Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2NSW1

Protein Details
Accession A0A0D2NSW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-125EQDRERHKRLRERRWVRPALHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-119DRERHKRLRERR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042326  Ctk3  
IPR024637  Ctk3_C  
Gene Ontology GO:0070692  C:CTDK-1 complex  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
Pfam View protein in Pfam  
PF12350  CTK3_C  
Amino Acid Sequences MVKSHSKSERSLLANANGLYVQFVSRDLNRIVESIVPDGKQGLPNLVSXKQILENWRTKRYVDPQRIDDVLSTLNSRPVPAPVAVSTPTKSPHQALRRAEVNKRIEQDRERHKRLRERRWVRPALHSSTALQPLQLACFYPLGDVEECALDIEFDNDWETTSDWNEDDEEATAEEAELAFRDDEVRVGERTRKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.4
3 0.36
4 0.28
5 0.24
6 0.2
7 0.15
8 0.12
9 0.08
10 0.09
11 0.11
12 0.12
13 0.17
14 0.17
15 0.19
16 0.19
17 0.2
18 0.19
19 0.18
20 0.19
21 0.18
22 0.19
23 0.16
24 0.15
25 0.16
26 0.17
27 0.18
28 0.17
29 0.17
30 0.16
31 0.19
32 0.21
33 0.23
34 0.22
35 0.19
36 0.21
37 0.23
38 0.26
39 0.26
40 0.32
41 0.34
42 0.4
43 0.4
44 0.39
45 0.41
46 0.45
47 0.53
48 0.55
49 0.54
50 0.52
51 0.55
52 0.54
53 0.48
54 0.38
55 0.29
56 0.21
57 0.16
58 0.14
59 0.1
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.14
66 0.12
67 0.13
68 0.1
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.13
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.22
79 0.27
80 0.33
81 0.34
82 0.36
83 0.41
84 0.43
85 0.44
86 0.44
87 0.43
88 0.39
89 0.4
90 0.37
91 0.35
92 0.36
93 0.41
94 0.44
95 0.49
96 0.52
97 0.55
98 0.59
99 0.66
100 0.72
101 0.75
102 0.75
103 0.74
104 0.78
105 0.82
106 0.83
107 0.75
108 0.74
109 0.69
110 0.64
111 0.58
112 0.49
113 0.41
114 0.38
115 0.4
116 0.3
117 0.24
118 0.19
119 0.17
120 0.17
121 0.15
122 0.11
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.13
171 0.15
172 0.15
173 0.19