Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1ZQM9

Protein Details
Accession A0A0D1ZQM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-27SDKIRNKRLAKLQQSQSQSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSDPTADSDKIRNKRLAKLQQSQSQSSSPQPQDSLISQDAAPSTSSSPAPSPLPSAPQSPPPSESSSTPINISKPSSPPPAASSTRIRVTPSTITPQKREMNGLSRPTSAKPNEPIEQWEDRTLRNLFRITFDPAQTKDQHGQVLHQVPQLRDELESEGQPVLLNNAILEQAIMEAGASLSQRITPHDWLFGSWKRVTRISKAVKDRTPENPKWTILLEARRLCMNWCILSITTPDIFDATYDGIDALADHLLADPDDDRGVCQDFVNEALTRFEEDESIKLAFVAAVENLSRRLAKENMNTAYQPYVGMLRHLIRYKPIAVAITESVIFVDATVPAAQLEVASLLGPYFQLSPLQAEVTSSFFYEPKTMDPGKVRTNQTSLQMTLRTHQDELFDIVNTLVRASPEARERVLDWFALVVNSNHKRRAMRVDKKTVSSDGFMINVNVVLDKLCEPFIDARFSKIDRVDIDYLRRNPRVDIKDETKINVDQDQSDSYFKTQAPGTNNFISELFFLTVASHQYGIEAARNILKEMDRELKHMAKQLEQFEGERHKYINNPVQLEMYDKALKKYRDQHDKGLSYKYAVQGVLLDEITQTRSMQFMRFVTVWLLRQVSPNRQFPNEKLTLPLSPEQPDAFKNLPEYFLEIISGNFGYIMYNMPQVISPTQSDELIMLCIAFLRNAEYIKNPYLKASLVTILFRGTWSWRQGGRGILADQYNSMPFATENLLHSLMQFFIEAEFMGGHGQFFDKFNVRFEIFQIIKCIWSNPVYRDNLLREAKVNIEFFVRFVNLLLNDVTFVLDESFTSFHQIYDISHELALAGTSLNEQQRQEKEEALESAKGKAKSYMQLTNETVGMVKLFTEALADAFTMPEIVQRLADMLDYNLDAMVPPKSTSLKVDNLQEYNFNPKALLSEIVDVYLNLSEKENFILAVARDGRSYKSENFVAAGNILKKFVLKSPQQLQRWSRLIERIAKAKSEDEAADADLGEIPDEFLDPLMYTLMEDPVLLPISKIVIDRSTIRSHLLSDPHDPFNRVPLKIEDVIPATDVKEKIAKFKEEKIGNRRRDFVETVKTEDSAAGVESSTTAPDDAMDTSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.71
3 0.73
4 0.74
5 0.76
6 0.78
7 0.78
8 0.8
9 0.75
10 0.68
11 0.61
12 0.54
13 0.51
14 0.52
15 0.47
16 0.45
17 0.42
18 0.4
19 0.4
20 0.39
21 0.39
22 0.3
23 0.28
24 0.24
25 0.25
26 0.24
27 0.21
28 0.2
29 0.15
30 0.15
31 0.16
32 0.17
33 0.17
34 0.18
35 0.2
36 0.22
37 0.21
38 0.25
39 0.24
40 0.29
41 0.29
42 0.33
43 0.32
44 0.39
45 0.43
46 0.42
47 0.43
48 0.41
49 0.45
50 0.42
51 0.42
52 0.37
53 0.37
54 0.35
55 0.35
56 0.34
57 0.3
58 0.31
59 0.33
60 0.34
61 0.34
62 0.38
63 0.43
64 0.41
65 0.41
66 0.42
67 0.45
68 0.44
69 0.44
70 0.46
71 0.44
72 0.47
73 0.46
74 0.45
75 0.39
76 0.41
77 0.42
78 0.39
79 0.43
80 0.46
81 0.51
82 0.51
83 0.58
84 0.59
85 0.55
86 0.56
87 0.52
88 0.52
89 0.54
90 0.57
91 0.52
92 0.49
93 0.49
94 0.45
95 0.49
96 0.44
97 0.44
98 0.44
99 0.47
100 0.48
101 0.47
102 0.49
103 0.46
104 0.48
105 0.44
106 0.44
107 0.4
108 0.37
109 0.41
110 0.39
111 0.36
112 0.35
113 0.36
114 0.3
115 0.32
116 0.35
117 0.36
118 0.38
119 0.38
120 0.38
121 0.37
122 0.42
123 0.41
124 0.43
125 0.4
126 0.39
127 0.4
128 0.35
129 0.35
130 0.37
131 0.4
132 0.38
133 0.37
134 0.38
135 0.33
136 0.36
137 0.35
138 0.27
139 0.22
140 0.21
141 0.22
142 0.2
