FuNGI

A0A0D2LM23

Protein Details

Accession

A0A0D2LM23

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-33	VDDEKSRYARRVKLKQLNTTTVV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MDSSTTGAQRVDDEKSRYARRVKLKQLNTTTVVQETAKLDSSLKRHTALITRIRRSLAADNREQIIKDIETLSLEKYVDELAGAVIEGLARCKTEKDVWGAVEVISAVHRRFPKTFTPALISNLSMAISAPPKATLAALTPEQREKDDSTRVTRQRPIVRVSSELALVGIIKDAPDRSGGEWVMKAMKELLSNDPSLSSLPLLTTFLKSYSRPFLGISPPLTPKQISVTAEPGSLSNSQVQEIGENDHYPSLLSEEEELVEQDIRDRFKRMCEGYFDNVCKKLVIELKRLQEQDKRNHEAYIRSGEIFEDRQQAYEKMTKSYEKLLASCQSLSELLYLPLPSLPTASQKSDSILIGSNSSHMNGDSDEILTTGGKWEDEEERRFFEDVQDLKDFVPSSVLGVEEEVEEEETKELERERAEREKEEVRKLEEELEKLSGTTASLDGVPVKHDESQEEDAPTPTPGTPKAHTPPLSPHLAPQGPSQLLTALLVRLPDATNRVLIDQAAIDFAFLNSKAARKRLVRFMSQVPKNRTDLLPHYSRLVATLNKYMPDVGIDVVAFLDEEFRYLQRKKNVVKELAEVRLKNILFFSNLTKFRVVPSHVILHMFKVCLDDFSGTNVENLALLLEGCGRFLLRSEDTAERFSTMLELMRRKQSMQHFDQRQLLLLENAYYQCNPPERAPKQEKTRTPMELFIRHLIYDVLAKKSIDKVLKLLRKLDWEDEEVKRYLHKIFTKPWKIKYGNIGLLAMLTYDLQRYRPAFAIAVVDQVLEDIRRGLEQNVYSTNQRRLATMKYLGELYIYRLLSSGIIFDTLWSIVTFGHADGRPLPNQAIPLDMPDDFFRVRLICVLLDTCGMCFDRGTQKKKLDNFLIFFQYYIKCKEPLPMDVDFMLSDSLEAVRPKLVLAKTLEESAVAVDEMYSSAYQMMGDDEGDDSEDEGERREEEDHDDEDEEDSGDGGSPNEERAPSPDQEIVLSASNSLQDNLGPSEEADAEFAKELAKLVTDTSAESRKVDKKTALALWDSAVPTNVRKRRTDEKDEDEEDGSSNGPETMAFTVITKKGNKQQARQIAVPSASALAVHTRTAQLQDKVEQQHLKRLVLNYEQREEAEELKAMEARHRAGAIKIRYVG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.46
3	0.51
4	0.55
5	0.6
6	0.62
7	0.66
8	0.72
9	0.76
10	0.78
11	0.81
12	0.84
13	0.84
14	0.82
15	0.75
16	0.69
17	0.6
18	0.51
19	0.45
20	0.35
21	0.31
22	0.25
23	0.24
24	0.22
25	0.21
26	0.22
27	0.25
28	0.3
29	0.34
30	0.35
31	0.34
32	0.34
33	0.38
34	0.43
35	0.46
36	0.51
37	0.53
38	0.55
39	0.57
40	0.57
41	0.54
42	0.5
43	0.52
44	0.51
45	0.49
46	0.5
47	0.5
48	0.51
49	0.52
50	0.47
51	0.4
52	0.35
53	0.28
54	0.24
55	0.21
56	0.19
57	0.19
58	0.2
59	0.19
60	0.18
61	0.17
62	0.15
63	0.14
64	0.14
65	0.12
66	0.1
67	0.09
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.05
72	0.04
73	0.05
74	0.05
75	0.07
76	0.08
77	0.08
78	0.1
79	0.11
80	0.16
81	0.21
82	0.26
83	0.31
84	0.35
85	0.35
86	0.37
87	0.36
88	0.31
89	0.26
90	0.2
91	0.14
92	0.11
93	0.13
94	0.12
95	0.17
96	0.21
97	0.25
98	0.27
99	0.31
100	0.38
101	0.42
102	0.46
103	0.44
104	0.46
105	0.44
106	0.46
107	0.44
108	0.35
109	0.29
110	0.25
111	0.21
112	0.15
113	0.13
114	0.12
115	0.11
116	0.12
117	0.12
118	0.12
119	0.12
120	0.13
121	0.13
122	0.11
123	0.12
124	0.14
125	0.18
126	0.21
127	0.24
128	0.28
129	0.29
130	0.3
131	0.31
132	0.32
133	0.34
134	0.39
135	0.41
136	0.44
137	0.52
138	0.57
139	0.6
140	0.62
141	0.65
142	0.65
143	0.66
144	0.64
145	0.61
146	0.57
147	0.54
148	0.49
149	0.42
150	0.34
151	0.28
152	0.22
153	0.15
154	0.12
155	0.09
156	0.07
157	0.06
158	0.05
159	0.07
160	0.08
161	0.08
162	0.1
163	0.12
164	0.12
165	0.18
166	0.18
167	0.19
168	0.19
169	0.2
170	0.22
171	0.2
172	0.19
