FuNGI

A0A0C9U1X0

Protein Details

Accession

A0A0C9U1X0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
154-179	FQTNTKPPRERPQCSNCKKRGHTIEV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 12, cyto 7, cysk 5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSRTPLQDEWIVRNAWTLGIIVFNTTNPVGLGIDMSKTAAEVWKSLLELYDVKSDLAIVNAERELRNVRLTDNDDFPTHIATLRTKWSIANAAGANISDTSFRMIVLTSLPSSWDSYITTLFDSKTSAEVVTRLNMYWMQVSRSKTPGANTTVFQTNTKPPRERPQCSNCKKRGHTIEVCYWKGGGKEGQFPPGFGKRGGESGNVQTASQGQNTKEREDDIRTYADSGATDHCFVNRADFSSYTELHEPREGQPANKQGKFRILGYGTVMKTIISAGYKSSITFKTALHTPDLAANLVSVSKFDGAGFSVLFGSGKATFMDKSGSSFMIGEKINELYLLQTVSPVMAMTAKSHEKPTSLDTWHRRFGHAGVTAIKNMIRHELVDGLEVTGEASVNGLCEDCIYGKQTQRPYDEKVTHEMELLERVHIDLHGPTRVRSFGGAWFMMLITDGASSYRTVYFLSEKSAAASFQAFKQFHAEAERQTGKKLREVRLDMGREWYNETWESYCQEKGIILISGAPYAHQQNGVSERANRIIINGTRCLLADTGLPPSLWAELAATTVYLVNFIPSARHPGKIPVEVWTGKRQDVSHLRAIGSIAFAHIPPEVGHSKLAPRSIKYTLIGYYGRDAYRLYDRSSKLVIKARNVIFEEGEGHHTPNIIPVEEVTDDFLYPQLKDNPPTPPPNTPLVIPNKPGLAPRPRESDPPLHPPIVLPEAISDQPDGGPRLRTANKPPVLRRSTRTQIPTKAVVEAAATLEREKEARTLGKEWATNSKHPEAHHVDIDGFLMSPNSHVAFMQSRKDPMLPRNYKEAMLDAEVWKPAMDEEMLKMRERGVWEVVDPPPGANILPSMWLYANKYDGDGNIIRRKARFLVLGNHQRKGIDFGETHADVVRMESFRIAAATAVELNLHTWQVDFVAAYLNSENKFDTYVRPAPGYLRPGEEGKVWKALRSVYGTMFGGYDWADDLENSYEGLGYYQSLADPCIHSRYIDEEYTLTSTYTDDVFGASSTEKGAKKAVEELERCYELKDAGSTGQILGIKVERDMEKGTLRLSQRAFMEEMLQEFGLKDCVPKYTPLPVGLDLTEADGPDNEEDRAFMEKVPFRKALGKLQWLANTTRPDLAQPVNRVSRFQSNPGPNHWKAVRHIMAYVRGSLDYGILYSRGAGSGLKPITYVDADYGNCMDTRRSTGGYVVMMAGGPVSWSSKRQQTVALSTTEAEYMAYTRAAQQAVWMSSFMSEIGLPQDLPAIIYGDNASAIALAKNASGHARAKHIDIRHHSIRERIKKGQIDIKHVPSTDNLADIFTKQLPRPAYEKAIRSLGLVKSTVVPV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.23
3	0.21
4	0.15
5	0.11
6	0.12
7	0.12
8	0.12
9	0.12
10	0.11
11	0.14
12	0.13
13	0.13
14	0.11
15	0.12
16	0.1
17	0.1
18	0.12
19	0.09
20	0.1
21	0.1
22	0.11
23	0.09
24	0.09
25	0.1
26	0.13
27	0.13
28	0.13
29	0.16
30	0.18
31	0.18
32	0.18
33	0.18
34	0.16
35	0.17
36	0.19
37	0.22
38	0.21
39	0.21
40	0.2
41	0.2
42	0.18
43	0.17
44	0.16
45	0.1
46	0.12
47	0.14
48	0.17
49	0.16
50	0.18
51	0.21
52	0.22
53	0.26
54	0.25
55	0.25
56	0.29
57	0.34
58	0.36
59	0.37
60	0.37
61	0.33
62	0.34
63	0.33
64	0.28
65	0.23
66	0.21
67	0.19
68	0.2
69	0.23
70	0.28
71	0.29
72	0.27
73	0.28
74	0.29
75	0.33
76	0.3
77	0.33
78	0.27
79	0.26
80	0.26
81	0.25
82	0.22
83	0.16
84	0.15
85	0.1
86	0.1
87	0.12
88	0.11
89	0.11
90	0.1
91	0.1
92	0.11
93	0.12
94	0.14
95	0.12
96	0.12
97	0.13
98	0.14
99	0.16
100	0.16
101	0.15
102	0.14
103	0.15
104	0.17
105	0.17
106	0.17
107	0.17
108	0.17
109	0.16
110	0.16
111	0.15
112	0.15
113	0.15
114	0.14
115	0.13
116	0.15
117	0.16
118	0.18
119	0.18
120	0.17
121	0.17
122	0.18
123	0.18
124	0.21
125	0.21
126	0.22
127	0.26
128	0.3
129	0.32
130	0.35
131	0.37
132	0.34
133	0.36
134	0.39
135	0.4
136	0.39
137	0.35
138	0.36
139	0.39
140	0.38
141	0.36
142	0.34
143	0.37
144	0.42
145	0.5
146	0.51
147	0.5
148	0.6
149	0.69
150	0.71
151	0.72
152	0.74
153	0.78
154	0.82
155	0.87
156	0.84
157	0.84
158	0.82
159	0.83
160	0.81
161	0.8
162	0.77
163	0.74
164	0.75
165	0.73
166	0.7
167	0.6
168	0.51
169	0.43
170	0.36
171	0.32
172	0.28
173	0.23
174	0.31
175	0.32
176	0.4
177	0.38
178	0.38
179	0.4
180	0.41
181	0.4
182	0.31
183	0.32
184	0.25
185	0.3
186	0.31
187	0.27
188	0.24
189	0.26
190	0.31
191	0.29
192	0.27
193	0.24
194	0.25
195	0.24
196	0.25
197	0.25
198	0.21
199	0.28
200	0.31
201	0.33
202	0.31
203	0.32
204	0.32
205	0.34
206	0.36
207	0.32
208	0.32
209	0.3
210	0.3
211	0.28
212	0.25
213	0.19
214	0.17
215	0.17
216	0.16
217	0.17
218	0.16
219	0.15
220	0.16
221	0.16
222	0.2
223	0.18
224	0.19
225	0.2
226	0.2
227	0.24
228	0.27
229	0.27
230	0.25
231	0.29
232	0.27
233	0.27
234	0.29
235	0.28
236	0.25
237	0.34
238	0.32
239	0.29
240	0.35
241	0.42
242	0.47
243	0.49
244	0.49
245	0.42
246	0.49
247	0.5
248	0.44
249	0.43
250	0.35
251	0.33
252	0.35
253	0.39
254	0.31
255	0.29
256	0.28
257	0.19
258	0.18
259	0.17
260	0.14
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.12
265	0.12
266	0.12
267	0.17
268	0.17
269	0.18
270	0.2
271	0.19
272	0.2
273	0.25
274	0.26
275	0.23
276	0.23
277	0.21
278	0.22
279	0.23
280	0.19
281	0.15
282	0.13
283	0.11
284	0.11
285	0.1
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.06
300	0.07
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.13
308	0.11
309	0.13
310	0.15
311	0.15
312	0.14
313	0.14
314	0.14
315	0.16
316	0.16
317	0.14
318	0.13
319	0.13
320	0.12
321	0.12
322	0.12
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.07
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.12
337	0.15
338	0.17
339	0.2
340	0.21
341	0.21
342	0.23
343	0.26
344	0.27
345	0.28
346	0.35
347	0.4
348	0.45
349	0.52
350	0.51
351	0.48
352	0.43
353	0.41
354	0.4
355	0.34
356	0.31
357	0.27
358	0.27
359	0.26
360	0.25
361	0.25
362	0.18
363	0.16
364	0.18
365	0.14
366	0.13
367	0.13
368	0.15
369	0.14
370	0.15
371	0.14
372	0.1
373	0.1
374	0.09
375	0.08
376	0.06
377	0.05
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.07
389	0.09
390	0.13
391	0.17
392	0.23
393	0.29
394	0.34
395	0.38
396	0.41
397	0.45
398	0.5
399	0.51
400	0.48
401	0.47
402	0.44
403	0.39
404	0.36
405	0.3
406	0.22
407	0.21
408	0.2
409	0.14
410	0.11
411	0.11
412	0.1
413	0.1
414	0.1
415	0.08
416	0.1
417	0.14
418	0.14
419	0.15
420	0.16
421	0.17
422	0.17
423	0.16
424	0.15
425	0.14
426	0.17
427	0.17
428	0.15
429	0.14
430	0.13
431	0.12
432	0.11
433	0.07
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.06
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.09
445	0.12
446	0.12
447	0.16
448	0.16
449	0.15
450	0.16
451	0.17
452	0.15
453	0.13
454	0.14
455	0.11
456	0.12
457	0.2
458	0.18
459	0.18
460	0.22
461	0.22
462	0.21
463	0.25
464	0.24
465	0.18
466	0.25
467	0.3
468	0.27
469	0.29
470	0.33
471	0.3
472	0.34
473	0.41
474	0.39
475	0.42
476	0.46
477	0.49
478	0.51
479	0.52
480	0.46
481	0.44
482	0.39
483	0.32
484	0.32
485	0.27
486	0.21
487	0.19
488	0.2
489	0.16
490	0.16
491	0.17
492	0.15
493	0.15
494	0.13
495	0.12
496	0.11
497	0.1
498	0.1
499	0.08
500	0.06
501	0.07
502	0.07
503	0.08
504	0.08
505	0.07
506	0.07
507	0.09
508	0.09
509	0.09
510	0.09
511	0.11
512	0.15
513	0.16
514	0.16
515	0.16
516	0.17
517	0.18
518	0.19
519	0.16
520	0.14
521	0.18
522	0.19
523	0.21
524	0.2
525	0.18
526	0.18
527	0.18
528	0.18
529	0.13
530	0.1
531	0.09
532	0.08
533	0.1
534	0.1
535	0.1
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.07
540	0.07
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.04
546	0.04
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.04
552	0.05
553	0.05
554	0.06
555	0.06
556	0.14
557	0.15
558	0.16
559	0.16
560	0.22
561	0.25
562	0.27
563	0.27
564	0.22
565	0.26
566	0.27
567	0.29
568	0.29
569	0.27
570	0.25
571	0.27
572	0.24
573	0.27
574	0.32
575	0.34
576	0.33
577	0.33
578	0.32
579	0.3
580	0.3
581	0.23
582	0.16
583	0.11
584	0.07
585	0.06
586	0.06
587	0.06
588	0.05
589	0.06
590	0.05
591	0.09
592	0.1
593	0.1
594	0.11
595	0.11
596	0.13
597	0.15
598	0.2
599	0.18
600	0.18
601	0.21
602	0.23
603	0.25
604	0.22
605	0.22
606	0.18
607	0.2
608	0.19
609	0.15
610	0.15
611	0.16
612	0.15
613	0.14
614	0.13
615	0.12
616	0.18
617	0.19
618	0.19
619	0.24
620	0.24
621	0.26
622	0.29
623	0.28
624	0.27
625	0.31
626	0.31
627	0.27
628	0.34
629	0.32
630	0.33
631	0.33
632	0.3
633	0.23
634	0.21
635	0.2
636	0.14
637	0.17
638	0.13
639	0.12
640	0.12
641	0.12
642	0.11
643	0.13
644	0.13
645	0.09
646	0.08
647	0.08
648	0.1
649	0.1
650	0.1
651	0.08
652	0.07
653	0.07
654	0.07
655	0.08
656	0.07
657	0.07
658	0.1
659	0.14
660	0.15
661	0.17
662	0.19
663	0.23
664	0.26
665	0.31
666	0.3
667	0.28
668	0.3
669	0.32
670	0.31
671	0.26
672	0.29
673	0.31
674	0.3
675	0.28
676	0.26
677	0.24
678	0.23
679	0.24
680	0.23
681	0.24
682	0.26
683	0.28
684	0.33
685	0.33
686	0.36
687	0.38
688	0.41
689	0.37
690	0.41
691	0.41
692	0.35
693	0.34
694	0.3
695	0.29
696	0.24
697	0.19
698	0.12
699	0.09
700	0.11
701	0.11
702	0.12
703	0.09
704	0.07
705	0.08
706	0.09
707	0.1
708	0.09
709	0.1
710	0.1
711	0.16
712	0.19
713	0.22
714	0.27
715	0.35
716	0.39
717	0.43
718	0.47
719	0.5
720	0.52
721	0.52
722	0.49
723	0.48
724	0.48
725	0.49
726	0.51
727	0.47
728	0.48
729	0.49
730	0.49
731	0.42
732	0.37
733	0.31
734	0.25
735	0.19
736	0.14
737	0.11
738	0.08
739	0.07
740	0.06
741	0.07
742	0.07
743	0.07
744	0.07
745	0.07
746	0.09
747	0.12