143 0.2
144 0.19
145 0.17
146 0.16
147 0.15
148 0.14
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.08
169 0.09
170 0.13
171 0.17
172 0.22
173 0.23
174 0.27
175 0.27
176 0.26
177 0.33
178 0.34
179 0.35
180 0.34
181 0.37
182 0.36
183 0.43
184 0.45
185 0.45
186 0.5
187 0.54
188 0.59
189 0.64
190 0.69
191 0.67
192 0.67
193 0.65
194 0.66
195 0.66
196 0.62
197 0.6
198 0.57
199 0.53
200 0.51
201 0.47
202 0.42
203 0.38
204 0.39
205 0.4
206 0.38
207 0.38
208 0.37
209 0.37
210 0.33
211 0.31
212 0.28
213 0.2
214 0.19
215 0.19
216 0.18
217 0.19
218 0.19
219 0.18
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.14
282 0.17
283 0.24
284 0.29
285 0.36
286 0.37
287 0.39
288 0.39
289 0.35
290 0.33
291 0.26
292 0.2
293 0.13
294 0.13
295 0.11
296 0.12
297 0.13
298 0.14
299 0.19
300 0.21
301 0.21
302 0.21
303 0.24
304 0.25
305 0.23
306 0.23
307 0.19
308 0.17
309 0.19
310 0.16
311 0.14
312 0.13
313 0.11
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.05
318 0.05
319 0.04
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.03
331 0.04
332 0.03
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.17
356 0.18
357 0.2
358 0.25
359 0.29
360 0.33
361 0.4
362 0.42
363 0.39
364 0.42
365 0.4
366 0.41
367 0.39
368 0.34
369 0.29
370 0.28
371 0.26
372 0.25
373 0.27
374 0.24
375 0.21
376 0.21
377 0.19
378 0.18
379 0.2
380 0.17
381 0.13
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.09
387 0.07
388 0.06
389 0.08
390 0.08
391 0.12
392 0.15
393 0.17
394 0.17
395 0.17
396 0.18
397 0.2
398 0.2
399 0.17
400 0.13
401 0.11
402 0.11
403 0.1
404 0.1
405 0.07
406 0.14
407 0.2
408 0.23
409 0.24
410 0.27
411 0.28
412 0.31
413 0.41
414 0.44
415 0.48
416 0.55
417 0.63
418 0.63
419 0.65
420 0.64
421 0.56
422 0.46
423 0.37
424 0.3
425 0.2
426 0.18
427 0.15
428 0.12
429 0.1
430 0.08
431 0.07
432 0.06
433 0.05
434 0.04
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.08
441 0.11
442 0.13
443 0.18
444 0.17
445 0.18
446 0.2
447 0.21
448 0.23
449 0.2
450 0.21
451 0.16
452 0.22
453 0.23
454 0.23
455 0.26
456 0.3
457 0.34
458 0.38
459 0.39
460 0.34
461 0.33
462 0.4
463 0.39
464 0.37
465 0.37
466 0.36
467 0.4
468 0.41
469 0.4
470 0.33
471 0.31
472 0.28
473 0.25
474 0.21
475 0.15
476 0.16
477 0.16
478 0.15
479 0.15
480 0.14
481 0.12
482 0.14
483 0.13
484 0.14
485 0.14
486 0.16
487 0.2
488 0.23
489 0.27
490 0.26
491 0.26
492 0.25
493 0.24
494 0.2
495 0.16
496 0.13
497 0.09
498 0.07
499 0.07
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.1
517 0.09
518 0.12
519 0.19
520 0.18
521 0.2
