Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1ZDD8

Protein Details
Accession A0A0D1ZDD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
544-568SFTHIHKRLARSRLRKRPRLVIRLGHydrophilic
622-649EKKKCNYTANIKLGRRRRKELEKALIQGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
550-562KRLARSRLRKRPR
636-640RRRRK
Subcellular Location(s) plas 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010640  Low_temperature_requirement_A  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF06772  LtrA  
Amino Acid Sequences MTSSPETDPKATSGTTTPSSHQHAHHHFHHPHVRRLTQFVHPHNGKTVHVCHSPEHAEEKKRELLEQEKGLTEFDIVLQGSPDHVEAVKQLHMHHEKRRDDLKERHGDIYSDIENVKSELDSLSAELHHLTTHAVSLDASFDRYGYSAHLRTKDEDSEVSSLHSDHPSASEKHADRSLEALKFIRRPVVRQYFHKGLLWRSSKAGEVASFELFVDLVYVGVIDIVGETAVEHPGGLALLQFVIVFSIAWKIWSDLTMVINHFEIDDIAHRLVVVFYLVCLFGFTTNIAYAFESTYTSLIAFYITNRMFGGIWYLLVAIALPNIRGPMIGMSIQIFLSVAIWIASIHVEWPNQLAPIFIALILDLFGGIFLVYLFRQVTTKVHFKSIARWFDFMPAINIEHRVDRSNAFTSLVFGYSILTILFQSSASFGINSFFGKGALGLIQAFTFNWIYFEIDNSNIHVHAIRRHWFSSSVWVSAHLPFIMGYILAASTLSQLVLAHDTADADEHDLGHHYEERSVGEIPVALRWFYCGGLGTALICMSIISFTHIHKRLARSRLRKRPRLVIRLGVAVIIICLPIARSLTSLELIAITTCLVAFVLMLDLFGNSCQGDRFWTGGWCDGEKKKCNYTANIKLGRRRRKELEKALIQGQKLSIADLMKRHSSMSSLESAPSRDEEWQGGHY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.29
4 0.3
5 0.33
6 0.39
7 0.41
8 0.43
9 0.47
10 0.51
11 0.56
12 0.6
13 0.64
14 0.61
15 0.65
16 0.71
17 0.67
18 0.68
19 0.69
20 0.69
21 0.62
22 0.65
23 0.61
24 0.6
25 0.62
26 0.59
27 0.61
28 0.57
29 0.56
30 0.58
31 0.56
32 0.48
33 0.46
34 0.45
35 0.41
36 0.44
37 0.43
38 0.38
39 0.42
40 0.43
41 0.4
42 0.42
43 0.43
44 0.45
45 0.47
46 0.5
47 0.51
48 0.48
49 0.47
50 0.45
51 0.45
52 0.46
53 0.47
54 0.44
55 0.4
56 0.39
57 0.38
58 0.32
59 0.25
60 0.18
61 0.13
62 0.13
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.1
74 0.13
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.25
79 0.34
80 0.39
81 0.46
82 0.52
83 0.53
84 0.59
85 0.67
86 0.64
87 0.65
88 0.68
89 0.7
90 0.71
91 0.7
92 0.67
93 0.6
94 0.54
95 0.46
96 0.42
97 0.33
98 0.24
99 0.21
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.15
104 0.1
105 0.09
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.1
125 0.09
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.16
134 0.19
135 0.25
136 0.3
137 0.31
138 0.34
139 0.38
140 0.37
141 0.34
142 0.3
143 0.28
144 0.26
145 0.23
146 0.21
147 0.18
148 0.16
149 0.16
150 0.16
151 0.13
152 0.11
153 0.14
154 0.17
155 0.18
156 0.2
157 0.26
158 0.26
159 0.3
160 0.34
161 0.31
162 0.27
163 0.3
164 0.33
165 0.26
166 0.27
167 0.25
168 0.25
169 0.28
170 0.28
171 0.31
172 0.26
173 0.28
174 0.37
175 0.45
176 0.45
177 0.48
178 0.55
179 0.53
180 0.55
181 0.55
182 0.48
183 0.41
184 0.46
185 0.45
186 0.38
187 0.34
188 0.33
189 0.31
190 0.29
191 0.26
192 0.17
193 0.16
194 0.17
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.1
200 0.09
201 0.07
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.08
250 0.07
251 0.05
252 0.06
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.05
261 0.03
262 0.03
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.12
295 0.12
296 0.14
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.04
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.02
351 0.02
352 0.02
353 0.02
354 0.02
355 0.02
356 0.02
357 0.03
358 0.03
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.09
365 0.13
366 0.2
367 0.2
368 0.22
369 0.25
370 0.25
371 0.33
372 0.39
373 0.42
374 0.37
375 0.37
376 0.35
377 0.36
378 0.36
379 0.28
380 0.21
381 0.14
382 0.14
383 0.13
384 0.15
385 0.12
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.14
390 0.14
391 0.17
392 0.17
393 0.17
394 0.17
395 0.16
396 0.16
397 0.15
398 0.14
399 0.11
400 0.08
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.07
433 0.07
434 0.06
435 0.07
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.12
444 0.12
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.16
450 0.21
451 0.25
452 0.27
453 0.28
454 0.3
455 0.3
456 0.29
457 0.34
458 0.31
459 0.27
460 0.23
461 0.24
462 0.24
463 0.23
464 0.24
465 0.14
466 0.12
467 0.1
468 0.1
469 0.09
470 0.06
471 0.05
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.06
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.09
497 0.1
498 0.13
499 0.12
500 0.13
501 0.14
502 0.14
503 0.15
504 0.16
505 0.14
506 0.11
507 0.12
508 0.11
509 0.14
510 0.14
511 0.11
512 0.1
513 0.12
514 0.13
515 0.11
516 0.11
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.1
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.06
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.07
531 0.09
532 0.11
533 0.2
534 0.24
535 0.28
536 0.32
537 0.4
538 0.46
539 0.54
540 0.62
541 0.64
542 0.71
543 0.79
544 0.84
545 0.86
546 0.84
547 0.85
548 0.86
549 0.84
550 0.79
551 0.75
552 0.68
553 0.62
554 0.55
555 0.44
556 0.34
557 0.24
558 0.19
559 0.11
560 0.08
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.05
565 0.07
566 0.07
567 0.08
568 0.09
569 0.11
570 0.12
571 0.12
572 0.11
573 0.1
574 0.1
575 0.09
576 0.08
577 0.06
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.07
593 0.06
594 0.06
595 0.07
596 0.07
597 0.11
598 0.13
599 0.15
600 0.16
601 0.19
602 0.2
603 0.25
604 0.28
605 0.26
606 0.31
607 0.36
608 0.44
609 0.48
610 0.53
611 0.54
612 0.59
613 0.63
614 0.65
615 0.67
616 0.69
617 0.71
618 0.75
619 0.73
620 0.75
621 0.79
622 0.81
623 0.79
624 0.77
625 0.77
626 0.79
627 0.84
628 0.86
629 0.86
630 0.83
631 0.8
632 0.79
633 0.74
634 0.63
635 0.55
636 0.45
637 0.39
638 0.31
639 0.27
640 0.22
641 0.2
642 0.23
643 0.24
644 0.29
645 0.28
646 0.29
647 0.29
648 0.26
649 0.26
650 0.26
651 0.26
652 0.26
653 0.23
654 0.26
655 0.27
656 0.28
657 0.28
658 0.27
659 0.25
660 0.23
661 0.24
662 0.24