173	0.16
174	0.18
175	0.18
176	0.2
177	0.24
178	0.23
179	0.24
180	0.24
181	0.22
182	0.21
183	0.19
184	0.17
185	0.11
186	0.09
187	0.08
188	0.09
189	0.11
190	0.12
191	0.13
192	0.13
193	0.15
194	0.17
195	0.18
196	0.22
197	0.26
198	0.27
199	0.26
200	0.26
201	0.28
202	0.31
203	0.35
204	0.32
205	0.3
206	0.32
207	0.33
208	0.33
209	0.29
210	0.25
211	0.25
212	0.29
213	0.26
214	0.25
215	0.28
216	0.27
217	0.27
218	0.26
219	0.21
220	0.18
221	0.17
222	0.15
223	0.15
224	0.15
225	0.15
226	0.16
227	0.16
228	0.14
229	0.14
230	0.17
231	0.14
232	0.14
233	0.15
234	0.14
235	0.13
236	0.12
237	0.11
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.08
249	0.11
250	0.14
251	0.17
252	0.18
253	0.21
254	0.21
255	0.26
256	0.34
257	0.33
258	0.33
259	0.36
260	0.4
261	0.44
262	0.49
263	0.47
264	0.43
265	0.42
266	0.39
267	0.33
268	0.28
269	0.27
270	0.27
271	0.29
272	0.33
273	0.38
274	0.42
275	0.49
276	0.5
277	0.48
278	0.49
279	0.52
280	0.54
281	0.57
282	0.58
283	0.53
284	0.54
285	0.52
286	0.49
287	0.45
288	0.41
289	0.34
290	0.27
291	0.26
292	0.24
293	0.24
294	0.23
295	0.21
296	0.21
297	0.19
298	0.2
299	0.22
300	0.22
301	0.24
302	0.28
303	0.26
304	0.23
305	0.26
306	0.27
307	0.27
308	0.32
309	0.33
310	0.29
311	0.29
312	0.3
313	0.3
314	0.3
315	0.28
316	0.23
317	0.19
318	0.17
319	0.16
320	0.13
321	0.1
322	0.09
323	0.1
324	0.1
325	0.09
326	0.09
327	0.09
328	0.08
329	0.08
330	0.09
331	0.13
332	0.16
333	0.18
334	0.2
335	0.2
336	0.21
337	0.22
338	0.21
339	0.17
340	0.16
341	0.14
342	0.14
343	0.13
344	0.13
345	0.11
346	0.11
347	0.1
348	0.08
349	0.09
350	0.08
351	0.09
352	0.08
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.08
364	0.14
365	0.19
366	0.23
367	0.24
368	0.26
369	0.28
370	0.28
371	0.27
372	0.23
373	0.25
374	0.22
375	0.24
376	0.23
377	0.22
378	0.21
379	0.23
380	0.21
381	0.14
382	0.14
383	0.1
384	0.09
385	0.09
386	0.09
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.05
391	0.06
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.07
401	0.09
402	0.1
403	0.12
404	0.18
405	0.25
406	0.27
407	0.28
408	0.32
409	0.37
410	0.41
411	0.45
412	0.42
413	0.38
414	0.37
415	0.37
416	0.39
417	0.34
418	0.3
419	0.25
420	0.24
421	0.2
422	0.18
423	0.18
424	0.11
425	0.08
426	0.08
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.07
434	0.07
435	0.09
436	0.1
437	0.11
438	0.12
439	0.16
440	0.19
441	0.2
442	0.21
443	0.2
444	0.18
445	0.18
446	0.18
447	0.14
448	0.11
449	0.1
450	0.12
451	0.15
452	0.15
453	0.2
454	0.24
455	0.3
456	0.3
457	0.31
458	0.34
459	0.34
460	0.37
461	0.32
462	0.29
463	0.29
464	0.29
465	0.28
466	0.24
467	0.24
468	0.2
469	0.21
470	0.19
471	0.13
472	0.12
473	0.12
474	0.11
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.07
482	0.09
483	0.09
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.1
488	0.09
489	0.09
490	0.06
491	0.06
492	0.05
493	0.05
