Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1XW80

Protein Details
Accession A0A0D1XW80    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-80STPTDQPTKKKEKAPKAPKPPKPAPVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-76KKKEKAPKAPKPPKP
Subcellular Location(s) mito 11, cyto_mito 10.666, cyto 9, mito_nucl 8.666, cyto_nucl 7.666, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR002547  tRNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0000049  F:tRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01588  tRNA_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50886  TRBD  
Amino Acid Sequences MSDPASSGTSTPAQHKPLVVGRTKPQSPSTPTPSTMSSSTPTPADPPAAAASSSTPTDQPTKKKEKAPKAPKPPKPAPVVAPLSPALIDLRVGHILRAIAHPNADSLYVSTIAMGDPEGTEFTQVDEATGKVVRTVCSGLNGLIPLEELQDRKIITVANLKPVNMRSIKSCAMVLCASPKPKEGEDAHGPDRKVEFVDPPAGSEAGDAVYFEGWEYGEGKGPEKQLNPKKKQWEAIQPGFFTDDDLSVGFDAAVTEVEGDKKGKLMVKGKGYCSVKSLKGAGCS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.36
4 0.39
5 0.43
6 0.42
7 0.42
8 0.45
9 0.52
10 0.54
11 0.53
12 0.51
13 0.52
14 0.55
15 0.59
16 0.59
17 0.55
18 0.54
19 0.53
20 0.5
21 0.46
22 0.39
23 0.33
24 0.27
25 0.24
26 0.24
27 0.22
28 0.21
29 0.19
30 0.19
31 0.19
32 0.16
33 0.17
34 0.17
35 0.17
36 0.16
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.15
41 0.13
42 0.12
43 0.14
44 0.21
45 0.26
46 0.33
47 0.4
48 0.49
49 0.55
50 0.63
51 0.7
52 0.74
53 0.8
54 0.83
55 0.84
56 0.86
57 0.9
58 0.89
59 0.89
60 0.85
61 0.82
62 0.77
63 0.7
64 0.62
65 0.6
66 0.57
67 0.47
68 0.43
69 0.35
70 0.3
71 0.25
72 0.22
73 0.14
74 0.09
75 0.09
76 0.06
77 0.08
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.14
85 0.14
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.04
103 0.03
104 0.04
105 0.05
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.17
144 0.17
145 0.23
146 0.24
147 0.24
148 0.25
149 0.26
150 0.29
151 0.22
152 0.22
153 0.18
154 0.22
155 0.23
156 0.22
157 0.22
158 0.17
159 0.18
160 0.18
161 0.15
162 0.16
163 0.17
164 0.19
165 0.19
166 0.21
167 0.21
168 0.21
169 0.27
170 0.24
171 0.28
172 0.32
173 0.36
174 0.39
175 0.4
176 0.4
177 0.36
178 0.35
179 0.29
180 0.24
181 0.19
182 0.17
183 0.16
184 0.21
185 0.19
186 0.19
187 0.2
188 0.19
189 0.17
190 0.15
191 0.13
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.16
208 0.2
209 0.23
210 0.26
211 0.36
212 0.42
213 0.52
214 0.58
215 0.63
216 0.69
217 0.71
218 0.75
219 0.73
220 0.74
221 0.73
222 0.74
223 0.71
224 0.61
225 0.56
226 0.5
227 0.42
228 0.33
229 0.24
230 0.16
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.1
235 0.1
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.08
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.16
250 0.19
251 0.26
252 0.32
253 0.38
254 0.47
255 0.53
256 0.55
257 0.61
258 0.59
259 0.53
260 0.5
261 0.49
262 0.43
263 0.42
264 0.44