Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C9VIU2

Protein Details
Accession A0A0C9VIU2    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-230AVAPVKRGRGRPRKYPKEEDSPKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-86DRSMSRGRSRARGRGI
141-145RKRNK
164-228KRDGVVVKRKREASEGGDDGDAKRKKGSKERGSSAKEEEAKEEAVAPVKRGRGRPRKYPKEEDSP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MVDCFIGRPRSTDRDASAPASTSASTPLRRGRSASSTSARYPTRGVKRGRNAEDYDNDNDDGKSLRERDRDRSMSRGRSRARGRGISASDRGGSSRPRSMSMSTSGRSHSHSHSGGRAGYGDEDEDEARVEEGEVIVAARRKRNKVVEGEKEKGVLPAPDETPKRDGVVVKRKREASEGGDDGDAKRKKGSKERGSSAKEEEAKEEAVAPVKRGRGRPRKYPKEEDSPKEKSKFDALLEYCAENNLPRPQLFNSSGQSDAERGIADGSGYRVWLVMGKEKLEHQMVFPSLEAGTERIAKSVLARLKAKKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.47
3 0.46
4 0.41
5 0.36
6 0.32
7 0.28
8 0.25
9 0.19
10 0.21
11 0.23
12 0.23
13 0.27
14 0.33
15 0.37
16 0.38
17 0.41
18 0.41
19 0.44
20 0.47
21 0.5
22 0.48
23 0.47
24 0.48
25 0.53
26 0.48
27 0.42
28 0.41
29 0.43
30 0.47
31 0.5
32 0.54
33 0.57
34 0.66
35 0.74
36 0.76
37 0.73
38 0.67
39 0.65
40 0.64
41 0.58
42 0.52
43 0.45
44 0.4
45 0.34
46 0.3
47 0.24
48 0.2
49 0.17
50 0.18
51 0.19
52 0.25
53 0.32
54 0.36
55 0.43
56 0.51
57 0.57
58 0.55
59 0.6
60 0.62
61 0.64
62 0.66
63 0.68
64 0.62
65 0.64
66 0.67
67 0.66
68 0.65
69 0.6
70 0.56
71 0.55
72 0.55
73 0.5
74 0.46
75 0.4
76 0.33
77 0.29
78 0.26
79 0.22
80 0.22
81 0.21
82 0.24
83 0.24
84 0.26
85 0.28
86 0.29
87 0.29
88 0.31
89 0.32
90 0.28
91 0.28
92 0.28
93 0.27
94 0.28
95 0.28
96 0.25
97 0.26
98 0.27
99 0.27
100 0.27
101 0.28
102 0.25
103 0.23
104 0.2
105 0.14
106 0.13
107 0.11
108 0.09
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.03
122 0.03
123 0.04
124 0.08
125 0.09
126 0.14
127 0.19
128 0.22
129 0.28
130 0.33
131 0.37
132 0.43
133 0.5
134 0.55
135 0.58
136 0.58
137 0.52
138 0.48
139 0.43
140 0.34
141 0.26
142 0.17
143 0.11
144 0.1
145 0.11
146 0.16
147 0.17
148 0.18
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.19
153 0.2
154 0.24
155 0.34
156 0.4
157 0.42
158 0.47
159 0.48
160 0.48
161 0.47
162 0.42
163 0.36
164 0.34
165 0.3
166 0.26
167 0.24
168 0.23
169 0.21
170 0.26
171 0.23
172 0.17
173 0.2
174 0.24
175 0.28
176 0.38
177 0.48
178 0.49
179 0.57
180 0.63
181 0.69
182 0.68
183 0.66
184 0.6
185 0.56
186 0.5
187 0.43
188 0.38
189 0.31
190 0.27
191 0.24
192 0.21
193 0.15
194 0.17
195 0.17
196 0.16
197 0.18
198 0.22
199 0.26
200 0.31
201 0.41
202 0.46
203 0.52
204 0.62
205 0.69
206 0.76
207 0.8
208 0.84
209 0.8
210 0.8
211 0.83
212 0.79
213 0.76
214 0.74
215 0.73
216 0.67
217 0.61
218 0.53
219 0.5
220 0.46
221 0.39
222 0.4
223 0.34
224 0.34
225 0.34
226 0.32
227 0.26
228 0.23
229 0.22
230 0.14
231 0.17
232 0.18
233 0.2
234 0.19
235 0.22
236 0.24
237 0.31
238 0.33
239 0.34
240 0.31
241 0.31
242 0.32
243 0.3
244 0.29
245 0.22
246 0.2
247 0.16
248 0.13
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.12
261 0.13
262 0.18
263 0.21
264 0.22
265 0.24
266 0.26
267 0.31
268 0.31
269 0.29
270 0.23
271 0.27
272 0.27
273 0.27
274 0.25
275 0.21
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.11
280 0.13
281 0.16
282 0.17
283 0.16
284 0.17
285 0.16
286 0.18
287 0.24
288 0.27
289 0.29
290 0.36