Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B5RUD6

Protein Details
Accession B5RUD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-55VSHVQPQKRKILYKAKNEKPLNVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013860  AreA_GATA  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG dha:DEHA2F10384g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08550  DUF1752  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MGPISHTPTLSKIPNIYNRRSSLGSVNDANKPVSHVQPQKRKILYKAKNEKPLNVAELIEDNDDSSLDVFKMYQHKYYLPHNKRISNIAWRIQNKKILALDRQKKREDRDIQDKKQDQKSSNDKSDEFDYISQIRKMSQEQEGEGGMATLFENKKHSPYTNSLTSDSSLFSGNRSASASTANPSTGDKSNENLLTSYINSLESTFKDDYKLPEKLSKSTKNTKFLQCTNCNTKTTPLWRKSNKGDLLCNACGLFYKLHGVLRPLSQPDRKSSVSNDTLTSTNKTESSKPNSNMGGNSKYDLSPSMISHHHHHHYVDPAEDESRRQANQDQNDDMNIDQFLEMDPPGRHTSMSNDNHSGLEMNPPQNRNSTSNNIDEIDMLLNMNLFQSESFVIGNGKSKTGVNEQENRNNNSNTNDNSVTNDGYNFDAQGMFYDMQHVGEVGIGDEILADQPSEQGPNWNWLDFVSNGDNEMNSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.54
3 0.58
4 0.6
5 0.59
6 0.6
7 0.57
8 0.52
9 0.49
10 0.48
11 0.45
12 0.43
13 0.44
14 0.45
15 0.44
16 0.42
17 0.35
18 0.34
19 0.33
20 0.32
21 0.37
22 0.42
23 0.51
24 0.6
25 0.66
26 0.71
27 0.74
28 0.74
29 0.74
30 0.75
31 0.75
32 0.75
33 0.8
34 0.8
35 0.83
36 0.8
37 0.76
38 0.69
39 0.65
40 0.57
41 0.48
42 0.39
43 0.3
44 0.29
45 0.26
46 0.22
47 0.17
48 0.13
49 0.11
50 0.11
51 0.1
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.11
58 0.19
59 0.21
60 0.25
61 0.26
62 0.3
63 0.33
64 0.44
65 0.51
66 0.5
67 0.58
68 0.61
69 0.62
70 0.62
71 0.64
72 0.59
73 0.57
74 0.57
75 0.53
76 0.55
77 0.56
78 0.58
79 0.58
80 0.59
81 0.5
82 0.49
83 0.47
84 0.44
85 0.47
86 0.52
87 0.56
88 0.6
89 0.66
90 0.68
91 0.69
92 0.7
93 0.72
94 0.71
95 0.7
96 0.72
97 0.75
98 0.75
99 0.79
100 0.79
101 0.77
102 0.76
103 0.74
104 0.66
105 0.65
106 0.69
107 0.67
108 0.68
109 0.64
110 0.56
111 0.53
112 0.52
113 0.45
114 0.37
115 0.29
116 0.24
117 0.23
118 0.26
119 0.24
120 0.21
121 0.2
122 0.2
123 0.22
124 0.23
125 0.25
126 0.24
127 0.24
128 0.25
129 0.24
130 0.21
131 0.18
132 0.15
133 0.09
134 0.07
135 0.06
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.14
140 0.15
141 0.18
142 0.21
143 0.23
144 0.24
145 0.3
146 0.35
147 0.38
148 0.4
149 0.38
150 0.36
151 0.35
152 0.3
153 0.25
154 0.19
155 0.15
156 0.12
157 0.11
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.14
172 0.15
173 0.18
174 0.17
175 0.18
176 0.22
177 0.22
178 0.22
179 0.19
180 0.17
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.17
195 0.2
196 0.24
197 0.27
198 0.23
199 0.28
200 0.3
201 0.34
202 0.4
203 0.44
204 0.45
205 0.52
206 0.57
207 0.58
208 0.62
209 0.63
210 0.6
211 0.59
212 0.6
213 0.56
214 0.56
215 0.57
216 0.55
217 0.5
218 0.45
219 0.42
220 0.38
221 0.41
222 0.44
223 0.43
224 0.48
225 0.5
226 0.55
227 0.58
228 0.62
229 0.58
230 0.51
231 0.47
232 0.42
233 0.44
234 0.39
235 0.34
236 0.25
237 0.2
238 0.17
239 0.16
240 0.12
241 0.06
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.13
247 0.13
248 0.15
249 0.17
250 0.17
251 0.21
252 0.24
253 0.25
254 0.28
255 0.32
256 0.31
257 0.31
258 0.31
259 0.34
260 0.34
261 0.33
262 0.3
263 0.26
264 0.27
265 0.26
266 0.26
267 0.19
268 0.17
269 0.17
270 0.18
271 0.22
272 0.27
273 0.34
274 0.39
275 0.4
276 0.44
277 0.44
278 0.43
279 0.41
280 0.39
281 0.34
282 0.27
283 0.26
284 0.22
285 0.2
286 0.19
287 0.17
288 0.15
289 0.13
290 0.13
291 0.15
292 0.17
293 0.19
294 0.22
295 0.27
296 0.27
297 0.27
298 0.28
299 0.27
300 0.31
301 0.3
302 0.27
303 0.22
304 0.21
305 0.21
306 0.21
307 0.19
308 0.17
309 0.19
310 0.18
311 0.19
312 0.24
313 0.29
314 0.36
315 0.4
316 0.38
317 0.36
318 0.36
319 0.35
320 0.29
321 0.23
322 0.16
323 0.11
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.09
330 0.09
331 0.13
332 0.16
333 0.16
334 0.16
335 0.16
336 0.21
337 0.28
338 0.33
339 0.34
340 0.34
341 0.35
342 0.35
343 0.34
344 0.3
345 0.2
346 0.22
347 0.22
348 0.25
349 0.29
350 0.31
351 0.32
352 0.35
353 0.39
354 0.36
355 0.37
356 0.39
357 0.38
358 0.4
359 0.41
360 0.37
361 0.34
362 0.29
363 0.25
364 0.18
365 0.14
366 0.11
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.05
372 0.05
373 0.04
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.16
382 0.16
383 0.16
384 0.17
385 0.18
386 0.21
387 0.27
388 0.34
389 0.35
390 0.43
391 0.49
392 0.57
393 0.63
394 0.64
395 0.63
396 0.58
397 0.53
398 0.49
399 0.49
400 0.43
401 0.42
402 0.39
403 0.34
404 0.36
405 0.35
406 0.32
407 0.27
408 0.24
409 0.19
410 0.19
411 0.19
412 0.15
413 0.13
414 0.12
415 0.11
416 0.12
417 0.15
418 0.13
419 0.12
420 0.15
421 0.15
422 0.15
423 0.15
424 0.14
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.07
439 0.09
440 0.11
441 0.11
442 0.18
443 0.19
444 0.27
445 0.3
446 0.28
447 0.27
448 0.25
449 0.29
450 0.23
451 0.26
452 0.22
453 0.2
454 0.21
455 0.22