748	0.14
749	0.16
750	0.19
751	0.22
752	0.23
753	0.23
754	0.3
755	0.31
756	0.31
757	0.34
758	0.36
759	0.35
760	0.34
761	0.4
762	0.37
763	0.37
764	0.34
765	0.3
766	0.25
767	0.23
768	0.23
769	0.15
770	0.09
771	0.06
772	0.05
773	0.05
774	0.05
775	0.06
776	0.06
777	0.06
778	0.06
779	0.08
780	0.12
781	0.15
782	0.19
783	0.19
784	0.2
785	0.21
786	0.24
787	0.26
788	0.28
789	0.36
790	0.37
791	0.38
792	0.44
793	0.45
794	0.42
795	0.39
796	0.34
797	0.25
798	0.21
799	0.21
800	0.15
801	0.14
802	0.14
803	0.13
804	0.11
805	0.1
806	0.08
807	0.07
808	0.06
809	0.06
810	0.07
811	0.14
812	0.15
813	0.16
814	0.16
815	0.16
816	0.17
817	0.19
818	0.19
819	0.15
820	0.14
821	0.15
822	0.18
823	0.18
824	0.19
825	0.17
826	0.14
827	0.12
828	0.12
829	0.11
830	0.07
831	0.07
832	0.05
833	0.07
834	0.07
835	0.08
836	0.08
837	0.09
838	0.11
839	0.11
840	0.13
841	0.12
842	0.13
843	0.12
844	0.12
845	0.15
846	0.16
847	0.2
848	0.24
849	0.26
850	0.27
851	0.27
852	0.29
853	0.27
854	0.27
855	0.26
856	0.23
857	0.28
858	0.36
859	0.46
860	0.47
861	0.46
862	0.44
863	0.4
864	0.37
865	0.35
866	0.26
867	0.2
868	0.17
869	0.17
870	0.22
871	0.22
872	0.22
873	0.17
874	0.17
875	0.12
876	0.13
877	0.14
878	0.09
879	0.09
880	0.09
881	0.09
882	0.09
883	0.09
884	0.08
885	0.05
886	0.05
887	0.06
888	0.06
889	0.05
890	0.05
891	0.05
892	0.06
893	0.06
894	0.06
895	0.05
896	0.05
897	0.05
898	0.06
899	0.06
900	0.05
901	0.05
902	0.08
903	0.08
904	0.09
905	0.09
906	0.11
907	0.12
908	0.12
909	0.13
910	0.1
911	0.12
912	0.12
913	0.14
914	0.19
915	0.24
916	0.25
917	0.25
918	0.25
919	0.26
920	0.3
921	0.31
922	0.25
923	0.23
924	0.23
925	0.24
926	0.24
927	0.25
928	0.24
929	0.22
930	0.28
931	0.26
932	0.25
933	0.26
934	0.26
935	0.26
936	0.27
937	0.27
938	0.2
939	0.22
940	0.21
941	0.2
942	0.19
943	0.15
944	0.11
945	0.09
946	0.08
947	0.05
948	0.06
949	0.05
950	0.05
951	0.07
952	0.08
953	0.08
954	0.08
955	0.07
956	0.07
957	0.07
958	0.07
959	0.06
960	0.05
961	0.05
962	0.05
963	0.06
964	0.06
965	0.07
966	0.08
967	0.1
968	0.11
969	0.14
970	0.14
971	0.14
972	0.15
973	0.19
974	0.21
975	0.2
976	0.19
977	0.16
978	0.17
979	0.19
980	0.18
981	0.14
982	0.1
983	0.1
984	0.1
985	0.1
986	0.09
987	0.07
988	0.07
989	0.07
990	0.07
991	0.08
992	0.07
993	0.07
994	0.08
995	0.13
996	0.14
997	0.15
998	0.18
999	0.18
1000	0.19
1001	0.25
1002	0.29
1003	0.31
1004	0.32
1005	0.36
1006	0.38
1007	0.39
1008	0.38
1009	0.33
1010	0.28
1011	0.21
1012	0.2
1013	0.17
1014	0.13
1015	0.11
1016	0.12
1017	0.12
1018	0.11
1019	0.13
1020	0.13
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.12
1025	0.12
1026	0.15
1027	0.13
1028	0.14
1029	0.16
1030	0.18
1031	0.19
1032	0.19
1033	0.2
1034	0.22
1035	0.23
1036	0.27
1037	0.27
1038	0.28
1039	0.27
1040	0.29
1041	0.29
1042	0.23
1043	0.24
1044	0.19
1045	0.19
1046	0.17
1047	0.16
1048	0.13
1049	0.12
1050	0.12
1051	0.11
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.09
1055	0.13
1056	0.14
1057	0.17
1058	0.19
1059	0.25
1060	0.28
1061	0.29
1062	0.31
1063	0.29
1064	0.3
1065	0.27
1066	0.25
1067	0.18
1068	0.17
1069	0.15
1070	0.12
1071	0.11
1072	0.09
1073	0.1
1074	0.11
1075	0.12
1076	0.1
1077	0.09
1078	0.1
1079	0.11
1080	0.14
1081	0.14
1082	0.13
1083	0.19
1084	0.23
1085	0.27
1086	0.32
1087	0.32
1088	0.3
1089	0.37
1090	0.4
1091	0.43
1092	0.46
1093	0.5
1094	0.48
1095	0.52
1096	0.53
1097	0.48
1098	0.48
1099	0.44
1100	0.4
1101	0.35
1102	0.34
1103	0.29
1104	0.26
1105	0.28
1106	0.31
1107	0.32
1108	0.32
1109	0.38
1110	0.43
1111	0.43
1112	0.43
1113	0.43
1114	0.47
1115	0.44
1116	0.45
1117	0.47
1118	0.48
1119	0.51
1120	0.58
1121	0.63
1122	0.54
1123	0.58
1124	0.56
1125	0.51
1126	0.46
1127	0.53
1128	0.49
1129	0.42
1130	0.44
1131	0.4
1132	0.44
1133	0.4
1134	0.38
1135	0.29
1136	0.25
1137	0.24
1138	0.2
1139	0.17
1140	0.1
1141	0.09
1142	0.08
1143	0.07
1144	0.07
1145	0.07
1146	0.07
1147	0.07
1148	0.07
1149	0.08
1150	0.08
1151	0.16
1152	0.16
1153	0.16
1154	0.16
1155	0.16
1156	0.18
1157	0.19
1158	0.18
1159	0.12
1160	0.15
1161	0.15
1162	0.17
1163	0.17
1164	0.15
1165	0.15
1166	0.15
1167	0.15
1168	0.14
1169	0.19
1170	0.21
1171	0.22
1172	0.22
1173	0.24
1174	0.26
1175	0.24
1176	0.23
1177	0.17
1178	0.14
1179	0.12
1180	0.11
1181	0.09
1182	0.05
1183	0.05
1184	0.05
1185	0.08
1186	0.09
1187	0.12
1188	0.17
1189	0.25
1190	0.28
1191	0.29
1192	0.35
1193	0.38
1194	0.44
1195	0.45
1196	0.42
1197	0.36
1198	0.33
1199	0.33
1200	0.26
1201	0.2
1202	0.13
1203	0.1
1204	0.09
1205	0.09
1206	0.09
1207	0.09
1208	0.11
1209	0.15
1210	0.16
1211	0.15
1212	0.17
1213	0.23
1214	0.24
1215	0.24
1216	0.21
1217	0.18
1218	0.18
1219	0.19
1220	0.15
1221	0.09
1222	0.07
1223	0.07
1224	0.1
1225	0.1
1226	0.1
1227	0.1
1228	0.12
1229	0.11
1230	0.11
1231	0.11
1232	0.1
1233	0.09
1234	0.1
1235	0.11
1236	0.09
1237	0.09
1238	0.08
1239	0.08
1240	0.06
1241	0.07
1242	0.07
1243	0.07
1244	0.07
1245	0.07
1246	0.08
1247	0.1
1248	0.11
1249	0.15
1250	0.19
1251	0.21
1252	0.28
1253	0.29
1254	0.33
1255	0.39
1256	0.42
1257	0.47
1258	0.5
1259	0.56
1260	0.58
1261	0.62
1262	0.6
1263	0.62
1264	0.68
1265	0.69
1266	0.68
1267	0.68
1268	0.68
1269	0.69
1270	0.73
1271	0.73
1272	0.68
1273	0.67
1274	0.68
1275	0.67
1276	0.64
1277	0.58
1278	0.52
1279	0.45
1280	0.46
1281	0.38
1282	0.32
1283	0.25
1284	0.21
1285	0.22
1286	0.21
1287	0.23
1288	0.2
1289	0.24
1290	0.23
1291	0.29
1292	0.3
1293	0.33
1294	0.37
1295	0.39
1296	0.45
1297	0.47
1298	0.5
1299	0.49
1300	0.51
1301	0.47
1302	0.46
1303	0.46
1304	0.39
1305	0.36
1306	0.32
1307	0.29

A0A0C9U1X0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer