Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2PB49

Protein Details
Accession A0A0D2PB49    Localization Confidence High Confidence Score 24.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSTAQKLTKKQKKGVAFRERKSGKRHydrophilic
120-157SAEKTSPKKTAKRKKTDGKDTTKPEEKKEKPSKQRFLLBasic
310-335GETHRGGERHHKKSKSKFPAKTWGTGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-25KKQKKGVAFRERKSGKR
60-93KKKGKAGDHARGGEGKHPEGKDGGKGKGKAKAED
100-152VVKKGAQKRKREEDEAGEGGSAEKTSPKKTAKRKKTDGKDTTKPEEKKEKPSK
318-326RHHKKSKSK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSTAQKLTKKQKKGVAFRERKSGKRHDESSMEANAVPAMEDEDLAGDAGYPHQGAGDNDKKKGKAGDHARGGEGKHPEGKDGGKGKGKAKAEDVPVAVEVVKKGAQKRKREEDEAGEGGSAEKTSPKKTAKRKKTDGKDTTKPEEKKEKPSKQRFLLFLGNLKYTTPLSAIQAHFAICDPPPTVRLLTPKSIAGGPAQKLKSKGCAFLEFSHRNALQQGLKLHQTMLDGRMINVELTAGGGGKSDSRLTKVRERNKALLEEREERVEKEATADGSFPNLPSRPQRFSATSGMEHAPVTQKTWTVGDADDGETHRGGERHHKKSKSKFPAKTWGTGVNAIPVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.84
3 0.85
4 0.79
5 0.82
6 0.81
7 0.77
8 0.75
9 0.75
10 0.73
11 0.73
12 0.73
13 0.69
14 0.66
15 0.65
16 0.62
17 0.54
18 0.44
19 0.35
20 0.31
21 0.24
22 0.2
23 0.14
24 0.09
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.05
39 0.06
40 0.08
41 0.09
42 0.18
43 0.27
44 0.29
45 0.35
46 0.39
47 0.39
48 0.4
49 0.45
50 0.39
51 0.4
52 0.46
53 0.51
54 0.54
55 0.55
56 0.54
57 0.5
58 0.48
59 0.44
60 0.38
61 0.31
62 0.3
63 0.28
64 0.28
65 0.28
66 0.28
67 0.3
68 0.31
69 0.34
70 0.35
71 0.39
72 0.41
73 0.45
74 0.47
75 0.42
76 0.41
77 0.41
78 0.38
79 0.38
80 0.35
81 0.29
82 0.26
83 0.24
84 0.2
85 0.15
86 0.11
87 0.09
88 0.12
89 0.13
90 0.2
91 0.28
92 0.36
93 0.44
94 0.54
95 0.62
96 0.66
97 0.68
98 0.66
99 0.63
100 0.62
101 0.54
102 0.45
103 0.34
104 0.27
105 0.22
106 0.18
107 0.12
108 0.06
109 0.09
110 0.11
111 0.13
112 0.2
113 0.27
114 0.35
115 0.46
116 0.57
117 0.64
118 0.72
119 0.8
120 0.83
121 0.87
122 0.89
123 0.88
124 0.85
125 0.83
126 0.79
127 0.76
128 0.75
129 0.67
130 0.62
131 0.63
132 0.59
133 0.62
134 0.66
135 0.68
136 0.7
137 0.79
138 0.8
139 0.76
140 0.78
141 0.69
142 0.63
143 0.58
144 0.48
145 0.42
146 0.36
147 0.3
148 0.24
149 0.22
150 0.19
151 0.13
152 0.13
153 0.1
154 0.08
155 0.09
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.06
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.17
173 0.18
174 0.2
175 0.21
176 0.2
177 0.2
178 0.19
179 0.18
180 0.15
181 0.17
182 0.16
183 0.21
184 0.22
185 0.23
186 0.26
187 0.26
188 0.32
189 0.29
190 0.32
191 0.28
192 0.31
193 0.32
194 0.34
195 0.42
196 0.35
197 0.35
198 0.35
199 0.33
200 0.29
201 0.27
202 0.27
203 0.2
204 0.21
205 0.22
206 0.19
207 0.21
208 0.21
209 0.2
210 0.18
211 0.17
212 0.15
213 0.15
214 0.16
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.15
219 0.13
220 0.11
221 0.09
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.09
232 0.09
233 0.13
234 0.19
235 0.24
236 0.33
237 0.42
238 0.5
239 0.58
240 0.64
241 0.66
242 0.66
243 0.69
244 0.63
245 0.61
246 0.57
247 0.53
248 0.48
249 0.47
250 0.44
251 0.37
252 0.36
253 0.3
254 0.24
255 0.22
256 0.22
257 0.18
258 0.18
259 0.18
260 0.14
261 0.16
262 0.16
263 0.14
264 0.16
265 0.15
266 0.18
267 0.27
268 0.33
269 0.35
270 0.38
271 0.43
272 0.42
273 0.46
274 0.5
275 0.45
276 0.4
277 0.39
278 0.37
279 0.32
280 0.29
281 0.26
282 0.24
283 0.21
284 0.22
285 0.19
286 0.19
287 0.2
288 0.21
289 0.21
290 0.16
291 0.16
292 0.17
293 0.17
294 0.18
295 0.18
296 0.18
297 0.2
298 0.18
299 0.18
300 0.18
301 0.17
302 0.18
303 0.27
304 0.36
305 0.44
306 0.53
307 0.61
308 0.68
309 0.78
310 0.87
311 0.87
312 0.87
313 0.86
314 0.85
315 0.88
316 0.82
317 0.78
318 0.71
319 0.67
320 0.6
321 0.56
322 0.48