522 0.23
523 0.24
524 0.25
525 0.3
526 0.27
527 0.23
528 0.27
529 0.27
530 0.26
531 0.24
532 0.23
533 0.2
534 0.25
535 0.22
536 0.19
537 0.17
538 0.16
539 0.18
540 0.23
541 0.26
542 0.25
543 0.25
544 0.25
545 0.25
546 0.24
547 0.25
548 0.19
549 0.16
550 0.17
551 0.15
552 0.17
553 0.22
554 0.23
555 0.25
556 0.34
557 0.4
558 0.47
559 0.5
560 0.55
561 0.58
562 0.61
563 0.58
564 0.52
565 0.44
566 0.34
567 0.33
568 0.27
569 0.21
570 0.17
571 0.15
572 0.12
573 0.12
574 0.12
575 0.09
576 0.08
577 0.06
578 0.06
579 0.07
580 0.07
581 0.06
582 0.05
583 0.07
584 0.08
585 0.09
586 0.11
587 0.1
588 0.13
589 0.13
590 0.13
591 0.14
592 0.15
593 0.15
594 0.14
595 0.16
596 0.13
597 0.18
598 0.21
599 0.28
600 0.32
601 0.37
602 0.38
603 0.4
604 0.42
605 0.38
606 0.43
607 0.37
608 0.31
609 0.28
610 0.27
611 0.24
612 0.25
613 0.26
614 0.2
615 0.19
616 0.2
617 0.18
618 0.17
619 0.17
620 0.18
621 0.16
622 0.15
623 0.16
624 0.16
625 0.17
626 0.15
627 0.18
628 0.14
629 0.13
630 0.13
631 0.1
632 0.09
633 0.09
634 0.09
635 0.06
636 0.05
637 0.05
638 0.04
639 0.05
640 0.06
641 0.06
642 0.07
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.08
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.11
651 0.12
652 0.11
653 0.11
654 0.1
655 0.1
656 0.08
657 0.08
658 0.05
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.06
665 0.07
666 0.08
667 0.09
668 0.11
669 0.14
670 0.18
671 0.21
672 0.19
673 0.19
674 0.2
675 0.2
676 0.18
677 0.16
678 0.15
679 0.13
680 0.13
681 0.12
682 0.12
683 0.11
684 0.11
685 0.1
686 0.11
687 0.14
688 0.16
689 0.2
690 0.21
691 0.23
692 0.25
693 0.26
694 0.25
695 0.22
696 0.21
697 0.19
698 0.19
699 0.17
700 0.15
701 0.14
702 0.12
703 0.1
704 0.09
705 0.07
706 0.06
707 0.08
708 0.09
709 0.09
710 0.1
711 0.12
712 0.14
713 0.13
714 0.14
715 0.13
716 0.11
717 0.1
718 0.09
719 0.06
720 0.05
721 0.06
722 0.05
723 0.05
724 0.04
725 0.04
726 0.05
727 0.05
728 0.04
729 0.05
730 0.05
731 0.06
732 0.07
733 0.1
734 0.14
735 0.15
736 0.17
737 0.21
738 0.22
739 0.21
740 0.21
741 0.27
742 0.24
743 0.24
744 0.24
745 0.21
746 0.21
747 0.21
748 0.21
749 0.14
750 0.18
751 0.2
752 0.22
753 0.29
754 0.3
755 0.31
756 0.34
757 0.34
758 0.38
759 0.37
760 0.34
761 0.28
762 0.27
763 0.29
764 0.29
765 0.26
766 0.18
767 0.19
768 0.18
769 0.16
770 0.17
771 0.14
772 0.11
773 0.1
774 0.13
775 0.1
776 0.12
777 0.12
778 0.1
779 0.1
780 0.1
781 0.09
782 0.06
783 0.06
784 0.06
785 0.05
786 0.05
787 0.07
788 0.08
789 0.07
790 0.11
791 0.11
792 0.1
793 0.11
794 0.12
795 0.1
796 0.16
797 0.18
798 0.15
799 0.15