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.05
499	0.06
500	0.06
501	0.09
502	0.11
503	0.13
504	0.19
505	0.22
506	0.27
507	0.35
508	0.38
509	0.38
510	0.4
511	0.46
512	0.5
513	0.51
514	0.55
515	0.51
516	0.5
517	0.49
518	0.47
519	0.4
520	0.34
521	0.32
522	0.3
523	0.28
524	0.25
525	0.25
526	0.23
527	0.22
528	0.19
529	0.18
530	0.14
531	0.13
532	0.17
533	0.16
534	0.16
535	0.16
536	0.15
537	0.13
538	0.12
539	0.1
540	0.06
541	0.06
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.04
547	0.03
548	0.04
549	0.03
550	0.04
551	0.05
552	0.05
553	0.1
554	0.12
555	0.17
556	0.23
557	0.3
558	0.33
559	0.42
560	0.48
561	0.48
562	0.47
563	0.47
564	0.44
565	0.43
566	0.42
567	0.33
568	0.27
569	0.28
570	0.26
571	0.22
572	0.19
573	0.14
574	0.12
575	0.13
576	0.16
577	0.17
578	0.19
579	0.2
580	0.2
581	0.2
582	0.2
583	0.23
584	0.21
585	0.17
586	0.18
587	0.2
588	0.19
589	0.21
590	0.2
591	0.18
592	0.17
593	0.14
594	0.12
595	0.11
596	0.11
597	0.09
598	0.1
599	0.09
600	0.08
601	0.1
602	0.11
603	0.09
604	0.09
605	0.09
606	0.08
607	0.07
608	0.07
609	0.04
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.05
620	0.09
621	0.08
622	0.1
623	0.13
624	0.17
625	0.18
626	0.2
627	0.19
628	0.16
629	0.16
630	0.15
631	0.12
632	0.09
633	0.1
634	0.12
635	0.15
636	0.17
637	0.22
638	0.22
639	0.22
640	0.28
641	0.33
642	0.37
643	0.41
644	0.48
645	0.46
646	0.49
647	0.54
648	0.48
649	0.42
650	0.34
651	0.29
652	0.2
653	0.16
654	0.13
655	0.09
656	0.1
657	0.09
658	0.09
659	0.09
660	0.11
661	0.13
662	0.15
663	0.17
664	0.27
665	0.28
666	0.38
667	0.45
668	0.49
669	0.57
670	0.63
671	0.65
672	0.6
673	0.63
674	0.58
675	0.52
676	0.51
677	0.46
678	0.41
679	0.39
680	0.37
681	0.32
682	0.27
683	0.26
684	0.2
685	0.15
686	0.16
687	0.15
688	0.14
689	0.15
690	0.15
691	0.16
692	0.19
693	0.23
694	0.21
695	0.19
696	0.22
697	0.3
698	0.35
699	0.36
700	0.36
701	0.34
702	0.37
703	0.38
704	0.37
705	0.31
706	0.29
707	0.32
708	0.31
709	0.32
710	0.27
711	0.25
712	0.22
713	0.22
714	0.21
715	0.22
716	0.26
717	0.27
718	0.35
719	0.46
720	0.55
721	0.58
722	0.61
723	0.65
724	0.61
725	0.6
726	0.6
727	0.57
728	0.51
729	0.46
730	0.41
731	0.31
732	0.29
733	0.25
734	0.17
735	0.09
736	0.05
737	0.04
738	0.05
739	0.06
740	0.07
741	0.11
742	0.12
743	0.14
744	0.15
745	0.16
746	0.15
747	0.15
748	0.18
749	0.15
750	0.15
751	0.12
752	0.11
753	0.09
754	0.09
755	0.09
756	0.05
757	0.05
758	0.04
759	0.05
760	0.06
761	0.07
762	0.08
763	0.12
764	0.13
765	0.15
766	0.18
767	0.2
768	0.23
769	0.26
770	0.31
771	0.32
772	0.32
773	0.31
774	0.3
775	0.32
776	0.34
777	0.35
778	0.31
779	0.26
780	0.26
781	0.24
782	0.23
783	0.19
784	0.17
785	0.17
786	0.16
787	0.15
788	0.15
789	0.15
790	0.14
791	0.14
792	0.11
793	0.06
794	0.07
795	0.06
796	0.06
797	0.07
798	0.07
799	0.07
800	0.06
801	0.06
802	0.05
803	0.07
804	0.07
805	0.06
806	0.12
807	0.12
808	0.13
809	0.16
810	0.2
811	0.2
812	0.21
813	0.22
814	0.17
815	0.19
816	0.18
817	0.17
818	0.14
819	0.14
820	0.15
821	0.14
822	0.14
823	0.13
824	0.15
825	0.12
826	0.12
827	0.12
828	0.11
829	0.11
830	0.12
831	0.12
832	0.1
833	0.11
834	0.11
835	0.1
836	0.11
837	0.11
838	0.09
839	0.1
840	0.1
841	0.09
842	0.09
843	0.12
844	0.21
845	0.3
846	0.35
847	0.41
848	0.48
849	0.55
850	0.6
851	0.64
852	0.61
853	0.59
854	0.57
855	0.54
856	0.51
857	0.44
858	0.39
859	0.34
860	0.3
861	0.26
862	0.28
863	0.26
864	0.22
865	0.23
866	0.29
867	0.29
868	0.3
869	0.32
870	0.29
871	0.28
872	0.27
873	0.27
874	0.21
875	0.18
876	0.13
877	0.09
878	0.07
879	0.06
880	0.06
881	0.08
882	0.09
883	0.09
884	0.1
885	0.1
886	0.11
887	0.16
888	0.16
889	0.19
890	0.21
891	0.25
892	0.25
893	0.26
894	0.26
895	0.19
896	0.19
897	0.14
898	0.12
899	0.08
900	0.06
901	0.05
902	0.05
903	0.05
904	0.06
905	0.06
906	0.05
907	0.05
908	0.06
909	0.06
910	0.06
911	0.07
912	0.06
913	0.06
914	0.06
915	0.07
916	0.07
917	0.08
918	0.07
919	0.07
920	0.07
921	0.08
922	0.08
923	0.09
924	0.1
925	0.1
926	0.11
927	0.12
928	0.13
929	0.17
930	0.21
931	0.21
932	0.22
933	0.22
934	0.21
935	0.21
936	0.2
937	0.15
938	0.11
939	0.09
940	0.08
941	0.07
942	0.07
943	0.06
944	0.07
945	0.07
946	0.09
947	0.11
948	0.11
949	0.11
950	0.16
951	0.21
952	0.2
953	0.24
954	0.25
955	0.23
956	0.23
957	0.23
958	0.21
959	0.18
960	0.17
961	0.14
962	0.12
963	0.14
964	0.14
965	0.13
966	0.11
967	0.09
968	0.12
969	0.13
970	0.13
971	0.11
972	0.11
973	0.13
974	0.13
975	0.13
976	0.12
977	0.11
978	0.11
979	0.11
980	0.11
981	0.09
982	0.09
983	0.09
984	0.08
985	0.09
986	0.08
987	0.09
988	0.11
989	0.11
990	0.13
991	0.17
992	0.22
993	0.22
994	0.23
995	0.3
996	0.34
997	0.38
998	0.42
999	0.41
1000	0.4
1001	0.46
1002	0.48
1003	0.45
1004	0.4
1005	0.36
1006	0.32
1007	0.32
1008	0.29
1009	0.22
1010	0.2
1011	0.18
1012	0.21
1013	0.3
1014	0.35
1015	0.36
1016	0.4
1017	0.47
1018	0.56
1019	0.64
1020	0.69
1021	0.68
1022	0.71
1023	0.74
1024	0.73
1025	0.69
1026	0.59
1027	0.5
1028	0.41
1029	0.32
1030	0.24
1031	0.15
1032	0.13
1033	0.09
1034	0.08
1035	0.07
1036	0.08
1037	0.09
1038	0.1
1039	0.1
1040	0.11
1041	0.16
1042	0.19
1043	0.25
1044	0.26
1045	0.31
1046	0.39
1047	0.49
1048	0.56
1049	0.58
1050	0.65
1051	0.7
1052	0.73
1053	0.7
1054	0.65
1055	0.61
1056	0.54
1057	0.47
1058	0.37
1059	0.28
1060	0.21
1061	0.18
1062	0.15
1063	0.13
1064	0.14
1065	0.14
1066	0.15
1067	0.15
1068	0.17
1069	0.23
1070	0.29
1071	0.29
1072	0.32
1073	0.35
1074	0.41
1075	0.44
1076	0.5
1077	0.52
1078	0.47
1079	0.52
1080	0.53
1081	0.52
1082	0.49
1083	0.49
1084	0.47
1085	0.49
1086	0.56
1087	0.53
1088	0.52
1089	0.51
1090	0.46
1091	0.46
1092	0.42
1093	0.36
1094	0.29
1095	0.25
1096	0.22
1097	0.22
1098	0.24
1099	0.2
1100	0.24
1101	0.25
1102	0.25
1103	0.26
1104	0.27
1105	0.27
1106	0.3
1107	0.39
1108	0.38

A0A0D2LM23

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer