Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9UZD6

Protein Details
Accession A0A0C9UZD6    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-59EDPVSVKRGRGRPKGSKNKPREGAABasic
63-84STAPTGEKRKRGRPPKEKPAAABasic
93-114EDNPPAKRPRGRPRKNPLPAESBasic
157-176AGAASPKKRGRPPKSDKSTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-87KRGRGRPKGSKNKPREGAASSSSTAPTGEKRKRGRPPKEKPAAAPAT
92-121GEDNPPAKRPRGRPRKNPLPAESAAAKPAA
161-171SPKKRGRPPKS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MSDADKVDETTSPKVAVEDKADSDQQLTGDAAEGEDPVSVKRGRGRPKGSKNKPREGAASSSSTAPTGEKRKRGRPPKEKPAAAPATSETGGEDNPPAKRPRGRPRKNPLPAESAAAKPAADKPVSTSKPEEKDKEKPAADDDAEGEPAAAPSSAAAGAASPKKRGRPPKSDKSTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.23
4 0.23
5 0.23
6 0.24
7 0.27
8 0.27
9 0.26
10 0.24
11 0.22
12 0.18
13 0.16
14 0.13
15 0.1
16 0.1
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.1
26 0.1
27 0.12
28 0.19
29 0.27
30 0.36
31 0.45
32 0.54
33 0.6
34 0.71
35 0.81
36 0.84
37 0.87
38 0.86
39 0.87
40 0.83
41 0.76
42 0.68
43 0.61
44 0.54
45 0.47
46 0.41
47 0.32
48 0.27
49 0.24
50 0.2
51 0.17
52 0.13
53 0.15
54 0.22
55 0.26
56 0.33
57 0.39
58 0.48
59 0.58
60 0.67
61 0.73
62 0.75
63 0.8
64 0.83
65 0.86
66 0.79
67 0.71
68 0.69
69 0.62
70 0.52
71 0.42
72 0.32
73 0.26
74 0.24
75 0.22
76 0.13
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.12
84 0.14
85 0.17
86 0.23
87 0.32
88 0.42
89 0.51
90 0.6
91 0.67
92 0.76
93 0.83
94 0.86
95 0.84
96 0.77
97 0.72
98 0.63
99 0.56
100 0.48
101 0.38
102 0.3
103 0.23
104 0.19
105 0.14
106 0.16
107 0.16
108 0.14
109 0.13
110 0.17
111 0.27
112 0.29
113 0.31
114 0.33
115 0.36
116 0.44
117 0.5
118 0.52
119 0.48
120 0.55
121 0.59
122 0.62
123 0.57
124 0.51
125 0.47
126 0.47
127 0.41
128 0.33
129 0.3
130 0.22
131 0.22
132 0.2
133 0.16
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.07
138 0.05
139 0.04
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.1
146 0.17
147 0.19
148 0.24
149 0.29
150 0.37
151 0.46
152 0.57
153 0.61
154 0.66
155 0.74
156 0.8