800 0.15
801 0.14
802 0.14
803 0.13
804 0.06
805 0.05
806 0.04
807 0.05
808 0.08
809 0.1
810 0.13
811 0.14
812 0.2
813 0.24
814 0.28
815 0.29
816 0.29
817 0.29
818 0.29
819 0.31
820 0.27
821 0.28
822 0.24
823 0.27
824 0.3
825 0.29
826 0.27
827 0.28
828 0.29
829 0.31
830 0.35
831 0.37
832 0.34
833 0.39
834 0.4
835 0.38
836 0.34
837 0.28
838 0.23
839 0.16
840 0.14
841 0.08
842 0.07
843 0.06
844 0.05
845 0.05
846 0.05
847 0.05
848 0.06
849 0.06
850 0.06
851 0.06
852 0.06
853 0.06
854 0.05
855 0.05
856 0.07
857 0.08
858 0.08
859 0.08
860 0.08
861 0.09
862 0.09
863 0.1
864 0.08
865 0.07
866 0.07
867 0.07
868 0.08
869 0.07
870 0.06
871 0.06
872 0.07
873 0.08
874 0.08
875 0.08
876 0.11
877 0.13
878 0.15
879 0.19
880 0.23
881 0.28
882 0.31
883 0.37
884 0.4
885 0.4
886 0.4
887 0.38
888 0.34
889 0.37
890 0.34
891 0.27
892 0.22
893 0.2
894 0.21
895 0.2
896 0.21
897 0.14
898 0.16
899 0.16
900 0.16
901 0.16
902 0.14
903 0.13
904 0.13
905 0.12
906 0.09
907 0.11
908 0.11
909 0.11
910 0.13
911 0.12
912 0.1
913 0.1
914 0.13
915 0.11
916 0.17
917 0.19
918 0.18
919 0.19
920 0.21
921 0.23
922 0.23
923 0.28
924 0.24
925 0.28
926 0.29
927 0.28
928 0.28
929 0.27
930 0.24
931 0.2
932 0.22
933 0.19
934 0.18
935 0.18
936 0.17
937 0.17
938 0.18
939 0.22
940 0.26
941 0.27
942 0.35
943 0.44
944 0.54
945 0.57
946 0.64
947 0.64
948 0.65
949 0.66
950 0.6
951 0.56
952 0.53
953 0.54
954 0.54
955 0.55
956 0.53
957 0.5
958 0.5
959 0.47
960 0.42
961 0.38
962 0.32
963 0.27
964 0.21
965 0.2
966 0.18
967 0.17
968 0.15
969 0.14
970 0.12
971 0.11
972 0.09
973 0.08
974 0.07
975 0.07
976 0.07
977 0.07
978 0.05
979 0.06
980 0.06
981 0.07
982 0.07
983 0.07
984 0.07
985 0.08
986 0.09
987 0.08
988 0.08
989 0.08
990 0.1
991 0.12
992 0.11
993 0.1
994 0.09
995 0.11
996 0.12
997 0.13
998 0.13
999 0.13
1000 0.16
1001 0.2
1002 0.25
1003 0.28
1004 0.28
1005 0.3
1006 0.29
1007 0.3
1008 0.33
1009 0.35
1010 0.33
1011 0.36
1012 0.4
1013 0.44
1014 0.46
1015 0.46
1016 0.41
1017 0.45
1018 0.47
1019 0.41
1020 0.4
1021 0.37
1022 0.41
1023 0.41
1024 0.42
1025 0.36
1026 0.32
1027 0.31
1028 0.29
1029 0.25
1030 0.2
1031 0.23
1032 0.21
1033 0.2
1034 0.24
1035 0.24
1036 0.32
1037 0.38
1038 0.45
1039 0.44
1040 0.53
1041 0.6
1042 0.62
1043 0.7
1044 0.72
1045 0.76
1046 0.77
1047 0.78
1048 0.76
1049 0.71
1050 0.69
1051 0.64
1052 0.61
1053 0.61
1054 0.54
1055 0.55
1056 0.51
1057 0.47
1058 0.41
1059 0.36
1060 0.29
1061 0.19
1062 0.17
1063 0.11
1064 0.09
1065 0.08
1066 0.09
1067 0.09
1068 0.1
1069 0.1
1070 0.09
1071 0.08
1072 0.09
1073 0.1