
192 0.42
193 0.42
194 0.4
195 0.37
196 0.33
197 0.3
198 0.22
199 0.18
200 0.1
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.05
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.09
214 0.11
215 0.12
216 0.14
217 0.19
218 0.2
219 0.22
220 0.22
221 0.21
222 0.19
223 0.18
224 0.15
225 0.08
226 0.08
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.11
247 0.12
248 0.16
249 0.19
250 0.2
251 0.21
252 0.22
253 0.24
254 0.23
255 0.24
256 0.21
257 0.18
258 0.18
259 0.17
260 0.16
261 0.14
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.17
266 0.17
267 0.17
268 0.18
269 0.17
270 0.14
271 0.12
272 0.16
273 0.21
274 0.22
275 0.23
276 0.22
277 0.22
278 0.21
279 0.2
280 0.19
281 0.16
282 0.19
283 0.19
284 0.21
285 0.22
286 0.26
287 0.27
288 0.26
289 0.22
290 0.18
291 0.19
292 0.21
293 0.21
294 0.17
295 0.16
296 0.15
297 0.17
298 0.17
299 0.15
300 0.11
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.07
306 0.08
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.14
311 0.2
312 0.26
313 0.28
314 0.29
315 0.26
316 0.27
317 0.26
318 0.27
319 0.22
320 0.16
321 0.14
322 0.13
323 0.18
324 0.17
325 0.2
326 0.23
327 0.28
328 0.35
329 0.39
330 0.4
331 0.4
332 0.45
333 0.43
334 0.41
335 0.41
336 0.37
337 0.36
338 0.37
339 0.34
340 0.33
341 0.34
342 0.32
343 0.26
344 0.24
345 0.21
346 0.18
347 0.15
348 0.11
349 0.11
350 0.18
351 0.25
352 0.34
353 0.38
354 0.4
355 0.48
356 0.55
357 0.62
358 0.64
359 0.63
360 0.61
361 0.61
362 0.59
363 0.51
364 0.45
365 0.37
366 0.29
367 0.24
368 0.17
369 0.12
370 0.11
371 0.11
372 0.09
373 0.08
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.08
378 0.14
379 0.17
380 0.2
381 0.26
382 0.34
383 0.43
384 0.47
385 0.53
386 0.57
387 0.65
388 0.72
389 0.77
390 0.79
391 0.79
392 0.86
393 0.83
394 0.83
395 0.83
396 0.83
397 0.82
398 0.83
399 0.84
400 0.77
401 0.8
402 0.75
403 0.7
404 0.7
405 0.71
406 0.69
407 0.71
408 0.73
409 0.72
410 0.76
411 0.77
412 0.71
413 0.71